рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы

Классы МПК:C12N1/21 модифицированные введением чужеродного генетического материала
C12N15/52 гены, кодирующие ферменты или проферменты
C12N15/70 векторы или системы экспрессий, специально приспособленные для Ecoli
Автор(ы):, , ,
Патентообладатель(и):Химический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова (Химфак МГУ) (RU)
Приоритеты:
подача заявки:
2003-12-19
публикация патента:

Изобретение относится к генной инженерии и может быть использовано для гидролиза фосфорорганических соединений. Сконструирована рекомбинантная плазмидная ДНК pTES-His-OPH для экспрессии полипептида со свойствами орагнофосфатгидролазы, включающая ClaI/Hind III фрагмент плазмиды pTrcTEGF, фрагмент плазмиды pTES-ОРН, имеющий нуклеотидную последовательность, которая кодирует аминокислотную последовательность зрелой формы органофосфатгидролазы, и нуклеотидную последовательность, кодирующую 6 остатков гистидина, которая располагается на 5-конце нуклеотидной последовательности, кодирующей органофосфатгидролазу. На основе указанной плазмиды получен штамм Escherichia coli ЦКМИБХ-29 - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы. Использование предложенного изобретения позволяет по упрощенной технологии получить полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, который обладает улучшенной каталитической эффективностью действия по отношению к тиосодержащим триэфирам фосфорной кислоты. 2 н.п. ф-лы, 4 ил., 2 табл.

рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид   со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli   - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы, патент № 2255975

рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид   со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli   - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы, патент № 2255975 рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид   со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli   - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы, патент № 2255975 рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид   со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli   - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы, патент № 2255975 рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид   со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli   - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы, патент № 2255975

Формула изобретения

1. Рекомбинантная плазмидная ДНК pTES-His-OPH, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, с молекулярной массой 3,48 Md (5,276 т.п.о.), включающая

СlaI/Hind III фрагмент ДНК плазмиды pTrcTEGF длиной 4,232 т.п.о.,

фрагмент плазмиды pTES-OPH длиной 1,011 т.п.о., имеющий нуклеотидную последовательность, которая кодирует аминокислотную последовательность зрелой формы органофосфатгидролазы, и фланкированный сайтами рестрикции Barn HI и Hind III, и

нуклеотидную последовательность АТGАGАGGАТСGСАТСАССАТСАССАТСАСGGА, располагающуюся на 5'-конце нуклеотидной последовательности, кодирующей аминокислотную последовательность зрелой формы органофосфатгидролазы, а также содержащая уникальные сайты узнавания рестрикционными эндонуклеазами: Nco I - 265, Eco R1 - 270, Kpn I - 286, Xba I - 340, Cla I - 377, Hind III - 1427.

2. Штамм бактерий Escherichia coli ЦКМИБХ-29 - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы.

Описание изобретения к патенту

Изобретение относится к биотехнологии, в частности к генетической инженерии, и представляет собой сконструированную in vitro рекомбинантную плазмидную ДНК, содержащую ДНК процессированной формы фермента органофосфатгидролазы (ОРН), участок ДНК, кодирующий синтез аффинной последовательности, состоящей из шести аминокислотных остатков гистидина (6х-His), trc-промотор Escherichia coli и синтетический участок - усилитель трансляции, обуславливающие биосинтез His-OPH, а также штамм Escherichia coli - продуцент этого белка.

Органофосфатгидролаза (ОРН) (арилдиалкилфосфатаза, параоксоназа, фосфотриэстераза, ЕС 3.1.8.1) - фермент, катализирующий гидролиз эфирной связи в триэфирах фосфорной кислоты, содержит по два иона бивалентного металла (Zn2+ или Со2+ ) на одну субъединицу. Фермент в разной степени способен катализировать гидролиз Р-О, P-F и P-S связей в триэфирах фосфорной кислоты [Ефременко Е.Н., Сергеева B.C. Органофосфатгидролаза - фермент, катализирующий деградацию фосфорсодержащих отравляющих веществ и пестицидов.// Известия АН Сер. Хим., №10, с.1743-1749, (2001)].

Потребность получения ОРН в промышленном масштабе определяется необходимостью его использования в виде каталитически активного элемента биосенсорных устройств, предназначенных для определения фосфорорганических соединений в различных объектах (сельскохозяйственной продукции, продуктах питания, текстиле, речной воде и сточных водах) [Mulchandani P., Chen W., Mulchandani A. Flow injection amperometric enzyme biosensor for direct determination of organophosphate nerve agents.// Environ. Sci. Technol., V.35, p.2562-2565, (2001); Simonian A.L., Efremenko E.N., Wild J.R. Discriminative detection of neurotoxins in multi-component samples.// Anal. Chim. Acta, V.444, p.179-186, (2001)], а также возможностью эффективной биодеградации фосфорорганических нейротоксинов, к числу которых относятся все фосфорорганические пестициды, широко применяемые в сельском хозяйстве, и боевые отравляющие вещества (зарин, зоман и Vx) [Hoskin F.C., Walker J.E., Dettbarn W.D., Wild J.R. Hydrolysis of tetriso by an enzyme derived from Pseudomonas diminuta as a model for the detoxication of O-ethyl S-(2-diisopropylaminoethyl) methylphosphonothiolate (VX).// Biochem. Pharmacol., V.49, p.711-715, (1995); Rastogi V.K., DeFrank J.J., Cheng T.C., Wild J.R. Enzymatic hydrolysis of Russian-VX by organophosphorus hydrolase.// Biochem. Biophys. Res. Commun., V. 241, p.294-296, (1997)], уничтожение которых предусмотрено Международной конвенцией о химическом разоружении [United Nation, Convention on the prohibition of the development, production, stockpiling and use of chemical weapons and on their destruction, corrected version in accordance with Depositary Notification C.N.246.1994. <http://www.opcw.org/html/db/cwc/eng/cwc frameset.html>].

Существующий процесс выделения и очистки ОРН, состоящий из пяти последовательных стадий [Grimsley J.K., Scholtz J.M., Pace C.N., Wild J.R. Organophosphorus hydrolase is a remarkably stable enzyme that unfolds through a homodimeric intermediate.// Biochemistry, V.36, p.14366-14374, (1997)], является трудоемким, длительным и потому нетехнологичным. Создание конструкции, позволяющей экспрессировать генетически модифицированный фермент, содержащий олигогистидиновую последовательность, может позволить выделить высокоочищенный фермент за две стадии при использовании металл-хелатирующей хроматографии. Данный метод очистки белка основан на образовании аффинного комплекса между олигогистидиновой последовательностью белка и металлом, которым модифицирован хроматографический носитель.

Известны попытки коструирования эффективных генно-инженерных продуцентов His-OPH на основе клеток E.coli.

Была создана генетическая конструкция pGFP-OPH [Wu C.F., Cha H.J., Rao G., Valdes J.J., Bentley W.E. A green fluorescent protein fusion strategy for monitoring the expression, cellular location, and separation of biologically active organophosphorus hydrolase.// Appl. Microbiol. Biotechnol., V.54, р.78-83, (2000)], кодирующая синтез гибридного белка со свойствами ОРН, с целью получения экспрессируемого фермента. В качестве вектора была использована коммерческая плазмида pTrcHis (Invitrogen). В состав данного вектора был введен ген, кодирующий синтез зеленого флуоресцентного белка ("green fluorescent protein", GFP), для мониторинга экспрессии ОРН в клетках E.coli BL21. Конечная конструкция кодировала ген гибридного белка, содержащего олигогистидиновую последовательность, GFP, сайт узнавания энтерокиназой (ЕК) и ОРН (His-GFP-EK-OPH). Анализ уровня экспрессии His-OPH осуществляли опосредованно через регистрацию уровня флуоресценции GFP. Выход белка со свойствами ОРН в созданной биологической системе (плазмида pGFP-OPH, штамм E.coli BL21) составил не более 1,4 мг белка из 1 литра культуральной жидкости. Согласно данным, приведенным авторами, максимальный выход биомассы составил около 3 грамм с литра культуральной жидкости, следовательно, выход белка His-GFP-OPH не превышал 0,5 мг из 1 г клеток. Недостатком данной конструкции является не только низкий уровень экспрессии белка, но и довольно сложная процедура его очистки, вследствие того, что необходима обработка выделенного гибридного белка энтерокиназой (в течение 12 ч при 37° С) с целью отделения His-GFP-EK фрагмента белка. Далее необходима дополнительная очистка ОРН от посторонних белков (GFP и ЕК), присутствие которых снижает активность ОРН в 3 раза.

Была предпринята попытка увеличения выхода ОРН путем создания различных гибридных белков, содержащих в своем составе ОРН [Wu C.F., Valdes J.J., Rao G., Bentley W.E. Enhancement of organophosphorus hydrolase yield in Escherichia coli using multiple gene fusions.// Biotechnol Bioeng., V.75, p.100-103, (2001)]. Были созданы генетические конструкции на основе коммерческой плазмиды pTrcHis (Invitrogen), кодирующие синтез различных гибридных белков, содержащих по две копии гена ОРН в одном белке. В качестве штамма-хозяина использовали клетки E.coli BL21. Во всех случаях между геном, кодирующим ОРН, и олигогистидиновой последовательностью находился сайт узнавания энтерокиназой (ЕК). В случае конструкции His-GFP-EK-OPH-EK-OPH, содержащей две копии гена кодирующего ОРН, расположенных после His-GFP, выход ОРН увеличился в два раза и составил около 1 мг белка из 1 г клеток. Данный подход к увеличению выхода ОРН кроме недостатков, присущих предыдущему аналогу, имеет еще один, связанный с высокой массой полученной генетической конструкции (4,8 Md), что приводит к неустойчивому существованию экспрессионной системы. Данные по активности конечного белка авторами не приводятся.

Данное техническое решение, как наиболее близкое к заявляемому по своему назначению, а именно, получению экспрессионной системы, обеспечивающей максимальный выход His-OPH, принято за прототип.

Предлагаемое изобретение решает задачу получения His-OPH путем создания генно-инженерной конструкции и штамма клеток, которые обеспечивают синтез значительных количеств активной растворимой формы ОРН, содержащей олигогистидиновую последовательность, в цитоплазме клеток путем индуцибельного синтеза фермента с помощью индуктора (изопропил-рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид   со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli   - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы, патент № 2255975 -D-галактопиранозид, ИПТГ).

Поставленная задача решается путем конструирования рекомбинантной плазмидной ДНК pTES-His-OPH, кодирующей индуцибельный синтез фермента ОРН, содержащего олигогистидиновую последовательность, и штамма Escherichia coli SG13009[pREP4]/pTES-His-ОРН, обеспечивающего синтез этого белка с уровнем экспрессии, позволяющим получать не менее 5 мг очищенного белка из 1 г влажной биомассы за две стадии (ультразвуковое разрушение клеток и металл-хелатирующая хроматография).

Индуцибельный высокий уровень синтеза целевого полипептида обеспечивается наличием в плазмиде pTES-His-OPH trc-промотора Е. coli и синтетического усилителя трансляции гена 10 бактериофага Т7.

Рекомбинантная плазмидная ДНК pTES-His-OPH, кодирующая фермент органофосфатгидролазу, характеризуется следующими признаками:

- имеет молекулярную массу 3,48 Md (5,276 т.п.о.);

- кодирует аминокислотную последовательность фермента органофосфатгидролазы;

- содержит оптимизированную гексагистидиновую последовательность на 5'-конце гена, кодирующего аминокислотную последовательность фермента органофосфатгидролазы;

- состоит из Cla I/Hind III - фрагмента ДНК плазмиды pTrcTEGF (Патент RU 2185438 С2, кл. С 12 N 15/12, 1/21, 2002) длиной 4,232 т.п.о., содержащего trc-промотор Е. coli, синтетический усилитель трансляции TREN гена 10 бактериофага Т7, ген bla рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид   со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli   - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы, патент № 2255975 -лактамазы, определяющий устойчивость трансформированных плазмидой pTES-His-OPH клеток к ампициллину и участок ori инициации репликации; а также из ДНК фермента органофосфатгидролазы длиной 1,011 т.п.о., фланкированного сайтами рестрикции Ваm HI и Hind III и оптимизированную гексагистидиновую последовательность;

- содержит: trc-промотор Е. coli, уникальные сайты узнавания рестрикционными эндонуклеазами, имеющими следующие координаты: Nco I - 265, Eco RI - 270, Крn I - 286, Xba I - 340, Cla I - 377, Hind III – 1427.

Особенностью предложенной плазмидной конструкции является наличие trc-промотора Е. coli, контролирующего синтез ДНК фермента ОРН, а для усиления трансляции используется синтетический усилитель трансляции, что в совокупности обеспечивает индуцибельный синтез целевого белка с надежной регуляцией и высоким выходом, достигаемым при малых концентрациях индуктора.

Для получения штамма-продуцента фермента ОРН компетентные клетки Escherichia coli SG13009[pREP4] трансформируют рекомбинантной плазмидой pTES-His-OPH.

Полученный штамм Escherichia coli SG13009[pREP4]/pTES-His-OPH характеризуется следующими признаками:

Морфологические признаки. Клетки мелкие палочковидной формы, грамотрицательные, неспороносные, 1× 3-5 мкм, подвижные.

Культуральные признаки. При росте на агаризованной среде LB (Состав среды LB: триптон - 10,0 г/л; дрожжевой экстракт - 5,0 г/л; NaCl - 5,0 г/л; и 1,7% бактоагара) колонии круглые, гладкие, полупрозрачные, блестящие, серые, край ровный, диаметр колоний 1-3 мм; консистенция пастообразная. Рост в жидкой среде LB (триптон - 10,0 г/л; дрожжевой экстракт - 5,0 г/л; NaCl - 5,0 г/л) характеризуется ровным помутнением с образованием легкого осадка.

Физико-биохимические признаки. Клетки растут при температуре 4-42° С при оптимуме рН 6,8-7,2. В качестве источника азота используют как минеральные соли в аммонийной форме, так и органические соединения в виде пептона, триптона, дрожжевого экстракта, аминокислот. В качестве источника углерода используют аминокислоты, глицерин, углеводы.

Устойчивость к антибиотикам. Клетки проявляют устойчивость к ампициллину (до 200 мкг/мл), обусловленную наличием в плазмиде гена рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид   со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli   - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы, патент № 2255975 -лактамазы, а также к канамицину (до 40 мкг/мл).

Штамм Е. coli SG13009[pREP4]/pTES-His-OPH обеспечивает индуцибельный синтез фермента органофосфатгидролазы, содержащего олигогистидиновую последовательность, с высоким содержанием растворимой формы фермента в цитоплазме, что позволяет получать не менее 5 мг очищенного белка из 1 г влажной биомассы за одну стадию. Совокупность перечисленных свойств штамма Е. coli SG13009[pREP4]/pTES-His-OPH делает получение рекомбинантной His-ОРН высокотехнологичным процессом.

Полученный штамм депонирован в коллекции культур микроорганизмов Института биоорганической химии им. М.М.Шемякина -Ю.А. Овчинникова Российской Академии Наук под номером 29.

На фиг.1 представлена физическая карта рекомбинантной плазмиды pTES-His-OPH; на фиг.2 - нуклеотидная последовательность ДНК фермента органофосфатгидролазы с прилегающими регуляторными элементами: trc - промотор (1-30 п.о.), усилитель трансляции TREN (93-188 п.о.), ген, кодирующий гексануклеотидную последовательность (189-221), ген органофосфатгидролазы (222-1232 п.о.); инициирующий и терминирующий кодоны подчеркнуты, в рамки взяты сайты рестриктаз: Eco RI, Cla I и Hind III; на фиг.3 - аминокислотная последовательность фермента органофосфатгидролазы, кодируемого рекомбинантной плазмидой pTES-His-OPH; на фиг.4 - электрофореграмма лизатов клеток штамма-реципиента Е. coli SG13009[pREP4] (дорожка 1), штамма-продуцента Е. coli SG13009[pREP4]/pTES-His-OPH (дорожка 2), белковых стандартов молекулярного веса (дорожка 3) в 12%-ном полиакриламидном геле (стрелкой указан фермент органофосфатгидролаза).

Изобретение иллюстрируется следующими примерами.

Пример 1. Конструирование рекомбинантной плазмиднои ДНК pTES-His-ОРН.

Проводят модификацию гена органофосфатгидролазы путем присоединения на 5'-конце нуклеотидной последовательности, кодирующей 6 остатков гистидина и несколько дополнительных аминокислотных остатков. Такую модификацию осуществляют следующим образом.

Проводят амплификацию гена органофосфатгидролазы с двумя праймерами: праймером For-Bam, имеющим нуклеотидную последовательность CTTCCGGATCCATCGGCACAGGCGATC, и Seq-Rev, имеющим нуклеотидную последовательность GTAACCACTCACACGGCA. Праймер For-Bam позволяет ввести сайт рестрикции эндонуклеазы Ваm HI в начало кодирующей области гена органофосфатгидролазы. Праймер Seq-Rev комплементарен внутренней области гена органофосфатгидролазы. Амплификацию осуществляют следующим образом. К 5 мкл раствора плазмидной ДНК pTES-OPH, состоящей из Cla I/Hind III - фрагмента ДНК плазмиды pTrcTEGF (Патент RU2185438 С2, кл. С 12 N 15/12, 1/21, 2002) длиной 4,232 т.п.о. и ДНК фермента органофосфатгидролазы длиной 1,011 т.п.о. (10 нг/мкл) (выделенной из хромосомной ДНК клеток Pseudomonas diminuta VKM B-1297 полимеразной цепной реакцией с праймерами FOR-Cla с нуклеотидной последовательностью СТТ ССА TCG АТА TGA GAG GAT CGC АТС и REV-Hind с нуклеотидной последовательностью ССА САА AGC TTC ATG ACG CCC GCA AGG ТС), прибавляют по 60 пмоль праймера For-Bam и 60 пмоль праймера Seq-Rev, 8 мкл смеси, содержащей 2,5 мМ каждого из дезоксинуклеозидтрифосфатов, 10 мкл 10-кратного буфера (100 мМ трис-HCl, рН 8,8, 500 мМ КСl, 15 мМ MgCl2 ), 2 ед. Taq ДНК-полимеразы и воду до общего объема реакционной смеси 100 мкл. Полимеразную цепную реакцию (ПЦР) проводят в следующем режиме: денатурация - 40 сек, 94° С; отжиг - 50 сек, 55° С; достройка - 1 мин, 72° С; количество циклов - 25. В результате амплификации получают ДНК длиной 530 п.н. Реакционную смесь после прохождения ПЦР экстрагируют равным объемом хлороформа, после чего осаждают этиловым спиртом. После центрифугирования и высушивания ДНК растворяют в 20 мкл 10 мМ трис-HCl, 1 мМ ЭДТА, рН 8,0. 5 мкл амплифицированной ДНК обрабатывают 10 ед. рестриктазы Ваm HI и 15 ед. рестриктазы Sal I (Fermentas, Литва) в течение 1 ч при 37° С в 20 мкл буферного раствора, содержащего 33 мМ трис-ацетата (рН 7,9), 10 мМ ацетата магния, 66 мМ ацетата калия, и из полученного гидролизата выделяют переносом из 1,5%-ного агарозного геля на DEAE-мембрану фрагмент ДНК органофосфатгидролазы длиной 218 т.п.о. (Ваm HI - Sal I фрагмент), осаждают этиловым спиртом, высушивают и растворяют в 20 мкл Н2О.

5 мкг плазмидной ДНК pTES-OPH размером 5243 т.п.о. (0,5 мкг/мкл) обрабатывают 10 ед. рестриктазы Сla I, 10 ед. рестриктазы Sal I и 15 ед. рестриктазы Hind III в течение 2 ч при 37° С в 30 мкл буферного раствора, содержащего 33 мМ трис-ацетата (рН 7,9), 10 мМ ацетата магния, 66 мМ ацетата калия, и из полученного гидролизата выделяют переносом из 0,8%-ного агарозного геля на DEAE-мембрану NA-45 3'-концевую часть кДНК органофосфатгидролазы длиной 796 т.п.о. (Sal I - Hind III фрагмент), а также векторную часть плазмидной ДНК длиной 4,232 т.п.о. (Sal I - Hind III фрагмент). Выделенные фрагменты осаждают этиловым спиртом, высушивают и растворяют в 20 мкл Н2О. Олигогистидиновую последовательность присоединяют в составе синтетического олигонуклеотидного дуплекса следующей структуры:

рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид   со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli   - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы, патент № 2255975

рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид   со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli   - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы, патент № 2255975

Данный дуплекс получают следующим образом: по 20 пмоль каждого из олигонуклеотидов (I) и (II) смешивают в водном растворе объемом 20 мкл, содержащем 40 мМ трис-HCl, рН 7,8 и 10 мМ MgCl 2, после чего полученную смесь нагревают до 80° С в водяной бане и охлаждают до 20° С в течение 1 часа.

2 мкл раствора олигонуклеотидов после образования дуплекса смешивают с 0,02 мкг Sal I - Hind III фрагмента ДНК фермента органофосфатгидролазы длиной 696 т.п.о., 0,03 мкг Bam HI - SalI фрагмента длиной 418 и 0,05 мкг векторной части плазмидной ДНК pTrcTEGF(b) длиной 4,232 т.п.о. и проводят лигазную реакцию в течение 3 ч при 10° С в 15 мкл раствора, содержащего 40 мМ трис-НСl (рН 7,8), 10 мМ MgCl2, 10 мМ дитиотреитола, 0,5 мМ аденозинтрифосфата и 2 ед. Вейса Т4 ДНК-лигазы. 5 мкл реакционной смеси используют для трансформации 200 мкл компетентных клеток XL-1 Blue. 1/10 клеток, использованных для трансформации, высевают на LB-агар, содержащий 100 мкг/мл ампициллина. Из выросших клонов выделяют плазмидную ДНК, содержащую ДНК фермента органофосфатгидролазы, модифицированной добавлением гексагистидиновой последовательности.

Окончательно структуру рекомбинантной ДНК pTES-His-OPH подтверждают определением нуклеотидной последовательности в области встроенного гена органофосфатгидролазы. Аминокислотная последовательность органофосфатгидролазы, модифицированной добавлением гексагистидиновой последовательности, приведена на Фиг.3.

Пример 2. Получение штамма-продуцента фермента органофосфатгидролазы.

Компетентные клетки Escherichia coli SG13009[pREP4]: NalS Str S rifS, lac- ara- gal - mtl- F- recA+ uvr + трансформируют рекомбинантной плазмидной ДНК pTES-His-OPH и получают штамм-продуцент фермента His-OPH.

Пример 3. Выделение и очистка рекомбинантного фермента органофосфатгидролазы, содержащей олигогистидиновую последовательность.

Для накопления биомассы клеток используют жидкую питательную среду TYE (триптон - 12,0 г/л, дрожжевой экстракт - 24,0 г/л, глицерин - 4,0 мл/л, КН2РO4 - 6,95 г/л, K2HPO 4· 3H2O - 12,54 г/л, рН среды 7,0), в которую добавляют СоСl2· 2О до концентрации 237 мг/л. Перед посевом клеток в среду добавляют раствор ампициллина (концентрация в среде 100 мкг/мл) и канамицина (концентрация в среде 25 мкг/мл).

Для получения инокулята производят посев культуры петлей с чашек Петри в 20 мл среды LB, содержащей ампициллин 100 мкг/мл, канамицин 25 мкг/мл. 16-часовой инокулят вносят в колбу, содержащую 100 мл полноценной питательной среды, культуру выращивают при 30° С и постоянном перемешивании (200 об/мин) до тех пор, пока оптическая плотность при длине волны 540 нм не достигнет 0,6, после чего добавляют ИПТГ до концентрации 0,4 мМ. Клетки культивируют в течение 24 часов. Полученную биомассу отделяют центрифугированием (5000 g, 15 мин), взвешивают и ресуспендируют в 50 мМ фосфатном буфере, рН 8,0, содержащем 300 мМ хлорида натрия (буфер для озвучивания) (массовое соотношение биомасса:буфер - 1:5). Клетки разрушают обработкой ультразвуком (частота 44 кГц) 6 раз по 45 секунд, между обработками биомассу выдерживают в течение 1 мин во льду. Осадок отделяют центрифугированием (15000 g, 30 мин).

К супернатанту добавляют равный объем 50% суспензии Ni-NTA агарозы, предварительно уравновешенной в буфере для озвучивания, и перемешивают в течение 1 ч. Колонку заполняют полученной суспензией, промывают (0,5 мл/мин) элюирующим буфером (50 мМ фосфат натрия (рН 6,0), 300 мМ хлорид натрия, 10% глицерин) и элюируют фермент с колонки градиентным раствором имидазола (от 0 до 0,5 М) в элюирующем буфере. Полученные фракции, содержащие His-OPH, объединяют и подвергают диализу против 20 мМ фосфатно-карбонатного буфера (рН 8,5).

В процессе очистки из 1 г влажной биомассы получают 5 мг высокоочищенного фермента со средней удельной активностью 6870 ед/мг белка. Выход фермента составляет 81,7% от исходного количества His-OPH, синтезированного клетками (табл.1).

Таблица 1.

Баланс процедуры очистки и выделения His-OPH из 1 г биомассы.
Этап очистки Суммарный белок, мг Суммарная активность, едУдельная активность, ед/мг белкаОчистка, раз Выход,

%
Обработка клеток 31243680 1401 100
ультразвуком       
Ni-NTA колонка 5,235730 68706081,7

Пример 4. Исследование свойств рекомбинантного фермента органофосфатгидролазы, содержащей олигогистидиновую последовательность.

За скоростью исследуемой реакции следят спектрофотометрически по накоплению продукта 4-нитрофенолят аниона (рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид   со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli   - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы, патент № 2255975 =18000 М-1см-1, рН 10,7, рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид   со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli   - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы, патент № 2255975 =405 нм). Для определения каталитической активности His-OPH в водных растворах используют 0,05 М карбонатный буфер (рН 10,5). В качестве субстрата используют 1 мМ водные растворы параоксона, паратиона и метил-паратиона.

Каталитическую реакцию инициируют внесением в кювету с буфером и субстратом раствора His-OPH в 20 мМ фосфатно-карбонатном буфере (рН 8,5). Концентрация фермента в кювете составляет 10-10-10-9 М.

За единицу ферментативной активности принимают такое количество фермента, которое необходимо для того, чтобы гидролизовать 1 мМ субстрата за 1 мин при рН 10,5 и 20° С.

Расчет скоростей ферментативной реакции проводят по начальным линейным участкам кинетических кривых (vo=tgрекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид   со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli   - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы, патент № 2255975 ). Максимальную скорость ферментативной реакции (Vm ) и константу Михаэлиса (Km) определяют с использованием двойных обратных координат 1/vo-1[S] (Лайнуивера-Берка).

Кинетические характеристики рекомбинантной органофосфатгидролазы приведены в табл.2. рН-оптимум действия фермента составляет 10,5.

Таблица 2.

Константы гидролиза ФОС олигогистидинсодержащей органофосфатгидролазой.
Субстрат kcat, с -1Km, мкМ kcat/K m, M-1c-1
Параоксон5100± 10010± 0,55,1× 108
Паратион 530± 3015± 0,53,5× 107
Метил-паратион 310± 2073± 1,0 4,2× 106

Таким образом, заявляемое техническое решение представляет собой плазмиду уникальной конструкции для микробного синтеза полипептида, обладающего свойствами ОРН, и штамм E.coli, обеспечивающий экспрессию данной плазмиды. Данное техническое решение обеспечивает высокий выход растворимого белка His-OPH (не менее 5 мг из 1 г клеток) (Пример 3), который в 5 раз превышает выходы аналогичных гибридных белков, содержащих олигогистидиновую последовательность, в известных экспрессионных системах.

В отличие от известных аналогов, предлагаемое техническое решение позволяет:

- получить полипептид, каталитическая эффективность которого увеличена в 10 раз по ряду основных субстратов по сравнению с нативным ферментом ОРН (Пример 4);

- сократить процесс выделения His-OPH до двух стадий, позволяющих получить более 80% от исходного синтезированного белка в клетках (Пример 3) и получить каталитически активный фермент без необходимости отделения ОРН от посторонних белков-маркеров, в частности, от His-GFP-EK.

Все это позволяет значительно повысить технологичность и экономичность процесса получения высокоактивного рекомбинантного фермента органофосфатгидролазы.

Рекомбинантный фермент может быть использован для приготовления наборов для аналитического определения фосфорорганических соединений, а также для производства препаратов на основе ОРН, предназначенных для деградации фосфорорганических соединений.

Класс C12N1/21 модифицированные введением чужеродного генетического материала

рекомбинантный штамм бактерий escherichia coli n41 (pbpun4/mr)-продуцент сайт-специфической эндонуклеазы рестрикции bpun4i -  патент 2529362 (27.09.2014)
рекомбинантная плазмидная днк ppa-oprf-eta, кодирующая синтез рекомбинантного белка oprf-eta pseudomonas aeruginosa, штамм escherichia coli pa-oprf-eta - продуцент рекомбинантного белка oprf-eta pseudomonas aeruginosa и способ получения рекомбинантного белка oprf-eta pseudomonas aeruginosa -  патент 2529359 (27.09.2014)
нуклеиноваяя кислота, обладающая активностью гена фосфатазы фосфатидной кислоты (варианты), белок, рекомбинантный вектор, трансформант и способ получения композиции жирной кислоты -  патент 2528875 (20.09.2014)
слитый белок тиоредоксина и домена 4 инфестина, способ его получения, экспрессионная плазмидная днк, кодирующая слитый белок, и бактерия рода escherichia coli, трансформированная такой плазмидной днк -  патент 2528251 (10.09.2014)
тест-система для скрининга ингибиторов протеинкиназы gsk3 ; человека -  патент 2528059 (10.09.2014)
рекомбинантный штамм бактерий escherichia coli - продуцент янтарной кислоты (варианты) и способ получения янтарной кислоты с использованием этого штамма -  патент 2528056 (10.09.2014)
проникающие в клетку пептиды и полипептиды для клеток микроорганизмов -  патент 2526511 (20.08.2014)
плазмида 40nagal, определяющая синтез -n-ацетилгалактозаминидазы -alnagal, штамм e.coli rosetta(de3)/40nagal - продуцент химерного белка, включающего аминокислотную последовательность рекомбинантной -n-ацетилгалактозаминидазы -alnagal, и способ ее получения -  патент 2525682 (20.08.2014)
антитело к epha2 -  патент 2525133 (10.08.2014)
штамм бактерий escherichia coli - продуцент рекомбинантного флагеллина -  патент 2524133 (27.07.2014)

Класс C12N15/52 гены, кодирующие ферменты или проферменты

тест-система для скрининга ингибиторов протеинкиназы gsk3 ; человека -  патент 2528059 (10.09.2014)
мутантная формиатдегидрогеназа (варианты) -  патент 2522819 (20.07.2014)
способ синтеза n-замещенных акриламидов и рекомбинантный штамм rhodococcus erythropolis для его осуществления (варианты) -  патент 2522804 (20.07.2014)
способ идентификации улучшенных вариантов белка -  патент 2520808 (27.06.2014)
новые гидрогеназы, выделенные из thermococcus spp., гены, кодирующие эти гидрогеназы, и способы продуцирования водорода с использованием микроорганизмов, содержащих указанные гены -  патент 2499831 (27.11.2013)
полученная из микроорганизма протеаза усовершенствованного типа, обеспечивающая свертывание молока -  патент 2495931 (20.10.2013)
способ получения и экспрессии кодирующей последовательности изоформы 2 гена реналазы человека -  патент 2482185 (20.05.2013)
новая гидрогеназа seq id no:5, очищенная из thermococcus onnurienus na1 с помощью моноokcида углерода, кодирующие ее гены, и способы получения водорода с использованием микроорганизма, имеющего указанные гены -  патент 2460789 (10.09.2012)
промотор для тканеспецифической экспрессии генов в герминальных тканях млекопитающих -  патент 2459870 (27.08.2012)
плазмида 40ph, определяющая синтез щелочной фосфатазы cmap, штамм e.coli rosetta(de3)/40ph - продуцент химерного белка, включающего аминокислотную последовательность рекомбинантной щелочной фосфатазы cmap, и способ ее получения -  патент 2447151 (10.04.2012)

Класс C12N15/70 векторы или системы экспрессий, специально приспособленные для Ecoli

рекомбинантная днк, кодирующая гранулоцитарный колониестимулирующий фактор человека (g-csf) и рекомбинантная плазмида рas017, обеспечивающая синтез g-csf в клетках escherichia coli -  патент 2529363 (27.09.2014)
рекомбинантная днк, кодирующая гибридный белок эпидермального фактора роста человека слитого последовательностью глутатион-s-трансферазы (gst-hegf) и рекомбинантная плазмида pas007, обеспечивающая синтез gst-hegf в клетках escherichia coli -  патент 2521515 (27.06.2014)
рекомбинантная плазмидная днк pg1-rm7, обеспечивающая синтез гибридного белка g1-rm7, и гибридный белок, связывающий фактор некроза опухолей и обладающий биолюминесцентной активностью -  патент 2513686 (20.04.2014)
рекомбинантная плазмидная днк pqe-p35d, обеспечивающая синтез рекомбинантного белка p35d вируса оспы коров, штамм бактерий escherichia coli - продуцент рекомбинантного белка p35d вируса оспы коров и рекомбинантный белок p35d вируса оспы коров, используемый для создания тест-систем и конструирования субъединичных вакцин против ортопоксвирусных инфекций -  патент 2511037 (10.04.2014)
способ получения рекомбинантного антигена g2 хантавируса добрава в клетках e.coli -  патент 2509805 (20.03.2014)
рекомбинантный полипептид а2, селективно связывающий hsa, рекомбинантная днк pa2, кодирующая hsa-связывающую часть полипептида a2, его продуцент - рекомбинантный штамм escherichia coli m15-a2, содержащий рекомбинантную плазмидную днк pqe 32-pa2, обеспечивающую получение полипептида a2 и применение полипептида а2 для диагностики микроальбуминурии и выделения hsa из сыворотки крови -  патент 2506271 (10.02.2014)
способ получения рекомбинантного антигена g2 хантавируса добрава в клетках e. coli -  патент 2495938 (20.10.2013)
система экспрессии компонентов ортогональной трансляции в эубактериальной клетке-хозяине -  патент 2467069 (20.11.2012)
штамм клеток e.coli bl21(de3)plyss, клон ptt9/asfvp30, содержащий рекомбинантную плазмиду со встройкой участка гена ср204l вируса африканской чумы свиней, кодирующего конформационный эпитоп белка p30, для изготовления диагностических препаратов -  патент 2463343 (10.10.2012)
рекомбинантная плазмидная днк pтв323, кодирующая гибридный полипептид gst-дельтамрт64 со свойствами видоспецифичного микобактериального антигена мрт64 (мрв64), рекомбинантный штамм бактерий escherichia coli - продуцент гибридного полипептида gst-дельтамрт64 и рекомбинантный полипептид gst-дельтамрт64 -  патент 2458130 (10.08.2012)
Наверх