рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид, содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий escherichia coli - продуцент гибридного полипептида, содержащего проинсулин человека

Классы МПК:C12N15/17 инсулины
C12N1/21 модифицированные введением чужеродного генетического материала
Автор(ы):, , , , , ,
Патентообладатель(и):Институт биоорганической химии им.М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова РАН,
Российское акционерное общество открытого типа "Биопрепарат"
Приоритеты:
подача заявки:
1999-05-18
публикация патента:

Изобретение относится к биотехнологии, в частности к генетической инженерии. Может быть использовано для получения рекомбинатного проинсулина человека. Рекомбинантная плазмидная ДНК pPINS16 содержит искусственный ген, кодирующий гибридный полипептид, состоящий из одного IgG-связывающего домена белка А из S. aureus, пептидного линкера His6GlySerArg и проинсулина человека, тандем промоторов триптофанового оперона Е.соli и синтетический усилитель трансляции гена 10 бактериофага Т7. Рекомбинантная плазмидная ДНК pPINS16 обеспечивает в клетках E.coli SG20050 конститутивный биосинтез гибридного полипептида на уровне 25-30% суммарного клеточного белка. Рекомбинантная плазмидная ДНК pPINS25 содержит искусственный ген, кодирующий гибридный полипептид, состоящий из одного IgG-связывающего домена белка А из S. aureus, пептидного линкера His6GlySerArg и проинсулина человека, гибридный trc-промотор, тандем двух терминаторов рибосомного оперона E.coli и мутантный ген, кодирующий термочувствительный lac-репрессор. Штамм Escherichia coli SG20050/pPINS25-продуцент гибридного полипептида, содержащего проинсулин человека. Изобретение позволяет индуцировать биосинтез целевого гибридного полипептида сдвигом температуры культивирования штамма-продуцента с 30 до 42°С. Уровень биосинтеза составляет не ниже 25% суммарного клеточного белка. 3 с.п.ф-лы, 3 ил.
Рисунок 1, Рисунок 2, Рисунок 3

Формула изобретения

1. Рекомбинантная плазмидная ДНК PINS16, кодирующая гибридный полипептид, содержащий проинсулин человека, в котором последовательность домена В стафилококкового белка А соединена через пептидный линкер His6GlySerArg с аминокислотной последовательностью проинсулина человека, с молекулярной массой 2,82 МДа, состоящая из ClaI/HindIII-фрагмента плазмиды pGGF8, включающего тандем двух trp-промоторов, ген рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493-лактамазы (bla), участок инициации репликации (ori), терминатор транскрипции бактериофага рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493 и ClaI/HindIII-фрагмента, содержащего искусственный ген, кодирующий IgG-связывающий домен белка А и S. aureus c гексагистидиновым линкером, соединенным через трипептид GlySerArg с последовательностью проинсулина человека, в качестве генетического маркера ген рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493-лактамазы (bla), определяющий устойчивость трансформированных плазмидой pPINS16 клеток бактерий к ампициллину, уникальные сайты узнавания рестрикционными эндонуклеазами, имеющими следующие координаты: EcoRI - 278, ClaI - 384, KpnI - 290, NcoI - 599 и 1677, BamHI - 603 и 1045, HindIII - 874.

2. Рекомбинантная плазмидная ДНК pPINS25, кодирующая гибридный полипептид, содержащий проинсулин человека, в котором последовательность домена В стафилококкового белка А соединена через пептидный линкер His6GlySerArg с аминокислотной последовательностью проинсулина человека, с молекулярной массой 3,12 МДа, состоящая из ClaI/HindIII-фрагмента плазмиды pTrcTEGFa, включающего химерный trc-промотор, синтетический усилитель трансляции гена Х бактериофага Т7, ген рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493-лактамазы (bla), участок инициации репликации (ori), терминатор транскрипции рибосомного оперона Е. coli, Iq-вариант гена lac-репрессора с ts-мутацией Gly187Ser и ClaI/HindIII-фрагмента плазмиды pPINS16, содержащего искусственный ген, кодирующий IgG-связывающий домен белка А из S. aureus с гексагистидиновым линкером, соединенным через трипептид GlySerArg с последовательностью проинсулина человека, в качестве генетического маркера ген рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493-лактамазы (bla), определяющий устойчивость трансформированных плазмидой pPINS25 клеток бактерий к ампициллину, уникальные сайты узнавания рестрикционными эндонуклеазами, имеющими следующие координаты: EcoRI - 270, KpnI - 282, XbaI - 340, ClaI - 376, NcoI - 265 и 591, BamHI - 595, PstI - 712 и 787, HindIII - 866, BstEI - 4131, EcoRV - 4398.

3. Штамм бактерий Escherichia coli SG20050/pPINS25 - продуцент гибридного полипептида, содержащего проинсулин человека.

Описание изобретения к патенту

Изобретение относится к области генетической инженерии и медицины и может быть использовано для создания лекарственных препаратов для лечения инсулинзависимого сахарного диабета.

Инсулин - пептидный гормон поджелудочной железы - синтезируется специализированными клетками, называемыми островками Лангерганса, в виде предшественника - препроинсулина, состоящего из 109 аминокислотных остатков. В процессе биосинтеза в результате отщепления сигнального пептида из 23 аминокислот высвобождается проинсулин. В дальнейшем проинсулин подвергается дальнейшему процессингу, приводящему к образованию собственно инсулина в результате специфического "выщепления" 35 аминокислот C-пептида. Зрелый биологически активный инсулин состоит из двух цепей, соединенных двумя дисульфидными связями. Цепь A содержит 21, а цепь B - 30 аминокислотных остатков.

Производство рекомбинантного инсулина человека основано на использовании гена проинсулина человека, полученного либо синтезом кДНК на матрице мРНК, выделенной из поджелудочной железы человека [1, 2], либо химико-ферментативным синтезом [3, 4]. При этом широко используется методология экспрессии гена проинсулина человека в клетках E.coli в составе гибридных белков в виде нерастворимых "телец включения". В качестве лидерных последовательностей, защищающих рекомбинантный белок от протеолитической деградации, использовали гомоолигопептиды [5] , бычий протимозин [6], глутатион-S-трансферазу [7], C-пептид проинсулина [8] и др. Отщепление инсулина от лидерного пептида достигается обработкой бромцианом по остатку метионина [9, 10].

Однако перечисленные полипептидные конструкции в настоящее время не используются вследствие низкой технологичности и необходимости использования высокотоксичного реагента на стадии расщепления белка-предшественника.

Наиболее близким по технической сущности к предлагаемому изобретению является рекомбинантная плазмидная ДНК pTrpZZ-R-proinsulin [11], кодирующая гибридный белок массой около 27 кДа, в котором тандем двух IgG-связывающих доменов соединен через остаток аргинина с аминокислотной последовательностью проинсулина человека. Биосинтез гибридного полипептида в клетках штамма-продуцента контролируется индуцибельным tac-промотором.

Однако необходимость индукции биосинтеза гибридного белка изопропилтио-рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493, D-галактопиранозидом (IPTG) усложняет технологический процесс и в значительной степени повышает затраты на получение целевого продукта - инсулина человека. Существенным недостатком является также невозможность промышленного масштабирования процесса получения инсулина человека из-за использования IgG-сефарозы для очистки гибридного полипептида перед ренатурацией.

Задачей изобретения является конструирование рекомбинантных плазмид и штамма-продуцента гибридного полипептида, содержащего проинсулин человека, обеспечивающих конститутивный и термоиндуцибельный биосинтез гибридного полипептида с уровнем экспрессии 25-30% суммарного клеточного белка и позволяющих упростить технологический процесс получения целевого продукта - инсулина человека - при их использовании.

Поставленная задача решается конструированием рекомбинантной плазмидной ДНК pPINS16, а также рекомбинантной плазмидной ДНК pPINS25 и штамма Escherichia coli SG20050/pPINS25.

Рекомбинантная плазмидная ДНК pPINS16 с молекулярной массой 2,82 МДа кодирует гибридный полипептид, содержащий проинсулин человека, в котором последовательность домена B стафилококкового белка A соединена через пептидный линкер His6GlySerArg с аминокислотной последовательностью проинсулина человека; она состоит из ClaI/HindIII-фрагмента плазмиды pGGF8, включающего тандем двух trp-промоторов, ген рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493-лактамазы (bla), определяющий устойчивость трансформированных плазмидой pPINS16 клеток бактерий к ампициллину, участок инициации репликации (ori), терминатор транскрипции бактериофага рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493 и ClaI/HindIII-фрагмента, содержащего искусственный ген, кодирующий IgG-связывающий домен белка A из S. aureus с гексагистидиновым доменом, соединенным через трипептид GlySerArg с последовательностью проинсулина человека.

Рекомбинантная плазмидная ДНК pPINS25 с молекулярной массой 3,12 МДа кодирует гибридный полипептид, содержащий проинсулин человека, в котором последовательность домена B стафилококкового белка A соединена через пептидный линкер His6GlySerArg с аминокислотной последовательностью проинсулина человека, она состоит из ClaI/HindIII-фрагмента плазмиды pTrcTEGFa, включающего химерный trc-промотор, синтетический усилитель трансляции гена X бактериофага T7, ген рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493-лактамазы (bla), определяющий устойчивость трансформированных плазмидой pPINS25 клеток бактерий к ампициллину, участок инициации репликации (ori), терминатор транскрипции рибосомного оперона E. coli, Iq-вариант гена lac-репрессора с ts-мутацией Gly187Ser и ClaI/HindIII-фрагмента плазмиды pPINS16, содержащего искусственный ген, кодирующий IgG-связывающий домен белка A из S. aureus с гексагистидиновым линкером, соединенным через трипептид GlySerArg с последовательностью проинсулина человека.

Штамм бактерий Escherichia coli SG20050/pPINS25 - продуцент гибридного полипептида, содержащего проинсулин человека.

Использование изобретения позволяет получить следующий технический результат.

Рекомбинантная плазмидная ДНК pPINS16 позволяет упростить и удешевить технологию культивирования рекомбинантного бактериального штамма, в частности, E. coli SG20050, обеспечивая в его клетках биосинтез гибридного полипептида на уровне 25-30% суммарного клеточного белка за счет содержащегося в ней гибридного гена, который экспрессируется конститутивно и не требует стадии химической индукции.

Использование рекомбинантной плазмидной ДНК pPINS25 позволяет избежать длительного культивирования штамма-продуцента E. coli SG20050 и повысить за счет этого качество гибридного полипептида в "тельцах включения", а также обеспечивает высокий уровень его биосинтеза - 25-30% суммарного клеточного белка, который индуцируется сдвигом температуры культивирования от 30oC до 42oC. Температурная индукция транскрипции целевого гена в плазмидной ДНК pPINS25 обеспечивается гибридным промотором Ptrc и наличием гена, кодирующего термочувствительный lac-репрессор.

Исходной для конструирования плазмидной ДНК pPINS16 служила ДНК pGGF8, кодирующая конститутивный биосинтез гранулоцитарного колониестимулирующего фактора человека под контролем тандема двух промоторов триптофанового оперона E. coli [12]. Конструирование плазмидной ДНК pPINS16 было проведено с помощью полимеразной цепной реакции. В качестве источника гена, кодирующего гибридный полипептид с проинсулином человека, использовали плазмидную ДНК pPINS07, сконструированную на основе плазмидного вектора pKK223-3. Рекомбинантная плазмидная ДНК pPINS07 содержит искусственный ген, кодирующий полипептид, состоящий из одного IgG-связывающего домена белка A из S. aureus, пептидного линкера His6GlySerArg и проинсулина человека, гибридный tac-промотор и терминатор транскрипции рибосомного оперона E. coli.

С использованием ДНК плазмиды pPINS07 в качестве матрицы аплифицировали ген, кодирующий гибридный белок, с праймерами

рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493

и

TCTCTCATCCGCCAAAA (II).

В структуре праймера I подчеркиванием выделен сайт рестриктазы ClaI. Продукт амплификации обрабатывали рестрикционными эндонуклеазами ClaI и HindIII, и гидролизат после очистки электрофорезом в 1% геле легкоплавкой агарозы лигировали с вектором, полученным гидролизом плазмиды pGGF8 рестриктазами ClaI и HindIII. В результате получили плазмидную ДНК pPINS16, кодирующую гибридный полипептид, содержащий проинсулин человека. Плазмида pPINS16 детерминирует в клетках E. coli SG20050 конститутивный биосинтез гибридного белка, содержание которого составляет 25-30% суммарного клеточного белка.

Рекомбинантная плазмидная ДНК pPINS16 кодирует гибридный полипептид с аминокислотной последовательностью проинсулина человека и характеризуется следующими признаками:

имеет молекулярную массу 2,82 МДа (4,274 т.п.о.);

кодирует гибридный белок, в котором последовательность IgG-связывающего домена B стафолококкового белка A с C-концевым гексагистидиновым линкером соединена через трипептид GlySerArg с аминокислотной последовательностью проинсулина человека;

состоит из: ClaI/HindIII-фрагмента плазмиды pGGF8, содержащей тандем двух trp-промоторов, ген рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493-лактамазы (bla), участок инициации репликации (ori), терминатор транскрипции бактериофага рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493 [13] и полученного амплификацией ClaI/HindIII-фрагмента, включающего искусственный ген, кодирующий IgG-связывающий домен белка A из S. aureus с гексагистидиновым доменом, соединенным через трипептид GlySerArg с последовательностью проинсулина человека;

содержит: тандем двух trp-промоторов транскрипции, синтетический усилитель трансляции гена X бактериофага T7, искусственный ген, кодирующий гибридный полипептид, в котором последовательность домена B стафилококкового белка A с C-концевым гексагистидиновым линкером соединена через трипептид GlySerArg с аминокислотной последовательностью проинсулина человека; терминатор транскрипции бактериофага рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493, в качестве генетического маркера ген рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493-лактамазы (bla), определяющий устойчивость трансформированных плазмидой pPINS16 клеток бактерий к ампициллину; уникальные сайты узнавания рестрикционными эндонуклеазами, имеющими следующие координаты:

EcoRI - 278, ClaI - 384, KpnI - 290, NcoI - 599 и 1677, BamHI - 603 и 1045, HindIII - 874.

Преимуществом предложенной плазмидной конструкции является то, что содержащийся в ней гибридный ген экспрессируется конститутивно, что не требует стадии химической индукции и значительно удешевляет и упрощает технологию культивирования рекомбинантного бактериального штамма B то же время необходимость длительного культивирования штамма-продуцента на основе плазмиды pPINS16 в значительной степени снижает качество гибридного полипептида в "тельцах включения".

Отмеченный недостаток устраняют конструированием рекомбинантной плазмидной ДНК, детерминирующей термоиндуцибельную экспрессию искусственного гена, кодирующего гибридный полипептид, состоящий из одного IgG-связывающего домена B белка A из S. aureus, пептидного линкера His6GlySerArg и проинсулина человека.

Конструируют рекомбинантную плазмидную ДНК pPINS25, в которой экспрессия гибридного гена, кодирующего биотехнологический предшественник инсулина человека, контролируется сдвигом температуры культивирования плазмидосодержащего штамма. Температурная индукция целевого гена в плазмиде pPINS25 обеспечивается гибридным промотором Ptrc и наличием гена, кодирующего термочувствительный lac-репрессор.

Для конструирования плазмиды pPINS25 на первом этапе провели клонирование ClaI/HindIII-фрагмента плазмиды pPINS16, содержащего искусственный ген, кодирующий гибридный белок с последовательностью проинсулина человека, в плазмиду pTrcTEGFa [14]. В результате получили плазмиду pTrcPINS, в которой экспрессия целевого гибридного гена находится под контролем химерного trc-промотора и синтетического участка инициации трансляции с энхансером. Наличие в этой плазмиде Iq-аллельного варианта гена репрессора позволяет использовать эту плазмиду для индуцибельной экспрессии гибридного гена в любом штамме кишечной палочки. При этом экспрессия может иметь место только при индукции IPTG. Для получения термоиндуцибельного варианта проводили сайт направленный мутагенез. В качестве мишени для мутации был выбран остаток Gly187, так как замена его на серин приводит к фенотипу ts гена lac-репрессора [15, 16]. Мутагенез проводили на матрице плазмидной ДНК pTrcPINS с помощью двухстадийной полимеразной цепной реакции, при этом использовали уникальные для этой плазмиды сайты рестриктаз BstEl и EcoRI. Для мутагенеза были синтезированы два мутагенизирующих праймера:

рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493

и

рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493

(подчеркнуты измененные триплеты) и два якорных праймера: ACACCCATCAACAGTATTAT (V) и TACCGAGCTCGAATTCCAT (VI).

Чтобы реализовать аминокислотную замену Gly187Ser на первом этапе проводили реакцию на матрице плазмиды pTrcPINS с мутагенизирующим праймером (III) и якорным праймером (VI). Параллельно проводили полимеразную цепную реакцию (ПЦР) с праймерами (IV) и (V). Продукты ПЦР величиной 850 и 120 пар оснований (п. о. ) отделяли от праймеров, отжигали и проводили новый цикл ПЦР в присутствии только якорных праймеров (V) и (VI). Полученный таким образом фрагмент величиной 950 п.о. гидролизовали рестриктазами BstEl и EcoRI, и образовавшийся фрагмент клонировали по тем же сайтам в плазмиду pTrcPINS. В результате получили плазмиду pPINS25, содержащую мутантный ген lac-репрессора и искусственный ген, кодирующий гибридный белок с проинсулином человека под контролем trc-промотора.

Рекомбинантная плазмидная ДНК pPINS25 кодирует гибридный полипептид с аминокислотной последовательностью проинсулина человека и характеризуется следующими признаками:

имеет молекулярную массу 3,12 МДа (4,721 т.п.о.);

кодирует гибридный белок, в котором последовательность IgG-связывающего домена B стафолококкового белка A с C-концевым гексагистидиновым линкером соединена через трипептид GlySerArg с аминокислотной последовательностью проинсулина человека;

состоит из: ClaI/HindIII-фрагмента плазмиды pTrcTEGFa, содержащего trc-промотор, ген рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493-лактамазы (bla), участок инициации репликации (ori), терминатор транскрипции рибосомного оперона E. coli [17], Iq-вариант гена lac-репрессора с ts-мутацией Gly187Ser и ClaI/HindIII-фрагмента плазмиды pPINS16, содержащего искусственный ген, кодирующий IgG-связывающий домен белка A из S. aureus с гексагистидиновым линкером, соединенным через трипептид GlySerArg с последовательностью проинсулина человека;

содержит: химерный trc-промотор транскрипции, синтетический усилитель трансляции гена X бактериофага T7, искусственный ген, кодирующий гибридный полипептид, в котором последовательность домена B стафилококкового белка A с C-концевым гексагистидиновым линкером соединена через трипептид GlySerArg с аминокислотной последовательностью проинсулина человека; терминатор транскрипции рибосомного оперона E. coli, Iq-вариант гена lac-репрессора с ts-мутацией Gly187Ser; в качестве генетического маркера ген рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493-лактамазы (bla), определяющий устойчивость трансформированных плазмидой pPINS25 клеток бактерий к ампициллину; уникальные сайты узнавания рестрикционными эндонуклеазами, имеющими следующие координаты:

EcoRI - 270, KpnI - 282, XbaI - 340, ClaI - 376, NcoI - 265 и 591, BamHI - 595, PstI - 712 и 787, HindIII - 866, BstEI - 4131, EcoRV - 4398.

Для получения штамма-продуцента гибридного полипептида с проинсулином человека трансформируют компетентные клетки Escherichia coli SG20050 рекомбинантной плазмидной ДНК pPINS25.

Полученный штамм Escherichia coli SG20050/pPINS25 характеризуется следующими признаками.

Морфологические признаки. Клетки мелкие укороченной палочковидной формы, грамотрицательные, неспороносные, 1 х 3,5 мкм, подвижные.

Культуральные признаки. При росте на агаризованной среде LB колонии круглые, гладкие, полупрозрачные, блестящие, серые. Край ровный, диаметр колоний 1-3 мм, консистенция пастообразная. Рост в жидких средах (LB, минимальная среда с глюкозой) характеризуется ровным помутнением, осадок легко седиментирует.

Физико-биохимические признаки. Клетки растут при температуре 4 - 42oC, оптимум pH 6,8-7,6. В качестве источника азота используют как минеральные соли аммония, так и органические соединения: аминокислоты, пептон, триптон, дрожжевой экстракт. В качестве источника углерода при росте на минимальной среде используют глицерин, углеводы, аминокислоты.

Устойчивость к антибиотикам. Клетки штамма-продуцента проявляют устойчивость к ампициллину (до 300 мг/мл), обусловленную наличием в плазмиде гена рекомбинантная плазмидная днк ppins16, кодирующая гибридный   полипептид, содержащий проинсулин человека, рекомбинантная   плазмидная днк ppins25, кодирующая гибридный полипептид,   содержащий проинсулин человека, и штамм бактерий   escherichia coli - продуцент гибридного полипептида,   содержащего проинсулин человека, патент № 2143493-лактамазы (bla).

Полученный штамм депонирован в коллекции микроорганизмов ИБХ РАН под номером 113.

На фиг. 1 представлена нуклеотидная последовательность и кодируемая ею аминокислотная последовательность ClaI/HindIII-фрагмента плазмиды pPINS25; на фиг. 2 - физическая карта плазмиды pPINS16, на фиг. 3 - физическая карта плазмиды pPINS25.

Изобретение иллюстрируется следующими примерами.

Пример 1. Конструирование рекомбинантной плазмидной ДНК pPINS16.

5 мкг плазмидной ДНК pGGF8 обрабатывают совместно рестриктазами ClaI (10 ед) и HindIII (15 ед) в буфере R, содержащем 50 мМ Трис-HCl, pH 7,5, 10 мМ MgCl2, 50 мМ NaCl и 10 мМ меркаптоэтанол, и из полученного гидролизата выделяют с помощью электрофореза в 1% агарозном геле векторную часть плазмиды (около 3,7 т.п.о.).

Для конструирования плазмиды с конститутивной экспрессией гена, кодирующего гибридный полипептид с последовательностью проинсулина человека, проводят полимеразную цепную реакцию на матрице 10 нг ДНК плазмиды pPINS07 в присутствии олигонуклеотидных праймеров (I) и (II) в 100 мкл буфера для амплификации A, содержащего 10 мМ Трис-HCl, pH 8,8, 50 мМ KCl, 0,1% Тритон X-100, 0,01% желатин, 1,25 мМ MgCl2, 0,1 мМ каждого дезоксинуклеозид-5"-трифосфата и 50 пмолей каждого из праймеров (I) и (II). Проводят 25 циклов амплификации (95oC, 60 с; 52oC, 45 с; 72oC, 45 с), продукт амплификации гидролизуют рестриктазами ClaI и HindIII и фрагмент величиной около 350 п.о., кодирующий гибридный полипептид, очищают электрофорезом в 6% ПААГ.

1 мкг полученного вектора лигируют 10 ч при 8oC с 0,1 мкг полученного амплификацией ClaI/HindIII-фрагмента, содержащего гибридный ген, кодирующий предшественник проинсулина человека, в 25 мкл буфера L, содержащего 50 мМ Трис-HCl, pH 7,5, 10 мМ MgCl2, 5 мМ дитиотреита и 0,1 мМ АТР, в присутствии 10 ед T4 ДНК-лигазы. 2 мкл лигазной смеси используют для трансформации компентентных клеток E. coil SG20050 [18]. Трансформанты высевают на LB-агар, содержащий 100 мкг/мл ампициллина. Из выросших клонов выделяют плазмидную ДНК pPINSl6 и анализируют рестриктным анализом при помощи эндонуклеаз HaeIII и HpaII, а также совместным гидролизом рестриктазами ClaI+HindIII. Окончательно строение плазмиды pPINSl6 подтверждали определением нуклеотидной последовательности между сайтами рестриктаз ClaI и HindIII методом твердофазной химической модификации [19].

Пример 2. Конструирование рекомбинантной плазмидной ДНК pPINS25.

3 мкг плазмидной ДНК pTrcTEGFa обрабатывают совместно рестриктазами ClaI и HindIII, как описано в предыдущем примере, и из полученного гидролизата выделяют с помощью электрофореза в 1% агарозном геле векторный фрагмент (около 4,3 т.п.о.).

Для клонирования гена, кодирующего гибридный полипептид с последовательностью проинсулина человека, проводят гидролиз 20 мкг плазмидной ДНК pPINSl6 в буфере R рестриктазами ClaI и HindIII и фрагмент величиной около 350 п.о., кодирующий гибридный полипептид очищают электрофорезом в 6% ПААГ.

1 мкг полученного вектора лигируют 10 ч при 8oC с 0,1 мкг ClaI/HindIII-фрагмента плазмиды pPINS16, содержащего гибридный ген, кодирующий предшественник проинсулина человека, в 25 мкл буфера L в присутствии 10 ед T4 ДНК-лигазы. 1 мкл лигазной смеси используют для трансформации компентентных клеток E. coli SG20050 [18]. Трансформанты высевают на LB-агар, содержащий 100 мкг/мл ампициллина. Из выросших клонов выделяют плазмидную ДНК pTrcPINS и анализируют рестриктным анализом при помощи эндонуклеаз HaeIII и HpaII, а также совместным гидролизом рестриктазами ClaI+HindIII. Окончательно строение плазмиды pTrcPINS подтверждали определением нуклеотидной последовательности между сайтами рестриктаз ClaI и HindIII.

Замену глицинового кодона на сериновый в гене lac-репрессора проводят при помощи двухступенчатой полимеразной цепной реакции на матрице плазмиды pTrcPINS. Для этого на первом этапе 0,01 мкг ДНК плазмиды pTrcPINS амплифицируют в 50 мкл буфера, содержащего 25 мМ Трис-HCl, pH 8,8, 10 мМ (NH4)2SO4, 1,2 мМ MgCl2, 2 мМ меркаптоэтанол, 0,1 мМ каждого дезоксинуклеозид-5"-трифосфата и 50 пмолей мутагенизируещего (III) и якорного (VI) праймеров, в присутствии 2,5 ед Taq-ДНК-полимеразы. Проводят 20 циклов амплификации (94oC, 30 с; 48oC, 45 с; 72oC, 45 с). Продукт амплификации очищают электрофорезом в 1% геле легкоплавкой агарозы. В параллельном эксперименте проводят амплификацию на матрице ДНК плазмиды pTrcPINS с мутагенизирующим праймером (IV) и якорным праймером (V). Продукт величиной около 120 п.о. очищают при помощи электрофореза в 6% полиакриламидном геле. После этого смешивают 0,05 мкг каждого продукта амплификации и проводят еще 25 циклов амплификации, как описано выше, в присутствии только якорных праймеров (V) и (VI). Продукт амплификации величиной около 950 п.о. гидролизуют рестриктазами BstEl и EcoRI и лигируют с вектором, полученным гидролизом плазмидной ДНК pTrcPINS теми же рестриктазами в буфере L. 2 мкл лигазной смеси используют для трансформации компетентных клеток E. coli SG20050 [18]. Трансформанты высевают на LB-агар, содержащий 100 мкг/мл ампициллина. Из выросших клонов выделяют плазмидную ДНК и анализируют гидролизом рестриктазами HaeIII и HpaII и окончательно строение плазмиды pPINS25 подтверждают определением нуклеотидной последовательности фрагмента ДНК между сайтами рестриктаз BstEI и EcoRI. Полученная таким образом плазмида pPINS25 содержит ген, кодирующий гибридный полипептид, содержащий проинсулин человека под контролем trc-промотора, причем экспрессия этого гена индуцируется сдвигом температуры культивирования с 30oC до 42oC благодаря наличию в плазмиде гена термочувствительного lac-репрессора.

Пример 3. Определение продуктивности штамма E. coli SG20050/pPINS25 - продуцента гибридного полипептида, содержащего проинсулин человека.

В 20 мл жидкой среды LB, содержащей 100 мкг/мл ампициллина, инокулируют индивидуальную колонию клеток E. coli SG20050, содержащих плазмиду pPINS25 и выращивают при 30oC на качалке при 180 об/мин в течение 6 ч до мутности 0,8. Затем пробирку переносят в термостат, подогретый до 42oC, и продолжают инкубацию в течение 30 мин, после чего продолжают выращивание на качалке при 180 об/мин в течение 6 ч при 37oC. Отбирают пробу 2 мл и центрифугируют 5 мин при скорости 6000 об/мин, после чего клетки суспендируют в 200 мкл буфера, содержащего 125 мМ Трис-HCl, pH 6,8, 20% глицерин, 3% додецилсульфат натрия, 3% меркаптоэтанол и 0,01% бромфеноловый синий, и нагревают 10 мин на кипящей водяной бане. Отбирают образцы 2,5 мкл, 5 мкл, 7,5 мкл, 10 мкл и 15 мкл и анализируют электрофорезом в 13% полиакриламидном геле, содержащем 0,1% додецилсульфат натрия [20]. Гель окрашивают Кумасси R-250 и сканируют на лазерном денситометре Ultrascan XL. По данным сканирования гибридный полипептид составляет 25 - 30% суммарного клеточного белка.

Источники информации

1. Bell G. 1., Swain W. F., Pictet R., Cordell B., Goodman H. M., Rutter W. J. // Nature, 1979, v. 282, p. 525 - 527.

2. Sures I., Goeddel D. V., Gray A., Ulrich A. // Science, 1980, v. 208, p. 57 - 59.

3. Williams D. С., Van Frank R. M., Murth M. L., Burnett J. P. // Science, 1982, v. 215, p. 687 - 689.

4. Ovchinnikov Y. A. , Efimov V. A., Ivanova I. N., Reverdatto S. V., Skiba N. P., Chakhmakhcheva O. G. // Gene, 1984, v. 31, p. 65 - 68.

5. Sung W. L., Yao F.L., Zanab D. M., Narang S. A. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1986, v. 83, p. 561 - 565.

6. Tang J., Xue Y., Fan X., Fu Y. // Clin J. Biotechnol., 1993, v. 9, p. 71 - 78.

7. Berg H. , Walter M., Mauch L., Seissler J., Northemann W. J. // Immunol. Methods, 1993, v. 164, p. 221 - 231.

8. Wei G. , Hu M. H., Tang L. G. // Biochem. Mol. Biol. Int., 1995, v. 35, p. 37 - 46.

9. McGregor W. С. // Ann. N. Y. Acad. Sci., 1983, v. 413, p. 231 - 237.

10. Cowley D. J., Mackin R.B. // FEBS Lett., 1997, v. 402, p. 124 - 130.

11. Johansson P., Nilsson L., Samuelsson E., Moks T., Stahl S., Uhlen M. // Eur. J. Biochem., 1996, v. 236, p. 656 - 661.

12. Патент РФ N 96113021/13. Бюлл. N 13, 20.06.98.

13. Rosenberg M., Court D., Shimatake H., Brady C., Wulff D. // The operon / Eds. Miller J.H., Reznikoff W.S. Cold Spring Harbor Laboratory. 1980. P. 345 - 371.

14. Шингарова Л. Н., Кашьяп С.К., Петровская Л.Е., Петренко Л.А., Пустошилова Н.М., Синичкина С.А., Коробко В.Г. // Биотехнология, 1998, N 6, с. 24 - 35.

15. Bukrinsky MI, Barsov EV, Shilov AA // Gene, 1988, v. 70, p. 415 - 417.

16. Yabuta M., Onai-Miura S., Ohsuye K. // J. Biotechnol, 1995, v. 39, p. 67 - 73.

17. Brosius J., Dull T. J., Sleeter D. D., Noller H. F. // J. Mol. Biol. , 1981, v. 148, p. 107 - 127.

18. Hanahan J. // J. Mol. Biol., 1983, v. 227, p. 557 - 580.

19. Чувпило С. А, Кравченко В. В. // Биоорган, химия, 1983, т. 9, с. 1634 - 1637.

20. Laemmli U.K. // Nature, 1970, v. 227, p. 680 - 687.

Класс C12N15/17 инсулины

аналоги инсулина, устойчивые к протеазам -  патент 2524150 (27.07.2014)
рекомбинантная плазмидная днк phig05, кодирующая гибридный белок с проинсулином glargine человека, клетка escherichia coli, трансформированная рекомбинантной плазмидной днк phig05, и штамм бактерий escherichia coli jm109/phig05-продуцент гибридного белка с проинсулином glargine человека -  патент 2515115 (10.05.2014)
рекомбинатная плазмидная днк рнi03 кодирующая, гибридный белок с проинсулином человека, клетка escherichia coli, трансформированная рекомбинантной плазмидной днк рнi03, и штамм бактерий escherichia coli jm109/phi03-продуцент гибридного белка-предшественника инсулина человека -  патент 2515061 (10.05.2014)
рекомбинантная плазмидная днк philp07, кодирующая гибридный белок с проинсулином lispro человека, клетка escherichia coli, трансформированная рекомбинантной плазмидной днк philp07, и штамм бактерий escherichia coli jm109/philp07-продуцент гибридного белка с проинсулином lispro человека -  патент 2514480 (27.04.2014)
аналоги инсулиноподобного фактора роста-1 (igf-1), содержащие аминокислотную замену в положении 59 -  патент 2511577 (10.04.2014)
стабилизированные полипептиды инсулиноподобного фактора роста -  патент 2477287 (10.03.2013)
способ получения рекомбинантного с-пептида проинсулина человека -  патент 2451750 (27.05.2012)
фармацевтическая композиция для генной терапии заболеваний, требующих стимуляции регенераторных процессов, включая повреждения тканей человека различной этиологии, на основе синтетического модифицированного гена инсулиноподобного фактора роста человека первого типа (ифр-1, igf-1) -  патент 2372941 (20.11.2009)
рекомбинантная плазмидная днк phins11, кодирующая гибридный белок-предшественник инсулина человека, клетка escherichia coli, трансформированная рекомбинантной плазмидной днк phins11, штамм бактерий escherichia coli jm109/phins11 - продуцент гибридного белка-предшественника инсулина человека и способ получения инсулина человека -  патент 2354702 (10.05.2009)
рекомбинантная плазмидная днк pas-2, кодирующая полипептид проинсулина aspart человека, и штамм бактерий escherichia coli bas2 - продуцент рекомбинантного проинсулина aspart -  патент 2337964 (10.11.2008)

Класс C12N1/21 модифицированные введением чужеродного генетического материала

рекомбинантный штамм бактерий escherichia coli n41 (pbpun4/mr)-продуцент сайт-специфической эндонуклеазы рестрикции bpun4i -  патент 2529362 (27.09.2014)
рекомбинантная плазмидная днк ppa-oprf-eta, кодирующая синтез рекомбинантного белка oprf-eta pseudomonas aeruginosa, штамм escherichia coli pa-oprf-eta - продуцент рекомбинантного белка oprf-eta pseudomonas aeruginosa и способ получения рекомбинантного белка oprf-eta pseudomonas aeruginosa -  патент 2529359 (27.09.2014)
нуклеиноваяя кислота, обладающая активностью гена фосфатазы фосфатидной кислоты (варианты), белок, рекомбинантный вектор, трансформант и способ получения композиции жирной кислоты -  патент 2528875 (20.09.2014)
слитый белок тиоредоксина и домена 4 инфестина, способ его получения, экспрессионная плазмидная днк, кодирующая слитый белок, и бактерия рода escherichia coli, трансформированная такой плазмидной днк -  патент 2528251 (10.09.2014)
тест-система для скрининга ингибиторов протеинкиназы gsk3 ; человека -  патент 2528059 (10.09.2014)
рекомбинантный штамм бактерий escherichia coli - продуцент янтарной кислоты (варианты) и способ получения янтарной кислоты с использованием этого штамма -  патент 2528056 (10.09.2014)
проникающие в клетку пептиды и полипептиды для клеток микроорганизмов -  патент 2526511 (20.08.2014)
плазмида 40nagal, определяющая синтез -n-ацетилгалактозаминидазы -alnagal, штамм e.coli rosetta(de3)/40nagal - продуцент химерного белка, включающего аминокислотную последовательность рекомбинантной -n-ацетилгалактозаминидазы -alnagal, и способ ее получения -  патент 2525682 (20.08.2014)
антитело к epha2 -  патент 2525133 (10.08.2014)
штамм бактерий escherichia coli - продуцент рекомбинантного флагеллина -  патент 2524133 (27.07.2014)
Наверх