плазмида pnan5, определяющая синтез l-аспарагиназы еса2, штамм bacillus cereus 1576-pnan5 - промышленный штамм-продуцент рекомбинантной l-аспарагиназы еса2 и способ ее получения

Классы МПК:C12N1/21 модифицированные введением чужеродного генетического материала
C12N15/11 фрагменты ДНК или РНК; их модифицированные формы
C12N15/55 гидролазы (3)
Автор(ы):, ,
Патентообладатель(и):Общество с ограниченной ответственностью "ПРОМОГЕН" (RU)
Приоритеты:
подача заявки:
2006-08-07
публикация патента:

Изобретение относится к биофамакологии, препаративной биохимии, биотехнологии, и касается получения рекомбинантного белка L-аспарагиназы ЕсА2. Конструируют плазмиду pNAN5, определяющую синтез L-аспарагиназы ЕсА2. Клетки штамма Bacillus cereus 1576 трансформируют указанной плазмидой, затем штамм-продуцент выращивают в питательной среде, удаляют бактериальную массу путем фильтрации, культуральную жидкость концентрируют на полых волокнах, проводят гельфильтрацию на ультрагеле Sephacryl S200, концентрируют на ультрафильтрационной ячейке. Изобретение позволяет повысить эффективность синтеза L-аспарагиназы ЕсА2. 3 н.п. ф-лы, 4 ил.

плазмида pnan5, определяющая синтез l-аспарагиназы еса2, штамм   bacillus cereus 1576-pnan5 - промышленный штамм-продуцент рекомбинантной   l-аспарагиназы еса2 и способ ее получения, патент № 2313575 плазмида pnan5, определяющая синтез l-аспарагиназы еса2, штамм   bacillus cereus 1576-pnan5 - промышленный штамм-продуцент рекомбинантной   l-аспарагиназы еса2 и способ ее получения, патент № 2313575 плазмида pnan5, определяющая синтез l-аспарагиназы еса2, штамм   bacillus cereus 1576-pnan5 - промышленный штамм-продуцент рекомбинантной   l-аспарагиназы еса2 и способ ее получения, патент № 2313575 плазмида pnan5, определяющая синтез l-аспарагиназы еса2, штамм   bacillus cereus 1576-pnan5 - промышленный штамм-продуцент рекомбинантной   l-аспарагиназы еса2 и способ ее получения, патент № 2313575

Формула изобретения

1. Плазмида pNAN5 размером 11148 пар оснований (п.о.), определяющая синтез рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2 и характеризующаяся наличием следующих фрагментов: последовательность с 1 нуклеотида по 2237 нуклеотид (н.) является фрагментом ДНК плазмиды pUC19 размером 2237 п.о. и содержит промотор гена плазмида pnan5, определяющая синтез l-аспарагиназы еса2, штамм   bacillus cereus 1576-pnan5 - промышленный штамм-продуцент рекомбинантной   l-аспарагиназы еса2 и способ ее получения, патент № 2313575 -лактомазы (ген устойчивости к ампициллину - Amp R; последовательность с 2238 н. по 4614 н. включает фрагмент ДНК размером 2376 п.о. и содержит полноразмерный ген регулятора транскрипции atxA; последовательность с 4615 н. по 4621 н. включает фрагмент ДНК размером 6 п.о. и часть вектора pUC19 сайтом Sail; последовательность с 4622 н. по 6858 н. включает фрагмент ДНК размером 2237 п.о. и содержит химерный ген, состоящий из pag промотора с лидерным пептидом и структурной части гена аспарагиназы ЕсА2; последовательность с 6859 н. по 6997 н. включает фрагмент ДНК размером 8 п.о. вектора pUC19 и содержит сайты ресктрикции для Sad и BamHI; последовательность с 6998 н. по 10755 н. включает фрагмент ДНК плазмиды pUB11O размером 3757 п.о. и содержит ori- и ген устойчивости к канамицину); последовательность с 10756 н. по 11148 н. включает фрагмент ДНК плазмиды pUC19 размером 393 п.о.

2. Штамм Bacillus cereus 1576, трансформированный плазмидой pNAN5 по п.1 - продуцент рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2.

3. Способ получения рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2, характеризующийся тем, что культивируют штамм-продуцент Bacillus cereus 1576-pNAN5 по п.2 в питательной среде, затем удаляют бактериальную массу путем фильтрации на фильтре МФО-1 (Владипор), полученную культуральную жидкость концентрируют на полых волокнах UP 10 (Amicon), проводят гельфильтрацию на ультрагеле Sephacryl S200 (Amersham), концентрируют на ультрафильтрационной ячейке, концентрат содержит L-аспарагиназу ЕсА2 с чистотой более 95%.

Описание изобретения к патенту

Изобретение относится к биофамакологии, препаративной биохимии и биотехнологии, а именно к способам промышленного получения рекомбинантного белка L-аспарагиназы ЕсА2 медицинского назначения, а также к плазмидам для его получения и рекомбинантным штаммам Bacillus cereus.

L-аспарагиназа ЕсА2 представляет собой бактериальный (Escherichia coli) полипептид гомотетрамерной структуры с молекулярной массой 130000 Да [1]. Наиболее широко и успешно L-аспарагиназа применяется для лечения острых лимфобластных лейкозов, лимфо- и ретикулосарком, что объясняется специфичностью метаболических процессов в клетках этих форм опухолей. В ряде случаев отмечается положительный эффект при использовании фермента для лечения болезни Ходжкина, хронической лимфоцитарной лейкемии и меланосаркомы.

В настоящее время в онкологической практике нашли практическое применение выпускаемые за рубежом препараты нативных L-аспарагиназ из Е.coli (ASP, Elspare), Erwinia (ERW, Erwinase) и иммобилизованного на полиэтиленгликоле фермента из Е.coli (PEG, Oncaspar).

Известны способы получения рекомбинантного белка L-аспарагиназы с использованием штаммов Escherichia coli и, значительно реже, других микроорганизмов: [2] и RU №2224797, RU №2221868.

Основным недостатком этих способов получения являются высокие технологические затраты, большие потери белка при очистке и трудность отделения правильно свернутого белка от белка с неправильной конформацией, а также сложность удаления ЛПС, обладающего высокой пирогенностью.

Бациллы, в том числе и рекомбинантные, могут синтезировать белки в большом количестве и секретировать их во внешнюю среду культивирования. Это свойство бацилл существенно, так как секретируемые белки правильно свернуты с конформационной точки зрения. Кроме этого, у бацилл отсутствует эндотоксический ЛПС, и отпадает необходимость в его удалении. Все это позволяет резко снизить технологические затраты на производство рекомбинантноого белка. Однако значительный уровень протеолитической активности и слабая проработанность методов генетической инженерии для бацилл осложняет их использование в качестве продуцентов рекомбинантных белков. Это подтверждает интенсивное использование в качестве продуцентов Bacillus subtilis, которое пока не привело к позитивным примерам, так как выявило очень высокий уровень протеолитической активности и широкий спектр белков, синтезируемых во время интенсивного культивирования.

Задачей данного изобретения является конструирование рекомбинантого промышленного штамма-продуцента Bacillus creus с низкой протеазной активностью и плазмиды, кодирующей синтез рекомбинантного белка L-аспарагиназы ЕсА2.

Указанная задача решалась созданием рекомбинантной плазмиды pNAN5 и штамма Bacillus cereus 1576-pNAN5.

Технический результат заявленного изобретения - повышение выхода рекомбинантной L-аспарагиназы с высокой чистотой и упрощение технологии получения.

Плазмида pNAN5 имеет 11148 пар оснований (п.о.) и характеризуется наличием следующих фрагментов:

- последовательность с 1 нуклеотида по 2237 нуклеотид (н.) включает фрагмент ДНК плазмиды pUC19 размером 2237 п.о., содержащий промотор гена плазмида pnan5, определяющая синтез l-аспарагиназы еса2, штамм   bacillus cereus 1576-pnan5 - промышленный штамм-продуцент рекомбинантной   l-аспарагиназы еса2 и способ ее получения, патент № 2313575 -лактамазы (ген устойчивости к ампициллину - Amp R);

- последовательность с 2238 н. по 4614 н. включает фрагмент ДНК размером 2376 п.о., содержащий последовательность полноразмерного гена регулятора транскрипции atxA;

- последовательность с 4615 н. по 4621 н. включает фрагмент ДНК размером 6 п.о., содержащий часть вектора pUC19 сайтом Sail;

- последовательность с 4622 н. по 6858 н. включает фрагмент ДНК размером 2237 п.о., содержащий химерный ген, состоящий из pag промотора с лидерным пептидом и структурной части гена аспарагиназы ЕсА2;

- последовательность с 6859 н. по 6997 н. включает фрагмент ДНК размером 8 п.о. вектора pUC19, содержащий сайты ресктрикции для SacI и BamHI;

- последовательность с 6998 н. по 10755 н. включает фрагмент ДНК плазмиды pUB110 размером 3757 п.о., содержащий ori- и ген устойчивости к канамицину;

- последовательность с 10756 н. по 11148 н. включает фрагмент ДНК плазмиды pUC19 размером 393 п.о.

Изобретение поясняется чертежами.

На фиг.1, 2, 3, 4 представлены физические карты плазмид pUB110, pUC19, pUCB119 и pNAN5.

Нуклеотидная последовательность фрагмента плазмиды pNAN5, фланкированная сайтами Xhol и SacI, содержащая последовательность структурного гена L-аспарагиназы ЕсА2.

плазмида pnan5, определяющая синтез l-аспарагиназы еса2, штамм   bacillus cereus 1576-pnan5 - промышленный штамм-продуцент рекомбинантной   l-аспарагиназы еса2 и способ ее получения, патент № 2313575 плазмида pnan5, определяющая синтез l-аспарагиназы еса2, штамм   bacillus cereus 1576-pnan5 - промышленный штамм-продуцент рекомбинантной   l-аспарагиназы еса2 и способ ее получения, патент № 2313575

Штамм Bacillus cereus 1576-pNAN5 получен трансформацией клеток Bacillus cereus 1576 плазмидой pNAN5 с использованием традиционной генно-инженерной технологии.

Штамм Bacillus cereus 1576 (коллекция ГосНИИгенетика г.Москва) характеризуется следующими признаками.

Культурально-морфологические признаки.

Клетки крупные, прямые, грамположительные палочки, образущие цепочки, спорообразующие.

Клетки хорошо растут на простых питательных средах. При росте на агаре "Дифко" образуются шероховатые серые колонии, с неровными краями. При росте в жидких средах (в минимальной среде с глюкозой или в LB-бульоне) образуют интенсивную ровную муть.

Физико-биологические признаки.

Факультативный анаэроб. Температурный диапазон роста 4-45°С при оптимуме рН 6,5-8,0.

В качестве источника азота используют как минеральные соли в аммонийной и нитратной формах, так и органические соединения в виде аминокислот, пептона, триптона, дрожжевого экстракта и т.д.

В качестве источника углерода используют аминокислоты, глицерин, углеводы.

Устойчивость к антибиотикам.

Клетки проявляют спонтанную устойчивость к некоторым антибиотикам (стрептомицину до 5 мкг/мл, тетрациклину до 3 мкг/мл).

Патогенность и токсичность.

Рекомбинантный штамм Bacillus cereus 1576-pNAN5 не обладает остаточной патогенностью и при инфицирующей дозе 109 КОЕ не вызывает гибели беспородных белых мышей. В тестах на токсичность на белых мышах, морских свинках и кроликах не вызывает негативных проявлений в дозе до 109 КОЕ при подкожном введении.

Серологические свойства.

Рекомбинантный штамм теряет свойства секретировать энтеротоксины, протеазы и некоторые другие белки, синтез которых детерминируется инактивированным регулятором транскрипции PIcR.

Способ, условия и состав среды для хранения штамма.

В L-arape под маслом, в виде споровой суспензии с глицерином (до 30%) при -20°С.

Штамм Bacillus cereus 1576-pNAN5 идентифицирован по Определителю Берги (1974) как штамм вида Bacillus cereus.

Особенностью заявляемого способа является разработка технологии, позволяющая выделять рекомбинантный белок L-аспарагиназы ЕсА2 в чистом виде с минимальным количеством стадий.

Способ заключается в культивировании в питательной среде, содержащей на литр 3,6 г казаминовых кислот, 3,0 г дрожжевого экстракта, 8,0 г бикарбоната натрия, 3,0 г натрия хлорида и по 0,1 г 9 аминокислот, штамма Bacillus cereus 1576-pNAN5, удалении бактериальной массы с помощью фильтрации на фильтре МФО-1 (Владипор), концентрировании культуральной жидкости на полых волокнах UP 10 (Amicon), проведением гельфильтрации на ультрагеле Sephacryl S200 (Amersham) и концентрировании на ультрафильтрационной ячейке.

Оптимальными условиями проведения отдельных стадий получения рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2 являются следующие:

- ферментацию проводят при непрерывном добавлении субстратов в течение 8 часов, что обуславливает высокий уровень экспрессии рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2;

- удаление бактериальной культуры на фильтре Владипор;

- концентрирование на полых волокнах;

- хроматографическая очистка рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2 на колонке с Sephacryl S200.

Выход рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2 в результате применения описанного способа составляет не менее 20 мг рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2 с 1 л культуральной среды.

Существенными отличиями заявляемого способа от аналогов являются:

- использование конструкции штамма продуцента Bacillus cereus с низкой протеазной активностью, что позволяет получать при биосинтезе большое количество полноразмерной рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2;

- использование ультрафильтрационного концентрирования и эксклюзивной хроматографии этого фермента из полусинтетической среды микроанаэробного культивирования, что позволяет получать чистый белок рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2 за короткое время и с малыми потерями;

- использование штамма Bacillus cereus 1576-pNAN5, не имеющего эндотоксичного ЛПС, позволяет получать рекомбинантную L-аспарагиназу ЕсА2 без бактериальных эндотоксинов;

- одностадийная хроматографическая очистка рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2 позволяет получать белок более 95-98% чистоты по данным электорофореза в редуцирующих условиях.

Сущность и преимущества заявляемой группы изобретений иллюстрируется следующими примерами.

Пример 1. Конструирование штамма Bacillus cereus 1576 с низкой протеазной активностью.

Низкая протеазная активность штамма Bacillus cereus 1576 обусловлена инактивацией регуляторного гена pleR. Инактивация гена pleR была осуществлена с помощью гомологичной рекомбинации. В качестве суицидного вектора использовали вектор pYJ335 [3], содержащий ксилоза-тетрациклин-контролируемый промотор. ПЦР-фрагмент (плазмида pnan5, определяющая синтез l-аспарагиназы еса2, штамм   bacillus cereus 1576-pnan5 - промышленный штамм-продуцент рекомбинантной   l-аспарагиназы еса2 и способ ее получения, патент № 2313575 plcRF GGGGGGCCCGGGTATAGTGGGATGGTGAGTAAG; плазмида pnan5, определяющая синтез l-аспарагиназы еса2, штамм   bacillus cereus 1576-pnan5 - промышленный штамм-продуцент рекомбинантной   l-аспарагиназы еса2 и способ ее получения, патент № 2313575 plcRR GGGGGGCCCGGGAATAGCTTTATTTGCATGACA), содержащий плазмида pnan5, определяющая синтез l-аспарагиназы еса2, штамм   bacillus cereus 1576-pnan5 - промышленный штамм-продуцент рекомбинантной   l-аспарагиназы еса2 и способ ее получения, патент № 2313575 plcR и фланкированный двумя рестрикционными сайтами SmaI, был введен в EcoRV сайт вектора pYJ335. Сконструированная плазмида была электропорирована в штамм Bacillus cereus с селекцией по эритромицину. На среде с эритроцитами были отобраны не гемолитичные трансформанты, которые затем были проверены с помощью полимеразной цепной реакции со специфическими праймерами на гомологичную рекомбинацию (sphVF 5' GTATTCATTCATTATATTCACTGTG 3'; плазмида pnan5, определяющая синтез l-аспарагиназы еса2, штамм   bacillus cereus 1576-pnan5 - промышленный штамм-продуцент рекомбинантной   l-аспарагиназы еса2 и способ ее получения, патент № 2313575 plcRR 5' GGGGGGCCCGGGAATAGCTTTATTTGCATGACA 3').

Пример 2. Конструирование плазмиды pNAN5.

Способ конструирования плазмиды pNAN5 включает следующие этапы:

- конструирование бирепликонной плазмиды pUCB119;

- промежуточной плазмиды, содержащей pag промотор и структурную часть гена аспарагиназы;

- конструирование плазмиды pNANI, состоящей из бирепликонной плазмиды pUCB119 и гена регулятора транскрипции atxA;

- конструирование рекомбинантной плазмиды pNAN5, состоящей из плазмиды pNANI и химерного гена, состоящего из pag промотора и структурной части гена аспарагиназы есА2 (11148 п.о.).

Конструирование бирепликонной плазмиды pUCB119.

Бирепликонная плазмида pUCB119 представляет собой объединенные по сайтам EcoRI and BamHI плазмиды pUB110 и pUC19.

Конструирование плазмиды, содержащей pag промотор и структурную часть гена аспарагиназы.

На первом этапе получают фрагмент, содержащий промотор и лидерный пептид pag гена, при помощи полимеразной цепной реакции с использованием ДНК плазмиды рХО1 в качестве матрицы и праймеров:

pagF - 5' GGATGAGCTCATTCTAGGTGATTTTTAAATTAT 3'

pagR - 5' CTGAGCTCCTCGAGATTACCTGTGCTTGAAACTA 3'

Данную и последующие ПЦР-реакции проводят в следующих условиях: 20 mM Tris-HCl, рН 8.8, 10 mM (NH4) 2SO4, 10 mM KCl, 2 mM MgCl 2, 0.1% Triton X100, 0.1 mg/ml BSA, 0.2 mM каждого dNTP, 1.25 ед. Pfu ДНК полимеразы, 100 нг ДНК. Процесс амплификации состоит из следующих стадий: прогревание при 95°С 5 мин, 35 циклов ПЦР (30 сек 95°С, 30 сек 56°С, 2 мин 72°С) и инкубация 10 мин при 72°С. После амплификации (и после последующих амплификаций) фрагмент ДНК очищают электрофоретически в 1% агарозном геле. Фрагмент обрабатывают последовательно рестриктазами Xhol и Sall в соответствии с методикой, описанной в работе [4].

Затем получают фрагмент, содержащий структурную часть гена есА2, при помощи полимеразной цепной реакции с использованием ДНК Е.coli К12 в качестве матрицы и праймеров:

asp2F - 5' ACGCTCGAGGTGATTCAGGCAGAATTACCCAATATCACCATTTTAGC 3'

asp2R - 5' GTCGAGCTCAGTACTGATTGAAGATCTGCTG 3'

Данную и последующие ПЦР-реакции проводят в следующих условиях: 20 mM Tris-HCl, рН 8.8, 10 mM (NH4) 2SO4, 10 mM KCl, 2 mM MgCl 2, 0.1% Triton X100, 0.1 mg/ml BSA, 0.2 mM каждого dNTP, 1.25 ед. Pfu ДНК полимеразы, 100 нг ДНК. Процесс амплификации состоит из следующих стадий: прогревание при 95°С 5 мин, 35 циклов ПЦР (30 сек 95°С, 30 сек 56°С, 2 мин 72°С) и инкубация 10 мин при 72°С. После амплификации (и после последующих амплификаций) фрагмент ДНК очищают электрофоретически в 1% агарозном геле. Фрагмент обрабатывают последовательно рестриктазами Xhol и SacI в соответствии с методикой, описанной в работе [4].

100 мкг плазмидной ДНК pUC19 обрабатывают последовательно рестриктазами Sall и SacI в соответствии с методикой, описанной в работе [4], и из полученного гидролизата выделяют в 1% геле легкоплавкой агарозы векторную часть плазмиды.

Полученные фрагменты и векторную часть плазмиды pUC19 сшивают при помощи лигазной реакции в 50 мкл буфера для лигирования [4]. 10 мкг реакционной смеси используют для трансформации компетентных клеток Е.coli HB 101. Трансформанты высевают на LB-arap, содержащий 50 мкг/мл ампицилина. После инкубирования в течение 16 час при 37°С, клоны отсевают, выделяют плазмидную ДНК и анализируют рестрикционным анализом. Отбирают ДНК, содержащую нужный набор рестрикционных фрагментов. Получают плазмиду pUCpag-asp.

Конструирование pNAN1

Фрагмент, содержащий структурный ген atxA, получают при помощи полимеразной цепной реакции с использованием ДНК плазмиды рХО1 в качестве матрицы и праймеров:

atxA113PF - 5' GCTCTGCAGGTTCTAAATCGTAAGGGGTT 3'

atxA2460HR - 5' CTCCAAGCTTATTCACCGTTCTTTCCTGTA 3'

Данную и последующие ПЦР-реакции проводят в следующих условиях: 20 mM Tris-HCl, рН 8.8, 10 mM (NH4) 2SO4, 10 mM KCl, 2 mM MgCl 2, 0.1% Triton Х100, 0.1 mg/ml BSA, 0.2 mM каждого dNTP, 1.25 ед. Pfu ДНК полимеразы, 100 нг ДНК. Процесс амплификации состоит из следующих стадий: прогревание при 95°С 5 мин, 35 циклов ПЦР (30 сек 95°С, 30 сек 58°С, 2 мин 72°С) и инкубация 10 мин при 72°С. После амплификации (и после последующих амплификации) фрагмент ДНК очищают электрофоретически в 1% агарозном геле. Фрагмент обрабатывают последовательно рестриктазами HindIII и PstI в соответствии с методикой,описанной в работе[4].

5 мкг плазмидной ДНК pUCB119 обрабатывают последовательно рестриктазами HindIII и PstI в соответствии с методикой, описанной в работе [4], и из полученного гидролизата выделяют в 1% геле легкоплавкой агарозы векторную часть плазмиды.

Полученный фрагмент и векторную часть плазмиды pUC19 сшивают при помощи лигазной реакции в 50 мкл буфера для лигирования [4]. 10 мкг реакционной смеси используют для трансформации компетентных клеток Е.coli HB 101. Трансформанты высевают на LB-агар, содержащий 50 мкг/мл ампицилина. После инкубирования в течение 16 час при 37°С клоны отсевают, выделяют плазмидную ДНК и анализируют рестрикционным анализом. Отбирают ДНК, содержащую нужный набор рестрикционных фрагментов. Получают плазмиду pNAN1.

Конструирование плазмиды pNAN5 (11148 п.о.).

5 мкг плазмидной ДНК pUCpag-asp обрабатывают последовательно рестриктазами Sall и BamHI в соответствии с методикой, описанной в работе [4], и из полученного гидролизата выделяют в 1% геле легкоплавкой агарозы фрагмент 1053 п.о., содержащий pag промотор и структурную части гена есА2.

5 мкг плазмидной ДНК pNAN1 обрабатывают последовательно рестриктазами Sall и BamHI и переосаждают в соответствии с методикой, описанной в работе [4].

Полученный фрагмент и обработанную рестриктазами плазмиду pNAN1 сшивают при помощи лигазной реакции в 50 мкл буфера для лигирования [4]. 1 мкг реакционной смеси используют для трансформации компетентных клеток Е.coli HB101. Трансформанты высевают на LB-агар, содержащий 50 мкг/мл ампицилина. После инкубирования в течение 16 час при 37°С клоны отсевают, выделяют плазмидную ДНК и анализируют рестрикционным анализом. Отбирают ДНК, содержащую нужный набор рестрикционных фрагментов. Получают плазмиду pNAN5 размером 11148 п.о.

Пример 2. Получение штамма Bacillus cereus 1576-pNANS - продуцента рекомбинантного белка L-аспарагиназы ЕсА2

Штамм продуцент рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2 Bacillus cereus 1576-pNAN5 получают путем трансформации клеток штамма Bacillus cereus 1576 рекомбинантной плазмидой pNAN5. Штамм продуцент рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2 выращивают в 10-литровом ферментере, заполненным 8 литрами среды, содержащей на литр 3,6 г казаминовых кислот, 3,0 г дрожжевого экстракта, 8,0 г бикарбоната натрия, 3,0 г натрия хлорида и по 0,1 г 9 аминокислот. Культивирование проводят при температуре 37°С в микроанаэробных условиях при перемешивании биомассы со скоростью 100 об./мин в течение 8 часов. Рекомбинантный микроорганизм синтезирует полноценный белок L-аспарагиназы ЕсА2 и секретирует ее в среду культивирования на уровне 15-20 мг/л.

Для определения продуктивности штамма отбирают пробы культуральной среды и анализируют электрофорезом в 15% полиакриламидном геле с додецилсульфатом натрия. Гель окрашивают Кумасси R-250 по стандартной методике и сканируют для определения относительного количества белка в полосе целевого белка. По данным сканирования содержание рекомбинантного белка L-аспарагиназы в культуральной среде составляет не менее 90% от всех секретируемых клеточных белков.

Пример 3. Выделение и характеризация рекомбинантного полипептида со свойствами L-аспарагиназы ЕсА2.

Штамм-продуцент рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2 выращивают в 10-литровом ферментере, заполненным 8 литрами среды, содержащей на литр 3,6 г казаминовых кислот, 3,0 г дрожжевого экстракта, 8,0 г бикарбоната натрия, 3,0 г натрия хлорида и по 0,1 г 9 аминокислот. Культивирование проводят при температуре 37°С в микроанаэробных условиях при перемешивании биомассы со скоростью 100 об./мин в течение 8 часов. Удаление бактериальной культуры проводят на фильтре Владипор. Концентрирование рекомбинантного полипептида проводят на полых волокнах. После этого проводят хроматографическую очистку рекомбинантного полипептида на колонке с Sephacryl S200. Выход рекомбинантного полипептида в результате применения описанного способа, составляет не менее 20 мг с 1 л культуральной среды.

Подлинность полученного рекомбинантного полипептида определяют по первым 5 аминокислотам, определенным на автоматическом секвенаторе. Проведенное секвенирование препарата рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2, выделенной из бацилл, выявило аминокислотную последовательность Leu-Pro-Asn-Ile-Thr, соответствующую первым 5 аминокислотам полноразмерного нативного белка L-аспарагиназы ЕсА2 с молекулярным весом 34 kDa.

Биологическую (ферментативную, общую) активность определяют с помощью реагента Несслера. Препарат рекомбинантного белка L-аспарагиназы ЕсА2 (200 мкл) смешивают с 800 мкл 20 mM боратного буферного раствора, содержащего 40 mM L-аспарагина, и инкубируют смесь в течение 30 мин при 72°С. Реакцию останавливают внесением 250 мкл 20% трихлоруксусной кислоты. Одна единица активности фермента равняется 1 плазмида pnan5, определяющая синтез l-аспарагиназы еса2, штамм   bacillus cereus 1576-pnan5 - промышленный штамм-продуцент рекомбинантной   l-аспарагиназы еса2 и способ ее получения, патент № 2313575 mol аммония, образующегося в результате гидролиза L-аспарагина в течение 1 мин. Удельная активность рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2 из бацилл составляла 220 Ед/мг.

Полученные данные по характеристике и биологической (ферментативной, общей) активности продукта экспрессии искусственного гена L-аспарагиназы ЕсА2 в клетках штамма Bacillus cereus 1576-pNAN5 свидетельствуют о соответствии исследуемого полипептида его природному аналогу.

Как следует из приведенных примеров, заявляемая группа изобретений позволяет получать рекомбинантную L-аспарагиназу ЕсА2 с высоким выходом при относительно простой и надежной технологии.

Заявленное изобретение позволяет:

- с помощью использования штамма штамма Bacillus cereus 1576-pNAN5, не имеющего эндотоксичного ЛПС, получать рекомбинантную L-аспарагиназу ЕсА2, без бактериальных эндотоксинов, что подтверждает LAL-тест.

- использование штамма-продуцента Bacillus cereus 1576-pNAN5 с низкой протеазной активностью позволяет получать при биосинтезе большое количество полноразмерной рекомбинантной L-аспарагиназы ЕсА2.

использование ультрафильтрационного концентрирования и эксклюзивной хромотографии при очистке фермента из полусинтетической среды в процессе микроаанэробного культивирования позволяет получать фермент с чистотой более 98% за короткое время и с малыми потерями.

Источники информации

1. B.H.Frank, А.Н.Pekar, A.J.Vfros, P.K.Ho / Biol. Chemistry, Vol .245, No.14, Issue of July 26, pp.3716-3724, 1970.

2. J.Krasotkinal, A.Borisova, Y.V.Gervaziev and N.N.Sokolov / Biotechnol. Appl. Biochem. (2004) 39, 215-221.

3. Yinduo J.I., A.Marra, M.Martin, G.Woodnutt / J.Bacteriology 1999, p.6585-6590, Vol.181, No.21.

4. Sambrook J., Fritsch E.F., Maniatis Т. // Molecular Cloning. A. Laboratory Manual. 2bd ed. Cold Spring Harbor, NY, 1989.

5. Meister, A. Methods Enzymol. 1955, 2, 380-385.

Класс C12N1/21 модифицированные введением чужеродного генетического материала

рекомбинантный штамм бактерий escherichia coli n41 (pbpun4/mr)-продуцент сайт-специфической эндонуклеазы рестрикции bpun4i -  патент 2529362 (27.09.2014)
рекомбинантная плазмидная днк ppa-oprf-eta, кодирующая синтез рекомбинантного белка oprf-eta pseudomonas aeruginosa, штамм escherichia coli pa-oprf-eta - продуцент рекомбинантного белка oprf-eta pseudomonas aeruginosa и способ получения рекомбинантного белка oprf-eta pseudomonas aeruginosa -  патент 2529359 (27.09.2014)
нуклеиноваяя кислота, обладающая активностью гена фосфатазы фосфатидной кислоты (варианты), белок, рекомбинантный вектор, трансформант и способ получения композиции жирной кислоты -  патент 2528875 (20.09.2014)
слитый белок тиоредоксина и домена 4 инфестина, способ его получения, экспрессионная плазмидная днк, кодирующая слитый белок, и бактерия рода escherichia coli, трансформированная такой плазмидной днк -  патент 2528251 (10.09.2014)
тест-система для скрининга ингибиторов протеинкиназы gsk3 ; человека -  патент 2528059 (10.09.2014)
рекомбинантный штамм бактерий escherichia coli - продуцент янтарной кислоты (варианты) и способ получения янтарной кислоты с использованием этого штамма -  патент 2528056 (10.09.2014)
проникающие в клетку пептиды и полипептиды для клеток микроорганизмов -  патент 2526511 (20.08.2014)
плазмида 40nagal, определяющая синтез -n-ацетилгалактозаминидазы -alnagal, штамм e.coli rosetta(de3)/40nagal - продуцент химерного белка, включающего аминокислотную последовательность рекомбинантной -n-ацетилгалактозаминидазы -alnagal, и способ ее получения -  патент 2525682 (20.08.2014)
антитело к epha2 -  патент 2525133 (10.08.2014)
штамм бактерий escherichia coli - продуцент рекомбинантного флагеллина -  патент 2524133 (27.07.2014)

Класс C12N15/11 фрагменты ДНК или РНК; их модифицированные формы

способ идентификации вызывающих муковисцидоз мутаций в гене cftr человека, набор праймеров, биочип, набор мишеней и тест-система, используемые в способе -  патент 2529717 (27.09.2014)
синтетические олигонуклеотидные праймеры и способ выявления генотипов для идентификации личности с помощью системы микросателлитных днк-маркеров y-хромосомы -  патент 2528742 (20.09.2014)
способ оценки чувствительности клеток рака легкого к доксорубицину на основании уровней экспрессии маркерных генов и набор для его осуществления -  патент 2528247 (10.09.2014)
проникающие в клетку пептиды и полипептиды для клеток микроорганизмов -  патент 2526511 (20.08.2014)
набор синтетических олигонуклеитидов для выявления видовой принадлежности родиолы четырехнадрезной (rhodiola quadrifida (pall.) fisch. et mey.) -  патент 2526499 (20.08.2014)
способ определения генотипов золотистого стафилококка -  патент 2526497 (20.08.2014)
набор для выявления возбудителя ку-лихорадки в биологическом материале методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (пцр-рв) -  патент 2525059 (10.08.2014)
набор последовательностей олигонуклеотидов для диагностики герминальных мутаций в гене ret, ассоциированных с наследственной предрасположенностью к раку щитовидной железы -  патент 2524433 (27.07.2014)
синтетические 5 utr (нетранслируемые области), экспрессионные векторы и способ повышения трансгенной экспрессии -  патент 2524431 (27.07.2014)
одноцепочечная кольцевая рнк и способ ее получения -  патент 2523596 (20.07.2014)

Класс C12N15/55 гидролазы (3)

способ идентификации улучшенных вариантов белка -  патент 2520808 (27.06.2014)
термостабильная липаза из бактерии thermosyntropha lipolytica, активная в щелочной среде -  патент 2508402 (27.02.2014)
гомологи фосфатазы фосфатидной кислоты и их применение -  патент 2507264 (20.02.2014)
рекомбинантная плазмидная днк pyp2, кодирующая ферментативно-активную часть полипептида липазы, белка пищеварительного тракта пчелиной огневки -  патент 2507261 (20.02.2014)
фермент для продукции длинноцепочечной перкислоты -  патент 2487939 (20.07.2013)
штамм дрожжей yarrowia lipolytica - продуцент клеточно-связанной липазы -  патент 2475532 (20.02.2013)
способ получения белка -  патент 2470996 (27.12.2012)
тест-система для определения мутаций в генах фумарилацетоацетат гидролазы и альфа-1-антитрипсина человека -  патент 2458131 (10.08.2012)
способ обработки целлюлозного материала и используемые в нем ферменты -  патент 2458128 (10.08.2012)
плазмида 40ph, определяющая синтез щелочной фосфатазы cmap, штамм e.coli rosetta(de3)/40ph - продуцент химерного белка, включающего аминокислотную последовательность рекомбинантной щелочной фосфатазы cmap, и способ ее получения -  патент 2447151 (10.04.2012)
Наверх