способ количественного определения дегидрогеназной активности микроорганизмов

Классы МПК:C12Q1/32 дегидрогеназу
C12N9/02 оксидоредуктазы (1), например люцифераза
Автор(ы):,
Патентообладатель(и):Федеральное государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Северный (Арктический) федеральный университет" (С(А)ФУ) (RU)
Приоритеты:
подача заявки:
2011-04-27
публикация патента:

Изобретение относится к биотехнологии и может быть использовано для оценки дегидрогеназной активности активного ила. Способ предусматривает смешивание суспензии микроорганизма с субстратом (10%-ным раствором глюкозы) и акцептором водорода, в качестве которого используют краситель метиленовый синий с последующим измерением концентрации метиленового синего в ходе ферментативной реакции. По скорости изменения концентрации метиленового синего в линейной фазе ферментативной реакции определяют активность дегидрогеназ. Изобретение позволяет сократить сроки определения дегидрогеназной активности микроорганизмов и повысить качество ее определения. 1 ил.

способ количественного определения дегидрогеназной активности   микроорганизмов, патент № 2476598

Формула изобретения

Способ количественного определения дегидрогеназной активности микроорганизмов, предусматривающий их контакт с субстратом и акцептором водорода, отличающийся тем, что в качестве акцептора водорода используют краситель метиленовый синий, а активность дегидрогеназ определяют по скорости изменения концентрации метиленового синего в линейной фазе ферментативной реакции.

Описание изобретения к патенту

Изобретение относится к аналитическим способам определения ферментативной активности микроорганизмов и может быть использовано для оценки дегидрогеназной активности активного ила.

В настоящее время известен лишь один способ количественного определения дегидрогеназной активности микроорганизмов [Методические рекомендации по определению дегидрогеназной активности при технологическом контроле за работой аэротенков. - Министерство жилищно-коммунального хозяйства РСФСР Ордена Трудового Красного знамени, Академия коммунального хозяйства им. К.Д.Памфилова. - Москва, 1978]. Этот способ заключается в следующем: пробу микроорганизмов (активного ила) помещают в три центрифужные пробирки, доводят рН до 7 и центрифугируют. Затем из пробирок сливается надосадочная жидкость, и вместо нее добавляется водопроводная вода и неочищенная сточная вода. После перемешивания добавляют 0,5%-ный раствор 2,3,5-трифенилтетразол хлорида (ТТХ). Пробирки плотно закрывают, перемешивают и ставят в термостат на 55 минут при 37°С. Одновременно в термостат ставят четвертую пробирку с илом без ТТХ, служащую контролем. Через 55 минут пробы центрифугируются, надосадочная жидкость сливается и к осадку приливается 10 мл этанола. Содержимое пробирок перемешивается, а затем периодически встряхивается до полного обесцвечивания хлопьев ила, которое в зависимости от его качества происходит за 15-30 минут. После обесцвечивания пробы центрифугируются еще раз. Окрашенный спиртовой раствор из каждой пробы сливается в пробирку, перемешивается и колориметрируется на фотоэлектрическом колориметре (ФЭК) с синим светофильтром № 5 (490 нм) в кювете с толщиной слоя 0,5 см. Дегидрогеназная активность выражается в миллиграммах восстановленного формазана на 1 г сухого или беззольного вещества ила (удельная активность), или на 1 л смеси (общая активность).

Данный способ определения дегидрогеназной активности принят в качестве прототипа и характеризуется следующими недостатками:

1) длительность;

2) трудоемкость;

3) многостадийность;

4) продолжительность культивирования (55 минут). За это время клетка может выработать дополнительное количество необходимых ферментов. В то же время количество дегидрогеназ может уменьшаться за счет действия протеаз;

5) не учитывается специфика питательной среды для микроорганизмов (активного ила), поскольку при условии недостаточного углеродного питания скорость дегидрогеназной реакции будет определяться не непосредственно дегидрогеназной активностью, а концентрацией субстрата;

6) за такое длительное время и в случае нелинейности процесса одно и то же количество ТТХ может быть восстановлено различным количеством фермента;

7) не учитывается возможность содержания в микроорганизмах значительного количества веществ, способных восстанавливать ТТХ без наличия дегидрогеназ.

Задачей, на решение которой направлено настоящее изобретение, является разработка способа, позволяющего оперативно количественно оценить дегидрогеназную активность микроорганизмов и обладающего хорошей воспроизводимостью.

Это достигается тем, что при количественном определении дегидрогеназной активности микроорганизмов, предусматривающем их контакт с субстратом и акцептором водорода, в качестве акцептора водорода используют краситель метиленовый синий, а активность дегидрогиназ определяют по скорости изменения концентрации метиленового синего в линейной фазе ферментативной реакции.

О степени дегидрогеназной активности микроорганизмов в предлагаемом способе судят по убыли концентрации метиленового синего в ячейке, которую непрерывно регистрируют оптическим способом. Исследуемую суспензию микроорганизмов вводят в измерительную термостатируемую ячейку, включающую систему регистрации сигнала (светодиод, фотодатчик), в ячейке создаются анаэробные условия; сюда же вводят субстрат (например, глюкозу) и раствор метиленового синего в качестве акцептора водорода. Длительность эксперимента составляет 5-7 минут.

Иллюстративный пример реализации заявляемого способа включает выполнение следующих действий: в стакан измерительной ячейки на 100 мл вносили 60 мл дистиллированной воды, определенное количество тщательно перемешанной суспензии активного ила (1-2 мл), 1 мл 10%-ного раствора глюкозы. На стакан устанавливали крышку с встроенной системой регистрации сигнала измерительной ячейки. Доводили объем воды до метки (83 мл), обеспечивая анаэробные условия. После этого включали светодиод с фотодатчиком, мешалку. Помещали стакан в термостат и устанавливали требуемую температуру. После этого ожидали термостабилизации ячейки и стабилизации показаний фотодатчика, с помощью дозатора вводили 50 мкл 0,2%-ного раствора метиленового синего. Фотодатчик начинал фиксировать уменьшение концентрации метиленового синего в ходе ферментативной реакции.

В условиях избытка субстрата и акцептора водорода ход реакции линеен в течение примерно 300 секунд, по истечении которых процесс измерения останавливали. Показания фотодатчика фиксировали один раз в секунду, поэтому аппроксимировали показания прибора от времени по линейной зависимости (фиг.1).

Далее, исходя из тангенса наклона указанной линейной зависимости, соответствующей линейной фазе ферментативной реакции, рассчитывали дегидрогиназную активность, составляющую в данном случае

способ количественного определения дегидрогеназной активности   микроорганизмов, патент № 2476598

На фиг.2 установлена взаимосвязь между показаниями прибора (фотодатчика) и количеством внесенного в ячейку метиленового синего, характеризующаяся уравнением у=-0,02512х+1137,2263. То есть определено, что в используемом диапазоне концентраций увеличение показаний прибора на 1 соответствует уменьшению содержания метиленового синего в ячейке на 0,02512 нмоля. Вносимые в ячейку микроорганизмы, как правило, значительно рассеивают и поглощают свет, увеличивая коэффициент 1137,2263, однако величина 0,02512 остается неизменной.

В целом приведенные расчеты поясняют, что скорость протекания реакции равна W=10,68·0,02512 нмоль/с и с учетом того, что для реакции взято 2 мл суспензии микроорганизмов активность ферментов А=10,68·0,02512·60/2=8,05 нмоль/(мин·мл), где 60 - перевод в минуты.

Таким образом, исходя из тангенса наклона указанной линейной зависимости, соответствующей линейной фазе ферментативной реакции, рассчитывали дегидрогиназную активность, составляющую в данном случае 8,05 нмоль/(мин·мл).

В целом формулу расчета дегидрогеназной активности, исходя из тангенса угла наклона зависимости (фиг.1) и концентрации метиленового синего, можно представить следующим образом:

способ количественного определения дегидрогеназной активности   микроорганизмов, патент № 2476598

где A - активность фермента, моль·мин -1·мл-1;

С - концентрация метиленового синего, моль·мл-1;

Vp - объем реакционной ячейки (в примере 83 мл), мл;

V - объем пробы микроорганизмов, мл;

t - продолжительность ферментативной реакции, мин;

D - оптическая плотность реакционной смеси;

К 1 - коэффициент пропорциональности между С и D, равный произведению коэффициента экстинкции на длину пути света в растворе (закон Бугера-Ламберта-Бера (D=EL С)), мл·моль-1 ;

П - цифровые показания фотодатчика;

К2 - коэффициент пропорциональности между П и D;

VpK2/K1 - коэффициент пропорциональности между С и П с учетом объема реакционной ячейки, моль; определяется экспериментально (фиг.2). В нашем случае равен -0,02512.

dП/dt - скорость изменения показаний прибора во времени, с-1.

Коэффициент 10,68 в уравнении у=10,68х+37205 является тангенсом угла наклона прямой при изучении ферментативной реакции (фиг.1).

Итоговая формула может быть представлена:

способ количественного определения дегидрогеназной активности   микроорганизмов, патент № 2476598

Средство (прибор) измерения оптической плотности, подходящее для определения, известны специалисту в данной области техники. В частности, может быть использован спектрофотометр (колориметр или аналоги), имеющий интерфейс с ЭВМ, обладающий термостатируемой ячейкой, обеспечивающий перемешивание раствора и определение оптической плотности или другой, связанной с ней, величины. Предварительно должна быть произведена калибровка между этой величиной и количеством метиленового синего в ячейке (что очевидно для специалиста в данной области техники).

Результаты экспериментов воспроизводимы, так как опираются не на одно-два измерения, а на несколько сотен. При этом погрешность составляет менее 5%.

Существенными признаками предлагаемого способа по сравнению с прототипом являются следующие:

1) в качестве акцептора водорода используют метиленовый синий;

2) расходование метиленового синего определяют путем непрерывной регистрации концентрации метиленового синего фотометрическим способом;

3) регистрация изменения концентрации метиленового синего проводится в течение 5 минут;

4) количественно дегидрогеназная активность микроорганизмов выражается числом наномолей метиленового синего на единицу объема ила (массы сухого вещества микроорганизмов) в единицу времени.

Преимуществами предлагаемого способа по сравнению с прототипом является следующее:

1) быстрота (способ позволяет выполнить анализ за 5-7 минут);

2) значительное упрощение (меньше операций, автоматическая регистрация показаний, термостатирование);

3) исключение изменения концентрации дегидрогеназ, которое может происходить вследствие процессов, протекающих в живой клетке;

4) исключение влияния цветности среды, так как проводится измерение не абсолютного значения оптической плотности, а кинетики ее изменения, что особенно важно в случае окрашенных жидкостей сточных вод.

Класс C12Q1/32 дегидрогеназу

реагенты и способы обнаружения аналитов -  патент 2518310 (10.06.2014)
стабилизация дегидрогеназ стабильными коферментами -  патент 2499834 (27.11.2013)
самостоятельно ограничивающие размер композиции и тестирующие устройства для измерения содержания анализируемых веществ в биологических жидкостях -  патент 2413002 (27.02.2011)
способ оценки функционального состояния микробной популяции -  патент 2195496 (27.12.2002)
способ, средство, тест-система для колориметрического определения аналита и нитрозоанилиновые соединения -  патент 2114914 (10.07.1998)
способ определения активности глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы у бактерий рода gersinia -  патент 2059729 (10.05.1996)
способ выявления микроорганизмов - деструкторов ксенобиотиков -  патент 2051961 (10.01.1996)
способ иммуносупрессивной диагностики эндогенных депрессий -  патент 2042950 (27.08.1995)

Класс C12N9/02 оксидоредуктазы (1), например люцифераза

ингибитор андийского вируса крапчатости картофеля -  патент 2527899 (10.09.2014)
способ определения активности пероксидаз и субстратная смесь для определения активности пероксидаз -  патент 2525137 (10.08.2014)
гены дельта-8-десатуразы, ферменты, кодируемые ими, и их применение -  патент 2517615 (27.05.2014)
трансгенные растения -  патент 2515927 (20.05.2014)
укороченная мутантная люцифераза из metridia longa для применения в качестве биолюминесцентного репортера в живых клетках -  патент 2495929 (20.10.2013)
полипептиды для энантиоселективного ферментативного восстановления промежуточных соединений -  патент 2486239 (27.06.2013)
мутанты fad-2 и высокоолеиновые растения -  патент 2484137 (10.06.2013)
ингибитор вируса клещевого энцефалита -  патент 2473689 (27.01.2013)
способ получения субстанции l-лизин-альфа-оксидазы -  патент 2471866 (10.01.2013)
дельта-5-десатураза и ее применение для получения полиненасыщенных жирных кислот -  патент 2469092 (10.12.2012)
Наверх