предшественник инсулина, способ его получения и применение

Классы МПК:C07K14/62 инсулины
C12N15/17 инсулины
C12P21/00 Получение пептидов или протеинов
Автор(ы):, ,
Патентообладатель(и):НОВО НОРДИСК А/С (DK)
Приоритеты:
подача заявки:
2000-12-04
публикация патента:

Изобретение относится к области биотехнологии и может быть использовано в медико-биологической промышленности. Предложены новые полипептиды - предшественники инсулина или его аналогов, характеризующиеся повышенной стабильностью структуры и высоким уровнем экспрессии при получении в виде рекомбинантных форм в дрожжевых клетках. Полипептиды по изобретению отличаются от природной формы предшественника инсулина тем, что содержат укороченный С-пептид, включающий остаток ароматической аминокислоты, и имеют общую формулу: В (1-27)-X2-X3-X1 -Y-A (1-21), где Х1-пептидная последовательность из 1-3 аминокислотных остатков, в которой рядом с Y расположен остаток ароматической аминокислоты; Х2-Pro или Asp; Х 3-Lys; Y-Lys или Arg; A (1-21) - А-цепь инсулина человека, а В (1-27) - первые 27 аминокислотных остатков В-цепи инсулина человека. Раскрыт способ получения новых предшественников инсулина с помощью технологии рекомбинантных ДНК и последующего преобразования их в активный гормон. 5 с. и 4 з.п. ф-лы, 6 табл., 10 ил. предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

Формула изобретения

1. Предшественник инсулина или предшественник аналога инсулина, содержащий последовательность формулы

В (1-27)-Х231-Y-А (1-21),

где X1 представляет собой пептидную последовательность из 1-3 аминокислотных остатков, содержащую остаток ароматической аминокислоты непосредственно у N-конца Y;

Х2 представляет собой Pro или Asp;

Х3 представляет собой Lys в положении 29 В-цепи; и

Y представляет собой Lys или Arg;

В(1-27) обозначает природную В-цепь, в которой отсутствуют аминокислотные остатки В28, В29 и В30;

А(1-21) обозначает А-цепь инсулина человека.

2. Предшественник инсулина или предшественник аналога инсулина по п.1, где предшественник инсулина или предшественник аналога инсулина обладает повышенной стабильностью в растворе, измеряемой в виде Cmid, по сравнению с предшественником инсулина или предшественником аналога инсулина, который не содержит остатка ароматической аминокислоты в X1.

3. Предшественник инсулина или предшественник аналога инсулина по п.1, где X1-Y выбран из группы: Met-Trp-Lys; Ala-Trp-Lys; Val-Trp-Lys; Ile-Trp-Lys; Leu-Trp-Lys; Glu-Glu-Phe-Lys (SEQ ID NO: 15); Glu-Phe-Lys; Glu-Trp-Lys; Ser-Trp-Lys; Thr-Trp-Lys; Arg-Trp-Lys; Glu-Met-Trp-Lys (SEQ ID NO:1); GIn-Met-Trp-Lys (SEQ ID NO:2) и Asp-Trp-Lys.

4. Полинуклеотидная последовательность, кодирующая предшественник инсулина или предшественник аналога инсулина, характеризующаяся нуклеотидной последовательностью, определяющей аминокислотную последовательность предшественника по любому из пп.1-3.

5. Реплицируемый вектор экспрессии, содержащий полинуклеотидную последовательность по п.4.

6. Способ получения предшественника инсулина или предшественника аналога инсулина, где указанный способ включает (i) культивирование клеточной линии, содержащей реплицируемый вектор экспрессии по п.5, в условиях культивирования, подходящих для экспрессии указанного предшественника инсулина или предшественника аналога инсулина; и (ii) выделение экспрессированного предшественника инсулина или предшественника аналога инсулина.

7. Способ по п.6, где клеточной линией является дрожжевая клеточная линия.

8. Способ получения инсулина или аналога инсулина, где указанный способ включает (i) культивирование клеточной линии, содержащей реплицируемый вектор экспрессии по п.5, в условиях культивирования, подходящих для экспрессии предшественника инсулина или предшественника аналога инсулина; (ii) выделение предшественника инсулина или предшественника аналога инсулина из культуральной среды и (iii) преобразование предшественника инсулина или предшественника аналога инсулина в инсулин или аналог инсулина посредством химического или ферментативного превращения in vitro.

9. Способ по п.8, где клеточной линией является дрожжевая клеточная линия.

Приоритет по пунктам:

29.12.1999 по пп.1-9;

17.03.2000 по пп.1-9.

Описание изобретения к патенту

Организмы дрожжей продуцируют ряд белков, которые функционируют вне клетки. Такие белки называют секретируемыми белками. Указанные секретируемые белки сначала экспрессируются внутри клетки в виде предшественника или преформы, содержащей последовательность препептида, обеспечивающего эффективное направление (транслокацию) экспрессированного продукта через мембрану эндоплазматического ретикулума (ЭР). Препептид, обычно называемый сигнальным пептидом, как правило, отщепляется от желаемого продукта в ходе транслокации. После входа в секреторный путь белок транспортируется к аппарату Гольджи. Из аппарата Гольджи белок может следовать разными путями, которые ведут в такие компартменты, как клеточная вакуоль или клеточная мембрана, или он может быть направлен из клетки для секреции во внешнюю среду (Pfeffer et al. (1987) Ann. Rev. Biochem. 56: 829-852).

Инсулин является полипептидным гормоном, секретируемым предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 -клетками поджелудочной железы, и состоит из двух полипептидных цепей А и В, которые связаны двумя межцепочечными дисульфидными мостиками. Кроме того, особенностью А-цепи является наличие одного внутрицепочечного дисульфидного мостика.

Гормон синтезируется в виде одноцепочечного предшественника проинсулина (препроинсулина), состоящего из препептида длиной 24 аминокислоты, за которым следует проинсулин, содержащий 86 аминокислот в следующем порядке: препептид - В-Arg Arg - С - Lys Arg - А, в котором С означает соединительный пептид из 31 аминокислоты. Arg-Arg и Lys-Агд представляют собой расщепляемые сайты для отщепления соединительного пептида от А- и В-цепей.

Для получения инсулина человека в микроорганизмах использовали три основных способа. В двух способах применяли Escherichia coli либо в случае экспрессии крупного слитого белка в цитоплазме (Frank et al. (1981) in Peptides: Proceedings of the 7th American Peptide Chemistry Symposium (Rich and Gross, eds.), Pierce Chemical Co., Rockford, IL. p.729-739), либо в случае использования сигнального пептида, чтобы обеспечить возможность секреции в периплазматическое пространство (Chan et al. (1981) PNAS 78: 5401-5404). В третьем способе использовали Saccharomyces cerevisiae, чтобы секретировать предшественник инсулина в среду (Thim et al. (1986) PNAS 83: 6766-6770). В предшествующем уровне техники сообщается об ограниченном количестве предшественников инсулина, которые экспрессируются либо в Е. coli, либо в Saccharomyces cerevisiae, смотри патент США 5962267, заявки WO 95/16708, ЕР 0055945, ЕР 0163529, ЕР 0347845 и ЕР 0741188.

Круговой дихроизм (КД) используют для того, чтобы определить стабильность белка и относительные стабильности молекул. КД, наблюдаемый ниже 240 нм, обусловлен амидным хромофором пептида, и его можно использовать для оценки вторичной структуры белка (Johnson (1988) Ann. Rev. Biophys. Chem. 17: 145-166). Спектр инсулина характеризуется минимумами при 220 и 209 нм, отрицательно-положительным переходом вблизи 203 нм и максимумом при 195 нм. При денатурации отрицательная полоса спектра КД в пределах 240-218 нм постепенно уменьшается, что согласуется с потерей упорядоченной вторичной структуры, которая сопутствует разворачиванию белка. Поэтому стабильность укладки предшественника инсулина можно количественно проанализировать, измеряя потерю вторичной структуры как функцию добавленного денатурирующего агента, например гидрохлорида гуанидина (GuHCl) (смотри, например, Расе (1975) CRC Crit. Rev. Biochem. 3: 1-43).

СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ

Особенностью данного изобретения являются новые соединительные пептиды (С-пептиды), которые дают повышенный выход продукции и/или повышенную стабильность молекул предшественников инсулина и молекул аналогов предшественников инсулина при экспрессии в трансформированном микроорганизме, в частности, в дрожжах. Такие предшественники инсулина или аналоги предшественников инсулина затем можно превратить в инсулин или аналоги инсулина в ходе одной или нескольких подходящих, хорошо известных стадий превращения.

Соединительные пептиды согласно данному изобретению содержат, по меньшей мере, один остаток ароматической аминокислоты Phe, Trp или Tyr и, как правило, будут короче, чем природный С-пептид человека, который, включая фланкирующие сайты расщепления из двух основных аминокислот, состоят из 35 аминокислот. Таким образом, новые соединительные пептиды, как правило, будут длиной не более 15 аминокислотных остатков, и предпочтительно не более 9 аминокислотных остатков. Обычно новые соединительные пептиды будут длиной до 7 или до 5 аминокислотных остатков и предпочтительно не более 4 аминокислотных остатков в длину.

Как и в природной молекуле инсулина человека соединительный пептид будет содержать сайт расщепления на его С- и N-конце, обеспечивающий отщепление in vitro соединительного пептида от А- и В-цепей. Такими сайтами расщепления могут быть любые подходящие сайты расщепления, известные в данной области, например Met, отщепляемый бромцианом; отдельный остаток основной аминокислоты или пара остатков основных аминокислот (Lys или Arg), отщепляемые трипсином или трипсиноподобными протеазами; протеазой Acromobactor lyticus или протеазой карбоксипептидазой. Сайт расщепления, обеспечивающий отщепление соединительного пептида от А-цепи, предпочтительно представляет собой единственный остаток основной аминокислоты Lys или Arg, предпочтительно Lys.

Альтернативно отщепление соединительного пептида от В-цепи можно обеспечить посредством расщепления у природного аминокислотного остатка Lys в В-цепи, приводящего к образованию предшественника инсулина desВ30 или аналога предшественника инсулина desВ30. Требуемый аминокислотный остаток В30 затем можно добавить хорошо известными ферментативными способами in vitro.

В одном варианте соединительный пептид не будет содержать двух близлежащих остатков основных аминокислот (Lys, Arg). В указанном варианте отщепление от А-цепи можно осуществить у единственного Lys или Arg, локализованного на N-конце А-цепи, и природного Lys в положении В29 в В-цепи.

Соединительный пептид может содержать более одного остатка ароматической аминокислоты, но предпочтительно не более 5. Остатки ароматических аминокислот могут быть одинаковыми или отличаться друг от друга. Соединительный пептид предпочтительно не будет содержать более 3 остатков ароматических аминокислот и наиболее предпочтительно он будет содержать только единственный остаток ароматической аминокислоты.

В одном варианте данного изобретения один из остатков ароматических аминокислот в соединительном пептиде находится непосредственно у N-конца сайта расщепления, примыкающего к А-цепи. Кроме того, один из остатков ароматических аминокислот предпочтительно будет расположен на расстоянии менее 5 Å, по меньшей мере, от одного из остатков в положениях B11, B12 или В26 в В-цепи. В одном варианте ароматическая аминокислота, расположенная непосредственно у N-конца сайта расщепления, примыкающего к А-цепи, находится на расстоянии менее 5 Å, по меньшей мере, от одного из остатков в положениях В11, В12 или В26 в В-цепи.

Предшественники инсулина или аналоги предшественников инсулина характеризуются наличием высокой стабильности укладки в растворе. Предшественники согласно данному изобретению будут обладать более высокой стабильностью с более высоким значением Cmid по сравнению с инсулином или аналогами инсулина, которые не содержат остатка ароматической аминокислоты в соединительном пептиде. Стабильность, таким образом, будет выше с Cmid, выше чем примерно 5,5 М GuHCl, обычно выше чем около 6,0 М GuHCl и более типично выше чем около 6,5 М GuHCl.

Соответственно, в одном аспекте данное изобретение относится к предшественникам инсулина или аналогам предшественников инсулина, содержащим соединительный пептид (С-пептид), отщепляемый от А- и В-цепей, при этом указанный соединительный пептид содержит, по меньшей мере, один остаток ароматической аминокислоты и сайт расщепления, обеспечивающий расщепление пептидной связи между А-цепью и соединительным пептидом, где один остаток ароматической аминокислоты расположен непосредственно у N-конца указанного сайта расщепления.

В другом аспекте данное изобретение относится к предшественникам инсулина или аналогам предшественников инсулина, содержащим соединительный пептид (С-пептид), отщепляемый от А- и В-цепей, при этом указанный соединительный пептид содержит до 9 аминокислотных остатков, из которых, по меньшей мере, один является остатком ароматической аминокислоты.

В еще одном аспекте данное изобретение относится к предшественнику инсулина или аналогу предшественника инсулина, содержащему соединительный пептид (С-пептид), отщепляемый от А- и В-цепей, при этом указанный соединительный пептид содержит один остаток ароматической аминокислоты, который расположен на расстоянии менее 5 Å, по меньшей мере, от одного из остатков в положениях B11, B12 или В26 в В-цепи.

В следующем аспекте данное изобретение относится к предшественникам инсулина или аналогам предшественников инсулина, содержащим соединительный пептид (С-пептид), включающий в себя, по меньшей мере, один остаток ароматической аминокислоты и отщепляемый от А- и В-цепей. Указанные предшественники инсулина или аналоги предшественников инсулина обладают повышенной стабильностью с более высоким Cmid по сравнению с предшественником инсулина или аналогами предшественника инсулина, которые не содержат остатка ароматической аминокислоты в соединительном пептиде.

Повышенную активность определяют разными способами, известными специалисту в данной области и описанными ниже. В одном варианте повышенную стабильность измеряют определением посредством КД концентрации гидрохлорида гуанидина (GuHCl), необходимой для достижения половины от максимального разворачивания молекулы предшественника инсулина (Cmid).

В следующем аспекте данное изобретение относится к предшественникам инсулина или аналогам предшественников инсулина, содержащим последовательность формулы:

В (1-27)-X2-X3-X1-Y-A (1-21),

где

X1 представляет собой пептидную последовательность из 1-15 аминокислотных остатков, содержащую один остаток ароматической аминокислоты непосредственно у N-конца Y,

Х2 представляет собой одну из аминокислот Pro, Asp, Lys или Ile в положении 28 В-цепи,

Х3 представляет собой одну из аминокислот Pro, Lys, Ala, Arg или Pro-Thr в положении 29 В-цепи, и

Y является Lys или Arg.

В одном варианте общее количество аминокислотных остатков в X1 будет составлять 1-10, 1-9, 1-8, 1-7, 1-6, 1-5 или 1-4 аминокислотных остатка в длину. В другом конкретном варианте X1 означает 1-3 аминокислотных остатка и предпочтительно 1-2 аминокислотных остатка. Аминокислотным остатком в X1 может быть любой кодируемый аминокислотный остаток, и они могут быть одинаковыми или разными, только при условии, что один является остатком ароматической аминокислоты, расположенным непосредственно у N-конца Y.

В следующем аспекте данное изобретение относится к предшественникам инсулина или аналогам предшественников инсулина, содержащим последовательность формулы:

B(1-27)-X2-X3-X1 -Y-A(1-21),

где

X1 представляет собой пептидную последовательность из 1-15 аминокислотных остатков, один из которых является остатком ароматической аминокислоты, который расположен на расстоянии менее 5 Å, по меньшей мере, от одного из аминокислотных остатков в положении В11, В12 или В26 в В-цепи,

Х2 представляет собой одну из аминокислот Pro, Asp, Lys или Ile в положении 28 В-цепи,

Х3 представляет собой одну из аминокислот Pro, Lys, Ala, Arg или Pro-Thr в положении 29 В-цепи, и Y является Lys или Arg.

В одном варианте количество аминокислотных остатков в Xi составляет 1-9, 1-5 или 1-4. В другом варианте количество аминокислотных остатков составляет 1-3 или 1-2.

В другом аспекте данное изобретение относится к предшественникам инсулина или аналогам предшественников инсулина, содержащим последовательность формулы:

B(1-27)-X2-X3-X1 -Y-A(1-21),

где

X1 представляет собой пептидную последовательность из 1-8 аминокислотных остатков, по меньшей мере, один из которых является остатком ароматической аминокислоты,

Х2 представляет собой одну из аминокислот Pro, Asp, Lys или Ile в положении 28 В-цепи,

Х3 представляет собой одну из аминокислот Pro, Lys, Ala, Arg или Pro-Thr в положении 29 В-цепи, и

Y является Lys или Arg.

Общее количество аминокислотных остатков в X1 будет составлять 1-7, 1-6, 1-5 или 1-4 аминокислотных остатка. В более конкретном варианте X1 означает 1-3 аминокислотных остатка и предпочтительно 1-2 аминокислотных остатка. Аминокислотным остатком в X1 может быть любой кодируемый аминокислотный остаток, и они могут быть одинаковыми или разными, только при условии, что, по меньшей мере, один аминокислотный остаток в X1 является остатком ароматической аминокислоты.

В указанной выше формуле X1 может содержать до 5 остатков ароматических аминокислот, которые могут быть одинаковыми или разными. В конкретном варианте X1 содержит до 3 остатков ароматических аминокислот, которые могут быть одинаковыми или разными, X1 предпочтительно будет содержать только один остаток ароматической аминокислоты. Остатки ароматических аминокислот представляют собой Trp, Phe или Tyr, предпочтительно Phe или Trp.

В одном варианте Х2 означает Asp, а Х3 означает Lys. Указанный вариант охватывает аналоги предшественников инсулина, содержащие Asp в положении В28 В-цепи (называемые в дальнейшем «AspB28IP»). В другом варианте X2 означает Lys, а Х3 означает Pro. В следующем варианте последовательность X1-Y выбрана из группы: (a) Met-Trp-Lys; (b) Ala-Trp-Lys; (с) Val-Trp-Lys; (d) Ile-Trp-Lys; (e) Leu-Trp-Lys; (f) Glu-Glu-Phe-Lys (SEQ ID NO:15); (g) Glu-Phe-Lys; (h) Glu-Trp-Lys; (i) Ser-Trp-Lys; (j) Thr-Trp-Lys; (k) Arg-Trp-Lys; (1) Glu-Met-Trp-Lys (SEQ ID NO:1); (m) GIn-Met-Trp-Lys (SEQ ID NO:2) и (n) Asp-Trp-Lys.

В другом варианте Х2 означает Pro, а Х3 означает Lys, и X1 означает 1-2 аминокислотных остатка, один из которых является Trp или Phe.

В другом варианте X2 означает Lys, Х3 означает Pro-Thr, и X1 имеет в своем составе до 15 аминокислотных остатков, один из которых является Thr, Туг или Phe. В указанном варианте X1 будет содержать сайт расщепления на С-конце, например, сайт расщепления из одной или двух основных аминокислот (Lys, Arg).

Данное изобретение также относится к полинуклеотидным последовательностям, которые кодируют заявленные предшественники инсулина или аналоги предшественников инсулина. В следующем аспекте данное изобретение относится к векторам, содержащим такие полинуклеотидные последовательности, и к клеткам-хозяевам, содержащим такие полинуклеотидные последовательности или векторы.

В другом аспекте изобретение относится к способу получения предшественников инсулина или аналогов предшественников инсулина в клетке-хозяине, при этом указанный способ включает в себя (i) культивирование клетки-хозяина, содержащей полинуклеотидную последовательность, кодирующую предшественники инсулина или аналоги предшественников инсулина согласно изобретению, в условиях, подходящих для экспрессии указанного предшественника или аналога предшественника; и (ii) выделение предшественника или аналога предшественника из культуральной среды.

В еще одном аспекте изобретение относится к способу получения инсулина или аналогов инсулина в клетке-хозяине, при этом указанный способ включает в себя (i) культивирование клетки-хозяина, содержащей полинуклеотидную последовательность, кодирующую предшественник инсулина или аналоги предшественника инсулина согласно изобретению; (ii) выделение предшественника или аналога предшественника из культуральной среды и (iii) превращение предшественника или аналога предшественника в инсулин или аналог инсулина путем ферментативного превращения in vitro.

В одном варианте данного изобретения клетка-хозяин представляет собой дрожжевую клетку-хозяина, а в следующем варианте дрожжевая клетка-хозяин выбирается из клеток рода Saccharomyces. В следующем варианте дрожжевая клетка-хозяин выбирается из клеток вида Saccharomyces cerevisiae.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ РИСУНКОВ

На фиг.1 представлена экспрессирующая плазмида рАК721 S. cerevisiae, которая экспрессирует слитый белок лидер LA19-ЕЕАЕАЕАЕРК (SEQ ID NO:3)-IP(AlaAlaLys).

На фиг.2 представлена последовательность ДНК и рассчитанная аминокислотная последовательность кодируемого слитого белка (лидер предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 -фактора-ЕЕАЕАЕАРК (SEQ ID NO:4)-AspB28IP части плазмиды рАК1150, используемой в качестве матрицы в ПЦР (SEQ ID NO:5 и 6).

На фиг.3 представлена последовательность ДНК, кодирующая слитый белок лидер предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 -фактора-AspB28IP(GluTrpLys) с синтетическим мини-С-пептидом GluTrpLys, полученным путем рандомизированной оптимизации (SEQ ID NO:7 и 8). Мини-С-пептид (EWK) указан подчеркиванием.

На фиг.4 показана стабильность укладки аналога инсулина Asp B28IP(MetTrpLys) по сравнению с AspB28IP.

На фиг.5 показаны структуры AspB28IP(MetTrpLys) в растворе в виде линий основных цепей набора из 20 конвергентных структур.

На фиг.6 показано представление AspB28 IP(MetTrpLys) в виде ленты. Фигура получена с использованием MOLSCRIPT (Kraulis (1991) J. Appl. Crystallog. 24: 946-950). Аннотация к остаткам аминокислот дана следующим образом: В1-В29 (В-цепь) пронумерованы 1-29, остатки С1-С3 (соединительный пептид) пронумерованы 30-32 и остатки А1-А21 (А-цепь) пронумерованы 33-53.

Фиг.7 представляет собой идентификационный спектр ЯМР протонов для AspB28IP(MetTrpLys), записанный при 27°С при концентрации 1,0 мМ в 10%/90% D2O/H2 O с 10 мМ фосфатным буфером при рН 8,0.

На фиг.8 представлена ДНК и рассчитанная последовательность аминокислот экспрессирующей кассеты, которая экспрессирует слитый белок YAP3-TA39-EEGEPK (SEQ ID NO:11)-AspB28IP с синтетическим мини-С-пептидом GluTrpLys (SEQ ID NO:9 и 10) и

На фиг.9 представлена ДНК и рассчитанная аминокислотная последовательность экспрессирующей кассеты, которая экспрессирует слитый белок YAP3-TA57-EEGEPK (SEQ ID NO:17)-AspB28IP с синтетическим мини-С-пептидом GluTrpLys (SEQ ID NO:11 и 12).

На фиг.10 представлена кривая расщепления предшественника инсулина Aspart - протеазой Achromobacter Cyticus.

ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ

Сокращения и номенклатура

Под «соединительным пептидом» или «С-пептидом» подразумевается соединительный фрагмент «С» полипептидной последовательности В-С-А одноцепочечной молекулы, подобной препроинсулину. В частности, в природной цепи инсулина С-пептид связывает положение 30 В-цепи и положение 1 А-цепи. «Мини-С-пептид» или «соединительный пептид», такой как описанные здесь пептиды, связывает В29 или В30 с А1 и отличается по последовательности и длине от природного С-пептида.

Под «IP» подразумевается одноцепочечный предшественник инсулина, в котором dеsВ30-цепь связана с А-цепью инсулина посредством соединительного пептида. Одноцепочечный предшественник инсулина будет содержать правильно расположенные дисульфидные мостики (три), как в инсулине человека.

Термины «dеsВ30» или «В(1-29)» означают В-цепь природного инсулина, в которой отсутствует остаток аминокислоты В30, «А(1-21)» означает А-цепь природного инсулина, «В(1-27)» означает природную В-цепь, в которой отсутствуют аминокислотные остатки В28, В29 и В30; «AspB28IP» означает одноцепочечный предшественник инсулина с аспарагиновой кислотой в положении 28 В-цепи и без С-пептида) (В29 связан с A1). Мини-С-пептид и его аминокислотная последовательность указаны трехбуквенным кодом аминокислот в круглых скобках после IP; таким образом, «Asp B28IP(MetTrpLys)» означает одноцепочечный предшественник инсулина с аспарагиновой кислотой в положении 28 В-цепи и мини-С-пептидом с последовательностью Met-Trp-Lys, связывающим В29 с A1.

Термин «предшественник инсулина» означает одноцепочечный полипептид, который в результате одного или нескольких последовательных химических и/или ферментативных процессов можно превратить в инсулин человека.

Термин «аналог предшественника инсулина» означает молекулу предшественника инсулина, имеющую одну или несколько мутаций, замен, делеций и/или присоединений в А- и/или В-аминокислотных цепях, по сравнению с молекулой инсулина человека. Предпочтительны такие аналоги инсулина, в которых один или несколько аминокислотных остатков природного происхождения, предпочтительно один, два или три остатка, были заменены другим кодируемым аминокислотным остатком. В одном варианте данное изобретение включает в себя молекулы аналогов, в которых положение 28 В-цепи изменено по сравнению с природной молекулой инсулина человека. В указанном варианте положение 28 изменено с природного остатка Pro на один из остатков Asp, Lys или Ile. В предпочтительном варианте природный остаток Pro в положении В28 изменен на остаток Asp. В другом варианте Lys в положении В29 заменен на Pro; Asn в положении А21 также может быть изменен на Ala, Gin, Glu, Gly, His, Ile, Leu, Met, Ser, Thr, Trp, Tyr или Val, в частности на Gly, Ala, Ser или Thr и предпочтительно на Gly. Кроме того, Asn в положении В3 может быть изменен на Lys. Следующими примерами аналогов предшественников инсулина являются инсулин человека des(B30), аналоги инсулина, в которых был делегирован PheB1; аналоги инсулина, в которых А-цепь и/или В-цепь имеют N-концевое удлинение, и аналоги инсулина, в которых А-цепь и/или В-цепь имеют удлинение С-конца. Таким образом, к положению В1 могут быть добавлены один или два Arg.

Термин «непосредственно у N-конца» предназначен для иллюстрации ситуации, когда аминокислотный остаток или пептидная последовательность непосредственно связана своим С-концом с N-концом другого аминокислотного остатка или аминокислотной последовательности посредством пептидной связи.

В данном контексте термин «функциональный аналог инсулина» и тому подобное, предназначен для обозначения полипептида со сходным биологическим действием, как и у нативного белка инсулина человека.

Выражение расстояние «короче 5 Å» между двумя аминокислотными остатками означает самое короткое межатомное расстояние менее 5 Å между любым атомом в первой аминокислоте и любым атомом во второй аминокислоте. Атомные расстояния измеряют из трехмерной структуры молекулы, определенной либо посредством ЯМР (Wüthrich, К., 1986, NMR of Proteins and Nucleic Acids, Wiley, New York), либо способом рентгеновской кристаллографии (Drenth, J., 1994, Principles of Protein X-ray crystallography. Springer Verlag Berlin). Расстояние от одной аминокислоты до другой измеряют в виде самого короткого межатомного расстояния между любым атомом в первой аминокислоте и любым атомом во второй аминокислоте, если не оговорено особо.

Особенностью данного изобретения являются новые мини-С-пептиды, связывающие положение 29 В-цепи инсулина и положение 1 А-цепи инсулина, которые существенно увеличивали выход продукции в дрожжевой клетке-хозяине. Под термином «существенно увеличенная продукция», «увеличенный выход ферментации» и тому подобным понимают увеличение секретируемого количества молекулы предшественника инсулина или молекулы аналога предшественника инсулина в надосадке культуры по сравнению с выходом предшественника инсулина или аналога предшественника инсулина, не содержащего остатка ароматической аминокислоты в мини-С-пептиде. «Повышенный» выход ферментации представляет собой абсолютное количество, большее чем в контроле; предпочтительно увеличение представляет собой повышение на 50% или больше, чем уровень (AspB28 IP) в контроле; еще более предпочтительно увеличение представляет собой превышение на 100% или более по сравнению с контрольными уровнями.

Под термином «повышение стабильности» понимают, например, увеличенное значение Cmid в растворе по сравнению со значением, полученным для предшественника аналога инсулина (например. AspB28IP), не содержащего остатка ароматической аминокислоты в мини-С-пептиде. Под термином «Cmid» понимают концентрацию GuHCl, необходимую для развертывания половины популяции белков при анализе, в котором измеряется круговой дихроизм молекулы инсулина в дальнем УФ как функция возрастающих концентраций денатурирующего агента.

«РОТ» означает ген триозофосфатизомеразы Schizosaccharomyces pombe, а «TPI1» означает ген триозофосфатизомеразы S. cerevisiae.

Под «лидером» понимают аминокислотную последовательность, состоящую из препептида (сигнального пептида) и пропептида.

Подразумевается, что термин «сигнальный пептид» означает препептид, который присутствует в виде N-концевой последовательности в форме предшественника белка. Функция сигнального пептида состоит в том, чтобы обеспечить возможность для облегчения транслокации гетерологичного белка в эндоплазматический ретикулум. Сигнальный пептид обычно отщепляется в ходе этого процесса. Сигнальный пептид может быть гетерологичным или гомологичным по отношению к организму дрожжей, продуцирующему белок. Ряд сигнальных пептидов, которые можно использовать с конструкцией ДНК согласно изобретению, включает сигнальный пептид аспарагиновой протеазы 3 дрожжей (YАР3) или любой функциональный аналог (Egel-Mitani et al. (1990) YEAST 6: 127-137 и патент США 5726038) и сигнал предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 -фактора гена MFпредшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 1 (Thorner (1981) in The Molecular Biology of the Yeast Saccharomyces cerevisiae, Strathern et al., eds., p.143-180, Cold Spring Harbor Laboratory, NY и патент США 487000.

Термин «пропептид» означает полипептидную последовательность, функция которой состоит в обеспечении того, чтобы экспрессированный полипептид был направлен из эндоплазматического ретикулума в аппарат Гольджи и далее в секретируемую везикулу для секреции в культуральную среду (т.е. экспорта полипептида через клеточную стенку или, по меньшей мере, через клеточную мембрану в периплазматическое пространство дрожжевой клетки). Пропептидом может быть пропептид предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 -фактора дрожжей, смотри патенты США 4546082 и 4870008. Альтернативно, пропептидом может быть синтетический пропептид, что говорит о том, что пропептид не встречается в природе. Подходящими синтетическими пропептидами являются пропептиды, заявленные в патентах США 5395922; 5795746; 5162498 и заявке WO 98/32867. Пропептид предпочтительно будет содержать сайт процессинга эндопептидазой на С-конце, такой как последовательность Lys-Arg или любой его функциональный аналог.

Полинуклеотидную последовательность согласно изобретению можно получить синтетически стандартными принятыми способами, например, фосфоамидитным способом, описанным Beaucage et al. (1981) Tetrahedron Letters 22: 1859-1869, или способом, описанным Matthes et al. (1984) EMBO Journal 3: 801-805.

Согласно фосфоамидитному способу олигонуклеотиды синтезируют, например, в автоматическом синтезаторе ДНК, очищают, образуют дуплексы и лигируют, чтобы образовать синтетическую конструкцию ДНК. Предпочтительным в настоящее время способом получения ДНК-конструкции является полимеразная цепная реакция (ПЦР).

Полинуклеотидная последовательность согласно изобретению также может происходить из смешанной геномной, кДНК или синтетической ДНК. Например, последовательность геномной или кДНК, кодирующую лидерный пептид, можно соединить с последовательностью геномной ДНК или кДНК, кодирующей А- и В-цепи, после чего последовательность ДНК можно модифицировать в сайте встраиванием синтетических олигонуклеотидов, кодирующих желаемую аминокислотную последовательность для гомологичной рекомбинации, в соответствии с хорошо известными способами, или предпочтительно созданием желаемой последовательности с помощью ПЦР, используя подходящие олигонуклеотиды.

Изобретение включает в себя вектор, который способен к репликации в выбранном микроорганизме или клетке-хозяине и который несет полинуклеотидную последовательность, кодирующую предшественники инсулина или аналоги предшественников инсулина согласно изобретению. Рекомбинантный вектор может быть автономно реплицируюшимся вектором, т.е. вектором, который существует как внехромосомная единица, репликация которой не зависит от репликации хромосом, например, плазмидой, в не хромосомным элементом, минихромосомой или искусственной хромосомой. Вектор может содержать любые средства для обеспечения автономной репликации. В альтернативном случае вектором может быть вектор, который при введении в клетку-хозяина интегрируется в геном и реплицируется вместе с хромосомой(ами), в которую он был интегрирован. Кроме того, можно использовать отдельный вектор или плазмиду, или два или несколько векторов или плазмид, которые вместе содержат полную ДНК, которую необходимо ввести в геном клетки-хозяина, или транспозон. Векторы могут быть линейными или замкнутыми кольцевыми плазмидами, и предпочтительно будут содержать элемент(ты), который делает возможной стабильную интеграцию вектора в геном клетки-хозяина или автономную репликацию вектора в клетке независимо от генома.

В предпочтительном варианте рекомбинантный экспрессирующий вектор способен реплицироваться в организме дрожжей. Примерами последовательностей, которые дают возможность вектору реплицироваться в дрожжах, являются гены репликации 2 мкм-плазмиды дрожжей REP 1-3 и начало репликации.

Векторы согласно данному изобретению предпочтительно содержат один или несколько селектируемых маркеров, которые обеспечивают простую селекцию трансформированных клеток. Селектируемый маркер представляет собой ген, продукт которого обеспечивает биоцидную или вирусную резистентность, резистентность к тяжелым металлам, прототрофность ауксотрофам и тому подобное. Примерами бактериальных селектируемых маркеров являются гены dal Bacillus subtilis или Bacillus licheniformis, или маркеры, которые придают устойчивость к антибиотикам, такую как устойчивость к ампициллину, канамицину, хлорамфениколу или тетрациклину. Селектируемые маркеры для применения в клетке-хозяине нитчатых грибов включают amdS (ацетамидаза), argB (орнитинкарбамоилтрансфераза), pyrG (оротидин-5'-фосфатдекарбоксилаза) и trpC (антранилатсинтаза). Подходящими маркерами для дрожжевых клеток-хозяев являются ADE2, HIS3, LEU2, LYS2, МЕТ3, TRP1 и URA3. Предпочтительным селектируемым маркером для дрожжей является ген TPI Schizosaccharomyces pombe (Russell (1985) Gene 40: 125-130).

В векторе полинуклеотидная последовательность оперативно связана с подходящей последовательностью промотора. Промотор может быть любой последовательностью нуклеиновой кислоты, которая проявляет транскрипционную активность в клетке-хозяине, выбранной из мутантных, укороченных или гибридных промоторов, и может быть получен из генов, кодирующих внеклеточные или внутриклеточные полипептиды либо гомологичные, либо гетерологичные по отношению к клетке-хозяину.

Примерами подходящих промоторов для управления транскрипцией в бактериальной клетке-хозяине являются промоторы, полученные из lac-оперона Е coli, гена агаразы Streptomyces coelicolor (dagA), гена левансахаразы Bacillus subtilis (sacB), гена альфа-амилазы Bacillus licheniformis (amyL), гена мальтогенной амилазы Bacillus stearothermophilus (amyM), гена альфа-амилазы Bacillus amyloliquefaciens (amyQ) и гена пенициллиназы Bacillus licheniformis (penP). Примерами подходящих промоторов для управления транскрипцией в клетке-хозяине нитчатых грибов являются промоторы, полученные из генов амилазы Aspergillus oryzae ТАКА, аспарагиновой протеиназы Rhizomucor miehei, нейтральной альфа-амилазы Aspergillus niger и устойчивой к кислотам альфа-амилазы Aspergillus niger. В дрожжевой клетке-хозяине пригодными промоторами являются промоторы Mal, TPI, ADH или PGK Saccharomyces cerevisiae.

Полинуклеотидная конструкция согласно изобретению также, как правило, будет оперативно связана с подходящим терминатором. У дрожжей подходящим терминатором является терминатор TPI (Alber et al. (1982) J. Mol. Appl. Genet. 1: 419-434).

Способы, используемые для того, чтобы лигировать соответственно полинуклеотидную последовательность согласно изобретению, промотор и терминатор, и чтобы встроить их в подходящие дрожжевые векторы, содержащие информацию, необходимую для репликации у дрожжей, хорошо известны специалистам в данной области. Будет понятно, что вектор можно сконструировать либо путем получения сначала конструкции ДНК, содержащей полную последовательность ДНК, кодирующую предшественники инсулина или аналоги предшественников инсулина согласно изобретению, и затем встраиванием этого фрагмента в подходящий экспрессирующий вектор, или посредством последовательного встраивания фрагментов ДНК, содержащих генетическую информацию для отдельных элементов (таких как сигнал, пропептид, мини-С-пептид, А- и В-цепи) с последующим лигированием.

Данное изобретение также относится к рекомбинантным клеткам-хозяевам, содержащим полинуклеотидную последовательность, кодирующую предшественники инсулина или аналоги предшественников инсулина согласно изобретению. Вектор, содержащий такую полинуклеотидную последовательность, вводят в клетку-хозяина, так что вектор сохраняется в виде хромосомного компонента или в виде автономно реплицирующегося внехромосомного вектора, как описано ранее. Термин «клетка-хозяин» охватывает любое потомство родительской клетки, которое не идентично родительской клетке вследствие мутаций, которые происходят во время репликации. Выбор клетки-хозяина будет в большой степени зависеть от гена, кодирующего полипептид, и его источника. Клеткой-хозяином может быть одноклеточный микроорганизм, например, прокариот, или не одноклеточный микроорганизм, например, эукариот. Пригодными клетками одноклеточных являются бактериальные клетки, такие как грамположительные бактерии, включая, но не ограничивая указанным, клетку Bacillus, клетку Streptomyces, или грамотрицательные бактерии, такие как Е. coli и Pseudomonas sp. Эукариотические клетки могут быть клетками млекопитающих, насекомых, растений или грибов. В предпочтительном варианте клеткой-хозяином является дрожжевая клетка. Дрожжевым организмом, используемым в способе согласно изобретению, может быть любой подходящий организм дрожжей, который при культивировании продуцирует большие количества предшественника инсулина и аналогов предшественников инсулина согласно изобретению. Примерами подходящих организмов дрожжей являются штаммы, выбранные из видов дрожжей Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces kluyveri, Schizosaccharomyces pombe, Saccharomyces uvarum, Kluyveromyces lactis, Hansenula polymorpha, Pichia pastoris, Pichia methanolica, Pichia kluyveri, Yarrowia lipolytica, Candida sp., Candida utilis, Candida cacaoi, Geotrichum sp. и Geotrichum fermentans.

Трансформацию дрожжевых клеток можно, например, осуществить путем образования протопластов с последующей трансформацией по существу известным способом. Средой, используемой для культивирования клеток, может быть любая обычная среда, подходящая для роста организмов дрожжей. Секретированный предшественник инсулина или аналоги предшественника инсулина согласно изобретению, значительная часть которых будет присутствовать в среде в правильно процессированной форме, можно извлечь из среды традиционными способами, включая отделение дрожжевых клеток от среды центрифугированием, фильтрацией или улавливанием предшественника инсулина или аналога предшественника инсулина с помощью ионообменного матрикса или адсорбирующего матрикса обращенной фазы, осаждением белковых компонентов надосадка или фильтрата с помощью соли, например сульфата аммония, с последующей очисткой разными хроматографическими способами, например ионообменной хроматографией, аффинной хроматографией и тому подобного.

Предшественники инсулина или аналоги предшественников инсулина согласно изобретению могут быть экспрессированы с удлиненным аминокислотными остатками N-концом, как описано в патенте США 5395922 и Европейском патенте 765395А, оба этих патента специально включены здесь в виде ссылки. Обнаружено, что во время ферментации удлинение стабильно связано с предшественником инсулина или аналогами предшественника инсулина согласно изобретению, защищая N-конец предшественника инсулина или аналога предшественника инсулина от протеолитической активности дрожжевых протеаз, таких как DPAP. Присутствие удлинения N-конца в предшественнике инсулина или аналоге предшественника инсулина также может служить в качестве защиты N-концевой аминогруппы в ходе химической обработки белка, т.е. может служить как заместитель ВОС (трет-бутилоксикарбонила) или сходной защитной группы. N-концевое удлинение можно удалить из выделенного предшественника инсулина или аналога предшественника инсулина с помощью протеолитического фермента, который специфичен в отношении основной аминокислоты (например, Lys), так что концевое удлинение отщепляется у остатка Lys. Примерами таких протеолитических ферментов являются трипсин или протеаза Achromobacter lyticus.

После секреции в культуральную среду и выделения предшественник инсулина или аналоги предшественника инсулина согласно изобретению будут подвергнуты различным процедурам in vitro, чтобы удалить возможную последовательность удлинения N-конца и мини-С-пептид, чтобы получить инсулин или желаемый аналог инсулина. Такие способы включают ферментативное превращение с помощью трипсина или протеазы Achromobacter lyticus в присутствии сложного эфира L-треонина с последующим превращением сложного треонинового эфира инсулина или аналога инсулина в инсулин или аналог инсулина посредством основного или кислотного гидролиза, как описано в спецификации патента США 4343898 или 4916212 или Research Disclosure, September 1994/487, сообщения которых включены здесь в виде ссылки.

Как описано ниже, конструировали предшественники инсулина или аналоги предшественников инсулина с синтетическими С-пептидами, содержащими, по меньшей мере, одну ароматическую аминокислоту (пример 1). Экспрессирующие плазмиды Saccharomyces cerevisiae, содержащие полинуклеотидную последовательность, кодирующую заявленные предшественники инсулина или аналоги предшественников инсулина конструировали с помощью ПЦР и использовали для трансформации клетки-хозяина S. cerevisiae. Количество экспрессированного продукта, например аналога инсулина, измеряли в виде процента от соответствующего контрольного уровня, например AspB28IP, в котором отсутствует мини-С-пептид (таблица 1) и AspB28IP(AlaAlaLys) с мини-С-пептидом без остатка ароматической аминокислоты (таблица 2). Новые С-пептиды согласно изобретению давали увеличенные выходы до уровней в 7 раз выше контрольного.

Данное изобретение далее подробно описано на следующих примерах, которые никоим образом не предназначены для того, чтобы ограничить рамки заявленного изобретения. Предполагается, что прилагаемые фигуры должны рассматриваться как неотъемлемые части спецификации и описания изобретения. Все цитированные ссылки специально включены здесь в виде ссылки в отношении всего, что в них описано.

ПРИМЕРЫ Общие процедуры

Все экспрессирующие плазмиды являются плазмидами С-РОТ-типа, сходными с плазмидами, описанными в ЕР 171142, характерной особенностью которых является содержание гена триозофосфатизомеразы (РОТ) Schizosaccharomyces pombe с целью селекции и стабилизации плазмид в S. cerevisiae. Плазмиды также содержат промотор и терминатор триозофосфатизомеразы S. cerevisiae. Указанные последовательности сходны с соответствующими последовательностями в плазмиде pKFN1003 (описанной в WO 90/100075), так же как и все последовательности, за исключением последовательности EcoRI-XbaI фрагмента, кодирующего слитый белок лидера и продукта предшественника инсулина. Чтобы экспрессировать разные слитые белки EcoRI-XbaI фрагмент плазмиды pKFN1003 просто заменяют EcoRI-XbaI фрагментом, кодирующим представляющее интерес слияние лидер-предшественник инсулина. Такие EcoRI-XbaI фрагменты можно синтезировать, используя синтетические олигонуклеотиды и ПЦР, стандартными способами.

Трансформанты дрожжей получали путем трансформации штамма-хозяина S. cerevisiae, штамма МТ663 (MATalMATпредшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 рер4-3/рер4-3 HIS4/his4 tpi::LEU2/tpi::LEU2 Cir+ ). Штамм дрожжей МТ663 депонирован в Немецкой коллекции микроорганизмов и культур клеток (Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen) в связи с подачей заявки на патент WO 92/11378, и получил номер депозита DSM 6278.

МТ663 выращивали на YPGaL (1% дрожжевой бактоэкстракт, 2% бактопептон, 2% галактоза, 1% лактат) до OD при 600 нм, равной 0,6. 100 мл культуры собирали центрифугированием, промывали 10 мл воды, повторно центрифугировали и ресуспендировали в 10 мл раствора, содержащего 1,2 М сорбит, 25 мМ Na2 EDTA, pH 8,0 и 6,7 мг/мл дитиотреитола. Суспензию инкубировали при 30°С в течение 15 минут, центрифугировали и клетки ресуспендировали в 10 мл раствора, содержащего 1,2 М сорбит, 10 мМ Na2 EDTA, 0,1 М цитрат натрия, pH 5,8, и 2 мг Novozym®234. Суспензию инкубировали при 30°С в течение 30 минут, клетки собирали центрифугированием, промывали в 10 мл 1,2 М сорбита и 10 мл CAS (1,2 М сорбит, 10 мМ CaCl2, 10 мМ Трис-HCl (Трис = Трис(гидроксиметил)аминометан) pH 7,5) и ресуспендировали в 2 мл CAS. Для трансформации 1 мл клеток, суспендированных в CAS, смешивали примерно с 0,1 мг плазмидной ДНК и оставляли при комнатной температуре в течение 15 мин. Добавляли 1 мл раствора (20% полиэтиленгликоль 4000, 10 мМ CaCl2, 10 мМ Трис-HCl, рН 7,5) и смесь оставляли еще на 30 минут при комнатной температуре. Смесь центрифугировали, осадок ресуспендировали в 0,1 мл SOS (1,2 М сорбит, 33% об./об. YPD, 6,7 мМ CaCl2) и инкубировали при 30°С в течение 2 часов. Затем суспензию центрифугировали и осадок ресуспендировали в 0,5 мл 1,2 М сорбита. Затем добавляли 6 мл верхнего агара (среда SC Sherman et al. (1982) Methods in Yeast Genetics, Cold Spring Harbor Laboratory, содержащая 1,2 М сорбита плюс 2,5% агара) при 52°С и суспензию наливали сверху чашек, содержащих такую же агаризованную среду, содержащую сорбит.

Штамм МТ663 S. cerevisiae, трансформированный экспрессирующими плазмидами, выращивали в YPD в течение 72 час при 30°С. Количественный анализ выхода предшественника инсулина в надосадках культур осуществляли анализом обращенно-фазовой ВЭЖХ, используя в качестве внешнего стандарта инсулин человека (Snel and Damgaard (1988) Proinsulin heterogenity in pigs. Horm. Metabol. Res. 20: 476-488).

Пример 1

Конструирование синтетических С-пептидов с ароматической аминокислотой(ами)

Синтетические гены, кодирующие слитые белки, состоящие из Asp8B8IP, связанного с лидерной последовательностью, состоящей из препептида (сигнального пептида) и пропептида, конструировали, используя ПЦР в стандартных условиях (Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning, Cold Spring Harbor Laboratory Press) и полимеразу E.H.F. (Boehringer Mannheim GmbH, Sandhoefer Strasse 116, Mannheim, Germany). Полученные в результате фрагменты ДНК выделяли и расщепляли эндонуклеазами, очищали, используя набор для очистки генов (Bio101 Inc., La Jolla, CA, USA). Для лигирования ДНК использовали стандартные способы, трансформацию клеток Е. coli осуществляли CaCl2-способом (Sambrook et al. (1989), выше). Плазмиды очищали из трансформированных клеток, используя колонки QIAGEN (QIAGEN, Hilden, Germany). Определяли нуклеотидные последовательности, используя систему секвенирования ДНК ALF Pharmacia Biotech с очищенной двунитевой плазмидной ДНК в качестве матрицы. Олигонуклеотидные праймеры для ПЦР получали из DNA technology (Arhus, Denmark).

Экспрессию секретируемого AspB28IP в S. cerevisiae осуществляли, используя штамм МТ663 S. cerevisiae и экспрессирующий дрожжевой вектор СРОТ на основе 2 мкм-плазмиды (смотри фиг.1), как описано в Thim, L. et al. (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83: 6766-6770. Экспрессирующий дрожжевой вектор содержит ген триозофосфатизомеразы (РОТ) Schizosaccharomyces pombe для селекции и стабилизации плазмиды в S. cerevisiae. Кроме того, используют промотор и терминатор гена триозофосфатизомеразы (ТРИ) S. cerevisiae для инициации и терминации транскрипции рекомбинантного гена, кодирующего слитый белок лидер-AspB28IP. Секрецию AspB28IP обеспечивали лидером предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 -фактора, хотя можно использовать множество известных дрожжевых лидерных последовательностей.

Как показано на фиг.1, экспрессирующая плазмида рАК721 S. cerevisiae, которая экспрессирует слитый белок лидер LA19-ЕЕАЕАЕАЕРК (SEQ ID NO:3)-1Р, конструировали на основе челночной плазмиды РОТ S. cerevisiae - E. coli(патент США 5871957). На фиг 1. L-IP обозначает кассету, экспрессирующую слитый белок, кодирующую слитый белок лидер-IP; TPI-ПРОМОТОР означает промотор TPI1 S. cerevisiae, а TPI-ТЕРМИНАТОР означает терминатор TPI1 S. cerevisiae; TPI-POMBE обозначает ген РОТ S. pombe, используемый для селекции в S. cerevisiae; НАЧАЛО РЕПЛИКАЦИИ обозначает начало репликации S. cerevisiae, полученное из 2 мкм-плазмиды; AMP-R обозначает ген (S-лактамазы, придающий устойчивость к ампициллину, облегчающий селекцию в Е coli, и НАЧАЛО РЕПЛИКАЦИИ-PBR322 обозначает начало репликации Е. coli.

ДНК, кодирующую ряд слитых белков лидерных последовательностей и AspB28IP с различными мини-С-пептидами, создавали посредством ПЦР, используя в качестве праймеров соответствующие олигонуклеотиды, которые описаны ниже. Использовали стандартные способы для того, чтобы субклонировать фрагменты ДНК, кодирующие слитые белки лидер-Asp828 IP, в экспрессирующем векторе СРОТ в следующем составе: лидер-Lys-Arg-спейсер-Asp B28IP, где Lys-Arg является потенциальным диосновным сайтом процессинга эндопротеазой и спейсер является N-концевым удлинением. Чтобы оптимизировать процессинг слитого белка эндопротеазой Кех2 S. cerevisiae, ДНК, кодирующую спейсерный пептид (N-концевое удлинение), например, ЕЕАЕАЕАРК (SEQ ID NO: 4), встраивали между ДНК, кодирующими лидер и AspB28IP (Kjeldsen et al. (1996) Gene 170, 107-112.). Однако наличие спейсерного пептида не обязательно. Зрелый AspB28IP секретировался в виде одноцепочечного предшественника инсулина с удлиненным N-концом и мини-С-пептидом, связывающим LysB29 и GlyA1 . После очистки AspB28IP и протеолитического удаления удлинения N-конца и мини-С-пептида к LysB29 можно добавить аминокислоту Thr830 с помощью опосредованной ферментом транспептидации, чтобы получить Asp828-инсулин человека (Markussen, et al. (1987) in «Peptides 1986» (Theodoropoulos, D., Ed.), p.189-194, Walter de Gruyter and Co., Berlin.).

Разработку синтетических мини-С-пептидов осуществляли рандомизацией одного или нескольких кодонов, кодирующих аминокислоты в мини-С-пептиде. Характерной особенностью всех синтетических мини-С-пептидов является сайт ферментативного процессинга (Lys) на С-конце, который позволяет осуществлять ферментативное удаление синтетического мини-С-пептида (патент США 4916212, специально включенный здесь в виде ссылки). Рандомизацию выполняли, используя олигонуклеотиды с изменяемой структурой, которые вводили изменения кодона(нов) в одном или нескольких положениях синтетических мини-С-пептидов. Обычно изменяли структуру одного из двух праймеров (олигонуклеотидов), используемых для ПЦР. Примером пары олигонуклеотидов, используемой для создания методом ПЦР лидер-AspB28IP со случайными синтетическими мини-С-пептидами, применяемой для создаваемых синтетических мини-С-пептидов общей формулы: Xaa-Trp-Lys (XWK), являются следующие олигонуклеотиды:

Праймер А: 5'-ТАААТСТАТААСТАСААААААСАСАТА-3' (SEQ ID NO:13) и

Праймер В: 3'-CCAAAGAAGATGTGACTGTTCNNMACCTTCCCATAGCAACTT GTTACAACATGAAGATAGACAAGAAACATGGTTAACCTTTTGATGACATTGATCAGATCTTT GA-TTC-5' (SEQ ID NO:14), где N означает А, С, G или Т, а М означает С или А.

Полимеразная цепная реакция. ПЦР обычно выполняли, как указано ниже: 5 мкл праймера А (20 пмоль), 5 мкл праймера В (20 пмоль), 10 мкл 10 × буфера для ПЦР, 8 мкл смеси дНТФ, 0,75 мкл фермента E.H.F., 1 мкл плазмиды рАК1150 в качестве матрицы (примерно 0,2 мкг ДНК) и 70,25 мкл дистиллированной воды.

Обычно выполняли от 10 до 15 циклов, один цикл обычно представлял собой 94°С в течение 45 сек.; 55°С в течение 1 мин; 72°С в течение 1,5 мин. Затем смесь ПЦР наносили на 2% агарозный гель и выполняли электрофорез, используя стандартные способы. Полученный в результате фрагмент ДНК вырезали из агарозного геля и выделяли с помощью набора для очистки генов.

На фиг.2 показана последовательность ДНК рАК1150, используемая в качестве матрицы для ПЦР, и рассчитанные аминокислоты кодируемого слитого белка (предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 -фактор-лидер-ЕЕАЕАЕАРК (SEQ ID NO:4)-AspB28 IP плазмиды рАК1150 (SEQ ID NO:5 и 6). Плазмида рАК1150 сходна с рАК721, показанной на фиг.1. С-конец лидера предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 -фактора модифицировали для того, чтобы ввести сайт рестрикции эндонуклеазой Nco I, который изменяет рассчитанные аминокислотные последовательности с SerLeuAsp на SerMetAla. Кроме того, кодируемый AspB28IP не содержит мини-С-пептида, a Lys непосредственно связан с GlyA1.

Очищенный ПЦР-фрагмент ДНК растворяли в воде и буфере для эндонуклеаз рестрикции и расщепляли подходящими рестрикционными эндонуклеазами (например, Bgl II и Xba I) стандартными способами. BglII-Xbal-фрагменты ДНК подвергали электрофорезу в агарозном геле и очищали, используя набор для очистки генов.

Экспрессирующую плазмиду рАК1150 или сходную плазмиду СРОТ-типа. (смотри фиг.1) расщепляли эндонуклеазами рестрикции Bgl II и Xba I и выделяли фрагмент вектора длиной 10765 пар нуклеотидных оснований, используя набор для очистки генов.

Два расщепленных и выделенных фрагмента ДНК (фрагмент вектора и ПЦР-фрагмент) лигировали вместе, используя ДНК-лигазу Т4 и стандартные условия. Затем лигированной смесью трансформировали компетентный штамм Е. coli (R-, М+), после чего проводили селекцию на устойчивость к ампициллину. Плазмиды из полученных в результате клеток Е. coli выделяли с использованием колонок QIAGEN.

Затем плазмиды использовали для трансформации подходящего штамма-хозяина S. cerevisiae, например, МТ663 (MATalMATпредшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 рер4-3/рер4-3 HIS4/his4 tpi::LEU2/tpi::LEU2 Cir+ ). Отдельные трансформированные клоны S. cerevisiae выращивали в жидкой культуре и определяли количество AspB28IP, секретированного в надосадки культуры, с помощью ОФ-ВЭЖХ. Затем определяли последовательность ДНК, кодирующую синтетический мини-С-пептид экспрессирующих плазмид клонов S. cerevisiae, секретирующих повышенное количество AspB28IP. Затем идентифицированную последовательность синтетического мини-С-пептида можно подвергнуть еще одному раунду рандомизированной оптимизации.

Пример последовательности ДНК, кодирующей слитый белок лидер-Asp828IP(GluTrpLys), содержащий синтетический мини-С-пептид (GluTrpLys), полученный в результате описанного способа рандомизированной оптимизации, показан на фиг.3 (SEQ ID NO:7 и 8).

В таблице 1 и 2 показаны аналоги предшественников инсулина, созданные описанным выше способом, и выход продукции, выраженный в виде процента от контроля. Ферментацию проводили при 30°С в течение 72 час в 5 мл YPD. Выход предшественника инсулина определяли посредством ОФ-ВЭЖХ в надосадке культуры и выражали относительно выхода в контрольном штамме, экспрессирующем либо слитый белок лидер-AspB28IP, в котором остаток В29 связан с остатком А1 пептидной связью; либо слитый белок лидер-AspB28IP, в котором остаток В29 связан с остатком А1 мини-С-пептидом, соответственно. В таблицах «предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *» указан лидер предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 -фактора, в котором С-конец до LysArg был изменен с «SLD (SerLeuAsp)» на «SMA (SerMetAla)», и «ех4» обозначено N-концевое удлинение с аминокислотной последовательностью ЕЕАЕАЕАРК (SEQ ID NO:4). YАР3 означает сигнальную последовательность YAP3, ТА39 означает синтетическую пропоследовательность QPIDDTESNTTSVNLMADDTESRFATNTTLAGGLDVVNLISMAKR (SEQ ID NO:16). Последовательность EEGEPK (SEQ ID NO:17) представляет собой N-концевое удлинение В-цепи аналога инсулина. ТА57 означает синтетическую пропоследовательность QPIDDTESQTTSVNLMADDTESA FATQTNSGGLDVVGLISMAKR (SEQ ID NO:18).

ТАБЛИЦА 1
Лидер-N-концевое удлинениеПредшественник Мини-С-пептид Выход*SEQ ID NO;
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP (control) None100  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP MetTrpLys378  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP AlaTrpLys270  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP ValTrpLys284  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP IleTrpLys330  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP LeuTrpLys336  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP LysTrpLys288  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP GluGluPheLys272 SEQ ID NO:15
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP GluPheLys379  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP GluTrpLys374  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP SerTrpLys226  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP ThrTrpLys270  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP ArgTrpLys227  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP GluMetTrpLys212 SEQ ID NO:1
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP GlnMetTrpLys239 SEQ ID NO:2
ТАБЛИЦА 2
Лидер-N-концевое удлинение Предшественник Мини-С-пептидВыход* SEQ ID NO:
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP (control) AlaAlaLys100  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP GluTrpLys626  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP GluTyrLys466  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP GluPheLys444  
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4 AspB28IP AspTrpLys460  
YAP3-TA57-EEGEPK AspB28IP GluTrpLys 767(SEQ ID NO:17)
YАР3-ТА39-EEGEPKAsp B28IPMetTrpLys 687(SEQ ID NO:17)

Пример 2

Определение структуры Asp328IP (MetTrpLys) в водном растворе способом ЯМР-спектроскопии ЯМР-спектроскопия.

Образцы для ЯМР готовили растворением лиофилизированного белкового порошка в 10/90 D2O/H2O с 10 мМ фосфатным буфером, и рН доводили до нужного значения добавлением небольших объемов 1 М DCl или NaOD. Все показания рН-метра даны без корректировки на влияние изотопа. Образцы Asp828IP (MetTrpLys) для ЯМР готовили в концентрациях в пределах от 25 мкМ до 1 мМ при рН 8,0. Двумерные спектры 1H-1Н-ЯМР 1 мМ образцов, DQF-COSY (Piantini et al. (1982) J. Am. Chem. Soc. 104: 6800-6801, Rance et al. (1983) Biochem. Biophys. Res. Commun. 117: 479-485), TOCSY (Braunschweiler et al. (1983) J. Magn. Reson. 53: 521-528, Bax et al. (1985) J. Magn. Reson. 65: 355-360) и NOESY (Jeener et al. (1979) J. Chem. Phys. 71: 4546-4553) записывали при 600 МГц на ЯМР-спектрометре Varian Unity Inova, оборудованном 1H/13С/15N-датчиком тройного резонанса с самоэкранированной градиентной катушкой по трем осям, используя стандартные импульсные последовательности из библиотеки Varian для пользователей. Рабочая температура была установлена на уровне 27°С. Для каждого фазочувствительного двумерного ЯМР-спектра получали 512 t1-инкрементов, каждый с 2048 или 4096 реальными точками данных, способом TPPI-States (Marion et al. (1989) J. Magn. Reson. 85: 393-399). Использовали ширину спектров, равную 6983 Гц, в обоих измерениях, при этом опорная частота была расположена точно на резонансном сигнале воды, который подавляли либо насыщением между сканами в течение 1,5 сек, либо селективным возбуждением импульсной последовательностью возбуждения заданного градиента (WATERGATE, Piotto et al. (1992) J. Biomol. NMR 2: 661-665). Спектры DQFCOSY записывали, используя градиентно-усиленную версию с применением градиентов под магическим углом (Mattiello et al. (1996) J. Am. Ch'em. Soc. 118: 3253-3261). Для спектров TOCSY использовали время смешивания от 30 до 80 мсек, а для NOESY время смешивания составляло от 50 до 200 мсек.

Обработку двумерных ЯМР-спектров осуществляли с использованием пакета программ Xwinnmr (версия 2.5, компьютерная программа для обработки данных ЯМР Bruker Analytische Messtechnik GmbH, D-76275 Ettlingen, Germany). Каждое измерение обрабатывали с аподизацией сдвинутого «колокола» функции синуса и заполнением нулями, выполненном один раз в каждом измерении. При необходимости применяли корректировки базовой линии, используя стандартные способы Xwinnmr.

Спектральное отнесение, интегрирование кросс-пиков, специфичное отнесение последовательностей, стереоспецифичное отнесение и все другие типы обработок выполняли, используя программу PRONTO (PRONTO Software Development and Distribution, Copenhagen Denmark) (Kjaer et al. (1991) NATO ASI Series (Hoch, J.C., Redfield C., and Poulsen, F.M., Eds.) Plenum, New York). Химические сдвиги измеряли в м.д., и резонансный сигнал воды устанавливали при 4,75 м.д.

Расчеты структуры. Ограничения расстояний для последующего расчета структуры получали из интегрированных кросс-пиков NOESY, классифицированных как слабые, средние или сильные, соответствующие верхним ограничениям расстояний 5,5; 3,3 и 2,7 Å, соответственно. Что касается ограничений расстояний, относящихся к метильным группам, к верхнему пределу дополнительно добавляли 0,5 Å (Wagner et al. (1985) J. Mol. Biol. 196: 611-639). Расчеты структур выполняли, используя гибридный способ, объединяющий геометрию расстояний (Crippen et al. (1988) Distance Geometry and Molecular Conformation, Research Studies Press, Taunton, Somerset, England; Kuszewski et al. (1992) J. Biomol NMR 2: 33-56) и модельный отжиг, основанный на идеях Nilges et al. (1988) FEBS Lett. 229: 317-324, используя Х-PLOR 3.0 (Brünger (1992) версия 3.1 X-PLOR: A System for X-ray Crystallography and NMR, Yale University Press, New Haven) в соответствии с примерами, приведенными в руководстве X-PLOR manual (dg_sub_embed.inp.dgsa.inp,refine.inp). Номера остатков взяты из стандартной нумерации остатков инсулина, остатки в В-цепи пронумерованы В1-29, остатки в С-пептиде (например, MetTrpLys) пронумерованы С1-С3, и остатки в А-цепи пронумерованы А1-А21.

При спектральном отнесении ЯМР-спектра для большинства резонансов следовали стандартному способу последовательного отнесения, описанного Wüthrich (1986 NMR of Proteins and Nucleic Acids, Wiley, New York). Стандартный способ отнесения был неудачным в том случае, когда протон амида отдельного остатка аминокислоты быстро обменивался с протонами в воде. При рН 8,0 это имело место для нескольких аминокислотных остатков, однако сравнение с более ранними отнесениями ЯМР-спектров мутантного инсулина и идентификация соседних (в пространстве) аминокислотных остатков с помощью NOE дают возможность для получения почти полного спектрального отнесения. Анализ спектров NOESY показал, что несколько аминокислотных остатков образуют сеть взаимодействия NOE с окружающими остатками, сходную с взаимодействием, которое ранее было установлено для других молекул инсулина, т.е. мутанта HisB16 инсулина человека (Ludvigsen et al. (1994) Biochemistry 33: 7998-8006), и указанные сходные связи были обнаружены для остатков В1-В10, В13-В14, В17-В24 и А4-А21. Кроме того, ограничения двугранных углов для перечисленных выше остатков приняты, исходя из ограничений, использованных ранее (Ludvigsen et al. (1994), выше).

Несколько аминокислот, в частности В27-В29, С1-С3, А1-А3, имеют картины кросс-пиков, которые согласуются с пептидными цепями, которые менее упорядочены, чем хорошо определенные элементы вторичной структуры в большинстве случаев. Таким образом, дополнительные величины NOE превращали в ограничения расстояний без какой-либо дальнейшей классификации, кроме верхних пределов 5,5 Å или 6,0 Å в том случае, если включали метильную группу. Рассчитывали набор 20 конвергентных структур (фиг.5) и соответствующие параметры конвергентных структур перечислены в таблице 3. Каждое значение NOE, которое здесь идентично ограничению расстояния, рассчитано только один раз, даже хотя оно может несколько раз встречаться в спектре NOESY. Качественное отнесение на карте Рамачандрана представляет собой стандартные качественные параметры для оценки особенности локальной геометрии. В общем, описанные качественные параметры сравнимы со структурами белков, основанными на рентгеноструктурном анализе при разрешении 2,5 Å (Laskowski et al. (1996) J. Biomol. NMR 8: 477-486).

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

Описание рассчитанной структуры

Характерная структура, наиболее близкая к средней из группы, показана на фиг.6. AspB28IP (MetTrpLys) структурно сходен со структурой нативного инсулина в районах, содержащих остатки В1-В10, В14-В23, А4-А21. Различия, главным образом, четко выражены в районах вблизи соединительного пептида в положениях В26-В29, С1-С3, А1-А3 и менее выражены для остатков В11-В13. Структура AspB28 IP (MetTrpLys) вблизи С-пептида значительно отличается от структуры, подобной нативной структуре (Ludvigsen (1994) выше). Боковые цепи метионина и триптофана в AspB28IP(MetTrpLys) открывают традиционную структуру кора инсулина, отодвигая в одну сторону боковые цепи отдельных TyrB26 и PheB25 и оставляя интактным другой обычный близлежащий гидрофобный участок, состоящий из боковых цепей LeuB11, Val B12, IleA2 и TyrA19. Указанный карман, полученный передвижением PheB25, TyrB26 и пептидная цепь, образованная остатками с В25 по В29, по-видимому, хорошо подходят для размещения боковых цепей MetC1 и TrpC2 из С-пептида. Несколько NOE от указанных двух боковых цепей к близлежащим в структуре остаткам подтверждают указанное новое расположение боковых цепей, не наблюдаемое ранее ни в одной структуре инсулина. MetC1 размещается в кармане, образованном остатками LeuB15, PheB24 , TyrB26, TrpC1 IleA2 и Tyr A19, все из которых имеют NOE с MetC1. Trp C2 имеет даже более протяженную сеть NOE, но в результате факта обмена протона амида индола можно отнести только четыре резонанса, относящихся к ароматической кольцевой системе Trp C2. Несмотря на это в спектре NOESY AspB28IP (Met Trp Lys) было обнаружено 21 NOE между остатками между Trp C2 и соседними с ним положениями, занятыми LeuB11 , ValB12, LeuB15, TyrB26, Met C1 и IleA2.

Присутствие боковой цепи триптофана в кармане также оказывает большое влияние на химические сдвиги, наблюдаемые в спектре AspB28IP(Met Trp Lys). В условиях, используемых- для ЯМР на спектры AspB28IP(Met Trp Lys) в некоторой степени влияет самоассоциация (фиг.7), но обмен между мономером и димером на временной шкале ЯМР наблюдается только как среднее между двумя состояниями. Между концентрациями 25 мкМ и 0,2 мМ степень самоассоциации не меняется, как видно при ЯМР.

В таблице 4 показаны химические сдвиги Asp B28IP (MetTrpLys) при 27° по Цельсию, полученные при 600 мГц, рН 8 в 10%/90% D2O/H2O с 10 мМ фосфатным буфером. Химические сдвиги сравнивали с эталоном при установке остаточного сигнала воды при 4,75 м.д. N/A означает, что нет отнесения. Отнесения AspB28IP (MetTrpLys) - (1-29=В1-В29; 30-32=C1-C3 и 33-53=A1-A21), и таблица 5 дает координаты атомов AspB28IP (MetTrpLys) в форме PDB.

Таблица 4
Отнесения ЯМР-спектров для AspB28IP (MetTrpLys)
Система спинов HNНАДругие
Phe-1  4.52HB#a: 2.976, HB#b: 3.040, HD#: 7.104, HE#: 7.214, HZ: 7.177
Val-2N/АN/А HB: N/A, HG#a: N/A, HG#b: N/A
Asn-3  N/A HB#a: N/A, HB#b: N/A, HD2#a: N/A, HD2#b: N/A
Glu-4 N/А HB#a: N/A, HB#b: N/A
His-5 4.30 HB#a: 3.311, HB#a: 2.992, HD2: 6.850, HE1: 7.605
Leu-6  4.47HB#a: 1.635, HB#b: 0.807, HG: 1.506, HD#a: 0.753 HD#b: 0.675
Cys-78.304.83 HB#a: 2.901, HB#b: 3.173
Gly-8 N/А, N/А  
Ser-9  N/А HB#: N/A
His-10 N/A4.41HB#a: 3.140, HB#b: 3.351, HD2: 7.112, HE1: 7.729
Leu-11N/A3.93 HB#a: N/A, HB#b: 1.143, HG: 1.257, HD#a: 0.375, HD#b: 0.559
Val-12 7.253.37HB: 2.000, HG#a: 0.849, HG#b: N/A
Glu-13 N/АN/A HB#a: N/A, HB#a: N/A, HG#b: N/A
Ala-147.713.98 HB#: 1.307
Leu-l5 7.833.74 HB#a: 0.671, HB#b: 1.254, HG: 1.157, HD#a: N/A, HD#b: 0.295
Tyr-168.15 4.31HB#a: 3.115, HD#: 7.204, HE#: 6.734
Leu-17 7.994.05HB#A: 2.004, HB#b: 1.849, HG: 1.732, HD#a: 0.900, HD#b: 0.879
Val-188.49 3.71HB: 1.996, HG#a: 0.994, HG#b: 0.834
Cys-198.57 4.81HB#a: 2.820, HB#b: 3.250
Gly-20 7.753.96, N/A 
Arg-22N/А N/АHB#a: N/A, HB#b: N/A, HG#a: N/A, HG#b: N/A, HD#a: N/A, HD#b: N/A
Gly-237.124.06, 3.76  
Phe-24 7.564.99 HB#a: 2.971, HB#b: 3.206, HD#: 6.746, HE#: 6.877, HZ: N/A
Phe-25N/А 4.78HB#a: 3.051, HB#b: N/A, HD#: 7.172, HE#: 7.249
Tyr-26 N/А4.63 HB#a: 2.770, HB#b: N/A, HD#: 6.694, HE#: 6.291
Thr-27N/AN/А HB: N/A, HG2#: N/A
Asp-28N/АN/А HB#a: N/A, HB#b: N/A
Lys-29    
Met-30 7.844.18 HB#: 2.627, HG#: 2.904, HE#: 2.110
Trp-31 4.19 HB#a: 3.182, HE3: 7.037, HH2: 6.763, HZ2: 7.147, HZ3: 6.437
Lys-32    
Gly-33  N/A, N/A 
Ile-347.98 3.53HB: 0.953, HG1#a: 0.382, HG1#b: 0.562, HG2#: 0.234, HD#: 0.029
Val-35 7.75N/A, 4.00 HB: N/A, HB: 1.925, HG#a: N/A, HG#b: N/A, HG#b: 0.807
Glu-36N/А N/АHB#a: N/A, HG#a: N/A
Gln-377.733.96 HB: 2.033, HG#: 2.313
Cys-388.244.89 HB#a: 3.103, HB#b: 2.700
Cys-39N/АN/А HB#a: N/A, HB#b: N/A
Thr-40 3.95 HB: 4.411, HG2#: 1.167
Ser-416.974.59 HB#a: 3.698, HB#b: 3.867
Ile-427.594.32 HB: 1.399, HG1#a: N/A, HG2#: 0.573, HD#: 0.389
Cys-43N/А N/АHB#a: N/A
Ser-44N/А N/AHB#a: N/A, HB#b: N/A
Leu-45 3.86 HB#a: 1.412, HB#b: 1.489, HG: 1.565, HD#a: 0.808, HD#b: 0.733
Tyr-46 7.594.27HB#a: 2.938, HD#: 7.049, HE#: 6.784
Gln-47 7.493.87 HB#a: 2.235, HB#b: 1.948, HG#a: 2.305, HG#b: 2.076
Leu-487.66 4.11HB#a: 1.930, HB#b: 1.409, HG: 1.683, HD#a: 0.677, HD#b: N/A
Glu-49 7.754.12 HB#a: N/A, HB#b: 1.935, HG#a: 2.291, HG#b: 2.191
Asn-507.21 4.34HB#a: 2.363, HB#b: N/A
Tyr-517.76 4.50HB#a: 3.269, HB#b: 2.774, HD#: 7.250, HE#: 6.670
Cys-52 7.355.01HB#a: 2.785, HB#b: 3.322
Asn-53 8.184.40HB#a: 2.555, HB#b: 2.716, HD2#a: 7.426, HD2#b: N/A

Таблица 5
Координаты атомов AspB28IP (MetTrpLys) в формате PDB.
ATOM 1CAРНЕ 1-6.075-6.762 -0.761 1.00 0.00
ATOM 2НАРНЕ 1-5.526-6.571 0.1501.00 0.00
ATOM 3СВРНЕ 1-5.359-6.093 -1.9421.00 0.00
ATOM 4ВВ1РНЕ 1-5.934-6.258 -2.8421.00 0.00
ATOM 5ВВ2РНЕ 1-4.382-6.535 -2.0611.00 0.00
ATOM 6CGРНЕ 1-5.208-4.597 -1.7151.00 0.00
ATOM 7CD1РНЕ 1-4.925-4.081 -0.4361.00 0.00
ATOM 8BD1РНЕ 1-4.817-4.749 0.4051.00 0.00
ATOM 9CD2РНЕ 1-5.346-3.722 -2.7991.00 0.00
ATOM 10HD2РНЕ 1-5.563-4.112 -3.7831.00 0.00
ATOM 11СЕ1РНЕ 1-4.787-2.702 -0.2511.00 0.00
ATOM 12НЕ1РНЕ 1-4.573-2.308 0.7321.00 0.00
ATOM 13СЕ2РНЕ 1-5.204-2.341 -2.6121.00 0.00
ATOM 14НЕ2РНЕ 1-5.310-1.668 -3.4511.00 0.00
ATOM 15CZРНЕ 1-4.926-1.831 -1.3381.00 0.00
ATOM 16HZРНЕ 1-4.818-0.768 -1.1951.00 0.00
ATOM 17CРНЕ 1-7.491-6.201 -0.6281.00 0.00
ATOM 18OРНЕ 1-8.361-6.497 -1.4251.00 0.00
ATOM 19NРНЕ 1-6.144-8.234 -0.9951.00 0.00
ATOM 20НТ1РНЕ 1-6.303-8.723 -0.0911.00 0.00
ATOM 21HT2РНЕ 1-5.250-8.560 -1.4151.00 0.00
ATOM 22HT3РНЕ 1-6.930-8.446 -1.6421.00 0.00
ATOM 23NVAL 2-7.730-5.399 0.3801.00 0.00
ATOM 24HNVAL 2-7.013-5.181 1.0111.00 0.00
ATOM 25CAVAL 2-9.095-4.819 0.5781.00 0.00
ATOM 26НАVAL 2-9.838-5.571 0.3541.00 0.00
ATOM 27CBVAL 2-9.270-4.345 2.0301.00 0.00
ATOM 28HBVAL 2-8.787-3.387 2.1541.00 0.00
ATOM 29CG1VAL 2-10.760-4.206 2.3391.00 0.00
ATOM 30HG11VAL 2-11.281-3.863 1.4571.00 0.00
ATOM 31HG12VAL 2-10.897-3.493 3.1391.00 0.00
ATOM 32HG13VAL 2-11.156-5.164 2.6411.00 0.00
ATOM 33CG2VAL 2-8.653-5.362 3.0011.00 0.00
ATOM 34HG21VAL 2-8.836-6.363 2.6371.00 0.00
ATOM 35HG22VAL 2-9.103-5.245 3.9761.00 0.00
ATOM 36HG23VAL 2-7.589-5.193 3.0711.00 0.00
ATOM 37СVAL 2-9.279-3.628 -0.3691.00 0.00
ATOM 38OVAL 2-8.349-2.692 -0.6371.00 0.00
ATOM 39НASN 3-10.473-3.437 -0.8741.00 0.00
ATOM 40HNASN 3-11.204-4.045 -0.6411.00 0.00
ATOM 41CAASN 3-10.725-2.296 -1.8061.00 0.00
ATOM 42НАASN 3-9.782-1.927 -2.1841.00 0.00
ATOM 43СВASN 3-11.594-2.772 -2.9751.00 0.00
ATOM 44ВВ1ASN 3-12.168-1.940 -3.3571.00 0.00
ATOM 45ВВ2ASN 3-12.265-3.545 -2.6331.00 0.00
ATOM 46CGASN 3-10.702-3.324 -4.0871.00 0.00
ATOM 47OD1ASN 3-9.628-3.832 -3.8241.00 0.00
ATOM 48ND2ASN 3-11.103-3.251 -5.3271.00 0.00
ATOM 49HD21ASN 3-11.968-2.842 -5.5381.00 0.00
ATOM 50HD22ASN 3-10.539-3.603 -6.0461.00 0.00
ATOM 51СASN 3-11.448-1.171 -1.0551.00 0.00
ATOM 52OASN 3-12.648-1.002 -1.1821.00 0.00
ATOM 53NGLN 4-10.727-0.404 -0.2761.00 0.00
ATOM 54HNGLN 4-9.763-0.562 -0.1931.00 0.00

ATOM55 CAGLN4 -11.3700.7110.484 1.000.00
ATOM56 НАGLN4 -12.2821.008-0.011 1.000.00
ATOM57 СВGLN4 -11.6900.2601.917 1.000.00
ATOM58 НВ1GLN4 -12.3810.9582.365 1.000.00
ATOM59 НВ2GLN4 -10.7790.2372.498 1.000.00
ATOM60 CGGLN4 -12.318-1.1361.905 1.000.00
ATOM61 HG1GLN4 -11.533-1.8791.890 1.000.00
ATOM62 НG2GLN4 -12.936-1.2451.028 1.000.00
ATOM63 CDGLN4 -13.173-1.3253.160 1.000.00
ATOM64 OE1GLN4 -13.712-0.3743.692 1.000.00
ATOM65 NE2GLN4 -13.323-2.5223.660 1.000.00
ATOM66 HE21GLN4 -12.892-3.2893.231 1.000.00
ATOM67 HE22GLN4 -13.867-2.6534.465 1.000.00
ATOM68 СGLN4 -10.4101.9030.543 1.000.00
ATOM69 OGLN4 -9.4241.950-0.168 1.000.00
ATOM70 NHIS5 -10.6902.8571.392 1.000.00
ATOM71 HNHIS5 -11.4882.7871.958 1.000.00
ATOM72 CAHIS5 -9.7994.0441.516 1.000.00
ATOM73 НАHIS5 -9.3344.2460.562 1.000.00
ATOM74 СВHIS5 -10.6225.2581.951 1.000.00
ATOM75 НВ1HIS5 -9.9956.1371.964 1.000.00
ATOM76 HB2HIS5 -11.0245.0872.939 1.000.00
ATOM77 CGHIS5 -11.7495.4590.974 1.000.00
ATOM78 ND1HIS5 -12.8834.6650.982 1.000.00
ATOM79 HD1HIS5 -13.0763.9341.608 1.000.00
ATOM80 CD2HIS5 -11.9186.343-0.064 1.000.00
ATOM81 HD2HIS5 -11.2117.103-0.355 1.000.00
ATOM82 CE1HIS5 -13.6775.080-0.021 1.000.00
ATOM83 HЕ1HIS5 -14.6294.635-0.264 1.000.00
ATOM84 NE2HIS5 -13.1366.102-0.690 1.000.00
ATOM85 СHIS5 -8.7183.7422.554 1.000.00
ATOM86 OHIS5 -9.0063.4463.697 1.000.00
ATOM87 NLEU6 -7.4753.7942.152 1.000.00
ATOM88 HNLEU6 -7.2774.0201.219 1.000.00
ATOM89 CALEU6 -6.3603.4853.093 1.000.00
ATOM90 НАLEU6 -6.6872.7543.815 1.000.00
ATOM91 СВLEU6 -5.1802.9232.298 1.000.00
ATOM92 HВ1LEU6 -4.4162.5802.979 1.000.00
ATOM93 HB2LEUG -4.7763.7051.667 1.000.00
ATOM94 CGLEU6 -5.6541.7521.428 1.000.00
ATOM95 HGLEU6 -6.5042-0650.841 1.000.00
ATOM96 CD1LEU6 -4.5231.3180.486 1.000.00
ATOM97 HD11LEU6 -3.8012.1160.395 1.000.00
ATOM98 HD12LEU6 -4.9351.094-0.487 1.000.00
ATOM99 HD13LEU6 -4.0390.4370.881 1.000.00
ATOM100 CD2LEU6 -6.0580.5742.328 1.000.00
ATOM101 HD21LEU6 -5.710-0.3521.892 1.000.00
ATOM102 HD22LEU6 -7.1360.5442.417 1.000.00
ATOM103 HD23LEU6 -5.6210.6993.308 1,000.00
ATOM104 СLEU6 -5.9124.7573.814 1.000.00
ATOM105 OLEU6 -5.3565.6543.213 1.000.00
ATOM106 NCYS7 -6.1434.8335.101 1.000.00
ATOM107 HNCYS7 -6.5854.0905.563 1.000.00
ATOM108 CACYS7 -5.7216.0415.870 1.000.00
ATOM109 НАCYS7 -4.8356.4535.422 1.000.00
ATOM110 BB1CYS7 -7.1337.3226.855 1.000.00
ATOM111 НВ2CYS7 -7.6956.6885.314 1.000.00
ATOM112 СCYS7 -5.4085.6407.314 1.000.00
ATOM113 OCYS7 -6.2805.2318.058 1.000.00

ATOM114 CBCYS7 -6.8447.0875.846 1.000.00
ATOM115 SGCYS7 -6.2728.5975.019 1.000.00
ATOM116 NGLY8 -4.1675.7607.712 1.000.00
ATOM117 HNGLY8 -3.4886.0947.050 1.000.00
ATOM118 САGLY8 -3.7815.3949.105 1.000.00
ATOM119 HА1GLYS -4.6715.2139.690 1.000.00
ATOM120 НА2GLY8 -3.2196.2059.546 1.000.00
ATOM121 СGLY8 -2.9234-1299.085 1.000.00
ATOM122 OGLY8 -1.9494.0418.360 1.000.00
ATOM123 NSER9 -3.2783.1509.877 1.000.00
ATOM124 ННSER9 -4.0683.25110.451 1.000.00
ATOM125 САSER9 -2.4901.8839.916 1.000.00
ATOM126 НАSER9 -1.4372.1169.986 1.000.00
ATOM127 CBSER9 -2.9121.06311.135 1.000.00
ATOM128 HB1SER9 -3.7770.46410.881 1.000.00
ATOM129 HB2SER9 -3.1641.72411.947 1.000.00
ATOM130 CGSER9 -1.8370.22211.531 1.000.00
ATOM131 HGSER9 -1.789-0.51010.913 1.000.00
ATOM132 СSER9 -2.7511.0768.643 1.000.00
ATOM133 OSER9 -1.8970.3508.173 1.000.00
ATOM134 NHIS10 -3.9291.1978.088 1.000.00
ATOM135 HNHIS10 -4.5991.7908.489 1.000.00
ATOM136 САHIS10 -4.2580.4396.843 1.000.00
ATOM137 НАHIS10 -4.122-0.6147.021 1.000.00
ATOM138 CBHIS10 -5.7200.7066.456 1.000.00
ATOM139 НВ1HIS10 -5.7710.9675.413 1.000.00
ATOM140 HB2HIS10 -6.1071.5227.049 1.000.00
ATOM141 CGHIS10 -6.547-0.5286.700 1.000.00
ATOM142 ND1HIS10 -6.371-1.6875.963 1.000.00
ATOM143 HD1HIS10 -5.723-1.8225.241 1.000.00
ATOM144 CD2HIS10 -7.556-0.7977.591 1.000.00
ATOM145 HD2HIS10 -7.945-0.1018.319 1.000.00
ATOM146 СЕ1HIS10 -7.253-2.5946.419 1.000.00
ATOM147 HE1HIS10 -7.345-3.5956.027 1.000.00
ATOM148 NE2HIS10 -8.001-2.1047.412 1.000.00
ATOM149 СHIS10 -3.3320.8805.701 1.000.00
ATOM150 OHIS10 -3.1490.1604.737 1.000.00
ATOM151 NLEU11 -2.7552.0525.797 1.000.00
ATOM152 HNLEU11 -2.9222.6196.578 1.000.00
ATOM153 САLEU11 -1.8512.5364.713 1.000.00
ATOM154 НАLEU11 -2.3842.5343.774 1.000.00
ATOM155 CBLEU11 -1.3923.9615.031 1.000.00
ATOM156 НВ1LEU11 -0.7263.9425.880 1.000.00
ATOM157 HB2LEU11 -2.2534.5725.261 1.000.00
ATOM158 CGLEU11 -0.6584.5433.823 1.000.00
ATOM159 HGLEU11 0.1443.8793.533 1.000.00
ATOM160 CD1LEU11 -1.6354.7012.655 1.000.00
ATOM161 HD11LEU11 -2.5655.1143.017 1.000.00
ATOM162 HD12LEU11 -1.8213.7352.209 1.000.00
ATOM163 HD13LEU11 -1.2095.3621.916 1.000.00
ATOM164 CD2LEU11 -0.0825.9124.194 1.000.00
ATOM165 HD21LEU11 -0.8556.6604.114 1.000.00
ATOM166 HD22LEU11 0.7276.1563.522 1.000.00
ATOM167 HD23LEU11 0.2885.8835.207 1.000.00
ATOM168 СLEU11 -0.6281.6204.604 1.000.00
ATOM169 OLEU11 -0.3031.1333.539 1.000.00
ATOM170 NVAL12 0.0551.3905.699 1.000.00
ATOM171 HNVAL12 -0.2261.8006.543 1.000.00
ATOM172 САVAL12 1.2650.5145.663 1.000.00

ATOM173 НАVAL12 1.9030.8194.847 1.000.00
ATOM174 СВVAL12 2.0330.6516.981 1.000-00
ATOM175 НВVAL12 1.4420.2437.787 1.000.00
ATOM176 CG1VAL12 3.356-0.1106.883 1.000.00
ATOM177 HG11VAL12 3.9360.0597.777 1.000.00
ATOM178 HG12VAL12 3.9090.2396.023 1.000.00
ATOM179 HG13VAL12 3.157-1.1676.778 1.000.00
ATOM180 CG2VAL12 2.3212.1307.253 1.000.00
ATOM181 HG21VAL12 2.9172.5346.446 1.000.00
ATOM182 HG22VAL12 2.8622.2258.182 1.000.00
ATOM183 HG23VAL12 1.3902.6737.322 1.000.00
ATOM184 СVAL12 0.852-0.9505.461 1.000.00
ATOM185 OVAL12 1.637-1.7645.009 1.000.00
ATOM186 NGLU13 -0.365-1.2945.802 1.000.00
ATOM187 HNGLU13 -0.978-0.6256.171 1.000.00
ATOM188 САGLU13 -0.827-2.7065.640 1.000.00
ATOM189 НАGLU13 -0.099-3.3716.080 1.000.00
ATOM190 СВGLU13 -2.165-2.8826.361 1.000.00
ATOM191 НВ1GLU13 -2.707-3.7035.916 1.000.00
ATOM192 HВ2GLU13 -2.745-1.9756.270 1.000.00
ATOM193 CGGLU13 -1.913-3.1857.840 1.000.00
ATOM194 HG1GLU13 -2.783-2.9108.417 1.000.00
ATOM195 HG2GLU13 -1.060-2.6198.182 1.000.00
ATOM196 CDGLU13 -1.638-4.6808.016 1.000.00
ATOM197 OE1GLU13 -2.032-5.2179.038 1.000.00
ATOM198 OE2GLU13 -1.036-5.2617.128 1.000.00
ATOM199 СGLU13 -1.001-3.0584.154 1.000.00
ATOM200 OGLU13 -1.130-4.2193.805 1.000.00
ATOM201 NALA14 -1.020-2.0793.277 1.000.00
ATOM202 HNALA14 -0.923-1.1513.574 1.000.00
ATOM203 САALA14 -1.200-2.3811.824 1.000.00
ATOM204 НАALA14 -1.699-3.3331.714 1.000.00
ATOM205 СВALA14 -2.055-1.2881.178 1.000.00
ATOM206 НВ1ALA14 -2.984-1.1911.722 1.000.00
ATOM207 HВ2ALA14 -2.266-1-5560.152 1.000.00
ATOM208 HB3ALA14 -1.522-0.3501.203 1.000.00
ATOM209 CALA14 0.160-2.4431.120 1.000.00
ATOM210 OALA14 0.340-3.1890.176 1.000.00
ATOM211 NLEU15 1.114-1.6621.565 1.000.00
ATOM212 HNLEU15 0.943-1.0652.324 1.000.00
ATOM213 САLEU15 2.459-1.6750.914 1.000.00
ATOM214 НАLEU15 2.338-1.551-0.153 1.000.00
ATOM215 СВLEU15 3.309-0.5291.462 1.000.00
ATOM216 НВ1LEU15 4.336-0.6611.152 1.000.00
ATOM217 НВ2LEU15 3.256-0.5252.542 1.000.00
ATOM218 CGLEU15 2.7850.8010.921 1.000.00
ATOM219 HGLEU15 1.7290.8851.137 1.000.00
ATOM220 CD1LEU15 3.5331.9561.590 1.000.00
ATOM221 НD11LEU15 3.9031.6352.554 1.000.00
ATOM222 HD12LEU15 2.8632.7911.723 1.000.00
ATOM223 HD13LEU15 4.3642.2560.969 1.000.00
ATOM224 CD2LEU15 3.0060.859-0.594 1.000.00
ATOM225 НD21LEU15 2.9501.884-0.927 1.000.00
ATOM226 HD22LEU15 2.2430.278-1.092 1.000.00
ATOM227 HD23LEU15 3.9780.456-0.834 1.000.00
ATOM228 СLEU15 3.156-3.0091.190 1.000.00
ATOM229 OLEU15 3.865-3.5280.349 1.000.00
ATOM230 NTYR16 2.957-3.5712.358 1.000.00
ATOM231 HNTYR16 2.378-3.1353.018 1.000.00

ATOM232 CATYR16 3.606-4.8762.681 1.000.00
ATOM233 НАTYR16 4.609-4.8692.277 1.000.00
ATOM234 СВTYR16 3.689-5.0374.230 1.000.00
ATOM235 ВВ1TYR16 3.494-4.0764.686 1.000.00
ATOM236 НВ2TYR16 4.688-5.3464.492 1.000.00
ATOM237 CGTYR16 2.704-6.0574.783 1.000.00
ATOM238 CD1TYR16 3.181-7.2095.421 1.000.00
ATOM239 HD1TYR16 4.244-7.3715.517 1.000.00
ATOM240 CD2TYR16 1.324-5.8464.659 1.000.00
ATOM241 HD2TYR16 0.954-4.9604.166 1.000.00
ATOM242 СЕ1TYR16 2.282-8.1505.934 1.000.00
ATOM243 НЕ1TYR16 2.651-9.0386.425 1.000.00
ATOM244 СЕ2TYR16 0.423-6.7905.171 1.000.00
ATOM245 НЕ2TYR16 -0.640-6.6285.076 1.000.00
ATOM246 CZTYR16 0.902-7.9415.809 1.000.00
ATOM247 OHTYR16 0.016-8.8686.315 1.000.00
ATOM248 HHTYR16 -0.479-8.4517.024 1.000.00
ATOM249 CTYR16 2.815-6.0061.997 1.000.00
ATOM250 OTYR16 3.363-7.0261.626 1.000.00
ATOM251 NLEU17 1.531-5.8161.825 1.000.00
ATOM252 HNLEU17 1.118-4.9812.129 1.000.00
ATOM253 CALEU17 0.691-6.8531.160 1.000.00
ATOM254 НАLEU17 0.816-7.7991.665 1.000.00
ATOM255 СВLEU17 -0.778-6.4211.227 1.000.00
ATOM256 НВ1LEU17 -0.897-5.4830.705 1.000.00
ATOM257 НВ2LEU17 -1.068-6.2952.260 1.000.00
ATOM258 CGLEU17 -1.668-7.4800.573 1.000.00
ATOM259 HGLEU17 -1.242-7.773-0.377 1.000.00
ATOM260 CD1LEU17 -1.767-8.7041.484 1.000.00
ATOM261 HD11LEU17 -2.581-9.3321.154 1.000.00
ATOM262 HD12LEU17 -1.950-8.3842.499 1.000.00
ATOM263 HD13LEU17 -0.844-9.2601.442 1.000.00
ATOM264 CD2LEU17 -3.064-6.8980.350 1.000.00
ATOM265 HD21LEU17 -3.522-7.382-0.499 1.000.00
ATOM266 HD22LEU17 -2.985-5.8380.163 1.000.00
ATOM267 HD23LEU17 -3.668-7.0651.228 1.000.00
ATOM268 СLEU17 1.128-6.987-0.302 1.000.00
ATOM269 OLEU17 1.024-8.044-0.897 1.000.00
ATOM270 NVAL18 1.614-5.919-0.883 1.000.00
ATOM271 HNVAL18 1.683-5.081-0.380 1.000.00
ATOM272 CAVAL18 2.059-5.966-2.306 1.000.00
ATOM273 НАVAL18 1.392-6.595-2.875 1.000.00
ATOM274 СВVAL18 2.052-4.548-2.886 1.000.00
ATOM275 HBVAL18 2.802-3.954-2.382 1.000.00
ATOM276 CG1VAL18 2.375-4.606-4.380 1.000.00
ATOM277 HG11VAL18 1.457-4.614-4.947 1.000.00
ATOM278 HG12VAL18 2.939-5.504-4.594 1.000.00
ATOM279 HG13VAL18 2.961-3.741-4.656 1.000.00
ATOM280 CG2VAL18 0.674-3.907-2.683 1.000.00
ATOM281 HG21VAL18 0.117-4.466-1.943 1.000.00
ATOM282 HG22VAL18 0.131-3.910-3.617 1.000.00
ATOM283 HG23VAL18 0.799-2.889-2.345 1.000.00
ATOM284 СVAL18 3.480-6.523-2.376 1.000.00
ATOM285 OVAL18 3.801-7.325-3.233 1.000.00
ATOM286 NCYS19 4.334-6.086-1.490 1.000.00
ATOM287 HNCYS19 4.048-5.430-0.821 1.000.00
ATOM288 CACYS19 5.746-6.566-1.501 1.000.00
ATOM289 НАCYS19 5.981-6.963-2.478 1.000.00
ATOM290 НВ1CYS19 7.708-5.690-1.396 1.000.00

ATOM291 HB2CYS19 6.603-5.126-0.146 1.000.00
ATOM292 СCYS19 5.910-7.669-0.451 1.000.00
ATOM293 OCYS19 6.116-8.822-0.782 1.000.00
ATOM294 СВCYS19 6.693-5.394-1.186 1.000.00
ATOM295 SGCYS19 6.271-3.960-2.210 1.000.00
ATOM296 NGLY20 5.806-7.3260.809 1.000.00
ATOM297 HNGLY20 5.629-6.3921.048 1.000.00
ATOM298 САGLY20 5.938-8.3541.885 1.000.00
ATOM299 НА1GLY20 5.615-9.3131.508 1.000.00
ATOM300 HА2GLY20 5.319-8.0742.725 1.000.00
ATOM301 СGLY20 7.395-8.4582.341 1.000.00
ATOM302 OGLY20 7.969-7.5082.837 1.000.00
ATOM303 NGLU21 7.991-9.6152.186 1.000.00
ATOM304 HNGLU21 7.499-10.3641.789 1-000.00
ATOM305 САGLU21 9.410-9.8092.615 1.000.00
ATOM306 НАGLU21 9.482-8.6673.684 1.000.00
ATOM307 СВGLU21 9.856-11.2292.262 1.000.00
ATOM308 НВ1GLU21 10.925-11.314.2.391 1.000.00
ATOM309 HB2GLU21 9.598-11.4411.235 1.000.00
ATOM310 CGGLU21 9.154-12.2273.183 1.000.00
ATOM311 HG1GLU21 8.975-13.1492.647 1.000.00
ATOM312 HG2GLU21 8.212-11.8133.513 1.000.00
ATOM313 CDGLU21 10.040-12.5134.398 1.000.00
ATOM314 OE1GLU21 9.858-11.8515.407 1.000.00
ATOM315 ОЕ2GLU21 10.885-13.3874.298 1.000.00
ATOM316 СGLU21 10.321-8.8001.908 1.000.00
АТОМ317 OGLU21 11.338-8.3942.441 1.000.00
ATOM318 NARG22 9.965-8.3950.715 1.000.00
ATOM319 HNARG22 9.141-8.7390.310 1.000.00
ATOM320 САARG22 10.807-7.413-0.030 1.000.00
ATOM321 НАARG22 11.805-7.809-0.145 1.000.00
ATOM322 СВARG22 10.198-7.162-1.410 1.000.4)0
ATOM323 НВ1ARG22 10.595-6.244-1.813 1.000.00
ATOM324 HВ2ARG22 9.126-7.079-1.314 1.000.00
ATOM325 CGARG22 10.537-8.329-2.351 1.000.00
ATOM326 HG1ARG22 9.626-8.727-2.767 1.000.00
ATOM327 HG2ARG22 11.050-9.104-1.801 1.000.00
ATOM328 CDARG22 11.438-7.835-3.489 1.000.00
ATOM329 HD1ARG22 10.951-7.021-4.006 1.000.00
ATOM330 HD2ARG22 11.618-8.644-4.182 1.000.00
ATOM331 NEARG22 12.735-7.363-2.928 1.000.00
ATOM332 HEARG22 12.747-6.827-2.107 1.000.00
ATOM333 CZARG22 13.854-7.662-3.527 1.000.00
ATOM334 NH1ARG22 13.963-7.517-4.820 1.000.00
ATOM335 HH11ARG22 13.186-7.175-5.351 1.000.00
ATOM336 НН12ARG22 14.821-7.746-5.280 1.000.00
ATOM337 NH2ARG22 14.867-8.105-2.835 1.000.00
ATOM338 НН21ARG22 14.785-8.216-1.845 1.000.00
ATOM339 HH22ARG22 15.726-8.335-3.294 1.000.00
ATOM340 СARG22 10.870-6.0980.750 1.000.00
ATOM341 OARG22 11.919-5.4970.889 1.000.00
ATOM342 NGLY23 9.752-5.6521.266 1.000.00
ATOM343 HNGLY23 8.923-6.1591.141 1.000.00
ATOM344 САGLY23 9.734-4.3782.045 1.000.00
ATOM345 НА1GLY23 10.693-4.2332.520 1.000.00
ATOM346 НА2GLY23 8.962-4.4342.800 1.000.00
ATOM347 СGLY23 9.450-3.2001.111 1.000.00
ATOM348 OGLY23 9.449-3.339-0.098 1.000.00
ATOM349 NPHE24 9.207-2.0411.668 1.000.00

ATOM350 HNРНЕ24 9.214-1.9612.646 1.000.00
ATOM351 CAРНЕ24 8.919-0.8380.829 1.000.00
ATOM352 НАРНЕ24 9.341-0.984-0.155 1.000.00
ATOM353 СВРНЕ24 7.400-0.6290.703 1.000.00
ATOM354 НВ1РНЕ24 7.001-1.341-0.004 1,000.00
ATOM355 HВ2РНЕ24 7.2030.3720.350 1.000.00
ATOM356 CGРНЕ24 6.723-0.8282.043 1.000.00
ATOM357 CD1РНЕ24 6.408-2.1222.472 1.000.00
ATOM358 HD1РНЕ24 6.652-2.9681.848 1.000.00
ATOM359 CD2РНЕ24 6.4060.2722.848 1.000.00
ATOM360 HD2РНЕ24 6.6481.2722.520 1.000.00
ATOM361 СЕ1РНЕ24 5.778-2.3183.706 1.000.00
ATOM362 HЕ1РНЕ24 5.537-3.3184.036 1.000.00
ATOM363 СE2РНЕ24 5.7760.0774.083 1.000.00
ATOM364 НЕ2PHE24 5.5310.9264.706 1.000.00
ATOM365 С2РНЕ24 5.461-1.2204.513 1.000.00
ATOM366 HZРНЕ24 4.975-1.3705.464 1.000.00
ATOM367 СРНЕ24 9.5570.3961.472 1.000.00
ATOM368 OРНЕ24 9.0040.9922.376 1.000.00
ATOM369 NРНЕ25 10.7220.7801.010 1.000.00
ATOM370 HNРНЕ25 11.1460.2780.283 1.000.00
ATOM371 CAРНЕ25 11.4081.9721.590 1.000.00
ATOM372 НАPHE25 11.1382.0742.631 1.000.00
ATOM373 CBРНЕ25 12.9241.7911.474 1.000.00
ATOM374 НВ1РНЕ25 13.4112.7481.591 1.000.00
ATOM375 НВ2РНЕ25 13.1631.3820.503 1.000.00
ATOM376 CGРНЕ25 13.4070.8482.551 1.000.00
ATOM377 CD1РНЕ25 13.976-0.3812.200 1.000.00
ATOM378 HD1РНЕ25 14.069-0.6571.161 1.000.00
ATOM379 CD2РНЕ25 13.2841.2063.898 1.000.00
ATOM380 HD2РНЕ25 12.8452.1544.169 1.000.00
ATOM381 СЕ1РНЕ25 14.423-1.2553.197 1.000.00
ATOM382 HE1РНЕ25 14.864-2.2042.927 1.000.00
ATOM383 CE2РНЕ25 13.7320.3324.896 1.000.00
ATOM384 НЕ2РНЕ25 13.6390.6065.937 1.000.00
ATOM385 CZРНЕ25 14.302-0.9004.545 1.000.00
ATOM386 HZPHE25 14.648-1.5735.315 1.000.00
ATOM387 СРНЕ25 10.9913.2300.926 1.000.00
ATOM388 OPHE25 10.3743.155-0.220 1.000.00
ATOM389 NTYR26 11.3254.3861.345 1.000.00
ATOM390 HNTYR26 11.8234.4142.188 1.000.00
ATOM391 CATYR26 10.9565.6590.659 1.000.00
ATOM392 НАTYR26 10.1085.4860.011 1.000.00
ATOM393 СВTYR26 10.5946.7191.703 1.000.00
ATOM394 НВ1TYR26 10.2137.5981.205 1.000.00
ATOM395 НВ2TYR26 11.4756.9802.270 1.000.00
ATOM396 CGTYR26 9.5396.1732.635 1.000.00
ATOM397 CD1TYR26 8.2895.7942.131 1.000.00
ATOM398 HD1TYR26 8.0795.8911.076 1.000.00
ATOM399 CD2TYR26 9.8096.0464.002 1.000.00
ATOM400 HD2TYR26 10.7726.3394.392 1.000.00
ATOM401 СЕ1TYR26 7.3115.2872.993 1.000.00
ATOM402 HE1TYR26 6.3484.9942.604 1.000.00
ATOM403 CE2TYR26 8.8295.5404.866 1.000.00
ATOM404 НЕ2TYR26 9.0385.4425.922 1.000.00
ATOM405 CZTYR26 7.5815.1614.362 1.000.00
ATOM406 ОНTYR26 6.6164.6615.212 1.000.00
ATOM407 HHTYR26 6.6143.7075.129 1.000.00
ATOM408 СTYR26 12.1436.150-0.171 1.000.00

ATOM409 OTYR26 13.2115.565-0.147 1.000.00
ATOM410 NTHR27 11.9667.221-0.907 1.000.00
ATOM411 HNTHR27 11.0967.673-0.908 1.000.00
ATOM412 CATHR27 13.0847.753-1.741 1.000.00
ATOM413 НАTHR27 14.0237.574-1.237 1.000.00
ATOM414 СВTHR27 13.0947.039-3.097 1.000.00
ATOM415 HBTHR27 13.7157.589-3.787 1.000.00
ATOM416 OG1THR27 11.7706.969-3.604 1.000.00
ATOM417 HG1THR27 11.8166.651-4.509 1.000.00
ATOM418 CG2THR27 13.6575.627-2.928 1.000.00
ATOM419 HG21THR27 13.8805.211-3.899 1.000.00
ATOM420 HG22THR27 12.9255.007-2.429 1.000.00
ATOM421 HG23THR27 14.5595.666-2.337 1.000.00
ATOM422 СTHR27 12.9069.258-1.960 1.000.00
ATOM423 OTHR27 13.75710.048-1.596 1.000.00
ATOM424 NASP28 11.8139.660-2.564 1.000.00
ATOM425 HNASP28 11.1479.003-2.857 1.000.00
ATOM426 CAASP28 11.58811.115-2.820 1.000.00
ATOM427 НАASP28 12.31211.692-2.264 1.000.00
ATOM429 СВASP28 11.75911.396-4.315 1.000.00
ATOM429 НВ1ASP28 11.47212.415-4.524 1.000.00
ATOM430 HВ2ASP28 11.13310.722-4.881 1.000.00
ATOM431 CGASP28 13.22211.188-4.712 1.000.00
ATOM432 OD1ASP28 13.94212.170-4-780 1.000.00
ATOM433 OD2ASP28 13.59710.050-4.941 1.000.00
ATOM434 СASP28 10.17611.519-2.384 1.000.00
ATOM435 OASP28 9.99312.153-1.363 1.000.00
ATOM436 NLYS29 9.17711.162-3.157 1.000.00
ATOM437 HNLYS29 9.35310.656-3.978 1.000.00
ATOM438 CALYS29 7.77611.533-2.797 1.000.00
ATOM439 НАLYS29 7.75611.902-1.782 1.000.00
ATOM440 СВLYS29 7.27812.631-3.746 1.000.00
ATOM441 НВ1LYS29 7.86913.523-3.607 1.000.00
ATOM442 НВ2LYS29 6.24212.850-3.528 1.000.00
ATOM443 CGLYS29 7.40412.159-5.200 1.000.00
ATOM444 HG1LYS29 6.62811.440-5.413 1.000.00
ATOM445 HG2LYS29 8.37011.697-5.344 1.000.00
ATOM446 CDLYS29 7.25813.356-6.151 1.000.00
ATOM447 HD1LYS29 6.89814.215-5.604 1.000.00
ATOM448 HD2LYS29 6.55313.107-6.931 1.000.00
ATOM449 СЕLYS29 8.61313.691-6.780 1.000.00
ATOM450 HE1LYS29 9.39113.596-6.036 1.000.00
ATOM451 HE2LYS29 8.59614.702-7.156 1.000.00
ATOM452 NZLYS29 8.88512.749-7.905 1.000.00
ATOM453 HZ1LYS29 8.36613.060-8.750 1.000.00
ATOM454 HZ2LYS29 8.57411.792-7.638 1.000.00
ATOM455 HZ3LYS29 9.90412.739-8.110 1.000.00
ATOM456 СLYS29 6.87410.299-2.904 1.000.00
ATOM457 OLYS29 5.91110.280-3.649 1.000.00
ATOM459 NMET30 7.1799.270-2.156 1.000.00
ATOM459 HNMET30 7.9579.312-1.562 1.000.00
ATOM460 CAMET30 6.3468.032-2.201 1.000.00
ATOM461 НАMET30 5.8827.948-3.171 1.000.00
ATOM462 СВMET30 7.2376.813-1.957 1.000.00
ATOM463 НВ1MET30 7.2746.597-0.900 1.000.00
ATOM464 НВ2MET30 8.2357.018-2.319 1.000.00
ATOM465 CGMET30 6.6645.607-2.701 1.000.00
ATOM466 HG1MET30 6.4555.880-3.724 1.000.00
ATOM467 HG2MET30 5.7515.288-2.219 1.000.00

ATOM468 SDMET30 7.8634.254-2.670 1.000.00
ATOM469 CEMET30 7.2653.464-1.156 1.000.00
ATOM470 HE1MET30 6.4604.055-0.737 1.000.00
ATOM471 HE2MET30 8.0693.399-0.441 1.000.00
ATOM472 HE3MET30 6.9072.471-1.387 1.000.00
ATOM473 СMET30 5.2608.094-1.119 1.000.00
ATOM474 OMET30 4.2427.434-1.221 1.000.00
ATOM475 NTRP31 5.4698.873-0.086 1.000.00
ATOM476 HNTRP31 6.2989.389-0.024 1.000.00
ATOM477 САTRP31 4.4558.9701.007 1.000.00
ATOM478 НАTRP31 3.9528.0221.116 1.000.00
ATOM479 СВTRP31 5.1589.3242.319 1.000.00
ATOM480 НВ1TRP31 5.22210.3972.414 1.000.00
ATOM481 НВ2TRP31 6.1548.9032.317 1.000.00
ATOM482 CGTRP31 4.3858.7663.468 1.000.00
ATOM483 CD1TRP31 3.9029.4904.503 1.000.00
ATOM484 HD1TRP31 4.01010.5574.630 1.000.00
ATOM485 CD2TRP31 3.9997.3843.719 1.000.00
ATOM486 NE1TRP31 3.2468.6395.376 1.000.00
ATOM487 HE1TRP31 2.8078.9136.208 1.000.00
ATOM488 СЕ2TRP31 3.2777.3314.935 1.000.00
ATOM489 СЕ3TRP31 4.2036.1853.016 1.000.00
ATOM490 HE3TRP31 4.7486.1952.084 1.000.00
ATOM491 CZ2TRP31 2.7786.1275.435 1.000.00
ATOM492 HZ2TRP31 2.2316.1126.367 1.000.00
ATOM493 CZ3TRP31 3.7034.9723.516 1.000.00
ATOM494 HZ3TRP31 3.8664.0562.968 1.000.00
ATOM495 СН2TRP31 2.9914.9444.724 1.000.00
ATOM496 НН2TRP31 2.6104.0075.104 1.000.00
ATOM497 СTRP31 3.42110.0580.691 1.000.00
ATOM498 OTRP31 2.33810.0651.243 1.000.00
ATOM499 NLYS32 3.74510.983-0.178 1.000.00
ATOM500 HNLYS32 4.62510.969-0.605 1.000.00
ATOM501 САLYS32 2.77512.072-0.503 1.000.00
ATOM502 НАLYS32 2.20012.3130.378 1,000.00
ATOM503 СВLYS32 3.54213.314-0.962 1.000.00
ATOM504 НВ1LYS32 3.75113.236-2.019 1.000.00
ATOM505 НВ2LYS32 4.47313.381-0.417 1.000.00
ATOM506 CGLYS32 2.70014.570-0.696 1.000.00
ATOM507 HG1LYS32 3.13215.1220.125 1.000.00
ATOM508 HG2LYS32 1.69014.284-0.442 1.000.00
ATOM509 CDLYS32 2.67915.456-1.946 1.000.00
ATOM510 HD1LYS32 1.79416.073-1.933 1.000.00
ATOM511 HD2LYS32 2.66914.831-2.826 1.000.00
ATOM512 CELYS32 3.92316.347-1.966 1.000.00
ATOM513 HE1LYS32 4.33716.417-0.971 1.000.00
ATOM514 HE2LYS32 3.65217.333-2.314 1.000.00
ATOM515 NZLYS32 4.93515.758-2.887 1.000.00
ATOM516 HZ1LYS32 5.63316.483-3.145 1.000.00
ATOM517 HZ2LYS32 4.46115.410-3.745 1.000.00
ATOM518 HZ3LYS32 5.41814.970-2.412 1.000.00
ATOM519 СLYS32 1.82911.620-1.617 1.000.00
ATOM520 OLYS32 0.65811.951-1.616 1.000.00
ATOM521 NGLY33 2.32810.879-2.574 1.000.00
ATOM522 HNGLY33 3.27710.635-2.556 1.000.00
ATOM523 САGLY33 1.46310.419-3.697 1.000.00
ATOM524 HA1GLY33 2.07910.208-4.559 1.000.00
ATOM525 HA2GLY33 0.75611.198-3.947 1.000.00
ATOM526 СGLY33 0.6989.149-3.306 1.000.00

ATOM527 OGLY33 -0.2968.811-3.921 1.000.00
ATOM528 NILE34 1.1568.431-2.306 1.000.00
ATOM529 HNILE34 1.9658.711-1.830 1.000.00
ATOM530 CAILE34 0.4497.175-1.908 1.000.00
ATOM531 НАILE34 0.0846.687-2.798 1.000.00
ATOM532 СВILE34 1.4276.230-1.189 1.000.00
ATOM533 НВILE34 2.2726.041-1.832 1.000.00
ATOM534 CG1ILE34 0.7144.903-0.882 1.000.00
ATOM535 HG11ILE34 0.3484.473-1.803 1.000.00
ATOM536 HG12ILE34 -0.1195.089-0.218 1.000.00
ATOM537 CG2ILE34 1.9226.8640.119 1.000.00
ATOM538 HG21ILE34 1.0946.9690.804 1.000.00
ATOM539 HG22ILE34 2.3467.835-0.087 1.000.00
ATOM540 HG23ILE34 2.6776.2280.561 1.000.00
ATOM541 CD1ILE34 1.6853.924-0.218 1.000.00
ATOM542 HD11ILE34 1.2272.947-0.158 1.000.00
ATOM543 HD12ILE34 1.9224.2720.778 1.000.00
ATOM544 HD13ILE34 2.5923.862-0.801 1.000.00
ATOM545 СILE34 -0.7437.490-0.992 1.000.00
ATOM546 OILE34 -1.7386.797-1.017 1.000.00
ATOM547 NVAL35 -0.6448.509-0.177 1.000.00
ATOM548 HNVAL35 0.1759.048-0.161 1.000.00
ATOM549 CAVAL35 -1.7738.8370.750 1.000.00
ATOM550 НАVAL35 -2.2967.9281.006 1.000.00
ATOM551 СВVAL35 -1.2169.4722.028 1.000.00
ATOM552 НВVAL35 -0.77110.4271.791 1.000.00
ATOM553 CG1VAL35 -2.3529.6733.034 1.000.00
ATOM554 HG11VAL35 -3.1118.9232.874 1.000.00
ATOM555 HG12VAL35 -2.78110.6552.900 1.000.00
ATOM556 HG13VAL35 -1.9649.5844.037 1.000.00
ATOM557 CG2VAL35 -0.1588.5462.637 1.000.00
ATOM558 HG21VAL35 -0.2208.5853.714 1.000.00
ATOM559 HG22VAL35 0.8238.8662.323 1.000.00
ATOM560 HG23VAL35 -0.3297.5332.305 1.000.00
ATOM561 СVAL35 -2.7519.8080.080 1.000.00
ATOM562 OVAL35 -3.9199.8470.420 1.000.00
ATOM563 NGLU36 -2.28910.591-0.858 1.000.00
ATOM564 HNGLU36 -1.34110.547-1.110 1.000.00
ATOM565 CAGLU36 -3.19511.563-1.539 1.000.00
ATOM566 НАGLU36 -3.89611.962-0.820 1.000.00
ATOM567 СВGLU36 -2.36212.709-2.121 1.000.00
ATOM568 HB1GLU36 -2.13012.494-3.154 1.000.00
ATOM569 HB2GLU36 -1.44212.803-1.560 1.000.00
ATOM570 CGGLU36 -3.14814.022-2.036 1.000.00
ATOM571 HG1GLU36 -2.48314.820-1.745 1.000.00
ATOM572 HG2GLU36 -3.93513.924-1.300 1.000.00
ATOM573 CDGLU36 -3.76414.346-3.399 1.000.00
ATOM574 OE1GLU36 -3.83815.520-3.730 1.000.00
ATOM575 OE2GLU36 -4.15213.417-4.088 1.000.00
ATOM576 СGLU36 -3.96210.866-2.667 1.000.00
ATOM577 OGLU36 -5.07611.237-2.987 1.000.00
ATOM578 NGLN37 -3.3729.874-3.281 1.000.00
ATOM579 HNGLN37 -2.4709.602-3.012 1.000.00
ATOM580 CAGLN37 -4.0599.163-4.402 1.000.00
ATOM581 НАGLN37 -4.7389.848-4.893 1.000.00
ATOM582 СВGLN37 -3.0188.680-5.413 1.000.00
ATOM583 HB1GLN37 -2.5897.751-5.071 1.000.00
ATOM584 HВ2GLN37 -2.2399.423-5.511 1.000.00
ATOM585 CGGLN37 -3.6908.460-6.770 1.000.00

ATOM586 HG1GLN37 -3.7559.399-7.298 1.000.00
ATOM587 HG2GLN37 -4.6838.063-6.617 1.000.00
ATOM588 CDGLN37 -2.8677.468-7.592 1.000.00
ATOM589 OE1GLN37 -2.3957.794-8.663 1.000.00
ATOM590 NE2GLN37 -2.6726.264-7.133 1.000.00
ATOM591 HE21GLN37 -3.0526.001-6.268 1.000.00
ATOM592 HE22GLN37 -2.1455.620-7.652 1.000.00
ATOM593 СGLN37 -4.8527.960-3.883 1.000.00
ATOM594 OGLN37 -5.8317.556-4.480 1.000.00
ATOM595 NCYS38 -4.4227.368-2.797 1.000.00
ATOM596 HNCYS38 -3.6187.697-2.345 1.000.00
ATOM597 CACYS38 -5.1386.167-2.265 1.000.00
ATOM598 НАCYS38 -5.5895.631-3.086 1.000.00
ATOM599 HВ1CYS38 -4.6494.387-1.174 1.000.00
ATOM600 HB2CYS38 -3.6745.787-0.749 1.000.00
ATOM601 СCYS38 -6.2316.567-1.272 1.000.00
ATOM602 OCYS38 -7.4006.350-1.513 1.000.00
ATOM603 CBCYS38 -4.1365.252-1.563 1.000.00
ATOM604 SGCYS38 -2.8714.725-2.746 1.000.00
ATOM605 NCYS39 -5.8607.122-0.147 1.000.00
ATOM606 HNCYS39 -4.9067.2640.032 1.000.00
ATOM607 CACYS39 -6.8747.5080.889 1.000.00
ATOM608 НАCYS39 -7.2976.6101.316 1.000.00
ATOM609 НВ1CYS39 -5.7939.2211.592 1.000.00
ATOM610 HB2CYS39 -5.3687.7242.406 1.000.00
ATOM611 СCYS39 -8.0108.3480.274 1.000.00
ATOM612 OCYS39 -9.1698.1460.589 1.000.00
ATOM613 СВCYS39 -6.1818.3052.000 1.000.00
ATOM614 SGCYS39 -7.3658.6823.324 1.000.00
ATOM615 NTHR40 -7.6969.288-0.585 1.000.00
ATOM616 NHTHR40 -6.7579.440-0.821 1.000.00
ATOM617 CATHR40 -8.77010.135-1.197 1.000.00
ATOM618 НАTHR40 -9.29010.671-0.415 1.000.00
ATOM619 СВTHR40 -8.14311.138-2.166 1.000.00
ATOM620 HBTHR40 -8.91821.747-2.607 1.000.00
ATOM621 OG1THR40 -7.45210.438-3.192 1.000.00
ATOM622 HG1THR40 -6.8269.844-2.773 1.000.00
ATOM623 CG2THR40 -7.16812.038-1.408 1.000.00
ATOM624 HG21THR40 -6.74312.762-2.087 1.000.00
ATOM625 HG22THR40 -6.38011-434-0.983 1.000.00
ATOM626 HG23THR40 -7.69512.552-0.619 1.000.00
ATOM627 СTHR40 -9.7669.251-1.954 1.000.00
ATOM628 OTHR40 -10.9599.491-1.933 1.000.00
ATOM629 NSER41 -9.2848.238-2.620 1.000.00
ATOM630 HNSER41 -8.3188.071-2.619 1.000.00
ATOM631 CASER41 -10.1927.333-3-385 1.000.00
ATOM632 НАSER41 -11.2187.626-3.211 1.000.00
ATOM633 СВSER41 -9.8657.469-4.877 1.000.00
ATOM634 НВ1SER41 -10.6466.998-5.460 1.000.00
ATOM635 HВ2SER41 -8.9246.989-5.088 1.000.00
ATOM636 OGSER41 -9.7728.847-5.212 1.000.00
ATOM637 HGSER41 -8.9259.172-4.895 1.000.00
ATOM638 CSER41 -9.9815.884-2.900 1.000.00
ATOM639 OSER41 -9.7415.659-1.728 1.000.00
ATOM640 NILE42 -10.0664.901-3.772 1.000.00
ATOM641 HNILE42 -10.2635.091-4.711 1.000.00
ATOM642 CAILE42 -9.8573.491-3.335 1.000.00
ATOM643 НАILE42 -9.6063.477-2.283 1.000.00
ATOM644 СВILE42 -11.1392.683-3.562 1.000.00

ATOM645 HBILE42 -11.3902.690-4.611 1.000.00
ATOM646 CG1ILE42 -12.2703.324-2.756 1.000.00
ATOM647 HG11ILE42 -12.3574.365-3.023 1.000.00
ATOM648 HG12ILE42 -12.0523.240-1.701 1.000.00
ATOM649 CG2ILE42 -10.9331.237-3.093 1.000.00
ATOM650 HG21ILE42 -10.1721.212-2.326 1.000.00
ATOM651 HG22ILE42 -10.6220.628-3.928 1.000.00
ATOM652 HG23ILE42 -11.8600.853-2.694 1.000.00
ATOM653 CD1ILE42 -13.5892.614-3.059 1.000.00
ATOM654 HD11ILE42 -13.6412.388-4.112 1.000.00
ATOM655 HD12ILE42 -14.4133.255-2.785 1.000.00
ATOM656 HD13ILE42 -13.6421.696-2.490 1.000.00
ATOM657 СILE42 -8.6992.897-4.139 1.000.00
ATOM658 OILE42 -8.8852.325-5.197 1.000.00
ATOM659 NCYS43 -7.4993.050-3.643 1.000.00
ATOM660 HNCYS43 -7.3873.527-2.793 1.000.00
ATOM661 САCYS43 -6.2952.525-4.354 1.000.00
ATOM662 НАCYS43 -6.1803.043-5.293 1.000.00
ATOM663 HВ1CYS43 -4.5501.830-3.290 1.000.00
ATOM664 НВ2CYS43 -5.3783.183-2.530 1.000.00
ATOM665 СCYS43 -6.4421.022-4.617 1.000.00
ATOM666 OCYS43 -7.1000.312-3.880 1.000.00
ATOM667 CBCYS43 -5.0592.767-3.471 1.000.00
ATOM668 SGCYS43 -3.9183.924-4.276 1.000.00
ATOM669 NSER44 -5.8130.539-5.657 1.000.00
ATOM670 HNSER44 -5.2831.137-6.225 1.000.00
ATOM671 САSER44 -5.883-0.912-5.981 1.000.00
ATOM672 НАSER44 -6.568-1.404-5.305 1.000.00
ATOM673 CBSER44 -6.360-1.092-7.422 1.000.00
ATOM674 HB1SER44 -7.440-1.078-7.445 1.000.00
ATOM675 НВ2SER44 -6.006-2.033-7.808 1.000.00
ATOM676 OGSER44 -5.843-0.035-8.221 1.000.00
ATOM677 HGSER44 -6.246-0.095-9.091 1.000.00
ATOM678 СSER44 -4.485-1.511-5.823 1.000.00
ATOM679 OSER44 -3.498-0.798-5.827 1.000.00
ATOM680 NLEU45 -4.387-2.808-5.682 1.000.00
ATOM681 HNLEU45 -5.194-3.364-5.681 1.000.00
ATOM682 САLEU45 -3.045-3.444-5.521 1.000.00
ATOM683 НАLEU45 -2.560-3.041-4.644 1.000.00
ATOM684 CBLEU45 -3.206-4.956-5.361 1.000.00
ATOM685 HB1LEU45 -3.320-5.413-6.332 1.000.00
ATOM686 НВ2LEU45 -4.079-5.164-4.759 1.000.00
ATOM687 CGLEU45 -1.965-5.522-4.677 1.000.00
ATOM688 HGLEU45 -1.079-5.102-5.132 1.000.00
ATOM689 CD1LEU45 -1.995-5.150-3.193 1.000.00
ATOM690 HD11LEU45 -2.974-5.355-2.791 1.000.00
ATOM691 HD12LEU45 -1.774-4.099-3.081 1.000.00
ATOM692 HD13LEU45 -1.257-5.732-2.660 1.000.00
ATOM693 CD2LEU45 -1.947-7.044-4.825 1.000.00
ATOM694 HD21LEU45 -2.936-7.435-4.638 1.000.00
ATOM695 HD22LEU45 -1.252-7.467-4.114 1.000.00
ATOM696 HD23LEU45 -1.640-7.303-5.827 1.000.00
ATOM697 СLEU45 -2.187-3.154-6.754 1.000.00
ATOM698 OLEU45 -0.976-3.060-6.671 1.000.00
ATOM699 NTYR46 -2.809-3.008-7.895 1.000.00
ATOM700 HNTYR46 -3.786-3.087-7.930 1.000.00
ATOM701 САTYR46 -2.045-2.721-9.141 1.000.00
ATOM702 НАTYR46 -1.290-3.477-9.281 1.000.00
ATOM703 CBTYR46 -3.007-2.732-10.336 1.000.00

ATOM704 HB1TYR46 -3.810-2.033-10.158 1.000.00
ATOM705 HB2TYR46 -3.414-3.724-10.459 1.000.00
ATOM706 CGTYR46 -2.264-2.335-11.590 1.000.00
ATOM707 CD1TYR46 -2.461-1.062-12.137 1.000.00
ATOM708 HD1TYR46 -3.146-0.369-11.659 1.000.00
ATOM709 CD2TYR46 -1.376-3.233-12.193 1.000.00
ATOM710 HD2TYR46 -1.220-4.211-11.760 1.000.00
ATOM711 CE1TYR46 -1.770-0.686-13.295 1.000.00
ATOM712 HE1TYR46 -1.9210.296-13.719 1.000.00
ATOM713 CE2TYR46 -0.683-2.856-13.349 1.000.00
ATOM714 HE2TYR46 0.002-3.547-13.819 1.000.00
ATOM715 CZTYR46 -0.882-1.583-13.902 1.000.00
ATOM716 ОНTYR46 -0.199-1.212-15.042 1.000.00
ATOM717 HNTYR46 0.494-0.600-14.786 1.000.00
ATOM718 СTYR46 -1.371-1.349-9.025 1.000.00
ATOM719 OTYR46 -0.223-1.183-9.391 1.000.00
ATOM720 NGLN47 -2.080-0.369-8.541 1.000.00
ATOM721 HNGLN47 -3.008-0.524-8.266 1.000.00
ATOM722 CAGLN47 -1.4850.990-8.416 1.000.00
ATOM723 НАGLN47 -1.0921.295-9.376 1.000.00
ATOM724 CBGLN47 -2.5671.969-7.974 1.000.00
ATOM725 HB1GLN47 -2.1182.917-7.729 1.000.00
ATOM726 HВ2GLN47 -3.0751.572-7.110 1.000.00
ATOM727 CGGLN47 -3.5732.161-9.110 1.000.00
ATOM728 HG1GLN47 -4.3251.388-9.057 1.000.00
ATOM729 HG2GLN47 -3.0602.100-10.060 1.000.00
ATOM730 CDGLN47 -4.2463.531-8.980 1.000.00
ATOM731 OE1GLN47 -4.2624.117-7.915 1.000.00
ATOM732 NE2GLN47 -4.8094.068-10.028 1.000.00
ATOM733 HE21GLN47 -4.7973.595-10.887 1.000.00
ATOM734 HE22GLN47 -5.2414.943-9.957 1.000.00
ATOM735 СGLN47 -0.3460.951-7.393 1.000.0,0
ATOM736 OGLN47 0.6101.696-7.495 1.000.00
ATOM737 NLEU48 -0.4360.081-6.417 1.000.00
ATOM738 HNLEU48 -1.212-0.516-6.363 1.000.00
ATOM739 CALEU48 0.651-0.016-5.396 1.000.00
ATOM740 НАLEU48 1.1240.947-5.295 1.000.00
ATOM741 CBLEU48 0.065-0.441-4.042 1.000.00
ATOM742 HВ1LEU48 0.833-0.930-3.460 1.000.00
ATOM743 HB2LEU48 -0.748-1.132-4.208 1.000.00
ATOM744 CGLEU48 -0.4570.777-3.266 1.000.00
ATOM745 HGLEU48 -1.2611.240-3.821 1.000.00
ATOM746 CD1LEU48 -0.9770.309-1.910 1.000.00
ATOM747 HD11LEU48 -2.0090.009-2.004 1.000.00
ATOM748 HD12LEU48 -0.8961.117-1.199 1.000.00
ATOM749 HD13LEU48 -0.385-0.528-1.572 1.000.00
ATOM750 CD2LEU48 0,6671.794-3.037 1.000.00
ATOM751 HD21LEU48 1.6221.292-3.091 1.000.00
ATOM752 HD22LEU48 0.5552.248-2.064 1.000.00
ATOM753 HD23LEU48 0.6172.558-3.797 1.000.00
ATOM754 СLEU48 1.707-1.051-5.829 1.000.00
ATOM755 OLEU48 2.726-1.202-5.182 1.000.00
ATOM756 NGLU49 1.473-1.775-6.905 1.000.00
ATOM757 HNGLU49 0.646-1.650-7.410 1.000.00
ATOM758 CAGLU49 2.467-2.800-7.360 1.000.00
ATOM759 НАGLU49 2.543-3.576-6,616 1.000.00
ATOM760 CBGLU49 2.004-3.420-8.684 1.000.00
ATOM761 HB1GLU49 2.865-3.647-9.297 1.000.00
ATOM762 HB2GLU49 1.371-2.717-9.205 1.000.00

ATOM763 CGGLU49 1.215-4.711-8.413 1.000.00
ATOM764 HG1GLU49 0.227-4.613-8.820 1.000.00
ATOM765 HG2GLU49 1.144-4.879-7.351 1.000.00
ATOM766 CDGLU49 1.916-5.902-9.074 1.000.00
ATOM767 ОE1GLU49 2.492-6.701-8.351 1.000.00
ATOM768 OE2GLU49 1.866-5.996-10.289 1.000.00
ATOM769 СGLU49 3.844-2.156-7.574 1.000.00
ATOM770 OGLU49 4.860-2.823-7.537 1.000.00
ATOM771 NASN50 3.881-0.869-7.823 1.000.00
ATOM772 HNASN50 3.046-0.357-7.869 1.000.00
ATOM773 САASN50 5.185-0.185-8.071 1.000.00
ATOM774 НАASN50 5.893-0.902-8.457 1.000.00
ATOM775 СВASN50 4.9750.920-9.111 1.000.00
ATOM776 НВ1ASN50 5.6481.741-8.908 1.000.00
ATOM777 HB2ASN50 3.9531.271-9.062 1.000.00
ATOM778 CGASN50 5.2580.368-10.509 1.000.00
ATOM779 OD1ASN50 6.3610.475-11.005 1.000.00
ATOM780 ND2ASN50 4.300-0.219-11.169 1.000.00
ATOM781 HD21ASN50 3.409-0.305-10.770 1.000.00
ATOM782 HD22ASN50 4.469-0.577-12.066 1.000.00
ATOM783 СASN50 5.7430.428-6.778 1.000.00
ATOM784 OASN50 6.3501.482-6.806 1.000.00
ATOM785 NTYR51 5.553-0.216-5.650 1.000.00
ATOM786 HNTYR51 5.063-1.063-5.643 1.000.00
ATOM787 САTYR51 6.0880.349-4,372 1.000.00
ATOM788 НАTYR51 6.4721.335-4.569 1,000.00
ATOM789 СВTYR51 4.9560.454-3.351 1.000.00
ATOM790 НВ1TYR51 5.3600.475-2.351 1.000.00
ATOM791 HВ2TYR51 4.289-0.387-3.464 1.000.00
ATOM792 CGTYR51 4.2041.725-3.623 1.000.00
ATOM793 CD1TYR51 3.3971.803-4.753 1.000.00
ATOM794 HD1TYR51 3.3000.945-5.398 1.000.00
ATOM795 CD2TYR51 4.3312.827-2.772 1.000.00
ATOM796 HD2TYR51 4.9532.763-1.891 1.000.00
ATOM797 СЕ1TYR51 2.7092.982-5.046 1.000.00
ATOM798 HЕ1TYR51 2.0863.038-5.925 1.000.00
ATOM799 СЕ2TYR51 3.6414.011-3.057 1.000.00
ATOM800 HE2TYR51 3.7384.862-2,402 1.000.00
ATOM801 CZTYR51 2.8304.090-4.197 1.000.00
ATOM802 ОНTYR51 2.1525.257-4.482 1.000.00
ATOM803 НВTYR51 1.3905.308-3.900 1.000.00
ATOM804 СTYR51 7.230-0.518-3.818 1.000.00
ATOM805 OTYR51 7.923-0.117-2.901 1.000.00
ATOM806 NCYS52 7.442-1.687-4.368 1.000.00
ATOM807 HNCYS52 6.879-1.991-5.103 1.000.00
ATOM808 САCYS52 8.546-2.564-3.875 1.000.00
ATOM809 НАCYS52 8.538-2.580-2.794 1.000.00
ATOM810 НВ1CYS52 9.063-4.649-3.923 1.000.00
ATOM811 HB2CYS52 8.548-3.997-5.475 1.000.00
ATOM812 СCYS52 9.886-2.011-4.367 1.000.00
ATOM813 OCYS52 10.029-1.645-5.519 1.000.00
ATOM814 СВCYS52 8.362-3.989-4.411 1.000.00
ATOM815 SGCYS52 6.671-4.570-4.093 1.000.00
ATOM816 NASN53 10.868-1.949-3.501 1.000.00
ATOM817 HNASN53 10.726-2.252-2.580 1.000.00
ATOM818 САASN53 12.203-1.421-3.913 1.000.00
ATOM819 НАASN53 12.072-0.513-4.483 1.000.00
ATOM820 СВASN53 13.041-1.123-2.665 1.000.00
ATOM821 НВ1ASN53 13.670-1.974-2.443 1.000.00

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

Пример 3

Относительная стабильность укладки аналогов AspB28IP.

Для оценки стабильности укладки аналогов предшественников инсулина, образцы денатурации получали, комбинируя разные соотношения аналога предшественника инсулина и исходных растворов GuHCl с 10 мМ Трис/ClO4 -, рН 8,0. Концентрация исходных растворов белков обычно составляла 0,06 мМ в 10 мМ Трис/ClO4 -, рН 8,0. Концентрация исходных растворов GuHCl составляла 8,25 М в 10 мМ Трис/ClO4 -, рН 8,0. Спектры КД записывали на спектрополяриметре Jasco J-715, откалиброванном с помощью (+)-10-камфаросульфоновой кислотой. Все спектры записывали при 20°С. Образцы денатурации сканировали от 250 до 218 нм. Типичная длина оптического пути в кювете и концентрация белка составляли 0,5 см и 3 мкМ соответственно. Все спектры сглаживали перед вычитанием соответствующих пустых контролей с растворителем. Круговой дихроизм выражали в виде предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 на основании молярной концентрации пептидной связи. В целях представления каждую кривую нормализовали по шкале 0-1 делением наблюдаемого изменения в каждой точке на общее изменение, наблюдаемое в эксперименте.

Анализ данных. Кривые денатурации GuHCl анализировали, полагая, что переход укладка/разворачивание представляет собой два состояния, как описано Santoro and Bolen (1988) Biochemistry 27: 8063-8068 and Kaarsholm et al. (1993) Biochemistry 32: 10773-10778, и обе эти публикации специально включены здесь в виде ссылки в качестве пособий в отношении способов расчета стабильности при денатурации GuHCl. Указанный анализ дает ряд параметров, включая концентрацию' GuHCl в средней точке кривой денатурации, Cmid, отражающую концентрацию денатурирующего агента, необходимую для того, чтобы развернуть половину популяции белков. Таким образом, увеличение стабильности укладки проявляется в увеличении значения Cmid. Константы равновесия можно получить при каждой концентрации денатурирующего агента, используя K=(предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 N-предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 )/(предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 -предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 U), где предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 означает наблюдаемое значение КД, а предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 N и предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 U представляют значения КД для нативной и развернутой форм, соответственно, при данной концентрации GuHCl (Расе, 1975). Значения предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 N и предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 U при концентрациях GuHCl в районе перехода получают линейной экстраполяцией базовых линий до и после перехода в район перехода, т.е. предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 N=предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 °N+mN[GuHCl], и предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 U=предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 °U+mU[GuHCl], где предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 °N и предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 °U означают пересечения, а mN и mU являются наклонами базовых линий до и после перехода соответственно. Свободная энергия развертывания при данной концентрации денатурирующего агента в зоне перехода имеет вид предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 G=-RTInK. Допуская линейную зависимость ДС от концентрации денатурирующего агента: предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 G=предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 GH2O-m[GuHCl], где предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 GH2O представляет собой значение предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 G в отсутствии денатурирующего агента, a m является мерой зависимости предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 G от концентрации денатурирующего агента. Следовательно, значения предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 G, полученные при К в зоне перехода, можно экстраполировать назад к 0 М денатурирующего агента, чтобы получить предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 GH2O. Взаимосвязь между предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 и [GuHCl] для кривой полного разворачивания показана в уравнении 1 (Santoro and Bolen, 1988):

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

При предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 в качестве ответного сигнала и [GuHCl] в качестве независимой переменной уравнение (1) подлежит нелинейному анализу методом наименьших квадратов с использованием процедуры NLIN PC SAS (SAS Inc. Cary, North Carolina). В таком случае кривая денатурации описывается шестью параметрами: предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 °N, предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 °U, mN, mU, m и предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 GH2O. Кроме того, концентрация GuHCl в средней точке кривой денатурации, Cmid, определяется предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 GH2O/m.

Оценку относительной стабильности укладки молекул производных AspB28IP с С-пептидом Met Trp Lys (AspB28IP(MetTrpLys)) проводили относительно AspB28IP. Результаты показывают, что молекула Asp B28IP(MetTrpLys) гораздо более стабильна, чем AspB28 IP (фиг.5), что очевидно на основании изменения Cmid. В то время как Cmid для AspB28IP составляет примерно около 5,5 М GuHCl, для AspB28IP(MetTrpLys) она увеличивается, по меньшей мере, примерно до 6,5 М GuHCl, при этом увеличение составляет примерно 18%.

Пример 4

Предшественник аналога инсулина AspB28IP(EWK) получили, культивируя штамм дрожжей МТ663, трансформированный экспрессирующей плазмидой, которая экспрессирует слитый белок YAP3-TA39-EEGEPK (SEQ ID NO:17)-Asp B28IP (EWK) или слитый белок YAP3-TA57-EEGEPK (SEQ ID NO:17)-Asp B28IP (EWK).

кДНК, кодирующую лидерные последовательности YAP3-TA39 и YAP3-TA57, и кДНК, кодирующие AspB28IP (EWK) и N-концевое удлинение, клонировали в экспрессирующем векторе С-РОТ-типа, используя стандартные способы (Sambrook J, Fritsch EF and Maniatis Т, Molecular cloning. Cold spring Harbour laboratory press, 1989). Последовательность ДНК и рассчитанные аминокислотные последовательности показаны на фиг.8 и 9.

В таблице 6 показаны выходы. Ферментацию проводили при 30°С в течение 72 час в 5 мл YPD. Выход IP определяли ОФ-ВЭЖХ надосадка культуры и выражали относительно выхода IP контрольного штамма.

В таблице 6 «предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *» указан лидер предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 -фактора, в котором С-конец до LysArg был изменен с «SLD (SerLeuAsp)» на «SMA (SerMetAla)», и «ех4» обозначено N-концевое удлинение с аминокислотной последовательностью ЕЕАЕАЕАРК (SEQ ID NO:4). YAP3 означает сигнальную последовательность YAP3. ТА39 означает синтетическую пропоследовательность QPIDDTESNTTSVNLMADDTESRFATNTTLAGGLDVVNLISMAKR (SEQ ID NO:16). Последовательность EEGEPK (SEQ ID NO:17) представляет собой N-концевое удлинение В-цепи аналога инсулина. ТА57 означает синтетическую пропоследовательность QPIDDTESQTTSVNLMADDTESAFATQTNSGGLDVVGLISMAKR (SEQ ID NO:18).

ТАБЛИЦА 6
ЛидерПредшественник N-концевое удлинениеС-пептид Выход*
предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846 *-ех4AspB28 IPGluGluAlaGluAlaGluAlaProLys (SEQ ID NO:4) None100
YAP3-TA39AspB28IP GluGluGlyGluProLys (SEQ ID NO:17) GluTrpLys531%
YАР3-ТА57AspB28IP GluGluGlyGluProLys (SEQ (D NO:17) GluTrpLys500%

Пример 5

Расщепление инсулинового предшественника продеазой Achromobacter lyticos (ALP)

В 1 мл 50 мМ глутамата натрия, рН 9,0, растворяли 10 мг одноцепочечного предшественника инсулина B28Asp desB30, содержащего на N-конце последовательность EEGEPK и в качестве соединительного пептида между В29 и А1 последовательность MWK. Послед того как рН доводили до 9,0, добавляли 12 мкл водного раствора, содержащего 100 мкг ALP, и реакционную смесь оставляли при температуре 23 С. Через 0,5 часа, 1 час и 2 часа отбирали образцы для анализа ВЭЖХ с обращенной фазой, и результаты показали 98%-ное преобразование в инсулин des(B30Thr) B28Asp (инсулин Aspart) через 2 часа. Данные показаны на фигуре 10.

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

предшественник инсулина, способ его получения и применение, патент № 2283846

Класс C07K14/62 инсулины

инсулин-олигомерные конъюгаты, их препараты и применения -  патент 2527893 (10.09.2014)
новые производные инсулина с чрезвычайно замедленным профилем время/действие -  патент 2524423 (27.07.2014)
аналоги инсулина, устойчивые к протеазам -  патент 2524150 (27.07.2014)
производные инсулина -  патент 2518460 (10.06.2014)
аналоги инсулина с ацильной и алкиленгликолевой группировкой -  патент 2514430 (27.04.2014)
аналоги инсулиноподобного фактора роста-1 (igf-1), содержащие аминокислотную замену в положении 59 -  патент 2511577 (10.04.2014)
хроматографические способы и соединения, очищенные этими способами -  патент 2508294 (27.02.2014)
способ регулирования условий для сайт-специфического связывания полипептида и непептидильного полимера -  патент 2495881 (20.10.2013)
способ получения рекомбинантного инсулина гларгина -  патент 2495131 (10.10.2013)
препаративный хроматографический способ на основе нелинейного градиента и продукты, очищенные этим способом -  патент 2489441 (10.08.2013)

Класс C12N15/17 инсулины

аналоги инсулина, устойчивые к протеазам -  патент 2524150 (27.07.2014)
рекомбинантная плазмидная днк phig05, кодирующая гибридный белок с проинсулином glargine человека, клетка escherichia coli, трансформированная рекомбинантной плазмидной днк phig05, и штамм бактерий escherichia coli jm109/phig05-продуцент гибридного белка с проинсулином glargine человека -  патент 2515115 (10.05.2014)
рекомбинатная плазмидная днк рнi03 кодирующая, гибридный белок с проинсулином человека, клетка escherichia coli, трансформированная рекомбинантной плазмидной днк рнi03, и штамм бактерий escherichia coli jm109/phi03-продуцент гибридного белка-предшественника инсулина человека -  патент 2515061 (10.05.2014)
рекомбинантная плазмидная днк philp07, кодирующая гибридный белок с проинсулином lispro человека, клетка escherichia coli, трансформированная рекомбинантной плазмидной днк philp07, и штамм бактерий escherichia coli jm109/philp07-продуцент гибридного белка с проинсулином lispro человека -  патент 2514480 (27.04.2014)
аналоги инсулиноподобного фактора роста-1 (igf-1), содержащие аминокислотную замену в положении 59 -  патент 2511577 (10.04.2014)
стабилизированные полипептиды инсулиноподобного фактора роста -  патент 2477287 (10.03.2013)
способ получения рекомбинантного с-пептида проинсулина человека -  патент 2451750 (27.05.2012)
фармацевтическая композиция для генной терапии заболеваний, требующих стимуляции регенераторных процессов, включая повреждения тканей человека различной этиологии, на основе синтетического модифицированного гена инсулиноподобного фактора роста человека первого типа (ифр-1, igf-1) -  патент 2372941 (20.11.2009)
рекомбинантная плазмидная днк phins11, кодирующая гибридный белок-предшественник инсулина человека, клетка escherichia coli, трансформированная рекомбинантной плазмидной днк phins11, штамм бактерий escherichia coli jm109/phins11 - продуцент гибридного белка-предшественника инсулина человека и способ получения инсулина человека -  патент 2354702 (10.05.2009)
рекомбинантная плазмидная днк pas-2, кодирующая полипептид проинсулина aspart человека, и штамм бактерий escherichia coli bas2 - продуцент рекомбинантного проинсулина aspart -  патент 2337964 (10.11.2008)

Класс C12P21/00 Получение пептидов или протеинов

рекомбинантная плазмидная днк ppa-oprf-eta, кодирующая синтез рекомбинантного белка oprf-eta pseudomonas aeruginosa, штамм escherichia coli pa-oprf-eta - продуцент рекомбинантного белка oprf-eta pseudomonas aeruginosa и способ получения рекомбинантного белка oprf-eta pseudomonas aeruginosa -  патент 2529359 (27.09.2014)
модифицированная дрожжевая двугибридная система для эффективного исследования взаимодействия между белками и их доменами. -  патент 2529356 (27.09.2014)
лейколектины и их применение -  патент 2528860 (20.09.2014)
модифицированный фактор виллебранда с удлиненным полупериодом существования in vivo, его применения и способы получения -  патент 2528855 (20.09.2014)
способ получения пептидов, специфично распознающих определенные типы клеток и предназначенных для терапевтических целей -  патент 2528739 (20.09.2014)
слитый белок тиоредоксина и домена 4 инфестина, способ его получения, экспрессионная плазмидная днк, кодирующая слитый белок, и бактерия рода escherichia coli, трансформированная такой плазмидной днк -  патент 2528251 (10.09.2014)
способ получения цитохрома с -  патент 2528061 (10.09.2014)
рсв-специфичные связывающие молекулы и средства для их получения -  патент 2527067 (27.08.2014)
способы, относящиеся к модифицированным гликанам -  патент 2526250 (20.08.2014)
l-фукоза 1 6 специфичный лектин -  патент 2524425 (27.07.2014)
Наверх