кормовой продукт и способ лечения расстройств, ассоциированных с избыточной массой животных
Классы МПК:
A23K1/10 из мяса, рыбы, костей; из кухонных отходов A61K31/00 Лекарственные препараты, содержащие органические активные ингредиенты A61P3/04 анорексанты; средства против ожирения
Группа изобретений относится к области кормления животных, а именно к кормовому продукту и способу лечения расстройств и заболеваний, ассоциированных с избыточной массой. Кормовой продукт содержит: от 30 мас.% до 37 мас.% сырого белка из расчета на сухую массу; от 7,5 мас.% до 9 мас.% сырого жира из расчета на сухую массу; от 30 мас.% до 35 мас.% суммарных пищевых волокон из расчета на сухую массу; от 20 мас.% до 25 мас.% сырых волокон из расчета на сухую массу; от 0,1 мас.% до 6 мас.% омега-3 полиненасыщенной жирной кислоты из расчета на сухую массу. Использование кормового продукта в способе лечения расстройств и заболеваний, ассоциированных с ожирением, положительно влияет на потерю массы, а также позволяет сохранить сухую мышечную массу и содержание минеральных веществ в костях. 2 н. и 5 з.п. ф-лы, 2 ил., 6 табл., 5 пр.
Формула изобретения
1. Кормовой продукт для кошек для лечения заболевания или расстройства, ассоциированного с ожирением, содержащий: (a) от 30% масс. до 37% масс. сырого белка из расчета на сухую массу; b) от 7,5% масс. до 9% масс. сырого жира из расчета на сухую массу; (c) от 30% масс. до 35% масс. суммарных пищевых волокон из расчета на сухую массу; (d) от 20% масс. до 25% масс. сырых волокон из расчета на сухую массу; и e) от 0,1% масс. до 6% масс. омега-3 полиненасыщенной жирной кислоты из расчета на сухую массу.
2. Кормовой продукт по п.1, где белок присутствует в количестве от 31% масс. до 36% масс.
3. Кормовой продукт по п.1, где белок присутствует в количестве от 33% до 35%.
4. Кормовой продукт по п.1, где сырой жир присутствует в количестве от 8,0% масс. до 8,5% масс.
5. Кормовой продукт по п.1, где суммарные пищевые волокна присутствуют в количестве от 31% масс. до 34% масс.
6. Кормовой продукт по п.1, где сырые волокна присутствуют в количестве от 21% масс. до 24% масс.
7. Способ лечения заболевания или расстройства, ассоциированного с ожирением, включающий введение кормового продукта по п.1 кошке, нуждающейся в таком лечении.
Описание изобретения к патенту
Область техники, к которой относится изобретение
Изобретение охватывает композиции и способы лечения расстройств и заболеваний, ассоциированных с ожирением. Изобретение также охватывает гены, дифференциально экспрессируемые у животных, и, в частности, относится к генам, которые дифференциально экспрессируются у животных, страдающих ожирением, в сравнении с худыми животными. Изобретение также охватывает композиции и способы модулирования количества жира у животных с помощью целенаправленного питания, которое предназначено для того, чтобы наряду с прочим оказывать влияние на ключевые гены, вовлеченные в метаболизм жиров. В изобретении, кроме того, определены биологически активные компоненты пищи, которые по отдельности или вместе могут влиять на экспрессию и активность ключевых генов, вовлеченных в метаболизм жиров.
Уровень техники
В научных кругах общепринято, что регуляция экспрессии генов играет ключевую роль в развитии некоторых заболеваний или состояний, которые влияют на здоровье и самочувствие животного. Таким же образом, дифференциальная экспрессия генов является одним из факторов развития таких заболеваний и состояний, и оценка картин генной экспрессии признана очень важной для понимания развития и борьбы с такими заболеваниями и состояниями на молекулярном уровне. Для развития представлений о генах и их связи с заболеванием, разработан ряд способов исследования дифференциальной генной экспрессии, например, микроматрицы ДНК, маркерные экспрессируемые последовательности (EST), серийный анализ экспрессии генов (SAGE), вычитающая гибридизация, вычитающее клонирование и дифференциальный дисплей (DD) мРНК, ПЦР с произвольными РНК-праймерами (RAP-PCR), репрезентативный разностный анализ (RDA), двухмерный гель-электрофорез, масс-спектрометрия, обращенно-фазовая белковая матрица и матрицы.
Экспрессию генов у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными совершенно не исследовали. Поэтому существует необходимость в идентификации генов и белков, которые экспрессируются иначе у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными. Такие гены, белки и их фрагменты могут быть использованы для составления прогноза вероятности появлении ожирения у животного, для постановки диагноза ожирения у животного, для скрининга веществ с целью определения того, можно ли их применять для модулирования количества жировой ткани у животного, и для применения таких веществ для модулирования количества жировой ткани у животного.
Животными с избыточной массой можно считать таких животных, которые имеют избыток жировой ткани в организме. Как правило, такие животные, как человек, собаки и кошки, у которых масса превышена более чем на 15% от их идеальной массы тела, считаются тучными. Наиболее общей причиной ожирения животного является чрезмерное потребление пищи, которое приводит к избыточному потреблению калорий. Однако имеются другие факторы, которые могут увеличивать вероятность появления ожирения у животного, например, образ жизни, состояние здоровья, привычки, связанные с питанием, порода, удаление яичников и кастрирование. Также, частота появления избыточной массы у животных, как правило, возрастает с увеличением возраста вследствие общего снижения скорости метаболизма и физической активности. В ходе исследований установлено, что 25% собак в Соединенных Штатах, которые посещают ветеринарные клиники, являются тучными на грани ожирения. Исследования показали, что для животных с избыточной массой значимо выше риск таких заболеваний, как артрит, болезнь сердца, респираторное заболевание, диабет, злокачественная опухоль мочевого пузыря, гипотиреоидизм и панкреатит.
Модулирование количества жировой ткани у животного, включая профилактику появления избыточной массы у животного или лечение животного с избыточной массой, чтобы уменьшить количество жировой ткани у животного, или лечение худого животного, чтобы увеличить количество жировой ткани у животного, является сложным. Увеличение количества жировой ткани у животного обычно вызывается увеличением количества потребляемой пищи. Наиболее эффективным и легким путем профилактики появления избыточной массы у животного или уменьшения количества жира у животного является ограничение пищи и физическая нагрузка. Однако часто трудно гарантировать соблюдение программ питания и физической нагрузки. Другие способы заключаются в применении лекарственных средств, таких как фентермин, фенфлурамин, сибутрамин, орлистат и фенилпропаноламин. К сожалению, при использовании таких лекарственных средств возникают побочные эффекты. Например, введение фенфлурамина и фентермина для лечения ожирения у человека может приводить к повреждению сердечных клапанов у человека. Сибутрамин может увеличивать давление крови, и орлистат может иметь неприятные побочные эффекты в желудочно-кишечном тракте.
Учитывая проблемы, связанные с современными способами, имеющими отношение к жировой ткани животного, авторы изобретения разработали способы и композиции, которые можно использовать для лечения заболеваний и расстройств у животных, и для составления прогноза вероятности появления ожирения у животного, для постановки диагноза ожирения у животного, для скрининга веществ с целью определения того, можно ли их применять для модулирования количества жировой ткани у животного, и для применения таких веществ для модулирования количества жировой ткани у животного.
Сущность изобретения
Изобретение относится к композициям и способам, которые можно использовать для лечения расстройств у домашних животных, нуждающихся в таком лечении.
В одном варианте осуществления изобретение относится к композиции корма для собак, содержащей эффективное количество одного или нескольких ингредиентов, которые препятствуют экспрессии одного или нескольких генов, иначе экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, где указанный один или несколько ингредиентов, которые препятствуют экспрессии одного или нескольких генов, содержат от 26% масс. до 35% масс. сырого белка из расчета на сухую массу, от 7,5% масс. до 8,5% масс. сырого жира из расчета на сухую массу, от 20% масс. до 30% масс. суммарных пищевых волокон из расчета на сухую массу и от 10% масс. до 20% масс. сырых волокон из расчета на сухую массу.
В другом варианте осуществления изобретение относится к композиции корма для кошек, содержащей эффективное количество одного или нескольких ингредиентов, которые препятствуют экспрессии одного или нескольких генов по иному экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, где указанный один или несколько ингредиентов, которые препятствуют экспрессии одного или нескольких генов, содержат: от 30% масс. до 37% масс. сырого белка из расчета на сухую массу, от 7,5% масс. до 9% масс. сырого жира из расчета на сухую массу, от 30% масс. до 35% масс. суммарных пищевых волокон из расчета на сухую массу и от 20% масс. до 25% масс. сырых волокон из расчета на сухую массу.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики резистентности к инсулину у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики панкреатита у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики гипотиреоидизма у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики остеоартрита у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики дислипидемии у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики гипертензии у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики глазных расстройств у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики измененной функции почек у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики респираторного заболевания у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики атеросклероза у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики сахарного диабета у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики заболевания мочевыводящих путей у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики липидоза печени у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики дислипидемиии печени у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики липидоза печени у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики неоплазии у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики заболевания ротовой полости/зубов у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики дерматопатии у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики хромоты у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики гиперлипидемии у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики расстройств метаболизма глюкозы у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления относится к способу лечения или профилактики коронарной болезни у домашнего животного, нуждающегося в таком лечении, например, у собаки или кошки, композицией настоящего изобретения.
Другой вариант осуществления изобретения охватывает один или несколько генов или участков генов, которые иначе экспрессируются у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными.
Другой вариант осуществления изобретения относится к комбинации двух или более полинуклеотидов или полипептидов, которые дифференциально экспрессируются у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными.
Другой вариант осуществления изобретения относится к композициям двух или более полинуклеотидных или полипептидных зондов, подходящих для выявления экспрессии генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, и таким устройствам, как матрицы на подложках, содержащие зонды.
Другой вариант осуществления изобретения относится к способам и композициям для выявления в образце дифференциальной экспрессии одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными.
Другой вариант осуществления изобретения относится к способам измерения влияния тестируемого вещества на профиль экспрессии одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в качестве способа скрининга тестируемого вещества с целью определения вероятной применимости такого вещества для модулирования количества жировой ткани у животного.
Другой вариант осуществления изобретения относится к способам составления прогноза возможного появления избыточной массы у животного или постановки диагноза наличия ожирения у животного.
Другой вариант осуществления изобретения относится к способам и композициям для модулирования экспрессии одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, или для модулирования количества жировой ткани у животного.
Один или несколько таких вариантов осуществления достигаются при использовании новых комбинаций 433 полинуклеотидных зондов, представляющих гены и участки генов, которые дифференциально экспрессируются в жировой ткани животных с избыточной массой по сравнению с жировой тканью худых животных (таблица 1). Кроме того, один или несколько таких вариантов осуществления достигаются при использовании новых комбинаций 1703 полинуклеотидных зондов, представляющих гены и участки генов, которые дифференциально экспрессируются в лимфоцитах, взятых от животных с избыточной массой, по сравнению с лимфоцитами, взятыми от худых животных (таблица 2). Кроме того, один или несколько таких вариантов осуществления достигаются при использовании новых комбинаций полинуклеотидных зондов, представляющих гены и участки генов, которые дифференциально экспрессируются у собак с избыточной массой и худых собак, и которые считаются ключевыми генами метаболизма жирных кислот (таблица 3). Полинуклеотиды используют для получения композиций, зондов, устройств, основанных на таких зондах, и в способах определения статуса полинуклеотидов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, используемых для достижения указанных выше целей, например для прогнозирования и диагностики состояний, связанных с жировой тканью животного, и для скрининга веществ с целью определения их возможной применимости для модулирования количества жировой ткани у животного. Такие вещества после идентификации можно использовать для модулирования количества жировой ткани у животного. Также предлагаются различные наборы, содержащие комбинации зондов, устройства, в которых используются такие зонды, и вещества.
Также один из вариантов осуществления настоящего изобретения относится к способам модулирования количества жировой ткани у животного in vivo путем введения композиции настоящего изобретения, которая, как показано, модулирует экспрессию генов, вовлеченных в метаболизм жиров.
Также вариант осуществления изобретения относится к модулированию различных биомаркеров собак, связанных с ожирением, посредством введения композиции настоящего изобретения животному, нуждающемуся в таком модулировании, в количестве, эффективном для модулирования биомаркера. Примерами биомаркеров, связанных с ожирением, которые можно модулировать, являются, но без ограничения, глюкоза, инсулин, GLP-1, IGF-1, холестерин, триглицериды, ЛПНП, хиломикроны, щелочная фосфатаза, синтез хряща типа-2, лептин, грелин и их комбинации.
Другие и дополнительные цели, признаки и преимущества настоящего изобретения будут легко понятны специалистам в данной области.
Краткое описание фигур
На фиг.1 показан результат потери массы у собак, которых кормили композицией состава настоящего изобретения, по сравнению с потерей массы при кормлении контрольным составом.
На фиг.2 показан сдвиг профиля генов у собак с ожирением, которых кормили композицией состава настоящего изобретения, по сравнению с худыми собаками.
Подробное описание изобретения
Определения
Термин «животное» означает человека или другое животное, включая птиц, коров, собак, лошадей, кошек, коз, мышей, овец и свиней, которые имеют жировую ткань. Когда термин используют в контексте сравнения животных с избыточной массой с худыми животными, то животные, которых сравнивают, являются животными одного и того же вида и по возможности одной и той же расы или породы. В предпочтительных вариантах осуществления животным является собака или кошка, наиболее предпочтительно собака.
Термин «антитело» означает любой иммуноглобулин, который связывает специфический антиген, включая антитела IgG, IgM, IgA, IgD и IgE. Термин включает поликлональные, моноклональные, моновалентные, гуманизированные, гетероконьюгаты, композиции антител с полиэпитопной специфичностью, химерные, биспецифичные антитела, диантитела, одноцепочечные антитела и фрагменты антител, такие как Fab, Fab', F(ab')2 и Fv, или другие антигенсвязывающие фрагменты.
Термин «матрица» означает упорядоченное расположение по меньшей мере двух зондов на подложке. По меньшей мере один из зондов является контрольным или стандартным и по меньшей мере один из зондов является диагностическим зондом. Расположение двух или более зондов (в настоящее время существуют матрицы, чипы и другие основания, которые превышают 40000 зондов) на подложке гарантирует, что размер и интенсивность сигнала каждого меченого комплекса, образованного между зондом и полинуклеотидом или полипептидом в образце, можно по-отдельности отличать.
Термин «оценка упитанности тела» (BCS) означает способ анализа состава тела на основе размера и формы тела животного. Специалистам в данной области известно несколько способов, например, способы, описанные в патенте США 6691639 и в публикации, озаглавленной «Small Animal Clinical Nutrition», 4th Edition, в главе 13 (ISBN 0-945837-05-4).
Термин «индекс массы тела» (ИМТ) означает массу животного (в килограммах), разделенную на его рост (в метрах) в квадрате.
Термин «DEXA» означает двухэнергетическую рентгеновскую абсорциометрию для анализа состава тела.
Термин «дифференциальная экспрессия» или «дифференциально экспрессируемый» означает повышенную экспрессию генов или повышающую регуляцию экспрессии генов или означает пониженную экспрессию генов или понижающую регуляцию экспрессии генов, которые выявляют по отсутствию, наличию или по меньшей мере 1,3-кратному изменению количества транскрибируемой матричной РНК или транслированного белка в образце.
Термин «тучный» применимо к животному означает любое животное, у которого определяют наличие избыточного количества жировой ткани в организме, или животное, у которого определяют склонность к развитию избыточного количества жировой ткани в организме с использованием методик и способов, известных медицинским работникам и другим специалистам в данной области. Животное является склонным к приобретению избыточной массы, если животное имеет склонность или более высокую вероятность развития избыточной жировой ткани по сравнению со средним животным в общей популяции. Обычно, но без ограничения, считают, что животное имеет избыточную массу, если (1) животное имеет ИМТ 25 или больше (число, которое, как полагают, включает «избыточную массу» и «ожирение» в некоторых способах характеристики состояний животных), (2) масса животного на 15% или больше превышает его «идеальную» массу тела, что определено работниками здравоохранения или подобными специалистами в данной области, (3) процентное содержание жира в организме животного составляет 27% или больше на основании определения с использованием DEXA, или (4) животное имеет оценку упитанности тела больше 3, которая определена специалистами с использованием способа, описанного в «Small Animal Clinical Nutrition», 4th Edition, в главе 13 (ISBN 0-945837-05-4), или эквивалентно другим используемым способам определения BCS.
Термин «ассоциированные с ожирением гены» означает все или подгруппу генов, указанных в таблицах 1 и 2, в частности гены, представленные последовательностями 433 зондов, которые дифференциально экспрессируются в жировой ткани, взятой от животных с избыточной массой, и в жировой ткани, взятых от худых животных, а также гены, представленные 1703 последовательностями зондов, которые дифференциально экспрессируются в лимфоцитах, взятых от животных с избыточной массой, и в лимфоцитах, взятых от худых животных.
Термин «ключевые гены» означает все или подгруппу генов, указанных в таблице 3.
Термин «кратный» при использовании в качестве меры дифференциальной экспрессии генов означает количество генной экспрессии у животного, которое является многократным или составляет долю от генной экспрессии при сравнении с количеством генной экспрессии у используемого для сравнения животного, например, у животных с избыточной массой по сравнению с худым животным. Например, ген, который экспрессируется в три раза больше у данного животного, чем у используемого для сравнения животного, имеет 3-кратную дифференциальную экспрессию гена, и говорят, что ген подвергается повышающей регуляции. С другой стороны, ген, экспрессия которого у данного животного составляет одну треть от экспрессии у используемого для сравнения животного, также имеет 3-кратную дифференциальную генную экспрессию, и говорят, что ген подвергается понижающей регуляции.
Термин «фрагмент» означает (1) олигонуклеотидную или полинуклеотидную последовательность, которая составляет часть полной последовательности, и которая обладает такой же или сходной активностью для конкретного применения, как и полная полинуклеотидная последовательность, или (2) пептидную или полипептидную последовательность, которая составляет часть полной последовательности, и которая обладает такой же или сходной активностью для конкретного применения, как и полная полипептидная последовательность. Такие фрагменты могут содержать любое количество нуклеотидов или аминокислот, которое, как считают, является подходящим для конкретного применения. Как правило, олигонуклеотидные или полинуклеотидные фрагменты содержат по меньшей мере 10, 50, 100 или 1000 нуклеотидов, и полипептидные фрагменты содержат по меньшей мере 4, 10, 20 или 50 следующих друг за другом аминокислот из полной последовательности. Термин охватывает полинуклеотидные и полипептидные варианты таких фрагментов.
Термин «ген» или «гены» означает полный или частичный участок ДНК, вовлеченный в продуцирование полипептида, включая области, предшествующие и следующие за кодирующей областью (лидер и концевой участок), и вставочные последовательности (интроны) между отдельными кодирующими участками (экзонами). Термин охватывает любую последовательность ДНК, которая гибридизуется с комплементом кодирующих последовательностей гена.
Термин «гены дифференциально экспрессируемые у животных с избыточной массой» означает гены, количество экспрессируемой мРНК которых или количество генного продукта, транслируемого с мРНК, явно отличается, является либо больше, либо меньше, в ткани животных с избыточной массой тела по сравнению с худыми животными.
Термин «гомолог» означает (1) полинуклеотид, включая полинуклеотиды того же или другого вида животного, имеющий сходство последовательностей, составляющее более 30%, 50%, 70% или 90% с полинуклеотидом, указанным в таблицах 1, 2, 3 и 5, и обладающий такими же или по существу такими же свойствами и осуществляющий такую же или по существу такую же функцию, как и полный полинуклеотид, или обладающий способностью специфически гибридизоваться с полинуклеотидом, указанным в таблицах 1, 2, 3 и 5 в жестких условиях; или (2) полипептид, включая полипептиды того же или другого вида животного, имеющий сходство последовательностей, составляющее более 30%, 50%, 70% или 90% с полипептидом, идентифицированным по экспрессии полинуклеотидов, указанных в таблицах 1, 2, 3 и 5, и обладающий такими же или по существу такими же свойствами и осуществляющий такую же или по существу такую же функцию, как и полный полипептид, или обладающий способностью специфически связываться с полипептидом, идентифицированным по экспрессии полинуклеотидов, указанных в таблицах 1, 2, 3 и 5. Сходство последовательностей двух полипептидных последовательностей или двух полинуклеотидных последовательностей определяют, используя способы, известные специалистам в данной области, например алгоритм Karlin и Altschul (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87: 2264-2268 (1990)). Такой алгоритм включен в программы NBLAST и XBLAST Altschul et al., (J. Mol. Biol. 215: 403-410 (1990)). Чтобы получить выравнивание с пробелами для сравнения, можно использовать программу Gapped Blast, как описано у Altschul et al., в (Nucl. Acids Res. 25: 3389-3402 (1997)). При использовании программ BLAST и Gapped BLAST применяют параметры соответствующих программ по умолчанию (например, XBLAST и NBLAST). См. .
Термин «комплекс гибридизации» означает комплекс, который образуется между полинуклеотидами в образце, когда пурины одного полинуклеотида связываются водородной связью с пиримидинами комплементарного полинуклеотида, например, 5'-A-G-T-C-3' образует пары оснований с 3'-T-C-A-G-5'. Степень комплементарности и использование аналогов нуклеотидов влияет на эффективность и жесткость реакций гибридизации.
Термин «совместно с» означает, что лекарственное средство, пищевое или другое вещество вводят животному (1) вместе в композиции, в частности, пищевой композиции, или (2) отдельно с одинаковой или разной частотой, используя одинаковые или различные пути введения, в одно и то же время или периодически. «Периодически» означает, что вещество вводят по схеме дозирования, приемлемой для конкретного вещества, «одно и то же время» обычно означает, что вещества (пищу или лекарственное средство) вводят одновременно или с интервалом в пределах 72 часов друг от друга. Термин «совместно с» специально включает схемы введения, согласно которым вещества, такие как лекарственные средства, вводят в течение предписанного периода времени, и композиции настоящего изобретения вводят нечетко ограниченно.
Термин «худое», который применяют по отношению к животному, означает любое животное, которое не имеет избыточной массы, судя по определению с использованием методик и способов, известных специалистам, обеспечивающим медицинское обслуживание, и другим специалистам, имеющим отношение к данной области. Обычно, не ограничивая определения, животное считают худым, если (1) животное имеет ИМТ меньше 25 или (2) масса животного на 15% или более меньше его «идеальной» массы тела, что определено специалистами, обеспечивающими медицинское обслуживание, или специалистами, имеющими отношение к данной области, (3) процентное содержание жира в организме животного составляет меньше 27%, как определено DEXA, или (4) животное имеет оценку упитанности тела 3 или меньше, как определено специалистами с использованием способа, описанного в «Small Animal Clinical Nutrition», 4th Edition, в главе 13 (ISBN 0-945837-05-4), или эквивалентно с использованием других способов определения BCS.
Термин «модулирование количества жировой ткани у животного» означает вызывание у животного потери жировой ткани, вызывание у животного увеличения жировой ткани или вызывание у животного сохранения количества жировой ткани, если животное склонно к увеличению или потере жировой ткани. Таким образом, модулирование количества жировой ткани у животного охватывает профилактику возникновения у худого животного избыточной массы и лечение животного с избыточной массой, чтобы снизить количество жировой ткани у животного, а также лечение худого животного, чтобы увеличить количество жировой ткани в соответствующих случаях, например, в случае лечения худого животного, у которого, как определено специалистами, такой недостаток массы, что требуется увеличение жировой ткани. Можно использовать обычные способы, чтобы оценить количество жировой ткани у животного, а также определить мышечную массу худого животного и/или содержание минеральных веществ в костях, информацию, которая может иметь значение для такой оценки.
Термин «полинуклеотид» или «олигонуклеотид» означает полимер из нуклеотидов. Термин охватывает молекулы ДНК и РНК (включая кДНК и мРНК), либо однонитевые, либо двунитевые, и если они являются однонитевыми, то их комплементарную последовательность в линейной или кольцевой форме. Термин также охватывает фрагменты, варианты, гомологи и аллели, которые соответствуют последовательностям, которые обладают такими же или по существу такими же свойствами и выполняют такую же или по существу такую же функцию, как и исходная последовательность. Последовательности могут быть полностью комплементарными (без ошибочных спариваний) при выравнивании или могут иметь до 30% несовпадений последовательностей. Предпочтительно в случае полинуклеотидов цепь содержит от 50 до 10000 нуклеотидов, более предпочтительно от 150 до 3500 нуклеотидов. Предпочтительно в случае олигонуклеотидов цепь содержит от 2 до 100 нуклеотидов, более предпочтительно от 6 до 30 нуклеотидов. Точный размер полинуклеотида или олигонуклеотида будет зависеть от разных факторов и от конкретного применения и использования полинуклеотида или олигонуклеотида. Термин включает нуклеотидные полимеры, которые синтезируют и которые выделяют и очищают из природных источников. Термин «полинуклеотид» включает «олигонуклеотид».
Термин «полипептид», «пептид» или «белок» означает полимер, состоящий из аминокислот. Термин охватывает встречающиеся в природе и не встречающиеся в природе (синтетические) полимеры и полимеры, в которых одна или несколько аминокислот заменены искусственными химическими миметиками. Термин также охватывает фрагменты, варианты и гомологи, которые обладают такими же или по существу такими же свойствами и выполняют такую же или по существу такую же функцию, как и исходная последовательность. Термин охватывает полимеры любой длины, предпочтительно полимеры, содержащие от 2 до 1000 аминокислот, более предпочтительно от 5 до 500 аминокислот. Термин включает полимеры из аминокислот, которые синтезируют и которые выделяют и очищают из природных источников.
Термин «зонд» означает (1) олигонуклеотид или полинуклеотид, либо РНК, либо ДНК, либо встречающийся в природе, как в очищенном продукте расщепления ферментами рестрикции, либо полученный синтетически, который способен к отжигу или специфической гибридизации с полинуклеотидом с последовательностями, комплементарными зонду, или (2) пептид или полипептид, способный специфически связывать конкретный белок или белковый фрагмент, по существу, исключая другие белки или белковые фрагменты. Олигонуклеотидный или полинуклеотидный зонд может быть либо однонитевым, либо двунитевым. Точная длина зонда будет зависеть от многих факторов, включая температуру, источник и применение. Например, для диагностических применений в зависимости от сложности последовательности-мишени олигонуклеотидный зонд обычно содержит 10-100, 15-50 или 15-25 нуклеотидов. В случае некоторых диагностических применений полинуклеотидный зонд содержит 100-1000, 300-600 нуклеотидов, предпочтительно 300 нуклеотидов. Зонды в данном случае выбирают так, чтобы они были «по существу» комплементарными разным нитям конкретной последовательности-мишени. Это значит, что зонды должны быть в достаточной степени комплементарными, чтобы специфически гибридизоваться или отжигаться с соответствующими последовательностями-мишенями в предварительно определенных условиях. Следовательно, последовательность зонда не должна точно отражать комплементарную последовательность мишени. Например, некомплементарный нуклеотидный фрагмент может быть связан с 5'- или 3'-концом зонда, при этом остальная часть последовательности зонда является комплементарной последовательности-мишени. Альтернативно, некомплементарные основания или более длинные последовательности могут быть рассеяны по зонду, при условии, что последовательность зонда имеет достаточную комплементарность с последовательностью полинуклеотида-мишени для специфического отжига с полинуклеотидом-мишенью. Пептидный или полипептидный зонд может представлять собой любую молекулу, с которой белок или пептид специфически связывается, включая ДНК (в случае ДНК-связывающих белков), антитела, рецепторы клеточных мембран, пептиды, кофакторы, лектины, сахара, полисахариды, клетки, клеточные мембраны, органеллы и мембраны органелл.
Термин «образец» означает любую ткань или жидкость животного, содержащую, например, полинуклеотиды, полипептиды, антитела, метаболиты и тому подобное, включая клетки и другую ткань, содержащую ДНК и РНК. Примерами являются жировая ткань, кровь, хрящ, соединительная, эпителиальная, лимфоидная, мышечная, нервная ткань, слюна и тому подобное. Образец может быть твердым или жидким и может представлять собой ДНК, РНК, кДНК, жидкости организма, такие как кровь или моча, клетки, клеточные препараты или растворимые фракции или аликвоты их сред, хромосомы, органеллы и тому подобное.
Термин «отдельная упаковка» означает, что компоненты набора физически ассоциированы в одном или нескольких или с одним или несколькими контейнерами и считаются единицей производства, распространения, продажи или применения. Контейнеры представляют собой, но без ограничения, пакеты, коробки, бутылки, упаковку в термоусадочной пленке, скрепленные скобками или иным образом скрепленные компоненты или их комбинации. Отдельная упаковка может представлять собой контейнеры с отдельными пищевыми композициями, физически ассоциированными так, что они считаются единицей производства, распространения, продажи или применения.
Термин «применимые вариации» означает (1) в случае полинуклеотида комплементы полинуклеотида; гомологи полинуклеотида и их комплементы; варианты полинуклеотида, их комплементы и их гомологи; и фрагменты полинуклеотида, их комплементы, их гомологи и их варианты и (2) в случае полипептида гомологи полипептида; варианты полипептида и их гомологи; и фрагменты полипептида, их гомологи и их варианты.
Термин «виртуальная упаковка» означает, что компоненты снабжены инструкциями, относящимися к одному или нескольким физическим или виртуальным компонентам набора, информирующими пользователя о том, как получить другие компоненты, например, в пакете, содержащем один компонент, и инструкции, информирующие пользователя о необходимости знакомства с Интернет-сайтом, знакомства с записанным сообщением, просмотра визуального сообщения или обращения к лицу, осуществляющему уход за больным, или инструктору для получения инструкций о том, каким образом пользоваться набором.
Термин «стандарт» означает (1) контрольный образец, который содержит ткань худого животного, если исследованию подвергают животное с избыточной массой, или ткань животного с избыточной массой, если исследованию подвергают худое животное, или (2) контрольный образец, который содержит ткань подвергаемого исследованию худого животного или животного с избыточной массой, которое не было подвергнуто воздействию тестируемого вещества, исследуемого в соответствующем худом животном или животном с избыточной массой, чтобы определить, вызывает ли тестируемое вещество дифференциальную экспрессию генов, которая является подходящей в контексте его применения.
Термин «жесткие условия» означает (1) гибридизацию в 50% (об./об.) формамиде с 0,1% бычьего сывороточного альбумина, 0,1% фикола, 0,1% поливинилпирролидона, 50 мМ натрий-фосфатного буфера, pH 6,5, содержащего 750 мМ NaCl, 75 мМ цитрат натрия, при 42°C, (2) гибридизацию в растворе, содержащем 50% формамида, 5× SSC (0,75М NaCl, 0,075М цитрата натрия), 50 мМ фосфат натрия (pH 6,8), 0,1% пирофосфат натрия, 5× раствор Денхардта, обработанную ультразвуком ДНК спермы лосося (50 мкг/мл), 0,1% SDS и 10% сульфат декстрана, при 42°C; с промывками при 42°C в 0,2× SSC и 0,1% SDS или промывками в 0,015М NaCl, 0,0015М цитрате натрия, 0,1% Na2SO4 при 50°C, или сходные способы с использованием сходной низкой ионной силы и средств для промывки при высокой температуре и сходных денатурирующих средств.
Термин «вещество» означает элемент, соединение, молекулу или их смесь или любое другое вещество, которое потенциально может быть использовано для диагностики, прогноза или модулирования количества жировой ткани у животных, включая любое лекарственное средство, химический объект или биологический объект.
Термин «миРНК» означает полинуклеотид, который образует двунитевую РНК, которая снижает или ингибирует экспрессию гена, когда миРНК экспрессируется в той же клетке, что и ген. Термин охватывает двунитевую РНК, образованную комплементарными нитями. Комплементарные части миРНК, которые гибридизуются с образованием двунитевой молекулы, обычно имеют существенную или полную идентичность. Обычно миРНК содержит по меньшей мере 15-50 нуклеотидов, и двунитевая миРНК содержит 15-50 пар оснований, предпочтительно 20-30 нуклеотидов и пар оснований.
Термин «специфически связывает» означает особое и точное взаимодействие между двумя молекулами, которое зависит от их структуры, в частности, от боковых групп молекулы. Например, интеркаляция регуляторного белка в главную бороздку молекулы ДНК, образование водородных связей вдоль остова между двумя однонитевыми нуклеиновыми кислотами или связывание между эпитопом белка и агонистом, антагонистом или антителом.
Термин «специфически гибридизоваться» означает ассоциацию между двумя однонитевыми полинуклеотидами с достаточной комплементарностью последовательностей для того, чтобы осуществить такую гибридизацию в предварительно определенных условиях, обычно используемых в данной области (иногда называемых «комплементарными в значительной степени»). Например, термин может относиться к гибридизации полинуклеотидного зонда с последовательностью, комплементарной ему в значительной степени, находящейся в однонитевой молекуле ДНК или РНК согласно одному аспекту настоящего изобретения, по существу, при исключении гибридизации полинуклеотидного зонда с однонитевыми полинуклеотидами некомплементарной последовательности.
Термин «вариант» означает (1) полинуклеотидную последовательность, содержащую любую замену, изменение, модификацию, перестановку, делецию или добавление одного или нескольких нуклеотидов в полинуклеотидной последовательности, и которая обладает такими же или по существу такими же свойствами и осуществляет такую же или по существу такую же функцию, как и исходная последовательность; и (2) полипептидную последовательность, содержащую любую замену, изменение, модификацию, перестановку, делецию или добавление одной или нескольких аминокислот в полипептидной последовательности, и которая обладает такими же или по существу такими же свойствами и осуществляет такую же или по существу такую же функцию, как и исходная последовательность. Таким образом, термин включает однонуклеотидный полиморфизм (SNP) и аллельные варианты и включает консервативные и неконсервативные аминокислотные замены в полипептидах. Термин также в соответствующих случаях охватывает химическое образование производных полинуклеотида или полипептида и замену нуклеотидов или аминокислот нуклеотидами или аминокислотами, которые не встречаются в природе.
Изобретение не ограничено конкретной методикой, протоколами и реагентами, описанными в настоящем описании, так как они могут варьировать. Кроме того, терминология, используемая в настоящем описании, использована только в целях описания конкретных вариантов осуществления и не предназначена для ограничения объема настоящего изобретения. В используемом в настоящем описании и в прилагаемой формуле изобретения смысле формы единственного числа включают указание и на множественное число, если контекст ясно не указывает иное, например, указание «вариант» включает множество вариантов. Кроме того, определенные термины включают изменения терминов, используемые в правильном грамматическом контексте, например, термин «специфически связывает» включает «специфическое связывание» и другие формы термина. Подобным образом, слова «содержат», «содержит» и «содержащий» необходимо интерпретировать включительно, а не исключительно.
Если не указано иное, все технические и научные термины и любые акронимы, используемые в настоящем описании, имеют такое же значение, которое обычно понимают специалисты в области, к которой относится изобретение. Хотя при практическом осуществлении настоящего изобретения можно использовать любые композиции, способы, изделия производства или другие средства или вещества, сходные или эквивалентные тем, которые описаны в настоящем описании, описаны и предпочтительные композиции, способы, изделия производства или другие средства или вещества.
Все патенты, патентные заявки, публикации и другие ссылки, цитированные или указанные в данном описании, включены в настоящее описание в рамках, определяемых законодательством. Обсуждение таких публикаций предназначено только для суммирования приведенных в них данных. Не допускается, чтобы любые такие патенты, патентные заявки, публикации или ссылки или любая их часть, считались как относящиеся к прототипу настоящего изобретения и в частности сохраняется право на сомнение в отношении правильности и значимости таких патентов, патентных заявок, публикаций и других ссылок.
Модулирование генной экспрессии белка
В одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к одному или нескольким генам или участкам генов («гены» имеют значение, определенное в настоящем описании), которые дифференциально экспрессируются в жировой ткани и/или лимфоцитах животных с избыточной массой по сравнению с жировой тканью и/или лимфоцитами худых животных. Изобретение основано на открытии того, что дифференциально экспрессируемые гены, которые представлены 445 полинуклеотидами в жировой ткани животных с избыточной массой по сравнению с жировой тканью худых животных и 1767 полинуклеотидами в лимфоцитах, взятых у животных с избыточной массой, по сравнению с лимфоцитами, взятыми у худых животных. Кроме того, изобретение основано на идентификации 7 ключевых генов, вовлеченных в метаболизм жирных кислот, которые дифференциально экспрессируются у животных с избыточной массой и худых животных, которые перечислены в таблице 3. Такие ключевые гены представляют членов семейства киназы пируватдегидрогеназы, семейства карнитинпальмитоилтрансферазы и семейства растворимых переносчиков 27 (переносчики жирных кислот) и гены, ассоциированные с элонгацией длинноцепочечных жирных кислот, при этом семейство киназ пируватдегидрогеназы и семейство карнитинпальмитоилтрансферазы являются наиболее важными и в некоторых случаях ограничивающими скорость ферментами. Гены идентифицировали путем сравнения экспрессии генов в жировой ткани и лимфоцитах, взятых от животных, у которых диагностировано наличие избыточной массы, с генами в жировой ткани и лимфоцитах от животных, которые диагностированы как худые с использованием методики Affymetrix GcneChip®. Полинуклеотиды показаны в таблице 1, 2 и 3. В таблицах представлена информация об идентификационном номере зонда Affymetrix (в настоящем описании «APIN»), p-значение, q-значение, кратная экспрессия (тучные/худые), верхняя аннотация BLAST к данному зонду, номер доступа наилучшего совпадения BLAST, символ гена и, наконец, в последней колонке приведено описание гена. Описание предполагаемого или реального гена может быть в некоторых случаях получено из базы данных BLAST с использованием способов, известных специалистам в данной области. Как правило, функцию предполагаемого или реального гена определяют посредством (1) идентификации APIN для каждого гена, который имеет 1,3-кратную или более высокую генную экспрессию у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, (2) определения нуклеотидной последовательности каждого такого гена путем ввода APIN в общедоступную базу данных Affymetrix, которая соотносит номера AIPN с последовательностями, и (3) ввода нуклеотидной последовательности в базу данных BLAST, предоставленную Национальными институтами здравоохранения, и определения функции предполагаемого или реального гена на основе совпадений полученной последовательности с гомологичными последовательностями в базе данных.
Полинуклеотиды и гены идентифицируют, измеряя различия между генной экспрессией в жировой ткани и лимфоцитах собак, у которых диагностирована избыточная масса, и генной экспрессией в жировой ткани и лимфоцитах собак, которые диагностированы как худые. Изменения в генной экспрессии могут быть определены любым способом, известным специалистам в данной области. Как правило, изменения в генной экспрессии определяют путем измерения транскрипции (определения количества мРНК, продуцируемой геном) или измерения трансляции (определения количества белка, продуцируемого геном). Количество РНК или белка, продуцируемых геном, может быть определено с использованием любого способа, известного специалистам в данной области, предназначенного для количественной оценки полинуклеотидов и белков. Как правило, экспрессию РНК определяют с использованием способов, включая, но без ограничения, полимеразную цепную реакцию (ПЦР) (включая, но без ограничения, ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) и количественную ПЦР в режиме реального времени PCR (кПЦР)), защиту от РНКаз, нозерн-блоттинг и другие способы гибридизации. Измеряемая РНК обычно имеет форму мРНК или обратно транскрибированной мРНК или комплементарной ДНК (кДНК). Экспрессию белка или полипептида определяют, используя различные колориметрические, флуоресцентные и спектроскопические анализы и способы, включая, но без ограничения, вестерн-блоттинг, ELISA, мониторинг множественных реакций, обращенно-фазовые матрицы и матрицы антител. В предпочтительном способе изменения в генной экспрессии определяют, используя чипы GeneChip® Affymetrix Canine-1 и Canine-2, которые можно приобрести у Affymetrix, Inc., и инструкции по применению таких чипов для определения генной экспрессии.
Обычно, дифференциальную экспрессию генов у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными определяют посредством измерения экспрессии по меньшей мере одного гена. Предпочтительно измеряют экспрессию двух или более дифференциально экспрессируемых генов, чтобы получить картину генной экспрессии или профиль генной экспрессии. Более предпочтительно измеряют экспрессию множества дифференциально экспрессируемых генов.
Полинуклеотиды, гены, белки, кодируемые полинуклеотидами и генами, и комплементы, гомологи, варианты или фрагменты, основанные на таких последовательностях, могут быть использованы в различных прогностических и диагностических анализах, относящихся к количеству жировой ткани у животного, и для скрининга тестируемых веществ для определения того, могут ли быть полезны данные вещества для модулирования количества жировой ткани у животного. Другие применения будут понятны из описания настоящего изобретения.
В другом аспекте изобретение относится к комбинации двух или более полинуклеотидов, которые дифференциально экспрессируются у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, или двух или более белков, продуцируемых в результате экспрессии двух или более полинуклеотидов, которые дифференциально экспрессируются у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными. В одном варианте осуществления комбинация включает два или более полинуклеотидов или белков, экспрессированных из полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3. Предпочтительно комбинации включают множество полинуклеотидов или белков, экспрессированных из полинуклеотидов, указанных в таблицах 1 и 2, и предпочтительно в таблице 3, обычно 10, 20, 50, 100, 200 или более полинуклеотидов или белков, в соответствии с конкретной группой и применением. Когда в комбинацию входит один или несколько фрагментов, фрагменты могут представлять собой фрагменты любого размера, которые сохраняют свойства и функцию исходного полинуклеотида или белка, предпочтительно 30%, 60% или 90% от исходных. Полинуклеотиды и белки могут быть из любого животного, предпочтительно собаки и кошки, наиболее предпочтительно собаки.
В другом аспекте изобретение относится к композиции, содержащей два или более олигонуклеотидных или полинуклеотидных зондов, подходящих для выявления экспрессии генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными. В одном варианте осуществления зонды содержат полинуклеотиды, выбранные из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3. В другом случае зонды содержат применимые варианты таких полинуклеотидов. Зонды содержат достаточное количество нуклеотидов, чтобы специфически гибридизоваться, по существу исключительно с соответствующими комплементарными полинуклеотидами. В некоторых вариантах осуществления зонды содержат по меньшей мере 10, 15, 20, 25 или 30 нуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления зонды содержат больше нуклеотидов и содержат по меньшей мере 30, 50, 70, 90 или 100 нуклеотидов или более. Зонды могут содержать полноразмерные функциональные гены настоящего изобретения. Предпочтительно композиция содержит множество полинуклеотидных зондов, подходящих для выявления генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, обычно 10, 50, 200, 500, 1000 или 2000 или более зондов. Полинуклеотидные зонды создают или получают, используя способы, известные специалистам в данной области, например, синтез in vitro из нуклеотидов, выделение и очистка из природных источников или ферментативное расщепление генов настоящего изобретения.
В другом аспекте изобретение относится к устройству, подходящему для выявления экспрессии множества генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными. Устройство содержит подложку, имеющую множество олигонуклеотидных или полинуклеотидных зондов настоящего изобретения, прикрепленных к подложке в определенных известных местах. Устройство по существу представляет собой иммобилизованный вариант олигонуклеотидных или полинуклеотидных зондов, описанных в настоящем описании. Устройство может быть использовано для быстрого и специфического выявления генов и полинуклеотидов и картин и профилей их экспрессии. Обычно такие зонды связаны с подложкой или сходной твердой основой, и образец, содержащий один или несколько полинуклеотидов (например, ген, продукт ПЦР, продукт лигазной цепной реакции (LCR), последовательность ДНК, которая была синтезирована с использованием методики амплификации или их смесь) подвергают воздействию зондов таким образом, чтобы полинуклеотид или полинуклеотиды в образце могли гибридизоваться с зондами. Либо зонды, либо полинуклеотид(ды) в образце, либо и то и другое метят, обычно флуорофором или другой меткой, такой как стрептавидин, и выявляют с использованием способов, известных специалистам в данной области. Если в образце метят полинуклеотиды, то гибридизация может быть выявлена путем регистрации связанной флуоресценции. Если метят зонды, то гибридизацию обычно выявляют по гашению метки. Если в образце метят как зонд, так и полинуклеотид(ды), то гибридизацию обычно выявляют путем мониторинга сдвига окраски в результате близости двух связанных меток. Множество методик мечения и меток известно специалистам в данной области, в частности, флуоресцирующих меток. Предпочтительно зонды иммобилизуют на подложках, подходящих для создания матрицы (известной под разными названиями, включая микроматрицу ДНК, генный чип, биочип, ДНК-чип и генную матрицу), сравнимой с матрицами, известными в данной области.
В другом аспекте изобретение относится к композиции, содержащей два или более пептидных или полипептидных зондов, подходящих для выявления экспрессии генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными. В одном варианте осуществления зонды содержат пептиды или полипептиды, которые специфически связываются с белками, продуцируемыми в результате экспрессии одного или нескольких полинуклеотидов, содержащих последовательности, выбранные из таблиц 1 и 2. В другом случае зонды содержат пептиды или полипептиды, которые специфически связываются с белками, продуцируемыми в результате экспрессии одного или нескольких полинуклеотидов, содержащих последовательности, выбранные из таблицы 3. В другом случае зонды содержат пептиды или полипептиды, которые специфически связываются с белками, продуцируемыми в результате экспрессии одного или нескольких применимых вариантов таких полипептидов. Зонды содержат достаточное количество аминокислот для специфического связывания с соответствующими полипептидами. Предпочтительно зонды содержат по меньшей мере 4, 10, 20, 40 или 80 аминокислот. В некоторых вариантах осуществления зонды содержат несколько аминокислот и содержат по меньшей мере 100 или более аминокислот. Зонды могут содержать полноразмерные функциональные белки, полученные в результате экспрессии полноразмерных функциональных генов, идентифицированных настоящим изобретением. Предпочтительно изобретение относится к множеству полипептидных зондов, подходящих для выявления генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, более предпочтительно к совокупности 10, 50, 100, 500 или 1000 или более таких зондов. В одном варианте осуществления зонды представляют собой антитела, предпочтительно моноклональные антитела.
Полипептидные зонды могут быть получены согласно обычным способам, например, с использованием данных о нуклеотидных последовательностях, полученных для полинуклеотидов настоящего изобретения, и способов, известных в данной области. Такие способы включают, но без ограничения, выделение полипептида непосредственно из клеток, выделение или синтез ДНК или РНК, кодирующей полипептиды, и использованием ДНК или РНК для получения рекомбинантных продуктов, химический синтез полипептидов из отдельных аминокислот и получение полипептидных фрагментов химическим расщеплением существующих полипептидов.
В другом аспекте изобретение относится к устройству, подходящему для выявления экспрессии множества генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными. Устройство содержит подложку, имеющую множество пептидных или полипептидных зондов настоящего изобретения, прикрепленных к подложке в определенных известных местах. Устройство по существу представляет собой иммобилизованный вариант пептидных или полипептидных зондов, описанных в настоящем описании. Устройство может быть использовано для быстрого и специфического выявления белков и картин их экспрессии. Обычно такие зонды связаны с подложкой, и образец, содержащий один или несколько белков, подвергают воздействию зондов таким образом, чтобы белки в образце могли гибридизоваться с зондами. В некоторых вариантах осуществления либо зонды, либо белки в образце, либо и то и другое метят и выявляют, обычно используя флуорофор или другое средство, известное специалистам в данной области. Как правило, некоторые способы и измерительные устройства, используемые для регистрации полинуклеотидных микроматриц, применяют к белковым матрицам. Предпочтительно зонды иммобилизуют на подложке, подходящей для создания матрицы.
Способы определения количества или концентрации белка в образце известны специалистам в данной области. Такие способы включают радиоиммуноанализы, анализы конкурентного связывания, вестерн-блот-анализы и анализы ELISA. Подходящими являются способы, в которых используют антитела, поликлональные и моноклональные антитела. Такие антитела могут быть иммунологически специфическими по отношению к белку, эпитопу белка или фрагменту белка.
В некоторых вариантах осуществления изобретения используют антитела для выявления и количественного анализа белков, продуцируемых в результате экспрессии полинуклеотидов настоящего изобретения. Хотя белки могут быть выявлены с использованием иммунопреципитации, аффинного разделения, вестерн-блот-анализа, белковых матриц и подобного, в предпочтительном способе используют методику ELISA, в которой антитело иммобилизуют на твердой подложке, и белок-мишень или пептид-мишень экспонируют с иммобилизованным антителом. Либо зонд, либо мишень, либо и то и другое можно метить с использованием известных способов.
В некоторых вариантах осуществления картины или профили экспрессии множества генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, исследуют, используя матрицу зондов для выявления полинуклеотидов или полипептидов. В одном варианте осуществления можно использовать матрицы олигонуклеотидных или полинуклеотидных зондов, тогда как в другом варианте осуществления можно использовать матрицы антител или других белков, которые специфически связываются с дифференциально экспрессируемыми генными продуктами настоящего изобретения. Такие матрицы могут быть коммерчески доступными, или они могут быть изготовлены по заказу способами, известными специалистам в данной области, например, с использованием синтеза in-situ на твердой подложке или связывания предварительно синтезированных зондов на твердой подложке с применением методики микропечати. В различных вариантах осуществления матрицы полинуклеотидных или полипептидных зондов изготавливают специально, чтобы специфически выявлять транскрипты или белки, продуцируемые дифференциально экспрессируемыми генами настоящего изобретения.
В одном варианте осуществления матрицы полинуклеотидных или полипептидных зондов изготавливают специально, чтобы специфически выявлять транскрипты или белки, продуцируемые двумя или более полинуклеотидами или генами, указанными в таблице 2. Такие зонды конструируют для выявления генов, ассоциированных с путями метаболизма липидов и глюкозы у животных. В другом варианте осуществления матрицы полинуклеотидных или полипептидных зондов специально изготавливают для того, чтобы специфически выявлять транскрипты или белки, продуцируемые двумя или более полинуклеотидами или генами, указанными в таблице 3. Такие зонды конструируют с целью выявления генов, которые в большей степени имеют отношение к животным с избыточной массой по сравнению с худыми животными.
В следующем аспекте изобретение относится к способу выявления в образце дифференциальной экспрессии одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными. Способ включает (a) гибридизацию совокупности множества полинуклеотидных зондов, которые дифференциально экспрессируются у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, с полинуклеотидами в образце с образованием одного или нескольких комплексов гибридизации; (b) необязательно гибридизацию совокупности множества полинуклеотидных зондов, которые дифференциально экспрессируются у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, с полинуклеотидами в стандартном образце с образованием одного или нескольких комплексов гибридизации; (c) регистрацию комплексов гибридизации в образце и необязательно в стандартном образце со стадии (b); и (d) сравнение комплексов гибридизации в образце с комплексами гибридизации в стандартном образце, где разница в количестве комплексов гибридизации между стандартом и образцом свидетельствует о дифференциальной экспрессии генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в образце. В различных вариантах осуществления множество полинуклеотидных зондов выбирают из зондов, указанных в таблицах 1 и 2, и предпочтительно в таблице 3. Такие полинуклеотиды используют для получения зондов, которые гибридизуются с полинуклеотидами в образце с образованием комплексов гибридизации, которые регистрируют и сравнивают с комплексами в стандартном образце. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотиды в образце перед гибридизацией амплифицируют. В некоторых вариантах осуществления зонды связывают с подложкой, предпочтительно в виде матрицы.
Стадия (b) и часть стадии (c) являются необязательными, и их используют, если необходимо провести относительно одновременное сравнение двух или более тест-систем. Однако в предпочтительном варианте осуществления стандарт, используемый для сравнения, основан на данных, полученных ранее с использованием настоящего способа.
Такие зонды подвергают взаимодействию с образцом с образованием комплексов гибридизации, которые регистрируют и сравнивают с комплексами гибридизации в стандартном образце. Различие между комплексами гибридизации в образце и стандарте свидетельствует о дифференциальной экспрессии полинуклеотидов и, следовательно, о наличии в образце генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными. В предпочтительном варианте осуществления получают зонды для специфического выявления полинуклеотидов или их фрагментов, продуцируемых одним или несколькими генами или генными фрагментами, идентифицированными по настоящему изобретению. Способы регистрации комплексов гибридизации известны специалистам в данной области.
В одном варианте осуществления способ дополнительно включает воздействие на животного или образец тестируемым веществом перед гибридизацией. Затем, сравнение является показателем того, изменяет ли тестируемое вещество экспрессию генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, ассоциированных с жирами генов, в образце.
В другом аспекте изобретение относится к способу выявления в образце дифференциальной экспрессии генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными. Способ включает (a) взаимодействие совокупности множества полипептидных зондов с белками в образце в условиях, которые обеспечивают специфическое связывание между зондами и белками, где белки, связанные с зондами, являются дифференциально экспрессируемыми у животного с избыточной массой по сравнению с худым животным; (b) необязательно взаимодействие совокупности множества полипептидных зондов с белками в стандартном образце в условиях, которые обеспечивают специфическое связывание между зондами и белками, где белки, связанные с зондами, являются дифференциально экспрессируемыми у животного с избыточной массой по сравнению с худым животным; (c) регистрацию специфического связывания в образце и необязательно в стандартном образце со стадии (b); и (d) сравнение специфического связывания в образце со связыванием стандарта, где различие между специфическим связыванием в стандартном образце и в данном образце свидетельствует о дифференциальной экспрессии генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными в образце.
В различных вариантах осуществления множество полипептидных зондов представляют собой зонды, которые специфически связываются с белками, продуцируемыми в результате экспрессии одного или нескольких полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, и применимых вариантов таких полинуклеотидов. Такие полинуклеотиды используют для получения зондов, которые специфически связываются с белками, которые выявляют и сравнивают с белками стандарта. В некоторых вариантах осуществления зонды связывают с подложкой, предпочтительно в виде матрицы. В одном варианте осуществления зонды представляют собой антитела.
Стадия (b) и часть стадии (c) являются необязательными, и их используют, если необходимо провести относительно одновременное сравнение двух или более тест-систем. Однако в предпочтительном варианте осуществления стандарт, используемый для сравнения, основан на данных, полученных ранее с использованием настоящего способа.
Такие зонды подвергают взаимодействию с образцом для получения специфического связывания, которое регистрируют и сравнивают со связыванием в стандартном образце. Различие между специфическим связыванием в образце и стандарте свидетельствует о дифференциальной экспрессии белков и, следовательно, о наличии в образце генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, ассоциированных с жирами генов. В предпочтительном варианте осуществления получают зонды для специфического выявления белков или их фрагментов, продуцируемых одним или несколькими генами или генными фрагментами, идентифицированными по настоящему изобретению.
В одном варианте осуществления способ дополнительно включает воздействие на животного или образец тестируемым веществом перед взаимодействием полипептидов с белками. Затем, сравнение является показателем того, изменяет ли тестируемое вещество экспрессию генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, ассоциированных с жирами генов, в образце.
В другом аспекте способ выявления в образце экспрессии генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, используют для мониторинга прогресса у животного при попытках модулировать количество жировой ткани у животного в ответ на программу модулирования жировой ткани. Способ осуществляют с интервалами, предпочтительно используя множество интервалов на протяжении программы модулирования, и за прогрессом у животного наблюдают путем сравнения результатов применения способа в двух или более точках в ходе программы модулирования. Изменение экспрессии одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, ассоциированных с жирами генов, или картины генной экспрессии, или отсутствие какого-либо изменения, определенное в результате сравнения, свидетельствует об эффективности программы модулирования. Например, можно провести мониторинг программы модулирования жировой ткани, предназначенного для уменьшения количества жировой ткани у животного, и показать, что она эффективна, если количество генной экспрессии генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, ассоциированных с жирами генов, снижается с течением времени в ответ на стимул в программе. Подобным образом, программа увеличения жировой ткани у худого или чрезмерно худого животного должна увеличивать профиль экспрессии таких генов. Может быть разработана программа модулирования для того, чтобы модулировать количество жировой ткани у животного, такая как программа питания, физической нагрузки, применения лекарственных средств или другая сходная программа.
В следующем аспекте изобретение относится к способу измерения влияния тестируемого вещества на профиль экспрессии одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, и к способу скрининга тестируемого вещества, чтобы определить, возможно ли его применение для модулирования количества жировой ткани у животного. Способы включают (a) определение первого профиля экспрессии посредством измерения продуктов транскрипции или трансляции двух или более полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, или их применимых вариантов в тест-системе в отсутствие тестируемого вещества; (b) определение второго профиля экспрессии посредством измерения продуктов транскрипции или трансляции двух или более полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, или их применимых вариантов в тест-системе в присутствии тестируемого вещества; и (c) сравнение первого профиля экспрессии со вторым профилем экспрессии.
Изменение во втором профиле экспрессии по сравнению с первым профилем экспрессии в 1,3 раза или более свидетельствует о том, что тестируемое вещество влияет на экспрессию генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, и что тестируемое вещество вероятно может быть использовано для модулирования количества жировой ткани у животного. В предпочтительном варианте осуществления генами, дифференциально экспрессируемыми у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, являются ключевые гены, ассоциированные с метаболизмом жирных кислот, и изменение является 1,3-кратным или большим изменением экспрессии по меньшей мере двух генов в первом профиле экспрессии по сравнению со вторым профилем экспрессии. Изобретение также относится к веществам, идентифицированным с использованием такого способа.
В одном варианте осуществления полинуклеотиды выбирают из полинуклеотидов, указанных в таблице 3, или их применимых вариантов, и изменение является 1,3-кратным или большим.
В одном варианте осуществления тест-система представляет собой тест-систему in vitro, такую как культура ткани, клеточный экстракт или клеточная линия. В другом случае тест-система представляет собой тест-систему in vivo, т.е. животное, такое как собака. В других вариантах осуществления тест-система представляет собой тканевую систему ex vivo или виртуальную систему.
Тестируемым веществом может быть любое вещество, которое может влиять на полинуклеотиды или гены, дифференциально экспрессируемые у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, на ассоциированные с жирами гены. Тестируемые вещества включают, но без ограничения, аминокислоты, белки, пептиды, полипептиды, нуклеиновые кислоты, олигонуклеотиды, полинуклеотиды, малые молекулы, макромолекулы, витамины, минералы, простые сахара, сложные сахара, полисахариды, углеводы, триглицериды со средней длиной цепи (MCT); триацилглицериды (TAG); n-3 (омега-3) жирные кислоты, включая ДГК, ЭПК, АЛК; n-6 (омега-6) жирные кислоты, включая ЛК, -линоленовую кислоту (ГЛК) и АРК; СК, МК, конъюгированную линолевую кислоту (КЛК); источники холина, такие как лецитин; жирорастворимые витамины, включая витамин A и его предшественники, такие как каротиноиды (например, -каротин), источники витамина D, такие как витамин D 2 (эргокальциферол) и витамин D3 (холекальциферол), источники витамина E, такие как токоферолы (например, -токоферол) и токотриенолы, и источники витамина K, такие как витамин K1 (филлохинон) и витамин K2 (менадион); водорастворимые витамины, включая витамины B, такие как рибофлавин, ниацин (включая никотинамид и никотиновую кислоту), пиридоксин, пантотеновая кислота, фолиевая кислота, биотин и кобаламин; и витамин C (аскорбиновую кислоту); антиоксиданты, включая некоторые витамины, перечисленные выше, особенно витамины E и C; также биофлавоноиды, такие как катехин, кверцетин и теафлавин; хиноны, такие как убихинон; каротиноиды, такие как ликопен и ликоксантин; ресвератрол; и -липоевую кислоту; L-карнитин; D-лимонен; глюкозамин; S-аденозилметионин; и хитозан. В предпочтительном варианте осуществления тестируемыми веществами являются питательные вещества, которые можно добавлять к пище или употреблять в виде добавок. Примерами, но без ограничения, являются жирные кислоты, такие как жирные кислоты омега-3 (например, ДГК и ЭПК) и жирные кислоты омега-6 (например, АРК), карнитин, метионин, витамин C, витамин E и витамин D.
В предпочтительном варианте осуществления вещества, полезные для оказания воздействия на экспрессию генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, ассоциированных с жирами генов, могут быть идентифицированы с использованием способов, описанных в совместно рассматриваемой предварительной патентной заявке США No. 60/657980, поданной 2 марта 2005, и любой более поздней патентной заявке США или иностранной патентной заявке, по которым испрашивается приоритет на эту тему.
В следующем варианте осуществления изобретение относится к способу составления прогноза, по которому животное вероятно будет иметь избыточную массу, или постановки диагноза наличия ожирения у животного. Способ включает определение того, имеется ли дифференциальная экспрессия одного или нескольких полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, или их применимых вариантов, или одного или нескольких полипептидов, которые специфически связываются с белками, продуцируемыми в результате экспрессии одного или нескольких полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1, 2, или их применимых вариантов, у данного животного по сравнению с одним или несколькими худыми животными. Животного определяют как животное, которое может приобрести избыточную массу, или определяют как животное, имеющее избыточную массу, если сравнение показывает, что полинуклеотиды дифференциально экспрессируются у данного животного по сравнению с худыми животными с кратностью 1,3 или более.
В различных вариантах осуществления прогноз или диагноз основан на полинуклеотидах, выбранных из таблицы 3, или применимых вариантах осуществления таких полинуклеотидов.
Профиль экспрессии для худых животных, используемых для сравнения, можно получить для одного или нескольких худых животных одновременно с получением профиля экспрессии для тестируемого животного, или из базы данных профилей экспрессии для худых животных. Предпочтительно база данных относительно профилей экспрессии для худых животных, накопленных в течение определенного периода времени, может быть использована в качестве эталона.
Определение того, экспрессируются ли дифференциально полинуклеотиды или полипептиды, можно осуществить посредством выявления полинуклеотидов или полипептидов с использованием способов, известных специалистам в данной области, некоторые из которых описаны в настоящем описании.
В другом аспекте изобретение относится к способу воздействия на геном или экспрессию генома животного, в частности, животного, отличного от человека. Способ включает нарушение экспрессии одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, предпочтительно с использованием олигонуклеотидов или полинуклеотидов, сконструированных с использованием полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, или их применимых вариантов.
Способы воздействия на геном известны специалистам в данной области. Такие способы включают получение трансгенных и нокаутированных животных и нарушение транскрипции или трансляции. В одном варианте осуществления один или несколько полинуклеотидов, выбранных таблиц 1 и 2, или их применимых вариантов, используют для получения конструкта, используемого для нарушения или «нокаута» соответствующего эндогенного гена у животного. Такой способ позволяет получать животное, имеющее нуль-мутацию в таком генном локусе. В других вариантах осуществления у животных наблюдают снижение или полное исключение экспрессии одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, ассоциированных с жирами генов. Изобретение также относится к животному, полученному с применением такого способа. В различных вариантах осуществления на геном воздействуют, используя один или несколько полинуклеотидов, выбранных из таблицы 3, или применимых вариантов таких последовательностей. Трансгенными животными предпочтительно являются млекопитающие, например, грызуны, такие как мыши и крысы, но может быть другое млекопитающее, такое как кошки и собаки.
Способы воздействия на экспрессию генома известны специалистам в данной области. Такие способы включают использование антисмысловых молекул или молекул миРНК, и применение таких молекул для нарушения трансляции или транскрипции генома. В одном варианте осуществления один или несколько полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, или их применимых вариантов, используют для получения антисмысловых и сходных ДНК-связывающих молекул, которые применимы для нарушения транскрипции, или для получения коротких (малых) интерферирующих РНК (миРНК), применимых для функционального нарушения трансляции. Коротко, экспрессию генов ингибируют антисмысловыми молекулами благодаря связыванию с ДНК и предотвращению транскрипции, и молекулами миРНК посредством интерференции РНК (РНК-и) или посттранскрипционному сайленсингу гена (PTGS). Мишени молекул миРНК гомологичны молекулам мРНК для разрушения путем расщепления молекулы мРНК в области, охватываемой молекулой миРНК. Соответственно, миРНК, способные целенаправленно воздействовать и расщеплять мРНК, транскрибированную из ассоциированного с жирами гена, используют для снижения или исключения экспрессии одного или нескольких таких генов. В других вариантах осуществления используют антисмысловые молекулы, способные к связыванию с ДНК, и миРНК, способные целенаправленно воздействовать и расщеплять мРНК, транскрибированную с одного или нескольких полинуклеотидов или генов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, или их применимых вариантов.
В другом аспекте изобретение относится к композиции, подходящей для воздействия на геном животного. Композиция содержит одно или несколько веществ, которые препятствуют экспрессии одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, ассоциированных с жирами генов. Предпочтительно вещества содержат олигонуклеотиды или полинуклеотиды, которые связываются с одним или несколькими генами или продуктами их транскрипции и препятствуют их репликации, транскрипции или трансляции, наиболее предпочтительно олигонуклеотиды или полинуклеотиды, сконструированные с использованием полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, или их применимых вариантов. В различных вариантах осуществления вещества содержат антисмысловые молекулы или миРНК.
В другом варианте осуществления изобретение относится к способу модулирования экспрессия одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, ассоциированных с жирами генов, или модулирования количества жировой ткани у животного, включающий введение животному модулирующего генную экспрессию или ткань количества композиции, содержащей один или несколько из следующих веществ: ДГК, ЭПК, ЭПК и ДГК, АЛК, ЛК, АРК, СК и МК. В предпочтительных вариантах осуществления композиция содержит, в миллиграммах на килограмм массы тела в сутки (мг/кг/сутки), ДГК в количестве от 1 до 30, предпочтительно от 3 до 15; ЭПК в количестве от 1 до 30, предпочтительно от 3 до 15; комбинированные ЭПК/ДГК (соотношение 1,5:1) в количестве от 4/2 до 30/45, предпочтительно от 9/6 до 18/12; АЛК в количестве от 10 до 100, предпочтительно от 30 до 60; ЛК в количестве от 30 до 600, предпочтительно от 60 до 300; АРК в количестве от 5 до 50, предпочтительно от 15 до 30; СК в количестве от 3 до 60, предпочтительно от 6 до 30; МК в количестве от 3 до 60, предпочтительно от 6 до 30; и КЛК (в качестве контроля) в количестве от 6 до 120, предпочтительно от 12 до 60. Композиция может быть введена животному любым способом или в любой форме, подходящей для такой композиции. Предпочтительно композицию вводят животному перорально в форме пищевой композиции или добавки. Пищевая композиция может быть в любой форме, например, сбалансированной по питательным веществам пищевой композицией, известной в данной области, такой как сухие корма, полувлажные корма и влажные корма для животных, в частности, для домашних животных, таких как кошачьи и собачьи животные. Добавки включают дозированные формы, такие как таблетки, капсулы и подобные формы. В следующем аспекте композицию вводят в комбинации с одним или несколькими лекарственными средствами или другими веществами, которые модулируют количество жировой ткани у животного. Лекарственные средства или вещества включают, но без ограничения, вещества, которые подавляют аппетит, усиливают метаболизм или препятствуют всасыванию конкретных питательных веществ, в частности, из пищи. Примерами, но без ограничения, являются орлистат (блокирует расщепление и всасывание жиров), анорексигенные средства, такие как декседрин (подавляет аппетит), анорексические средства, такие как фенфлурамин и фентермин, и сибутрамин, и фенилпропаноламин.
В другом аспекте изобретение относится к композиции, подходящей для модулирования экспрессии одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, ассоциированных с жирами генов, или модулирования количества жировой ткани у животного. Композиция содержит модулирующее генную экспрессию или ткань количество одного или нескольких из следующих веществ: ДГК, ЭПК, ЭПК и ДГК, АЛК, ЛК, АРК, СК, МК. В различных вариантах осуществления композиция содержит, в мг/кг/сутки, ДГК в количестве, достаточном для введения животному от 1 до 30; ЭПК в количестве, достаточном для введения животному от 1 до 30; комбинированные ЭПК/ДГК (соотношение 1,5:1) в количестве, достаточном для введения животному от 4/2 до 30/45; АЛК в количестве, достаточном для введения животному от 10 до 100; ЛК в количестве, достаточном для введения животному от 30 до 600; АРК в количестве, достаточном для введения животному от 5 до 50; СК в количестве, достаточном для введения животному от 3 до 60; МК в количестве, достаточном для введения животному от 3 до 60, и КЛК (в качестве контроля) в количестве, достаточном для введения животному от 6 до 120. Такие вещества могут быть использованы для модулирования количества жировой ткани у животного. Предпочтительно вещества влияют на экспрессию множества таких генов. В одном варианте осуществления композиция дополнительно содержит одно или несколько лекарственных средств или других веществ, которые модулируют количество жировой ткани у животного.
В другом варианте осуществления изобретение относится к способам отбора животного для включения в одну или несколько групп или подгрупп. Способ включает определение профиля экспрессии у животного в отношении (a) полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, или их применимых вариантов, или (b) полипептидов, каждый из которых специфически связывается с белками, продуцируемыми в результате экспрессии одного или нескольких полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, или их применимых вариантов, и отнесение животного к определенной группе на основании профиля экспрессии. Группы могут представлять собой любые используемые группы, предпочтительно группы, используемые в исследовательском эксперименте, испытании, клиническом испытании или другой сходной категории. Например, группы могут представлять собой группы, используемые в исследовательском эксперименте или клиническом испытании, в котором требуется одна или несколько контрольных групп и одна или несколько групп обработки. В одном варианте осуществления контрольная группа включает худых животных, и группа обработки включает животных с избыточной массой, или в другом случае наоборот. Можно определить профиль экспрессии для множества животных, и животных относят к контрольной группе или группе обработки на основании результатов исследовании профиля, т.е. животные с дифференциальной экспрессией, которая в 1,3 раза или более выше, чем в стандарте, относят к группе с избыточной массой, а животных с дифференциальной экспрессией, которая в 1,3 раза или менее ниже, чем в стандарте, относят к группе худых животных. Способ, в частности, может быть применен для распределения животных в клиническом испытании при тестировании потенциальных лекарственных средств или других веществ в отношении их способности снижать количество жировой ткани у животного.
В другом аспекте изобретение относится к компьютерной системе, подходящей для обработки данных, относящихся к одному или нескольким генам, дифференциально экспрессируемым у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, ассоциированным с жирами генам. Система включает базу данных, содержащую информацию, характеризующую уровень экспрессии одного или нескольких полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, или их применимых вариантов, и/или полипептидов, которые специфически связываются с белками, продуцируемыми в результате экспрессии одного или нескольких полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, или их применимых вариантов, у худых животных и/или животных с избыточной массой, и пользовательский интерфейс для взаимодействия с базой данных, в частности для введения, обработки и просмотра информации для разных животных или категорий животных, например, худых животных или животных с избыточной массой. В одном варианте осуществления база данных дополнительно содержит информацию, характеризующую уровень активности одного или нескольких полипептидов, кодируемых одним или несколькими полинуклеотидами, выбранными из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, или их применимых вариантов. В другом случае база данных дополнительно содержит информацию о последовательности одного или нескольких полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, или их применимых вариантов. В других вариантах осуществления база данных содержит дополнительную информацию, которая представляет собой предполагаемое описание генов у одного или нескольких видов животных. Компьютерная система представляет собой любое электронное устройство, способное хранить и обрабатывать данные и взаимодействовать с пользователем, например, обычный компьютер или аналитический прибор, предназначенный для облегчения применения настоящего изобретения и вывода результатов, относящихся к статусу животного.
В другом аспекте изобретение относится к способу применения компьютерной системы или настоящего изобретения для представления информации, характеризующей профиль экспрессии одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, ассоциированных с жирами генов. Способ включает сравнение уровня экспрессии двух или более полинуклеотидов или белков, экспрессированных из полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, из образца с профилем экспрессии полинуклеотидов или белков в компьютерной системе.
В следующем аспекте настоящее изобретение относится к наборам, подходящим для определения дифференциальной экспрессии одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, ассоциированных с жирами генов, в тест-системе. Наборы содержат в отдельных контейнерах в одной упаковке или в отдельных контейнерах в виртуальной упаковке, в зависимости от применения и компонента набора, два или более зондов, подходящих для определения экспрессии генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, при этом зонды включают (a) полинуклеотиды, выбранные из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, или их применимых вариантов, или (b) полипептиды, которые специфически связываются с белками, продуцируемыми в результате экспрессии одного или нескольких полинуклеотидов, выбранных из таблиц 1 и 2, и предпочтительно из таблицы 3, или их применимых вариантов, и по меньшей мере один из следующих компонентов (1) инструкции по применению зондов настоящего изобретения; (2) реагенты и оборудование, необходимое для применения зондов; (3) композицию, подходящую для модулирования экспрессии одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными; (4) композицию, подходящую для нарушения экспрессии одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными; (5) пищевую композицию, подходящую для модулирования количества жировой ткани у животного; и (6) одно или несколько лекарственных средств или других веществ, которые модулируют количество жировой ткани у животного. В одном предпочтительном варианте осуществления зонды связывают с подложкой, предпочтительно в виде матрицы.
Композиции настоящего изобретения
Изобретение относится к кормовым композициям для собак, содержащим от 26% масс. до 35% масс. сырого белка из расчета на сухую массу, от 7,5% масс. до 8,5% масс. сырого жира из расчета на сухую массу, от 20% масс. до 30% масс. суммарных пищевых волокон из расчета на сухую массу и от 10% масс. до 20% масс. сырых волокон из расчета на сухую массу.
Изобретение также относится к кормовым композициям для кошек, содержащим от 30% масс. до 37% масс. сырого белка из расчета на сухую массу, от 7,5% масс. до 9% масс. сырого жира из расчета на сухую массу, от 30% масс. до 35% масс. суммарных пищевых волокон из расчета на сухую массу и от 20% масс. до 25% масс. сырых волокон из расчета на сухую массу.
В некоторых вариантах осуществления композиции настоящего изобретения могут включать полиненасыщенные жирные кислоты омега-3 в количестве по меньшей мере 0,02% (или от 0,05% масс. до 10% масс., или от 0,1% масс. до 6% масс.) из расчета на сухую массу. В некоторых вариантах осуществления полиненасыщенной жирной кислотой омега-3 является ДГК. В других вариантах осуществления полиненасыщенной жирной кислотой омега-3 является ЭПК. В следующих вариантах осуществления полиненасыщенная жирная кислота омега-3 представляет собой смесь ДГК и ЭПК.
В других вариантах осуществления композиция, содержащая полиненасыщенную жирную кислоту омега-3, представляет собой корм. Хотя предлагаются как жидкие, так и твердые корма, обычно предпочтительными являются твердые корма. Корма включают как сухие корма, так и влажные корма. Некоторые компоненты кормов, не являющиеся полиненасыщенными жирными кислотами, и используемые количественные соотношения указаны ниже.
Композиции корма для собак
Компонент
Количественное соотношение в композиции (% сухой массы композиции или частей на миллион)
Белок
от 26% масс. до 35% масс. сырого белка из расчета на сухую массу или от 28% масс. до 33% масс., или от 30% масс. до 31% масс., или 26% масс., 26,5% масс., 27% масс., 27,5% масс., 28% масс., 28,5% масс., 29% масс., 29,5% масс., 30% масс., 30,5% масс., 31% масс., 31,5% масс., 32% масс., 32,5% масс., 33% масс., 33,5% масс., 34% масс., 34,5% масс., 35% масс.
Сырой жир
от 7,5% масс. до 8,5% масс. сырого жира из расчета на сухую массу или 7,6% масс., 7,7% масс., 7,8% масс., 7,9% масс., 8,0% масс., 8,1% масс., 8,2% масс., 8,3% масс., 8,4% масс.
Суммарные пищевые волокна
от 20% масс. до 30% масс. суммарных пищевых волокон из расчета на сухую массу или от 22% масс. до 28% масс., или от 24% масс. до 26% масс., или 20% масс., 20,5% масс., 21% масс., 21,5% масс., 22% масс., 22,5% масс., 23% масс., 23,5% масс., 24% масс., 24,5% масс., 25% масс., 25,5% масс., 26% масс., 26,5% масс., 27% масс., 27,5% масс., 28% масс., 28,5% масс., 29% масс., 29,5% масс.
Сырые волокна
от 10% масс. до 20% масс. сырых волокон из расчета на сухую массу или от 12% масс. до 18% масс., или от 14% масс. до 16% масс., или 10% масс., 10,5% масс., 11% масс., 11,5% масс., 12% масс., 12,5% масс., 13% масс., 13,5% масс., 14% масс., 14,5% масс., 15% масс., 15,5% масс., 16% масс., 16,5% масс., 17% масс., 17,5% масс., 18% масс., 18,5% масс., 19% масс., 19,5% масс.
Композиции корма для кошек
Компонент
Количественное соотношение в композиции (% сухой массы композиции или частей на миллион)
Белок
от 30% масс. до 37% масс. сырого белка из расчета на сухую массу или от 31% масс. до 36% масс., или от 33% масс. до 35% масс., или 30% масс., 30,5% масс., 31% масс., 31,5% масс., 32% масс., 32,5% масс., 33% масс., 33,5% масс., 34% масс., 34,5% масс., 35% масс., 35,5% масс., 36% масс., 36,5% масс., 36% масс.
Сырой жир
от 7,5% масс. до 9% масс. сырого жира из расчета на сухую массу или 7,6% масс., 7,7% масс., 7,8% масс., 7,9% масс., 8,0% масс., 8,1% масс., 8,2% масс., 8,3% масс., 8,4% масс., 8,5% масс., 8,6% масс., 8,7% масс., 8,8% масс., 8,9% масс., 9,0% масс.
Суммарные пищевые волокна
от 30% масс. до 35% масс. суммарных пищевых волокон из расчета на сухую массу или от 31% масс. до 34% масс., или от 32% масс. до 33% масс., или 30% масс., 30,5% масс., 31% масс., 31,5% масс., 32% масс., 32,5% масс., 33% масс., 33,5% масс., 34% масс., 34,5% масс., 35% масс.
Сырые волокна
от 20% масс. до 25% масс. сырых волокон из расчета на сухую массу или от 21% масс. до 24% масс., или от 22% масс. до 23% масс., или 20% масс., 20,5% масс., 21% масс., 21,5% масс., 22% масс., 22,5% масс., 23% масс., 23,5% масс., 24% масс., 24,5% масс., 25% масс.
В одном варианте осуществления композиции для собак настоящего изобретения содержат ингредиенты в количестве, эффективном для улучшения качества жизни животного. Такие композиции, как правило, содержат:
(a) от 26% масс. до 35% масс. сырого белка из расчета на сухую массу,
(b) от 7,5% масс. до 8.5% масс. сырого жира из расчета на сухую массу,
(c) от 20% масс. до 30% масс. суммарных пищевых волокон из расчета на сухую массу, и
(d) от 10% масс. до 20% масс. сырых волокон из расчета на сухую массу.
В другом варианте осуществления изобретение относится к композициям для кошек, которые, как правило, содержат:
(a) от 30% масс. до 37% масс. сырого белка из расчета на сухую массу,
(b) от 7,5% масс. до 9% масс. сырого жира из расчета на сухую массу,
(c) от 30% масс. до 35% масс. суммарных пищевых волокон из расчета на сухую массу, и
(d) от 20% масс. до 25% масс. сырых волокон из расчета на сухую массу.
В другом варианте осуществления композиции, как правило, содержат:
(a) по меньшей мере один из следующих компонентов:
(i) по меньшей мере 0,05% (или от 0,05% до 0,30%, или от 0,1% до 0,30%, или от 0,1% до 0,2%) ДГК, и
(ii) по меньшей мере 0,1% (или от 0,1% до 0,5%, или от 0,2% до 0,5%, или от 0,2% до 0,3%) ЭПК,
(b) по меньшей мере 15% (или от 15% до 55%, или от 30% до 55%, или от 33% до 36%) белка,
(c) по меньшей мере 9% (или от 9% до 35%, или от 18% до 35%, или от 18% до 24%) жира, и
(d) по меньшей мере один из следующих компонентов:
(i) по меньшей мере 250 МЕ/кг (или от 250 МЕ/кг до 1500 МЕ/кг или от 500 МЕ/кг до 1500 МЕ/кг, или от 500 МЕ/кг до 1100 МЕ/кг) витамина E,
(xii) по меньшей мере 50 ч./млн (или от 50 ч./млн до 300 ч./млн, или от 100 ч./млн до 300 ч./млн, или от 100 ч./млн до 200 ч./млн) витамина C,
(xiii) по меньшей мере 1100 ч./млн (или от 1100 ч./млн до 3500 ч./млн, или от 2300 ч./млн до 3500 ч./млн, или от 2300 ч./млн до 2350 ч./млн) таурина, и
(xiv) по меньшей мере 200 ч./млн (или от 200 до 750 ч./млн, или от 400 ч./млн до 750 ч./млн, или от 400 до 525 ч./млн) карнитина, и
(xv) по меньшей мере 0,05% (или от 0,05% до 0,6%, или от 0,1% до 0,6%, или от 0,1% до 0,4%) цистина.
В другом варианте осуществления композиции, как правило, содержат:
(a) 0,02% (или от 0,05% до 10%, или от 0,1% до 6%), по меньшей мере одной полиненасыщенной жирной кислоты омега-3, и
(b) по меньшей мере один из следующих компонентов:
(xvi) от 10% до 55% (или от 18% до 30%, или от 33% до 55% или от 18% до 20% или от 33% до 36%) белка,
(xvii) от 7% до 35% (или от 18% до 35%, или от 7% до 24%, или от 14% до 24%, или от 14% до 16% или от 18% до 24%) жира,
(xviii) по меньшей мере 0,05 (или от 0,05 ч./млн до 7500 ч./млн, или от 250 ч./млн до 3600 ч./млн, или от 250 ч./млн до 1650 ч./млн, или от 5 ч./млн до 225 ч./млн, или от 0,05 ч./млн до 2,4 ч./млн) антиоксиданта, и
(xix) по меньшей мере 1000 ч./млн (или от 1000 ч./млн до 5000 ч./млн, от 3300 ч./млн до 5000 ч./млн, или от 2000 ч./млн до 3000 ч./млн, или от 3000 ч./млн до 4000 ч./млн) холина.
В другом варианте осуществления композиции, как правило, содержат:
(a) по меньшей мере один из следующих компонентов:
(i) по меньшей мере 0,02% (или от 0,02% до 0,3%, или от 0,05% до 0,3%, или от 0,05% до 0,2%) ДГК, и
(ii) по меньшей мере 0,1% (или от 0,1% до 0,5%, или от 0,2% до 0,5%, или от 0,2% до 0,3%) ЭПК,
(b) по меньшей мере 9% (или от 9% до 30%, или от 18% до 30%, или от 18% до 20%) белка,
(c) по меньшей мере 7% (или от 7% до 24%, или от 14% до 24%, или от 14% до 16%) жира,
(d) по меньшей мере один из следующих компонентов:
(i) по меньшей мере 250 МЕ/кг (или от 250 МЕ/кг до 1500 МЕ/кг, или от 500 МЕ/кг до 1500 МЕ/кг, или от 500 МЕ/кг до 1000 МЕ/кг) витамина E,
(xx) по меньшей мере 50 ч./млн (или от 50 ч./млн до 500 ч./млн, или от 100 ч./млн до 500 ч./млн, или от 100 ч./млн до 301 ч./млн) витамина C,
(xxi) по меньшей мере 600 ч./млн (или от 600 ч./млн до 2400 ч./млн, или от 1260 ч./млн до 2400 ч./млн, или от 1260 ч./млн до 1545 ч./млн) таурина, и
(xxii) по меньшей мере 50 ч./млн (или от 50 ч./млн до 200 ч./млн, или от 100 до 160, или от 100 до 155) липоевой кислоты, и
(xxiii) по меньшей мере 50 ч./млн (или от 50 ч./млн до 500 ч./млн, или от 200 ч./млн до 500 ч./млн, или от 200 ч./млн до 350 ч./млн) карнитина,
(e) по меньшей мере 1000 ч./млн (или от 1000 ч./млн до 3200 ч./млн, или от 2000 ч./млн до 3200 ч./млн, или от 2000 ч./млн до 2500 ч./млн) холина,
(f) по меньшей мере 50 ч./млн (или от 50 ч./млн до 150 ч./млн, или от 100 ч./млн до 150 ч./млн, или от 100 ч./млн до 110 ч./млн) марганца, и
(g) по меньшей мере 0,4% (или от 0,4% до 2%, или от 0,9% до 2%, или от 0,9% до 1,2%) лизина, и
(h) по меньшей мере от 0,4% до 1,5% метионина.
В другом варианте осуществления композиции, как правило, содержат:
(a) по меньшей мере один из следующих компонентов:
(i) по меньшей мере 0,02% (или от 0,02% до 0,3%, или от 0,05% до 0,3%, или от 0,05% до 0,2%) ДГК, и
(ii) по меньшей мере 0,1% (или от 0,1% до 0,5%, или от 0,2% до 0,5%, или от 0,2% до 0,3%) ЭПК,
(b) по меньшей мере 9% (или от 9% до 30%, или от 18% до 30%, или от 18% до 20%) белка,
(c) по меньшей мере 7% (или от 7% до 24%, или от 14% до 24%, или от 14% до 16%) жира,
(d) по меньшей мере один из следующих компонентов:
(i) по меньшей мере 250 МЕ/кг (или от 250 МЕ/кг до 1500 МЕ/кг, или от 500 МЕ/кг до 1500 МЕ/кг, или от 500 МЕ/кг до 1000 МЕ/кг) витамина E,
(xxiv) по меньшей мере 50 ч./млн (или от 50 ч./млн до 500 ч./млн, или от 100 ч./млн до 500 ч./млн, или от 100 ч./млн до 301 ч./млн) витамина C,
(xxv) по меньшей мере 600 ч./млн (или от 600 ч./млн до 2400 ч./млн, или от 1260 ч./млн до 2400 ч./млн, или от 1260 ч./млн до 1575 ч./млн) таурина, и
(xxvi) по меньшей мере 50 ч./млн (или от 50 ч./млн до 200 ч./млн, или от 100 до 160, или от 100 до 155) липоевой кислоты, и
(xxvii) по меньшей мере 50 ч./млн (или от 50 ч./млн до 500 ч./млн, или от 200 ч./млн до 500 ч./млн, или от 200 ч./млн до 350 ч./млн) карнитина,
(e) по меньшей мере 1000 ч./млн (или от 1000 ч./млн до 3200 ч./млн, или от 2000 ч./млн до 3200 ч./млн, или от 2000 ч./млн до 2500 ч./млн) холина,
(f) по меньшей мере 50 ч./млн (или от 50 ч./млн до 150 ч./млн, или от 100 ч./млн до 150 ч./млн, или от 100 ч./млн до 110 ч./млн) марганца, и
(g) по меньшей мере 0,4% (или от 0,4% до 2%, или от 0,9% до 2%, или от 0,9% до 1,2%) лизина, и
(h) по меньшей мере от 0,4% до 1,5% метионина.
В другом варианте осуществления композиции, как правило, содержат:
(a) по меньшей мере один из следующих компонентов:
(i) по меньшей мере 0,05% (или от 0,05% до 0,30%, или от 0,1% до 0,30%, или от 0,1% до 0,2%) ДГК, и
(ii) по меньшей мере 0,1% (или от 0,1% до 0,5%, или от 0,2% до 0,5%, или от 0,2% до 0,3%) ЭПК,
(b) по меньшей мере 15% (или от 15% до 55%, или от 30% до 55%, или от 33% до 36%) белка,
(c) по меньшей мере 9% (или от 9% до 35%, или от 18% до 35%, или от 18% до 24%) жира,
(d) по меньшей мере один из следующих компонентов:
(i) по меньшей мере 250 МЕ/кг (или от 250 МЕ/кг до 1500 МЕ/кг, или от 500 МЕ/кг до 1500 МЕ/кг, или от 500 МЕ/кг до 1100 МЕ/кг) витамина E,
(xxviii) по меньшей мере 50 ч./млн (или от 50 ч./млн до 300 ч./млн, или от 100 ч./млн до 300 ч./млн, или от 100 ч./млн до 200 ч./млн) витамина C,
(xxix) по меньшей мере 1100 ч./млн (или от 1100 ч./млн до 3500 ч./млн, или от 2300 ч./млн до 3500 ч./млн, или от 2300 ч./млн до 2350 ч./млн) таурина, и
(xxx) по меньшей мере 200 ч./млн (или от 200 до 750 ч./млн, или от 400 ч./млн до 750 ч./млн, или от 400 до 525 ч./млн) карнитина, и
(xxxi) по меньшей мере 0,05% (или от 0,05% до 0,6%, или от 0,1% до 0,6%, или от 0,1% до 0,4%) цистеина,
(e) по меньшей мере 1600 ч./млн (или от 1600 ч./млн до 5000 ч./млн, или от 3300 ч./млн до 5000 ч./млн, или от 3300 ч./млн до 3400 ч./млн) холина,
(f) по меньшей мере 50 ч./млн (или от 50 ч./млн до 150 ч./млн, или от 100 ч./млн до 150 ч./млн, или от 100 ч./млн до 110 ч./млн) марганца, и
(g) по меньшей мере 0,7% (или от 0,7% до 3%, или от 1,4% до 3%, или от 1,4% до 1,7%) лизина, и
(h) по меньшей мере от 0,4% до 1,5% метионина.
Способы лечения или профилактики заболеваний и расстройств
Изобретение относится к способам лечения или профилактики заболеваний и расстройств, включающим введение композиций настоящего изобретения, которые эффективны при модулировании экспрессии и/или активности белков, ассоциированных с ожирением у животных, как in vitro, так и in vivo. Авторы изобретения неожиданно обнаружили, что композиции настоящего изобретения являются эффективными в модулировании у животных белков, ассоциированных с ожирением. Не ограничиваясь какой-либо теорией, авторы полагают, что модулирование у животных экспрессии и/или активности белков, ассоциированных с ожирением, может быть использовано для лечения или профилактики расстройства, ассоциированного с аномальными уровнями глюкозы в крови, увеличением массы или уровнями жировых отложений. Изобретение, кроме того, относится к композициям и препаратам, которые могут быть использованы для модулирования активности белков у животных с избыточной массой и/или ожирением. Изобретение также относится к способам модулирования активности белков или генов, включающим введение субъекту, предпочтительно домашнему млекопитающему, нуждающемуся в указанном лечении или профилактике, терапевтически или профилактически эффективного количества композиции для модулирования у субъекта активности белка или гена, ассоциированного с ожирением. В иллюстративном варианте осуществления средством для модулирования киназной активности lyn является соединение настоящего изобретения.
В одном варианте осуществления композицию настоящего изобретения вводят млекопитающему, предпочтительно домашнему животному, имеющему сердечнососудистое заболевание, дислипидемию, дислипопротеинемию, расстройство метаболизма глюкозы, метаболический синдром (т.е. синдром X), PPAR-ассоциированное расстройство, сепсис, тромботическое расстройство, диабет типа II, ожирение, панкреатит, гипертензию, заболевание почек или воспаление.
В одном варианте осуществления термины «лечение» или «осуществление лечения» относятся к ослаблению заболевания или расстройства или по меньшей мере его одного видимого симптома, предпочтительно ассоциированного с ожирением. В другом варианте осуществления «лечение» или «осуществление лечения» относится к улучшению по меньшей мере одного измеряемого физического параметра, необязательно воспринимаемого животным. В еще одном варианте осуществления «лечение» или «осуществление лечения» относится к ингибированию прогрессирования заболевания или расстройства, либо физически, например, стабилизация видимого симптома, физиологически, например, стабилизация физического параметра, или как физически, так и физиологически. В еще одном варианте осуществления «лечение» или «осуществление лечения» относится к отсрочке появления заболевания или расстройства.
В некоторых вариантах осуществления композиции настоящего изобретения вводят пациенту, предпочтительно домашнему животному, в качестве профилактической меры против таких заболеваний. В используемом в настоящем описании смысле термины «профилактика» или «осуществление профилактики» относятся к уменьшению риска появления данного заболевания или расстройства. В предпочтительном варианте осуществления композиции настоящего изобретения вводят в качестве профилактической меры пациенту, предпочтительно домашнему животному, имеющему генетическую предрасположенность к сердечнососудистому заболеванию, дислипидемии, дислипопротеинемии, расстройству метаболизма глюкозы, метаболическому синдрому (т.е., синдрому X), PPAR-ассоциированному расстройству, сепсису, тромботическому расстройству, диабету типа II, ожирению, панкреатиту, гипертензии, заболеванию почек или воспалению.
В другом иллюстративном варианте осуществления композиции настоящего изобретения вводят в качестве профилактической меры домашнему животному, имеющему предрасположенность к сердечнососудистому заболеванию, дислипидемии, дислипопротеинемии, расстройству метаболизма глюкозы, метаболическому синдрому (т.е., синдрому X), PPAR-ассоциированному расстройству, сепсису, тромботическому расстройству, диабету типа II, ожирению, панкреатиту, гипертензии, заболеванию почек или воспалению. Соответственно, композиции настоящего изобретения можно применять для профилактики одного заболевания или расстройства и одновременно для лечения другого (например, профилактика ожирения и при этом лечение диабета; профилактика воспаления и при этом лечение сердечнососудистого заболевания).
Сердечнососудистые заболевания, подвергаемые лечению или профилактике
Изобретение относится к способам лечения или профилактики сердечнососудистого заболевания, включающим введение домашнему животному терапевтически эффективного количества композиции настоящего изобретения и фармацевтически приемлемого наполнителя. В некоторых вариантах осуществления сердечнососудистое заболевание ассоциировано с аномальной/измененной экспрессией белка. В используемом в настоящем описании смысле термин «сердечнососудистые заболевания» относится к заболеваниям сердца и кровеносной системы. Такие заболевания часто ассоциированы с дислипопротеинемией и/или дислипидемией. Сердечнососудистые заболевания, для профилактики или лечения которых могут быть использованы композиции настоящего изобретения, включают, но без ограничения, артериосклероз; атеросклероз; удар; ишемию; дисфункции эндотелия, в частности, дисфункции, влияющие на эластичность кровеносных сосудов; заболевание периферических сосудов; коронарную болезнь сердца; инфаркт миокарда; церебральный инфаркт и рестеноз.
Дислипидемии, подвергаемые лечению или профилактике
Настоящее изобретение относится к способам лечения или профилактики дислипидемии, включающим введение домашнему животному терапевтически эффективного количества композиции настоящего изобретения и фармацевтически приемлемого наполнителя. В некоторых вариантах осуществления дислипидемия ассоциирована с аномальной/измененной активностью и/или экспрессией киназы lyn. В используемом в настоящем описании смысле термин «дислипидемии» относится к расстройствам, которые приводят или проявляются в виде аномальных уровней циркулирующих липидов. В тех случаях, когда уровни липидов в крови слишком высоки, композиции настоящего изобретения вводят домашнему животному, чтобы восстановить нормальные уровни. Нормальные уровни липидов сообщаются в медицинских трудах, известных специалистам в данной области. Например, рекомендованные уровни в крови ЛПНП, ЛПВП, свободных триглицеридов и других параметров, относящихся к метаболизму липидов, можно найти на веб-сайте Американской ассоциации кардиологов (American Heart Association) и веб-сайте национальной образовательной программы по холестерину Национального института болезней сердца, легких и крови. В настоящее время рекомендованный уровень холестерина ЛПВП в крови составляет более 35 мг/дл; рекомендованный уровень холестерина ЛПНП в крови составляет ниже 130 мг/дл; рекомендованное соотношение холестеринов ЛПНП:ЛПВП в крови ниже 5:1, идеально 3,5:1; и рекомендованный уровень свободных триглицеридов в крови составляет менее 200 мг/дл.
Дислипидемии, для профилактики или лечения которых могут быть использованы композиции настоящего изобретения, включают, но без ограничения, гиперлипидемию и низкие уровни в крови холестерина липопротеинов высокой плотности (ЛПВП). В некоторых вариантах осуществления гиперлипидемией, подвергаемой профилактике или лечению соединениями настоящего изобретения, является семейная гиперхолестеринемия; семейная комбинированная гиперлипидемия; пониженные уровни или недостаточные уровни или активность липопротеинлипазы, включая снижение или недостаточность в результате мутаций липопротеинлипазы; гипертриглицеридемия; гиперхолестеринемия; высокие уровни в крови кетоновых тел (например, -OH-масляной кислоты); высокие уровни в крови Lp(a)-холестерина; высокие уровни в крови холестерина липопротеинов низкой плотности (ЛПНП); высокие уровни в крови холестерина липопротеинов очень низкой плотности (ЛПОНП) и высокие уровни в крови неэтерифицированных жирных кислот.
Кроме того, настоящее изобретение относится к способам изменения метаболизма липидов у пациента, например, уменьшения ЛПНП в крови домашнего животного, уменьшения свободных триглицеридов в крови пациента, увеличения отношения ЛПВП к ЛПНП в крови пациента и ингибирования синтеза омыленных и/или неомыленных жирных кислот, при этом указанные способы включают введение пациенту композиции, содержащей соединение настоящего изобретения в количестве, эффективном для изменения метаболизма липидов.
Дислипопротеинемии, подвергаемые лечению или профилактике
Изобретение относится к способам лечения или профилактики дислипопротеинемии, включающим введение домашнему животному терапевтически эффективного количества композиции настоящего изобретения и фармацевтически приемлемого наполнителя. В используемом в настоящем описании смысле термин «дислипопротеинемии» относится к расстройствам, которые приводят или проявляются в виде аномальных уровней циркулирующих липопротеинов. В том случае, когда уровни липопротеинов в крови слишком высоки, пациенту вводят композиции настоящего изобретения, чтобы восстановить нормальные уровни. Наоборот, в том случае, когда уровни липопротеинов в крови слишком низкие, пациенту вводят композиции настоящего изобретения, чтобы восстановить нормальные уровни. Нормальные уровни липопротеинов указаны в медицинских трудах, известных специалистам в данной области.
Дислипопротеинемии, для профилактики или лечения которых могут быть использованы композиции настоящего изобретения, включают, но без ограничения, высокие уровни в крови ЛПНП; высокие уровни в крови аполипопротеина B (apo B); высокие уровни в крови Lp(a); высокие уровни в крови apo(a); высокие уровни в крови ЛПОНП; низкие уровни в крови ЛПВП; пониженные или недостаточные уровни или активность липопротеинлипазы, включая снижение или недостаточность в результате мутаций липопротеинлипазы; гипоальфалипопротеинемию; аномалии липопротеинов, ассоциированные с диабетом; аномалии липопротеинов, ассоциированные с диабетом типа II, ожирением; аномалии липопротеинов, ассоциированные с болезнью Альцгеймера; и семейную комбинированную гиперлипидемию.
Расстройства метаболизма глюкозы, подвергаемые лечению или профилактике
Изобретение относится к способам лечения или профилактики расстройства метаболизма глюкозы, включающим введение домашнему животному терапевтически эффективного количества композиции настоящего изобретения и фармацевтически приемлемого наполнителя. В используемом в настоящем описании смысле термин «расстройства метаболизма глюкозы» относится к расстройствам, которые приводят или проявляются аномальным накоплением и/или утилизацией глюкозы. В том случае, когда показатели метаболизма глюкозы (т.е. инсулин крови, глюкоза крови) являются слишком высокими, пациенту вводят композиции настоящего изобретения, чтобы восстановить нормальные уровни. Наоборот, в том случае, когда показатели метаболизма глюкозы являются слишком низкими, пациенту вводят композиции настоящего изобретения, чтобы восстановить нормальные уровни. Нормальные показатели метаболизма глюкозы приведены в медицинских трудах, известных специалистам в данной области. В некоторых вариантах осуществления расстройство метаболизма глюкозы ассоциировано с аномальной/измененной активностью и/или экспрессией киназы lyn.
Расстройства метаболизма глюкозы, для профилактики или лечения которых могут быть использованы композиции настоящего изобретения, включают, но без ограничения, нарушенную толерантность к глюкозе; резистентность к инсулину; связанную с резистентностью к инсулину злокачественную опухоль молочной железы, ободочной кишки или простаты; диабет, включая, но без ограничения, инсулиннезависимый сахарный диабет (NIDDM), инсулинозависимый сахарный диабет (IDDM), гестационный сахарный диабет (GDM) и диабет зрелого возраста у молодых (MODY); панкреатит; гипертензия; поликистоз яичника; и высокие уровни в крови инсулина и/или глюкозы.
Изобретение, кроме того, относится к способам изменения метаболизма глюкозы у пациента, например, для повышения чувствительности к инсулину и/или потребления кислорода у домашнего животного, при этом указанные способы включают введение домашнему животному композиции, содержащей соединение настоящего изобретения в количестве, эффективном для изменения метаболизма глюкозы.
Лечение или профилактика метаболического синдрома
В используемом в настоящем описании смысле «лечение или профилактика синдрома X или метаболического синдрома» охватывает лечение или профилактику симптома, ассоциированного с метаболическим синдромом, включая, но без ограничения, нарушенную толерантность к глюкозе, гипертензию и дислипидемию и/или дислипопротеинемию. В некоторых вариантах осуществления метаболический синдром ассоциирован с аномальной/измененной активностью и/или экспрессией киназы lyn.
Метаболический синдром характеризуется у пациента группой метаболических факторов риска. Факторы риска, которые ассоциированы с метаболическим синдромом, который можно лечить или предотвращать посредством введения композиции, содержащей соединение настоящего изобретения, включают, но без ограничения, центральный тип ожирения (т.е., наличие избыточной жировой ткани в и вокруг абдоминальной области); атерогенную дислипидемию (жировые расстройства крови, главным образом высокое содержание триглицеридов и низкое содержание холестерина ЛПВП, что стимулирует отложения бляшек в стенках артерий); гипертензия (130/85 мм Hg или выше); резистентность к инсулину или непереносимость глюкозы (организм не может правильно использовать инсулин или сахар крови); протромботический статус (например, высокий уровень фибриногена или ингибитора активатора плазминогена [-1] в крови); и провоспалительное состояние (например, повышенное содержание высокочувствительного C-реактивного белка в крови).
Причинами, лежащими в основе такого синдрома, являются избыточная масса/ожирение, физическая пассивность и генетические факторы, при этом для домашнего животного с метаболическим синдромом существует повышенный риск коронарной болезни сердца, других заболеваний, связанных с отложениями бляшек в стенках артерий (например, удара и болезни периферических сосудов), и диабета типа 2.
Метаболический синдром тесно ассоциирован с генерализованным метаболическим расстройством, называемым резистентностью к инсулину, при котором организм не может эффективно использовать инсулин. Поэтому метаболический синдром также называют синдромом резистентности к инсулину.
Некоторые домашние животные генетически предрасположены к развитию резистентности к инсулину. Приобретенные факторы, такие как избыток жира в организме и физическая пассивность, могут вызвать резистентность к инсулину и метаболический синдром у таких особей. Большинство домашних животных с резистентностью к инсулину имеют центральный тип ожирения. Биологические механизмы на молекулярном уровне, обеспечивающие взаимосвязь между резистентностью к инсулину и метаболическими факторами риска неполностью выяснены, и, по-видимому, являются сложными.
Поэтому композиции настоящего изобретения могут быть использованы для лечения или профилактики метаболического синдрома и расстройств и факторов риска, ассоциированных с метаболическим синдромом.
Лечение или профилактика диабета типа II
В используемом в настоящем описании смысле «лечение или профилактика диабета типа II» охватывает лечение или профилактику осложнения, ассоциированного с диабетом типа II, включая, но без ограничения, ретинопатию (т.е. слепоту); невропатию (т.е. повреждение нервов), которая приводит к язвам стопы, гангрене и ампутациям; повреждение почек, которое приводит к диализу; и сердечнососудистое заболевание. В некоторых вариантах осуществления диабет типа II ассоциирован с аномальной/измененной активностью и/или экспрессией киназы lyn.
Диабет типа II ассоциирован с ожирением и старением. Это зависимое от образа жизни заболевание, и оно имеет сильную генетическую компоненту (конкордантность у близнецов составляет 80-90%). По-видимому, проблема не столько в продуцировании инсулина, сколько в том, что когда инсулин достигает клеток-мишеней, он не может правильно работать. Большинство пациентов с диабетом типа II сначала имеют высокие уровни инсулина наряду с высоким содержанием сахара в крови. Однако так как сахар дает сигналы поджелудочной железе к высвобождению инсулина, то больные диабетом типа II, в конце концов, становятся резистентными к такому сигналу и эндокринная поджелудочная железа вскоре перестает производить достаточно инсулина. Для того чтобы справиться с заболеванием, таким домашним животным, в конце концов, нужен инсулин, и они нуждаются в намного более высоких дозах, так как они резистентны к нему.
Когда домашнее животное имеет высокую нагрузку сахаром, сахар стимулирует поджелудочную железу к высвобождению инсулина. Мишенями инсулина являются клетки мышц, жировые клетки и клетки печени. Такие клетки имеют участки рецепторов инсулинов на внешней стороне клеточной мембраны. У большинства домашних животных в том случае, когда инсулин связывается с рецепторами, начинается каскад событий, который приводит к транспорту сахара из крови во внутреннюю часть клетки. У больных диабетом типа II, даже когда инсулин присутствует на клеточной мембране, процесс не работает. Глюкоза никогда не перемещается в клетку и остается кровотоке.
Печень ответственна на продуцирование глюкозы, а инсулин является регуляторным средством продуцирования глюкозы. Высокое содержание сахара в крови заставляет поджелудочную железу высвобождать инсулин, и инсулин должен передавать сигнал печени, чтобы остановить продуцирование сахаров. Но у больных диабетом существует резистентность к такому сигналу, и печень продолжает продуцировать глюкозу. Гипергликемия приводит к токсичности глюкозы.
Патологическим процессом при диабете является невысокое содержание сахара в крови и осложнения в результате высокого содержания сахара в крови. Основной проблемой, стоящей перед врачами, является то, что некоторые пациенты с высоким содержанием сахара в крови чувствуют себя хорошо; трудно лечить заболевания, которые являются бессимптомными, так как большинство пациентов не хотят принимать таблетку из-за того, что они не чувствуют себя плохо. Поэтому композиции, содержащие соединение настоящего изобретения, могут быть использованы для лечения или профилактики диабета типа II или осложнений, возникающих в результате диабета типа II, и расстройств и факторов риска, ассоциированных с метаболическим синдромом. Осложнения диабета включают, но без ограничения, диабетическую невропатию, диабетическую ретинопатию, эректильную дисфункцию и заболевание почек, и соединения настоящего изобретения могут быть использованы для лечения или профилактики таких осложнений.
Лечение или профилактика ожирения
В используемом в настоящем описании смысле термин «лечение или профилактика ожирения» охватывает лечение или профилактику осложнения, ассоциированного с ожирением. Осложнения ожирения включают, но без ограничения, гиперхолестеринемию, гипертензию, дислипидемию (например, высокий уровень общего холестерина или высокие уровни триглицеридов), диабет типа 2, коронарную болезнь сердца, удар, заболевание желчного пузыря, остеоартрит, апноэ во сне и проблемы с дыханием, и некоторые злокачественные опухоли (эндометрия, молочной железы и ободочной кишки). В некоторых вариантах осуществления ожирение ассоциировано с аномальной/измененной активностью и/или экспрессией киназы lyn.
Другие заболевания, подвергаемые лечению или профилактике
Настоящее изобретение относится к способам лечения или профилактики сепсиса, тромботических расстройств, панкреатита, гипертензии, воспаления и импотенции, включающим введение пациенту терапевтически эффективного количества композиции, содержащей соединение настоящего изобретения и фармацевтически приемлемый носитель. В некоторых вариантах осуществления такие расстройства ассоциированы с аномальной/измененной активностью и/или экспрессией киназы lyn.
В используемом в настоящем описании смысле термин «лечение или профилактика сепсиса» охватывает лечение или профилактику септического шока.
В используемом в настоящем описании смысле термин «лечение или профилактика тромботических расстройств» охватывает лечение или профилактику высоких уровней в крови фибриногена и стимуляцию фибринолиза.
Кроме лечения или профилактики ожирения композиции настоящего изобретения можно вводить пациенту, чтобы стимулировать снижение массы пациента.
Наборы настоящего изобретения
Когда набор содержит виртуальную упаковку, набор ограничен инструкциями в виртуальной среде в комбинации с одним или несколькими физическими компонентами набора. В одном варианте осуществления набор содержит зонды и/или другие физические компоненты, и инструкции по применению зондов и других компонентов доступны в интернете. Набор может содержать дополнительные объекты, такие как устройство для смешивания образцов, зонды и реагенты, и устройство для использования набора, например, лабораторные пробирки или посуда для смешивания.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к средствам передачи информации или инструкций, относящихся к одному или нескольким из следующих применений: (1) применение полинуклеотидов настоящего изобретения для выявления в образце экспрессии генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, (2) применение полинуклеотидов настоящего изобретения для измерения влияния тестируемого вещества на экспрессию одного или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, (3) применение полинуклеотидов настоящего изобретения для скрининга тестируемого вещества с целью определения того, возможно ли его использование для модулирования количества жировой ткани у животного, (4) применение полинуклеотидов настоящего изобретения для составления прогноза вероятности появлении избыточной массы у животного или для постановки диагноза, что животное является тучным, (5) применение полинуклеотидов настоящего изобретения для обработки генома животного, отличного от человека, или экспрессии генома животного, (6) применение полинуклеотидов настоящего изобретения для модулирования экспрессии одной или нескольких генов, дифференциально экспрессируемых у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности ассоциированных с жирами генов, или для модулирования количества жировой ткани у животного, (7) применение полинуклеотидов настоящего изобретения для отбора животного для включения его в одну или несколько групп, (8) применение полинуклеотидов настоящего изобретения для использования компьютерной системы для обработки данных, относящихся к генам, дифференциально экспрессируемым у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными, в частности, ассоциированным с жирами генов, (9) введение веществ настоящего изобретения животному, отдельно или в комбинации с другими элементами настоящего изобретения, (10) применение веществ настоящего изобретения для модулирования количества жировой ткани у животного, (11) применение компьютерной системы настоящего изобретения, (12) применение наборов настоящего изобретения, и (13) инструкций по применению способов и композиций настоящего изобретения с одним или несколькими лекарственными средствами или другими веществами, которые модулируют количество жировой ткани у животного. Средства включают документ, цифровую запоминающую среду, оптическое запоминающее устройство, представление звуковыми средствами или визуальное изображение, содержащие информацию или инструкции. В некоторых вариантах осуществления средством связи является выведение на устройство отображения веб-сайта, визуальное изображение, автономная императивная система мультимедиа со свободным доступом, брошюра, товарная этикетка, вкладыш в упаковку, рекламное объявление, проспект, публичное сообщение, лента для звукозаписи, видеопленка, DVD, CD-ROM, компьютерный считываемый чип, компьютерная считываемая карта, компьютерный считываемый диск, память компьютера или их комбинация, содержащая такую информацию или инструкции. Используемая информация включает информацию по одному или нескольким из следующих пунктов (1) информацию о способах, способствующих здоровью и хорошему самочувствию животных и (2) контактная информация для людей, ухаживающих за животными, по применению, если они имеют вопрос по изобретению и его применению. Полезные инструкции включают методики применения зондов, инструкции по осуществлению анализа экспрессии генов и инструкции о количествах и частоте введения веществ. Средства связи могут быть использованы для инструктирования относительно преимуществ применения настоящего изобретения.
В настоящем описании раскрыты конкретные иллюстративные варианты осуществления изобретения, и хотя использованы специальные термины, они использованы только в общем и описательном смысле, а не в целях ограничения, так как возможны многие модификации и изменения изобретения в свете инструкций, приведенных в настоящем описании. Изобретение, кроме того, может быть проиллюстрировано следующими ниже примерами, хотя следует понимать, что такие примеры включены только в целях иллюстрации и не предназначены для ограничения объема изобретения, если специально не указано иное.
Примеры
Материалы и способы
Выделение рибонуклеиновой кислоты (РНК) из ткани
Образцы ткани, которые были собраны, замораживали в жидком азоте и размораживали, гомогенизировали и обрабатывали, используя способ экстракции РНК TRIzol®, получая РНК хорошего качества, которую затем подвергали дальнейшему анализу генома.
Материалы: лед, жидкий азот, замороженная ткань собаки или кошки, реагент для лизиса TRIzol®, хлороформ не менее 99%, изопропиловый спирт, 70% этанол (полученный с использованием абсолютного этанола и деионизованной не содержащей РНКаз воды), РНКаза Zap®, деионизованная вода, раствор для хранения РНК Ambion.
Оборудование: гомогенизатор Ultra-Turrax T25 Power, центрифуга Beckman Coulter Allegra 25R, центрифуга Eppendorf, пинцеты, скальпель, твердая поверхность для резки, т.е. доска для резки, микроцентрифужные пробирки, не содержащие ДНКазы и РНКазы, объемом 1,5 мл, одноразовые не содержащие ДНКазы и РНКазы/стерильные полипропиленовые пробирки, объемом 50 мл, пипетки P1000, P200, P20, P1O и P2 Rainin Pipetman, наконечники пипеток с фильтрами для пипеток P1000, P200, P20, P10 и P2, не содержащие ДНКазы и РНКазы/стерильные и неворсистые салфетки.
Подготовка: готовят полипропиленовые пробирки объемом 50 мл с 4 мл TRIzol® (одна пробирка для каждой ткани, выбранной для выделения РНК).
Гомогенизация ткани: Наполняют емкость, способную удерживать жидкий азот, 3-4 ложками жидкого азота. Сразу помещают кусочек замороженной ткани в указанную выше емкость (ткань должна иметь размер горошины) и помещают ткань в подходящую помеченную полипропиленовую пробирку объемом 50 мл (которая уже содержит 4 мл TRIzol®). Сразу же начинают гомогенизацию, используя гомогенизатор Ultra-Turrax T25 Power. Гомогенизируют при наиболее высоких параметрах установки (6) в течение 10-15 секунд. Охлаждают образец на льду еще в течение 10-15 секунд и затем повторяют обработку. Обработку продолжают вплоть до полной гомогенизации ткани и пока раствор не станет мутным. После завершения гомогенизации пробирку объемом 50 мл закрывают и возвращают на лед. Гомогенизированную ткань инкубируют при комнатной температуре в течение 5 минут перед обработкой с использованием способа выделения.
Выделение РНК: Обычно следуют методикам, приведенным в инструкциях Invitrogen, прилагаемых к реагенту TRIzol®. Разделяют гомогенизированный образец на четыре аликвоты объемом 1 мл в четыре микроцентрифужные пробирки объемом 1,5 мл. Добавляют 200 мкл хлороформа к каждой аликвоте объемом 1 мл. Пробирки закрывают, встряхивают с вихревым перемешиванием в течение 15 секунд и затем встряхивают в направлении вверх и вниз. В результате должна получиться розовая молочная жидкость. Пробирки инкубируют при комнатной температуре в течение 2-3 минут. Пробирки центрифугируют в течение 15 минут при 14000 об/мин и 4°C. Водную фазу (верхний слой) переносят в стерильную микроцентрифужную пробирку объемом 1,5 мл. Обычно объем водной фазы, которую следует перенести в новую пробирку, составляет 500 мкл. Убеждаются, что не перенесли ни промежуточной фазы, ни нижней фазы. РНК осаждают из раствора добавлением 500 мкл изопропилового спирта в каждую микроцентрифужную пробирку, содержащую водный слой. Пробирки встряхивают вверх и вниз в течение по меньшей мере 20 секунд. Образцы инкубируют при комнатной температуре в течение 10 минут. Образцы центрифугируют в течение 10 минут при 14000 об/мин и 4°C. Супернатант осторожно удаляют аспирацией жидкости, стараясь не потерять осадок. Добавляют 1 мл 70% этанола, для промывки осадка. Осадок сдвигают с места резким встряхиванием пробирки (или постукиванием пробирки о рабочую поверхность стола) и встряхивают для перемешивания. Центрифугируют в течение 5 минут при 8200 об/мин и 4°C. Осторожно удаляют супернатант аспирацией, стараясь не потерять осадок. Используя неворсистую салфетку, осторожно промокают избыток этанола, чтобы подсушить осадок. Каждый осадок ресуспендируют в 30 мкл раствора для сохранения РНК. Осторожно перемешивают пипетированием, пока РНК снова не перейдет в раствор, и затем хранят при -80°C. Может быть необходимо вихревое встряхивание образца в течение нескольких секунд с низкой скоростью, чтобы облегчить ресуспендирование РНК. При необходимости перед замораживанием образцы центрифугируют, используя микроцентрифугу.
Очистка РНК: Следующие способы описаны в руководстве RNeasy® Mini.
Выделение РНК из клеток, культивированных в камерах OptiCell, с использованием мининабора RNeasy
Культивированные клетки клеточных линий млекопитающих используют для выделения РНК хорошего качества, которую затем используют для будущего анализа генома вниз по ходу транскрипции. Всю работу, связанную с культивированием клеток, необходимо осуществлять в абсолютно асептических условиях.
Реагенты: 10X PBS, деионизованная H2O, абсолютный этанол, раствор для хранения РНК, -меркаптоэтанол, РНКаза Zap®, буфер RLT и буфер RW1 и буфер RPE (поставляемый в мининаборе RNeasy).
Оборудование/Материалы: Мининабор RNeasy, центрифужные колонки QIAshredder, скальпель OptiCell, стерильный шприц на 20 мл, наконечники OptiCell, скребок для клеток, пипетка Pipetman P1000, Rainin, пипетка Pipetman P200, Rainin, наконечники к пипеткам с фильтрами 100-1000 мкл, наконечники к пипетками с фильтрами 1-200 мкл, стерильные пипетки для переноса, стерильный лоток для раствора объемом 55 мл, стерильные микроцентрифужные пробирки объемом 1,5 мл и микроцентрифуга Eppendorf.
Растворы: Буфер RLT (исходный раствор, поставляемый в мининаборе RNeasy) добавляют 100 мкл -меркаптоэтанола на 10 мл буфера RLT перед началом выполнения протокола. 70% этанол: готовят 50 мл 70% этанола добавлением 35 мл абсолютного этанола к 15 мл деионизованной не содержащей РНКаз воды. 1X PBS: не содержащая РНКаз вода. Раствор фильтруют, используя 0,22 мкм-фильтр.
Способ: Извлечение клеток из камеры OptiCell (обрабатывают одну камеру OptiCell за один раз). Проверяют клетки под микроскопом, чтобы гарантировать, что клетки являются живыми перед выделением РНК. Удаляют и отбрасывают среду культивирования клеток. Используя скальпель OptiCell, срезают верхнюю мембрану, раскрывая клетки на нижней мембране. Мембрану, на которой прикреплены клетки, промывают три раза 1X PBS. Пипеткой вносят 600 мкл буферного раствора RLT (содержащего -меркаптоэтанол) в центр мембраны, на которой прикреплены клетки. Используя скребок для клеток, осторожно распределяют буфер RLT по всей поверхности мембраны и затем собирают жидкость в одном углу. Пипеткой собирают весь объем буфера RLT и помещают в центрифужную колонку QIAshredder.
Выделение РНК: Центрифугируют центрифужные колонки QIAshredder при 14000 об/мин в течение 2 минут. Убирают центрифужную колонку, но оставляют пробирку для сбора и ее содержимое. В пробирку для сбора добавляют 600 мкл 70% этанола и тщательно перемешивают пипетированием (теперь суммарный объем составляет 1,2 мл). Переносят 600 мкл клеточного лизата в миниколонку RNeasy и центрифугируют в течение 15 секунд при 14000 об/мин. Удаляют проходящий поток, но оставляют пробирку для сбора и центрифужную колонку. Переносят остальной объем клеточного лизата (~600 мкл) в центрифужную колонку и повторяют центрифугирование. Удаляют проходящий поток, но оставляют пробирку для сбора и центрифужную колонку. В центрифужную колонку добавляют 700 мкл буфера RW1. Центрифугируют в течение 15 секунд при 14000 об/мин, чтобы промыть колонку. Удаляют проходящий поток и пробирку для сбора. Переносят центрифужную колонку в новую пробирку для сбора объемом 2 мл и в колонку добавляют 500 мкл буфера RPE. Центрифугируют в течение 15 секунд при 14000 об/мин. Удаляют проходящий поток, оставляя пробирку для сбора/колонку. В колонку добавляют еще 500 мкл буфера RPE. Центрифугируют в течение 2 минут при 14000 об/мин. Центрифужную колонку переносят в пробирку для сбора объемом 1,5 мл. Добавляют 30 мкл раствора для хранения РНК непосредственно на мембрану из силикагеля и центрифугируют в течение 1 минуты при 14000 об/мин, чтобы элюировать РНК. Конечную РНК хранят при -70°C.
Анализ RNA 6000 Nano
Используя биоанализатор Agilent 2100 и анализ RNA 6000 Nano, анализируют РНК, выделенную из культивированных клеток млекопитающих, лимфоцитов или тканей в отношении качества.
Реагенты: гелевый матрикс RNA 6000 Nano, концентрат красителя RNA 6000 Nano, маркер RNA 6000 Nano (все указанные выше реагенты входят в набор для анализа RNA 6000 Nano, Agilent), лэддер RNA 6000, РНКаза Zap и не содержащая РНКаз вода из Ambion.
Оборудование/другие материалы: Agilent Chip Priming Station, Agilent, чип RNA 6000, Agilent, очистители электродов, стерильные пипетки P2, P10, P200 и P1000 Rainin Pipetman, не содержащие ДНКазы/РНКазы наконечники для пипеток с фильтрами, стерильные микроцентрифужные пробирки объемом 1,5 мл, вихревой встряхиватель, вихревая мешалка IKA, микроцентрифуга и нагревательный блок.
Способ: Способ приведен в руководстве к набору реагентов для анализа RNA 6000 Nano, редакция в ноябре 2003, Agilent Technologies. Способ осуществляют, как описано в руководстве, со следующими модификациями: Приготовление геля, стр. 17 - вместо того, чтобы разделять профильтрованный гель на аликвоты по 65 мкл каждая, исходный профильтрованный гель сохраняют в исходной микроцентрифужной пробирке и отбирают аликвоты по 65 мкл при необходимости. Загрузка маркера RNA 6000 Nano, стр. 22 - добавляют 1 мкл не содержащей РНКазы воды (вместо маркера RNA 6000 Nano) в каждую лунку для образцов, которая не должна содержать образца. Это не только позволит сберечь некоторое количество используемого маркера, но также служит в качестве негативного контроля, чтобы видеть, что ни один из реагентов не содержит примесей, включая не содержащую РНКаз воду. Загрузка лэддера и образцов, стр. 23 - с помощью нагревания денатурируют образцы и лэддер RNA 6000 дополнительно в течение 30 секунд (всего 2,5 минуты) при 71°C. Начало работы чипа, стр. 26 - выбирают опцию «Eukaryote Total RNA Nano» в меню анализа.
Анализ экспрессии с использованием Genechip Affymetrix
Экспрессию генов анализируют, используя GeneChip® Affymetrix Canine 1 и Canine 2. Матрицы коммерчески доступны от Affymetrix, Inc., Santa Clara, CA 95051. Суммарную РНК обратно транскрибируют в кДНК. кДНК используют для создания кРНК, которую фрагментируют и используют в качестве зондов для гибридизации на чипах GeneChip. Чипы с генами промывают и измеряют сигнал гибридизации с использованием лазерного сканнера Affymetrix. Затем данные по гибридизации подтверждают и нормализуют для последующего анализа.
Материалы: Affymetrix поставляет большинство реагентов и набор. Другие реагенты, перечисленные в руководстве Affymetrix, но не поставляемые в наборе, могут быть получены отдельно (подробности см. в техническом руководстве по анализу экспрессии GeneChip (701021 Rev.4)), РНКаза Zap® и деионизованная вода.
Оборудование: микроцентрифуга Eppendorf, не содержащие ДНКазы и РНКазы/стерильные микроцентрифужные пробирки объемом 1,5 мл, одноразовые не содержащие ДНКазы и РНКазы/стерильные полипропиленовые пробирки объемом 50 мл, пипетки P1000, P200, P20, P10 и P2 Rainin Pipetman, не содержащие ДНКазы и РНКазы/стерильные наконечники к пипеткам с фильтрами для пипеток P1000, P200, P20, P10 и P2, и термоциклер Peltier PTC-200.
Способ: Все процедуры выполняли точно, согласно описанному в техническом руководстве по анализу экспрессии GeneChip (Affymetrix Copyright 1999-2003). Используют 5 микрограмм суммарной РНК для синтеза первой нити кДНК. Используют либо термоциклер Peltier PTC-200, либо нагревательный блок для контролирования температуры реакций и денатурации зондов. Контроль качества осуществляют, используя чипы RNA NanoDrop, с помощью биоанализатора 2100. Используют форму 100 (матрица Midi) для чипа генов собак.
Пример 1
Определение дифференциальной экспрессии генов в образцах жировой ткани животных с избыточной массой и худых животных
Образцы жировой ткани получали от 18 (3 худых и 15 тучных) собак, или получали лимфоциты от 44 (12 худых и 32 тучных) собак, которые были диагностированы как «тучные» или «худые» с использованием обычных способов. «Тучность» или «худобу» животного определяли на основе измерений DEXA с использованием обычных способов или на основе системы оценки упитанности тела по 5 точкам. Например, животное считают худым, если оно имеет оценку упитанности тела 2 или 2,5 и/или процентное содержание общего жира согласно DEXA 27% или менее. Животного считают имеющим избыточную массу, если оно имеет оценку упитанности тела 4 или выше и процентное содержание общего жира в организме 30% или более. Все твердые образцы тканей моментально замораживали в жидком азоте сразу после извлечения из организма животного. Лимфоциты выделяли, используя пробирку для получения клеток BD Vacutainer® CPTTM, согласно инструкциям производителей и также моментально замораживали до использования.
Все образцы анализировали, используя чипы GeneChips® Affymetrix Canine-2, согласно рекомендациям производителей, чтобы определить, какие гены дифференциально экспрессируются у животных с избыточной массой по сравнению с худыми животными.
Данные анализировали, используя Partek® GS (Partek Inc., St. Charles, MO) в качестве компьютерной программы для данных по экспрессии генов (Partek Incorporated, 12747 Olive Blvd., Suite 205, St. Louis, Missouri 63141, U.S.A. http://www.partek.com/partekgs geneexpression). Алгоритм Robust Multichip Average (RMA) (Rafael. A. Irizarry, Benjamin M. Bolstad, Francois Collin, Leslie M. Cope, Bridget Hobbs and Terence P. Speed (2003), Summaries of Affymetrix GeneChip probe level data, Nucleic Acids Research 31(4):e15) использовали для корректировки фона, нормализации и подведения итогов относительно уровней зондов для образцов GeneChip®. Проводили анализ ANOVA, чтобы найти значимые дифференциально экспрессируемые гены среди любых двух групп с использованием контроля минимальной FDR при 0,1 (или p-значении 0,1 или 0,05, если мощность была недостаточной для применения FDR) и кратного изменения 1,3 в каждом направлении. Проведенные авторами эмпирические исследования показали, что GeneChips® Canine-2 имеет сопутствующий 1,3-кратный уровень шума. Поэтому во всех анализах, представленных в настоящем описании, использовали +/-1,3-кратный порог отсечения. Кроме того, порог средней доли ложных отклонений гипотез 0,1 (означает, что 10% наблюдений являются случайными) выбирали в качестве минимального уровня приемлемой статистической значимости для исследований, в которых включали не менее 12 животных на группу. Исследования с меньшими количествами животных не имели достаточной силы, чтобы обеспечить правильное применение FDR. Результаты представлены в таблицах ниже.
Таблица 1 Гены, дифференциально экспрессируемые в жировой ткани тучных животных по сравнению с худыми животными
Тучные по сравнению с худыми (сравнение экспрессии генов в жировой ткани), все гены, порог отсечения кратного изменения: 1,3; порог отсечения P-значения: 0,1; порог отсечения Q-значения: 1
Количество образцов в группе 1 (тучные): 15, в группе 2 (худые): 3
Кратное изменение >1 предполагает, что зонды повергаются повышающей регуляции в образцах жировой ткани тучных животных
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2, содержащей домен аррестина 2; вариант транскрипта 3 (LOC609489); мРНК
XM 860432
ARRDC2
содержащий домен аррестина 2
CfaAffx. 3339.1.S1 at
9,06E-02
1,00E+00
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с щелочной церамидазой 2 (LOC481553); мРНК
XM 538674
ASAH3L
подобный N-ацилфингозинамидогидролазе 3
Таблица 1: Гены, дифференциально экспрессируемые в жировой ткани тучных животных по сравнению с худыми животными
CfaAffx. 26949.1.S1 at
7,35E-02
1,00+00
0,55
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2, содержащим повтор анкирина и SOCS-бокс, (рассчитанный); вариант транскрипта 1 (LOC490836); мРНК
XM 547958
ASB2
содержащий повтор анкирина и SOCS-бокс, 2
Cfa. 10230.1.A1 at
7,69E-02
1,00E+00
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с АТФ-азой; переносчик аминофосфолипидов (APLT); класс I; тип 8A; представитель 1; вариант транскрипта 2 (LOC607976); мРНК
XM 853476
ATP8A1
АТФаза, переносчик аминофосфолипидов (APLT), класс I, тип 8A, представитель 1
Cfa. 16355.1.S1 s at
9,25E-02
1,00E+00
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с серин/треонин протеинкиназой 12 (Aurora- и Ipll-подобный ассоциированный с клеточной пластинкой белок 1) (AIM-1) (Aurora/IPLl-родственная киназа 2) (Aurora-родственная киназа 2) (STK 1) (Aurora-B); вариант транскрипта 4 (LOC479492); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с B-клеточный CLL/лимфома 6; представитель В (белок с цинковыми пальцами) (LOC489459); мРНК
XM 546577
BCL6B
B-клеточный CLL/лимфома 6, представитель В (белок с цинковыми пальцами)
Cfa. 7153.1.A1 s at
4,00E-02
1,00+00
0,41
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником морфогенного белка костей 2 (BMP-2) (BMP-2A); вариант транскрипта 1 (LOC477162); мРНК
XM 534351
BMP2
морфогенный белок костей 2
CfaAffx. 20448.1.S1 at
9,88E-02
1,00E+00
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком с цинковыми пальцами базонуклином 1 (LOC488756); мРНК
XM 545874
BNC1
базонуклин 1
CfaAffx. 28168.1.S1 at
6,80E-02
1,00E+00
0,69
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 6, содержащим домен BTB/POZ (белок с доменом Lens BTB); вариант транскрипта 2 (LOC611389); мРНК
XM 863593
BTBD6
содержащий домен BTB (POZ) 6
CfaAffx. 13161.1.S1 s at
2,64E-02
1,00E+00
0,58
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком BTG3 (белок Tob5) (белок, распространенный в области нейроэпителия); вариант транскрипта 2 (LOC487695); мРНК
XM 544819
BTG3
семейство BTG, представитель 3
Cfa. 10545.2.S1 s at
4,00E-02
1,00E+00
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, содержащим домен Brix 1; вариант транскрипта 2 (LOC475029); мРНК
XM 849359
BXDC1
содержащий домен brix, 1
Cfa. 11274.1.A1 at
8,77E-02
1,00E+00
0,71
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с суперсемейством иммуноглобулинов; представитель 4A, изоформа a; вариант транскрипта 3 (LOC695983); мРНК
XM 01089381
CADM1
молекула клеточной адгезии 1
Cfa. 3402.2.A1 at
8,07E-02
1,00E+00
1,51
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником калуменина; вариант транскрипта 4 (LOC475201); мРНК
XM 853521
CALU
калуменин
CfaAffx. 28438.1.S1 at
8,34E-02
1,00E+00
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, семейство доменов привлечения каспазы; представитель 6 (CARD6); мРНК
XM 01916765
CARD6
семейство доменов привлечения каспазы, представитель 6
Таблица 1: Гены, дифференциально экспрессируемые в жировой ткани тучных животных по сравнению с худыми животными
CfaAffx. 30657.1.S1 at
8,73E-02
1,00E+00
0,48
сходный с кинуренин-оксоглутараттрансаминазой I (кинуренинаминотрансфераза I) (KATI) (глутаминфенилпируваттрансаминаза) (глутаминтрансаминаза K) (GTK) (цистеин-S-конъюгирующая бета-лиаза) (LOC491310); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с протеинфосфатазой 18 двойной специфичности (фосфатаза 20 с двойной специфичностью и низкой молекулярной массой) (LOC486357); мРНК
XM 543483
DUSP18
фосфатаза 18 с двойной специфичностью
Таблица 1: Гены, дифференциально экспрессируемые в жировой ткани тучных животных по сравнению с худыми животными
Cfa. 16990.1.S1 at
3,22E-04
1,00E+00
1,65
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с дисферлином (ассоциированный с дистрофией fer-1-подобный белок) (Fer-1-подобный белок 1) (LOC483121); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с интегрином; предшественник альфа D (LOC607096); мРНК
XM 843683
ITGAD
интегрин, альфа D
Таблица 1: Гены, дифференциально экспрессируемые в жировой ткани тучных животных по сравнению с худыми животными
CfaAffx. 28297.1.S1 at
3,97E-02
1,00E+00
0,66
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с представителем семейства вариабельной аномальной морфологии (vab-19); вариант транскрипта 2 (LOC476723); мРНК
XM 849162
KAN КЗ
KN-мотив и домены повтора анкирина 3
Cfa. 15973.1.A1 at
7,96E-03
1,00E+00
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris сходный с KH domain containing; RNA binding; signal transduction associated 1; вариант транскрипта 1 (LOC487316); мРНК
XM 544442
KHDRBS1
KH-домен-содержащий, РНК-связывающий, ассоциированный с сигнальной трансдукцией 1
Таблица 1: Гены, дифференциально экспрессируемые в жировой ткани тучных животных по сравнению с худыми животными
Cfa. 20794.1.S1 at
1,12E-02
1,00E+00
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный со слиянием (вовлеченным в t(12;16) при злокачественной липосаркоме) (предполагаемый); вариант транскрипта 1 (LOC479778); мРНК
XM 536905
LOC479778
сходный со слиянием (вовлеченным в t12:16) при злокачественной липосаркоме) (предполагаемый)
Cfa. 20794.1.S1 s at
1,62E-02
1,00E+00
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный со слиянием (вовлеченным в t(12;16) при злокачественной липосаркоме) (предполагаемый); вариант транскрипта 7 (LOC479778); мРНК
XM 851770
LOC479778
сходный со слиянием (вовлеченным в t12:16) при злокачественной липосаркоме) (предполагаемый)
Cfa. 19285.1.S1 at
4,69E-02
1,00E+00
0,66
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом белка C9orf72; вариант транскрипта 1 (LOC481569); мРНК
XM 538691
LOC481569
сходный с гомологом белка C9orf72
CfaAffx. 3482.1.S1 s at
7,50E-02
1,00E+00
0,6
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом белка C9orf72; вариант транскрипта 4 (LOC481569); мРНК
XM 860140
LOC481569
сходный с гомологом белка C9orf72
CfaAffx. 3351.1.S1 s at
9,01E-03
1,00E+00
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 богатого цистеином и гистидином белка 1 изоформа 1 (LOC482097); мРНК
XM 539218
LOC482097
сходный с изоформой 1 богатого цистеином и гистидином белка 1
CfaAffx. 8785.1.S1 s at
2,96E-02
1,00E+00
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком KIAA0467 (LOC482532); мРНК
XM 539649
LOC482532
сходный с белком KIAA0467
Cfa. 13287.1.A1 s at
1,40E-02
1,00E+00
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG33154-PB; изоформа В (LOC482583); мРНК
белок 1, взаимодействующий с активируемой митогенами протеинкиназой 8
Cfa. 10212.1.A1 at
3,17E-02
1,00E+00
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, ассоциированным с микротрубочками; семейство RP/EB; представитель 3; вариант транскрипта 3 (LOC475694); мРНК
XM 854788
MAPRE3
ассоциированный с микротрубочками белок, семейство RP/EB, представитель 3
CfaAffx. 21136.1.S1 s at
9,18E-02
1,00E+00
0,67
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ассоциированными с микротрубочками белком tau (белок нейрофибриллярных клубков) (спаренный спиральный филамент-tau) (PHF-tau); вариант транскрипта 3 (LOC480488); мРНК
XM 855209
МАРТ
ассоциированный с микротрубочками белок tau
Cfa. 10118.1.A1 at
9,32E-02
1,00E+00
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 белка 8, поддерживающего минихромосомы; вариант транскрипта 1 (LOC477163); мРНК
XM 534352
MCM8
компонент 8 комплекса поддержания минихромосомы
Таблица 1: Гены, дифференциально экспрессируемые в жировой ткани тучных животных по сравнению с худыми животными
CfaAffx. 11578.1.S1 at
8,16E-02
1,00E+00
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником тирозинкиназы рецептора MER (LOC483060); мРНК
Таблица 1: Гены, дифференциально экспрессируемые в жировой ткани тучных животных по сравнению с худыми животными
Cfa. 2717.2.A1 at
5,44E-02
1,00E+00
0,65
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с нейротрофической тирозинкиназой; рецептор; предшественник изоформы c типа 3; вариант транскрипта 6 (NTRK3); мРНК
XM 001087841
NTRK3
нейротрофическая тирозинкиназа, рецептор типа 3
CfaAffx. 13803.1.S1 at
6,40E-02
1,00E+00
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником нуклеобиндина 2 (ДНК-связывающий белок NEFA) (антиген рака желудка Zg4); вариант транскрипта 7 (LOC476876); мРНК
XM 859996
NUCB2
нуклеобиндин 2
CfaAffx. 21366.1.S1 s at
2,20E-02
1,00E+00
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a белка 6, подобного оксистерин-связывающему белку; вариант транскрипта 1 (LOC478816); мРНК
XM 535978
OSB PL6
белок 6, подобный оксистерин-связывающему белку
Cfa. 5284.1.A1 at
9,31E-02
1,00E+00
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфопротеидом, ассоциированным с микродоменами гликосфинголипида 1 (LOC610895); мРНК
XM 848462
PAG1
фосфопротеид, ассоциированный с микродоменами гликосфинголипида 1
CfaAffx. 18467.1.S1 s at
8,37E-02
1,00E+00
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником изоформы 1 митохондриальной фосфоенолпируваткарбоксикиназой 2; вариант транскрипта 7 (LOC480255); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 3, подобным HMT1 гяРНП-метилтрансферазой; вариант транскрипта 1 (LOC476887); мРНК
XM 534089
PRMT3
протеинаргининметилтрансфераза 3
Cfa. 6910.1.A1 at
3,99E-02
1,00E+00
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с рибозофосфатпирофосфокиназой II (фосфорибозилпирофосфатсинтетаза II) (PRS-II); вариант транскрипта 5 (LOC476855); мРНК
XM 851577
PRPS2
фосфорибозилпирофосфатсинтетаза 2
CfaAffx. 19134.1.S1 at
1,66E-02
1,00E+00
0,71
Pan troglodytes, протеаза; сериновая; 12 (нейротрипсин; мотопсин) (PRSS12); мРНК
NM 001071807
PRS S12
протеаза, сериновая, 12 (нейротрипсин, мотопсин)
Таблица 1: Гены, дифференциально экспрессируемые в жировой ткани тучных животных по сравнению с худыми животными
CfaAffx. 10730.1.S1 at
5,23E-02
1,00E+00
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфатидилсеринсинтазой 2 (LOC483401); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с shroom (LOC478438); мРНК
XM 844910
SHROOM3
семейство shroom, представитель 3
Cfa. 21475.1.S1 at
2,78E-02
1,00E+00
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством трансмембранных белков SID1; представитель 2 (LOC489391); мРНК
XM 546509
SIDT2
семейство трансмембранных белков SID1, представитель 2
CfaAffx. 16900.1.S1 s at
9,11E-03
1,00E+00
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейство растворимых переносчиков 12; представитель 7 (электронейтральный переносчик калия-хлорида 4) (K-Cl-переносчик 4) (LOC488069); мРНК
XM 545193
SLC12A7
семейство растворимых переносчиков 12 (переносчики калия/хлорида), представитель 7
Cfa. 19806.1.S1 s at
7,93E-02
1,00E+00
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с переносчиком монокарбоксилата 1 (MCT 1); вариант транскрипта 3 (LOC475856); мРНК
XM 857592
SLC16A1
семейство растворимых переносчиков 16, представитель 1 (переносчик монокарбоновой кислоты 1)
Cfa. 16871.1.S1 at
5,07E-02
1,00E+00
0,54
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 27 (переносчик жирных кислот); представитель 6 (LOC474666); мРНК
XM 531894
SLC27A6
семейство растворимых переносчиков 27 (переносчик жирных кислот), представитель 6
Таблица 1: Гены, дифференциально экспрессируемые в жировой ткани тучных животных по сравнению с худыми животными
CfaAffx. 2004.1.S1 s at
1,11E-02
1,00E+00
0,48
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 27 (переносчик жирных кислот); представитель 6 (LOC474666); мРНК
XM 531894
SLC27A6
семейство растворимых переносчиков 27 (переносчик жирных кислот), представитель 6
CfaAffx. 16375.1.S1 s at
8,39E-03
1,00E+00
0,66
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с представителем 1 семейства растворимых переносчиков 37 (LOC487780); мРНК
XM 544905
SLC37A1
семейство растворимых переносчиков 37 (переносчик глицерин-3-фосфата), представитель 1
CfaAffx. 23808.1.S1 at
1,75E-02
1,00E+00
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 3 (активаторы транспорта двухосновных и нейтральных аминокислот); представитель 2, изоформа a (LOC483777); мРНК
XM 540898
SLC3A2
семейство растворимых переносчиков 3 (активаторы транспорта диосновных и нейтральных аминокислот), представитель 2
CfaAffx. 17822.1.S1 at
1,36E-02
1,00E+00
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с малой субъединицей 2 переносчика крупных нейтральных аминокислот (переносчик аминокислот L-типа 2) (hLAT2); вариант транскрипта 7 (LOC490608); мРНК
XM 853554
SLC7A8
Семейство растворимых переносчиков 7 (переносчик катионных аминокислот, Y+-система), представитель 8
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с трансмембранным белком 9, содержащим домен транспорта белка emp24; вариант транскрипта 1 (LOC481444); мРНК
XM 538565
TMED9
трансмембранный белок 9, содержащий домен транспорта белка emp24
CfaAffx. 1310.1.S1 at
4,56E-03
1,00E+00
1,51
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с трансмембранным белком 9, содержащим домен транспорта белка emp24; вариант транскрипта 1 (LOC481444); мРНК
XM 538565
TMED9
трансмембранный белок 9, содержащий домен транспорта белка emp24
CfaAffx. 4729.1.S1 at
3,53E-02
1,00E+00
2,29
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, белок 1, сходный с трансмембранным белком с EGF-подобным и двумя фоллистатин-подобными доменами; вариант транскрипта 2 (LOC612942); мРНК
XM 862118
TMEFF1
трансмембранный белок 1 с EGF-подобным и двумя фоллистатин-подобными доменами
Cfa. 1794.1.S1 at
6,31E-02
1,00E+00
0,69
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с BE10.2 (LOC475247); мРНК
XM 532481
TMEM195
трансмембранный белок 195
CfaAffx. 10111.1.S1 at
8,52E-02
1,00E+00
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG4050-PA; изоформа A (LOC475421); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком с цинковыми пальцами 227 (LOC484460); мРНК
XM 850112
ZNF227
белок с цинковыми пальцами 227
CfaAffx. 26487.1.S1 s at
4,20E-02
1,00E+00
0,69
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком с цинковыми пальцами 617 (LOC6U075); мРНК
XM 848708
ZNF564
белок с цинковыми пальцами 564
Cfa. 12414.1.A1 s at
5,90E-02
1,00E+00
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком с цинковыми пальцами 622; вариант транскрипта 2 (LOC479383); мРНК
XM 863227
ZNF622
белок с цинковыми пальцами 622
CfaAffx. 29168.1.S1 s at
4,34E-02
1,00E+00
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком с цинковыми пальцами 622; вариант транскрипта 3 (LOC479383); мРНК
XM 863237
ZNF622
белок с цинковыми пальцами 622
Cfa. 11779.1.A1 at
8,46E-02
1,00E+00
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, гипотетический LOC479517; вариант транскрипта 1 (LOC479517); мРНК
XM 536655
ZSWIM7
белок 7, содержащий цинковые пальцы, тип SWIM
Таблица 2 Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
Тучные по сравнению с худыми (сравнение экспрессии генов в цельной крови), все гены, порог отсечения кратного изменения: 1,3; порог отсечения P-значения:
Количество образцов в группе 1 (тучные): 32, в группе 2 (худые): 12
Кратное изменение >1 предполагает, что зонды повергаются повышающей регуляции в образцах тучных животных.
Зонд
P-значение
Q-значение
Кратное изменение
Аннотация к наилучшему совпадению BLAST
Доступ к наилучшему совпадению
Символ гена
Описание гена
CfaAffx. 14897.1.S1 at
5,05E-03
1,77E-02
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с аксотрофином; вариант транскрипта 1 (LOC478763); мРНК
XM 535929
7-Mar
ассоциированный с мембраной кольцевой палец (C3HC4)7
Canis familiaris, сходный с представителем 1 подсемейства E АТФ-связывающих кассет (ингибитор РНКазы L) (ингибитор рибонуклеазы 4) (RNS4I); вариант транскрипта 1 (LOC475454); мРНК
XM 532679
ABCE1
АТФ-связывающая кассета, подсемейство E (OABP), представитель 1
CfaAffx. 1556.1.S1 at
1,90E-02
3,07E-02
1,47
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с АТФ-связывающей кассетой; подсемейство F; представитель 1 (АТФ-связывающая кассета 50) (TNF альфа-стимулируемый белок ABC) (LOC474826); мРНК
XM 532056
ABCF1
АТФ-связывающая кассета, подсемейство F (GCN20), представитель 1
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
CfaAffx. 2390.1.S1 at
1,55E-03
1,26E-02
0,65
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком два, содержащим домен AAA; вариант транскрипта 2 (LOC475090); мРНК
XM 845427
ATAD2
семейство АТФаз, белок 2, содержащий домен AAA
Cfa. 16352.1.S1 at
1,45E-02
2,70E-02
0,75
Homo sapiens, мРНК для белка K1AA1240; частичная кодирующая последовательность
AB 033066
ATAD2B
семейство АТФаз, белок 2B, содержащий домен AAA
Cfa. 3397.1.A1 s at
6,36E-03
1,91E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, подобным белку 5 аутофагии (APG5-подобный) (специфичный для апоптоза белок); вариант транскрипта 1 (LOC610868); мРНК
XM 849201
ATG5
гомолог белка 5, связанного с аутофагией ATG5 (S. cerevisiae)
Cfa. 3397.1.A1 at
4,32E-03
1,68E-02
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, подобным белку 5 аутофагии (APG5-подобный) (специфичный для апоптоза белок); вариант транскрипта 1 (LOC610868); мРНК
XM 863268
ATG5
гомолог белка 5, связанного с аутофагией ATG5 (S. cerevisiae)
CfaAffx. 18231.1.S1 at
3,94E-04
9,61E-03
0,7
Homo sapiens, полная кодирующая последовательность кДНК FU56374; в высокой степени сходный с вероятной транспортирующей фосфолипиды АТФазой IF(EC 3.6.3.1)
AK 304855
ATP11B
АТФаза, класс VI, тип 11B
Cfa. 19636.1.S1 s at
9,14E-06
6,68E-03
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с вероятной транспортирующей фосфолипиды АТФазой IF (АТФаза класса I, тип 11B) (АТФаза IR) (LOC478644); мРНК
XM 535816
ATP11B
АТФаза, класс VI, тип 11B
CfaAffx. 18234.1.S1 s at
8,11E-05
8,77E-03
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с вероятной транспортирующей фосфолипиды АТФазой IF (АТфаза класса I, тип 11B) (АТФаза IR) (LOC478644); мРНК
XM 535816
ATP11B
АТФаза, класс VI, тип 11B
Cfa. 19006.1.S1 s at
1,08E-02
2,37E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1a транспортирующей кальций АТфазы 2C1; вариант транскрипта 12 (LOC477066); мРНК
XM 858740
ATP2C1
АТФаза, транспортирующая Ca++, тип 2C, представитель 1
CfaAffx. 10126.1.S1 s at
6,16E-04
1,05E-02
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1a транспортирующей кальций АТфазы 2C1; вариант транскрипта 12 (LOC477066); мРНК
XM 858740
ATP2C1
АТФаза, транспортирующая Ca++, тип 2C, представитель 1
Cfa. 990.1.S1 s at
8,57E-06
6,68E-03
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с АТФ-синтазой; транспортирующий H+; митохондриальный комплекс F1; предшественник изоформы H (сердце) субъединицы гамма; вариант транскрипта 1 (LOC478009); мРНК
XM 535193
ATP5C1
АТФ-синтаза, транспортирующая H+, митохондриальный комплекс F1, полипептид гамма 1
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ассоциированным с HLA-B транскриптом 4 (LOC481714); мРНК
XM 538835
BAT4
ассоциированный с HLA-B транскрипт 4
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
CfaAffx. 20602.1.S1 s at
4,68E-03
1,73E-02
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с бромсодержащим доменом, близлежащим у домену цинкового пальца; 1A изоформа a; вариант транскрипта 9 (LOC480287); мРНК
XM 856678
BAZ1A
бромсодержащий домен, близлежащий к домену цинкового пальца, 1A
CfaAffx. 7103.1.S1 at
2,90E-02
3,78E-02
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой b белка 7 синдрома Бардле-Бидля 7; вариант транскрипта 4 (LOC476092); мРНК
XM 852128
BBS7
синдром Бардле-Бидля 7
Cfa. 20742.1.S1 s at
5,32E-02
5,28E-02
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой d белка, ассоциированного с рецептором B-клеток, BAP29 (LOC475884); мРНК
XM 533092
BCAP29
белок 29, ассоциированный с рецептором B-клеток
Cfa. 3943.1.A1 a at
8,94E-03
2,20E-02
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом амплифицируемой в случае карциномы молочной железы последовательности 2 (белок амплифицируемой в случае карциномы молочной железы ДНК-1) (LOC475805); мРНК
XM 533014
BCAS2
амплифицируемая в случае карциномы молочной железы последовательность 2
CfaAffx. 21575.1.S1 s at
2,81E-02
3,72E-02
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с Bcl-2-родственным белком A1 (белок BFL-1) (белок раннего ответа, специфичный для гемопоэтических клеток) (белок GRS) (LOC488770); мРНК
Homo sapiens, кДНК FU75585, полная кодирующая последовательность; в высокой степени сходный с белком 2, родственным дистрофину Homo sapiens (DRP2); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фибронектином типа III и белком 1, содержащим SPRY-домен; вариант транскрипта 2 (LOC476743); мРНК
XM 533948
FSD1
фибронектин типа III и белок 1, содержащий SPRY-домен
CfaAffx. 31175.1.S1 at
3,33E-03
1,55E-02
1,6
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, связывающим элемент, расположенный выше Far (FUSE-связывающий белок 1) (FBP) (ДНК-геликаза V) (HDH V); вариант транскрипта 6 (LOC490201); мРНК
XM 862632
FUBP1
белок 1, связывающий элемент, расположенный выше far (FUSE)
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
CfaAffx. 31174.1.S1 at
3,72E-02
4,33E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, связывающим элемент, расположенный выше Far (FUSE-связывающий белок 1) (FBP) (ДНК-геликаза V) (HDH V); вариант транскрипта 20 (LOC490201); мРНК
XM 862753
FUBP1
белок 1, связывающий элемент, расположенный выше far (FUSE)
Cfa. 19777.1.S1 s at
1,69E-03
1,29E-02
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой b белка 1, связанного с умственной отсталостью при синдроме ломкости X-хромосомы; вариант транскрипта 12 (LOC478642); мРНК
XM 851395
FXR1
умственная отсталость при синдроме ломкости X-хромосомы, аутосомный гомолог 1
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с глюкозаминфосфат-N-ацетилтрансферазой 1 (LOC480325); мРНК
XM 537448
GNPNAT1
глюкозаминфосфат-N-ацетилтрансфераза 1
CfaAffx. 17247.1.S1 at
1,59E-03
1,26E-02
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с аутоантигеном Гольджи; представитель 5 подсемейства гольджина A (Гольджи-84) (белок RET-слитого гена 5) (Ret-II-белок) (LOC480233); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом белка 1 перехода из G1 в S-фазу (GTP-связывающий белок GST1-HS); вариант транскрипта 2 (LOC479846); мРНК
XM 858262
GSPT1
белок 1 перехода из G1 в S-фазу
Cfa. 5851.1.A1 a at
1,01E-02
2,31E-02
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактором высвобождения пептидной цепи 3; вариант транскрипта 1 (LOC480921); мРНК .
XM 538042
GSPT2
белок 2 перехода из G1 в S-фазу
CfaAffx. 16567.1.S1 s at
2,25E-03
1,38E-02
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с глутатион-S-трансферазой омега 1; вариант транскрипта 1 (LOC477813); мРНК
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
Cfa. 4491.1.S1 at
1,84E-03
1,31E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с 3-гидроксиацил-CoA-дегидрогеназой типа II (тип II HADH) (белок, связывающий пептид бета-амилоида, ассоциированный с эндоплазматическим ретикулумом) (дегидрогеназа короткоцепочечного типа/редуктаза XH98G2); вариант транскрипта 1 (LOC480930); мРНК
XM 538051
HSD17B10
гидроксистероид (17-бета)-дегидрогеназа 10
CfaAffx. 24950.1.S1 s at
2,07E-03
1,35E-02
0,71
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с 3-гидроксиацил-CoA-дегидрогеназой типа II (тип II HADH) (белок, связывающий пептид бета-амилоида, ассоциированный с эндоплазматическим ретикулумом) (дегидрогеназа короткоцепочечного типа/редуктаза XH98G2); вариант транскрипта 1 (LOC480930); мРНК
XM 538051
HSD17B10
гидроксистероид (17-бета)-дегидрогеназа 10
Cfa. 441.1.A1 at
3,68E-03
1,61E-02
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом стероиддегидрогеназы; вариант транскрипта 1 (LOC475939); мРНК
XM 533148
HSD17B12
гидроксистероид (17-бета)-дегидрогеназа 12
Cfa. 10807.1.S1 at
1,70E-02
2,91E-02
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2, подобным гидроксистероиддегидрогеназе; вариант транскрипта 2 (LOC474804); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с диметиладенозинтрансферазой (LOC100059778); мРНК
XM 001493893
LOC 100059778
сходный с диметиладенозинтрансферазой
CfaAffx. 20711.1.S1 at
5,11E-02
5,16E-02
0,71
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с ингибитором-2 (LOC100060058); мРНК
XM 001500822
LOC 100060058
сходный с ингибитором-2
Cfa. 16638.1.S1 at
6,58E-05
8,40E-03
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с транслоказой внутренней митохондриальной мембраны 13 (LOC100060448); мРНК
XM 001494016
LOC 100060448
гипотетический белок LOC 100060448
Cfa. 1295.1.S1 at
4,30E-04
9,78E-03
0,69
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с рецептором сигнальной последовательности; альфа (ассоциированный с транслоконом белок альфа) (LOC100061378); мРНК
XM 001493337
LOC 100061378
гипотетический белок LOC100061378
Cfa. 16541.1.S1 at
8,86E-03
2,19E-02
0,71
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с ядерным белком, содержащим сигнал протеолиза PEST; вариант транскрипта 1 (LOC100061942); мРНК
XM 001503437
LOC 100061942
сходный с ядерным белком, содержащим сигнал протеолиза PEST
Cfa. 2411.1.A1 at
2,64E-02
3,59E-02
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с mCG12474 (LOC100062680); мРНК
XM 001494169
LOC 100062680
гипотетический белок LOC 100062680
Cfa. 12874.1.A1 at
2,95E-03
1,50E-02
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с представителем 4 семейства AF4/FMR2 (ALL1-слитый ген хромосомы 5q31) (белок, ассоциированный с основным фактором элонгации CDK9) (LOC100063038); мРНК
XM 001504421
LOC 100063038
сходный с белком AF5q31
Cfa. 9741.2.A1 at
3,96E-03
1,64E-02
0,66
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с субъединицей казеинкиназы II альфа (LOC100063080); мРНК
сходный с убиквитин-конъюгирующим ферментом E2 Z (убиквитин-протеинлигаза Z) (белок-носитель убиквитина Z) (Uba6-специфичный E2-конъюгирующий фермент 1) (Use1)
Cfa. 10131.1.S1 s at
1,10E-02
2,38E-02
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с HLA-B-ассоциированным транскриптом 1 (LOC100146384); мРНК
XM 001917617
LOC 100146384
сходный с HLA-B-ассоциированным транскриптом 1
Cfa. 1992.1.S1 at
8,07E-03
2,10E-02
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с белком 1, содержащим цинковый палец и домен BTB (LOC100152273); мРНК
XM 001925789
LOC 100152273
сходный с белком 1, содержащим цинковый палец и домен BTB
Cfa. 3312.1.S1 at
4,95E-02
5,07E-02
0,71
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с полиглутамин-содержащим белком (LOC100152768); мРНК
XM 001928316
LOC 100152768
сходный с полиглутамин-содержащим белком
CfaAffx. 26442.1.S1 at
1,23E-03
1,23E-02
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с белком TIPIN (LOC100153268); мРНК
XM 001925231
LOC 100153268
сходный с белком TIPIN
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
Cfa. 8929.1.A1 at
4,64E-03
1,73E-02
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с пресквалендифосфатфосфатазой (белок 2, содержащий домен фосфатазы фосфатидной кислоты типа 2) (белок 2, содержащий домен PPAP2) (LOC100153280); мРНК
XM 001926782
LOC 100153280
сходный с пресквалендифосфатфосфатазой (белок 2, содержащий домен фосфатазы фосфатидной кислоты типа 2) (белок 2, содержащий домен PPAP2)
Cfa. 8215.1.A1 at
1,07E-03
1,20E-02
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с белком транскрипта 4, индуцируемого повреждением ДНК (белок, регулируемый при развитии, и белок 1 ответа на повреждение ДНК) (REDD-1) (HIF-1-чувствительный белок RTP801) (LOC100153821); мРНК
XM 001925275
LOC 100153821
сходный с белком транскрипта 4, индуцируемого повреждением ДНК (белок, регулируемый при развитии, и белок 1 ответа на повреждение ДНК) (REDD-1) (HIF-1-чувствительный белок RTP801)
Cfa. 12793.1.A1 at
9,32E-03
2,23E-02
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с белком 7, ассоциированным с циклом клеточного деления; вариант транскрипта 1 (LOC100154583); мРНК
XM 001928628
LOC 100154583
сходный с белком 7, ассоциированным с циклом клеточного деления
Cfa. 9507.1.A1 at
1,85E-02
3,04E-02
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с гомологом ядерной ундекапренилпирофосфатсинтазой 1 (LOC100154658); мРНК
XM 001928072
LOC 100154658
сходный с гомологом ядерной ундекапренилпирофосфатсинтазой 1
Cfa. 19021.2.S1 a at
3,91E-02
4,45E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с пластином-2 (L-пластин) (цитозольный белок лимфоцитов 1) (LCP-1) (LC64P); вариант транскрипта 2 (LOC100156254); мРНК
XM 001929145
LOC 100156254
сходный с пластином-2 (L-пластин) (цитозольный белок лимфоцитов 1) (LCP-1) (LC64P)
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
Cfa. 1029.1.A1 at
3,52E-04
9,50E-03
0,65
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с белком миграции везикул sec22b (LOC100157002); мРНК
XM 001928686
LOC 100157002
сходный с белком миграции везикул sec22b
Cfa. 11703.1.A1 at
6,63E-04
1,06E-02
0,74
мРНК Sus scrofa; клон:AMP010019E02; экспрессируемый в альвеолярных макрофагах
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей 4 комплекса THO (Tho4) (объединяемая с AML-1 и LEF-1) (транскрипционный коактиватор Aly/REF) (bZIP-усиливающий фактор BEF) (LOC607948); мРНК
XM 844818
LOC607948
сходный с субъединицей 4 комплекса THO (Tho4) (объединяемая с AML-1 и LEF-1) (транскрипционный коактиватор Aly/REF) (bZIP-усиливающий фактор BEF)
Cfa. 18383.1.S1 s at
1,40E-02
2,67E-02
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей 4 комплекса THO (Tho4) (объединяемая с AML-1 и LEF-1) (транскрипционный коактиватор Aly/REF) (bZIP-усиливающий фактор BEF) (LOC607948); мРНК
XM 844818
LOC607948
сходный с субъединицей 4 комплекса THO (Tho4) (объединяемая с AML-1 и LEF-1) (транскрипционный коактиватор Aly/REF) (bZIP-усиливающий фактор BEF) (LOC607948); мРНК
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
CfaAffx. 9765.1.S1 at
3,20E-02
3,98E-02
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей 4 комплекса THO 4 (Tho4) (объединяемый с AML-1 и LEF-1) (транскрипционный коактиватор Aly/REF) (bZIP-усиливающий фактор BEF) (LOC607948); мРНК
XM 844818
LOC607948
сходный с субъединицей 4 комплекса THO 4 (Tho4) (объединяемый с AML-1 и LEF-1) (транскрипционный коактиватор Aly/REF) (bZIP-усиливающий фактор BEF)
Cfa. 1050.3.S1 at
4,34E-04
9,78E-03
0,71
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, связывающим белок теплового шока 70 кД; вариант транскрипта 3 (LOC607960); мРНК
XM 844401
LOC607960
сходный с белком, связывающим белок теплового шока 70 кД
CfaAffx. 2582.1.S1 s at
1,34E-02
2,61E-02
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, связывающим белок теплового шока 70 кД; вариант транскрипта 4 (LOC607960); мРНК
XM 853827
LOC607960
сходный с белком, связывающим белок теплового шока 70 кД
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с интегральным мембранным белком NK62-F типа II (NKG2-F-активирующий рецептор NK) (рецептор F клеток NK) (LOC609192); мРНК
XM 846408
LOC609192
сходный с интегральным мембранным белком NK62-F типа II (NKG2-F-активирующий рецептор NK) (рецептор F клеток NK)
Cfa. 594.1.A1 at
1,19E-03
1,21E-02
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством со сходством последовательностей 32; подобный представителю A; вариант транскрипта 2 (LOC609217); мРНК
XM 858065
LOC609217
сходный с семейством со сходством последовательностей 32; подобный представителю A
Cfa. 19973.1.S1 at
1,91E-03
1,32E-02
0,68
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предполагаемым белком 40-2-3 (LOC609238); мРНК
XM 846457
LOC609238
сходный с предполагаемым белком 40-2-3
CfaAffx. 943.1.S1 at
9,87E-02
7,53E-02
0,69
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с 60S-рибосомным белком L17 (L23); вариант транскрипта 1 (LOC609261); мРНК
XM 847140
LOC609261
сходный с 60S-рибосомным белком L17 (L23)
Cfa. 13253.1.A1 at
9,00E-03
2,20E-02
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником белка KIAA0152; вариант транскрипта 1 (LOC609274); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с хи-цепью алкогольдегидрогеназы класса III (глутатион-зависимая формальдегиддегидрогеназа) (FDH) (LOC609781); мРНК
XM 847120
LOC609781
сходный с хи-цепью алкогольдегидрогеназы класса III (глутатион-зависимая формальдегиддегидрогеназа) (FDH)
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с представителем 1 семейства ассоциированных с микротрубочками белком RP/EB (APC-связывающий белок EB1) (связывающий конец белок 1) (EB1) (LOC608797); мРНК
XM 845932
MAPRE1
ассоциированный с микротрубочками белок, семейство RP/EB, представитель 1
Cfa. 15713.1.A1 at
4,83E-02
5,00E-02
0,67
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с рецептором макрофагов MARCO (рецептор макрофагов с коллагеновой структурой) (L0C476117); мРНК
XM 533324
MARCO
рецептор макрофагов с коллагеновой структурой
Cfa. 13953.1.A1 s at
2,67E-03
1,46E-02
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с метионинаденозилтрансферазой II; альфа; вариант транскрипта 7 (LOC475770); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактором транскрипции 2, связывающим элемент ответа на металлы (белок M96, связывающий ДНК элемента ответа на металлы); вариант транскрипта 1 (LOC479948); мРНК
XM 537073
MTF2
фактор транскрипции 2, связывающий элемент ответа на металлы
CfaAffx. 30853.1.S1 at
7,49E-04
1,09E-02
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактором транскрипции 2, связывающим элемент ответа на металлы (белок M96, связывающий ДНК элемента ответа на металлы); вариант транскрипта 3 (LOC479948); мРНК
XM 861836
MTF2
фактор транскрипции 2, связывающий элемент ответа на металлы
Cfa. 1889.1.A1 s at
2,00E-04
9,06E-03
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактором транскрипции 2, связывающим элемент ответа на металлы (белок M96, связывающий ДНК элемента ответа на металлы); вариант транскрипта 8(LOC479948); мРНК
XM 861899
MTF2
фактор транскрипции 2, связывающий элемент ответа на металлы
CfaAffx. 24531.1.S1 s at
3,38E-03
1,56E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с C-1-тетрагидрофолатсинтазой; цитоплазматической (C1-THF-синтаза) (LOC480352); мРНК
XM 537476
MTHFD1
метилентетрагидрофолатдегидрогеназа (зависимая от NADP+) 1, метенилтетрагидрофолатциклогидролаза, формилтетрагидрофолатсинтетаза
Cfa. 19689.1.S1 at
1,23E-03
1,23E-02
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, подобным метилентетрагидрофолатдегидрогеназе (зависимой от NADP+) 1-like (LOC476245); мРНК
XM 533450
MTHFD1L
подобный метилентетрагидрофолатдегидрогеназе (зависимой от NADP+) 1
Cfa. 20403.1.S1 a at
1,66E-02
2,89E-02
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с C01G5.8; вариант транскрипта 4 (LOC479017); мРНК
мотив 1 nudix (сцепленный с нуклеозиддифосфатом остаток X)-типа
Cfa. 10274.1.S1 s at
4,39E-04
9,78E-03
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с АДФ-сахар-пирофосфатазой (мотив 5 сцепленного с нуклеозиддифосфатом остатка X) (Nudix-мотив 5) (YSA1H); вариант транскрипта 1 (LOC478006); мРНК
XM 53510
NUDT5
мотив 5 nudix (сцепленный с нуклеозиддифосфатом остаток X)-типа
Cfa. 923.1.A1 s at
1,11E-03
1,20E-02
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком Nup107 комплекса ядерных пор (нуклеопорин Nup107) (нуклеопорин 107 кД); вариант транскрипта 2 (LOC474440); мРНК
XM 855893
NUP107
нуклеопорин 107 кД
Cfa. 13055.1.S1 at
2,65E-03
1,45E-02
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с нуклеопорином Nup37 (p37) (LOC475445); мРНК
XM 532669
NUP37
нуклеопорин 37 кД
CfaAffx. 13 595.1.S1 s at
1,44E-02
2,70E-02
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с нуклеопорином p54 (нуклеопорин 54 кД); вариант транскрипта 3 (LOC487813); мРНК
XM 843545
NUP54
нуклеопорин 54 кД
CfaAffx. 47 88.1.S1 at
6,17E-04
1,05E-02
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, подобным рецептору опиоидного фактора роста 1 (LOC481876); мРНК
XM 53897
OGFRL1
белок 1, подобный рецептору опиоидного фактору роста
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
Cfa. 15244.1.S1 at
1,89E-02
3,06E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 O-связанный-GlcNAc-трансферазы; вариант транскрипта 1 (LOC480955); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфопантотенатцистеинлигаза (фосфопантотеноилцистеинсинтетаза) (PPC-синтетаза); вариант транскрипта 1 (LOC475309); мРНК
XM 532539
PPCS
фосфопантотеноилцистеинсинтетаза
CfaAffx. 26086.1.S1 s at
1,88E-02
3,06E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником пептидил-пролил-цис-транс-изомеразы В (PPIаза) (ротамаза) (циклофилин-B) (S-циклофилин) (SCYLP) (CYP-S1); вариант транскрипта 2 (LOC478337); мРНК
XM 847296
PPIB
пептидилпролилизомераза В (циклофилин B)
Cfa. 7275.1.A1 s at
3,70E-03
1,61E-02
0,68
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником пептидил-пролил-цис-транс-изомеразы В (PPIase) (ротамаза) (циклофилин B) (S-циклофилин) (SCYLP) (CYP-S1); вариант транскрипта 3 (LOC478337); мРНК
XM 860503
PPIB
пептидилпролилизомераза В (циклофилин B)
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
CfaAffx. 13745.1.S1 s at
1,35E-04
8,90E-03
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с пептидилпролилизомеразой D; вариант транскрипта 1 (LOC475481); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с Px19-подобным белком (белок 25 кД, важный с эволюционной точки зрения и интересный для лимфоидной ткани) (PRELI); вариант транскрипта 1 (LOC479276); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком синдрома Швахмана-Бодиана-Даймонда (LOC607017); мРНК
XM 843539
SBDS
синдром Швахмана-Бодиана-Даймонда
CfaAffx. 16922.1.S1 at
8,76E-04
1,13E-02
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком синдрома Швахмана-Бодиана-Даймонда (LOC607017); мРНК
XM 843539
SBDS
синдром Швахмана-Бодиана-Даймонда
CfaAffx. 12131.1.S1 s at
3,27E-04
9,28E-03
0,64
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с sno; гомолог 1 strawberry notch; вариант транскрипта 1 (LOC477451); мРНК
XM 534649
SBN01
гомолог 1 strawberry notch (Drosophila)
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
Cfa. 18687.1.S1 at
3,64E-03
1,61E-02
1,3
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с мембранным белком 5, ассоциированным с переносчиком секрета (мембранный белок 5 переносчик секрета); вариант транскрипта 2 (LOC478371); мРНК
XM 862073
SCAMP5
мембранный белок 5 переносчик секрета
CfaAffx. 17216.1.S1 s at
1,69E-02
2,91E-02
1,57
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с альфа-субъединицей белка типа III натриевого канала (альфа-субъединица потенциалозависимого натриевого канала Nav1.3) (белок натриевого канала; субъединица III альфа головного мозга) (потенциалозависимый натриевый канал подтипа III); вариант транскрипта 6 (LOC478772); мРНК
XM 852824
SCN3A
натриевый канал, потенциалозависимый, тип III, субъединица альфа
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с коротким двуспиральным белком; вариант транскрипта 1 (LOC606862); мРНК
XM 843274
SCOC
короткий двуспиральный белок
Cfa. 391.1.S1 at
1,06E-03
1,19E-02
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2, подобным SCY1; вариант транскрипта 1 (LOC482622); мРНК
XM 539739
SCYL2
SCY1-подобный 2 (S. cerevisiae)
CfaAffx. 6509.1.S1 s at
3,30E-02
4,05E-02
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 3 синтенина; вариант транскрипта 1 (LOC482977); мРНК
XM 540090
SDCBP
синдекан-связывающий белок (синтенин)
Cfa. 10434.1.A1 at
1,44E-03
1,25E-02
0,69
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником фактора 2, полученного из стромальных клеток (SDF-2); вариант транскрипта 1 (LOC480626); мРНК
XM 537746
SDF2
фактор 2, полученный из стромальных клеток
CfaAffx. 28636.1.S1 s at
1,12E-03
1,20E-02
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником фактора 2, полученного из стромальных клеток (SDF-2); вариант транскрипта 1 (LOC480626); мРНК
XM 537746
SDF2
фактор 2, полученный из стромальных клеток
Cfa. 8688.1.A1 at
2,35E-03
1,40E-02
0,58
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником белка 1, подобного фактору 2, полученному из стромальных клеток (SDF2-подобный белок 1) (PWP1-взаимодействующий белок 8) (LOC608633); мРНК
XM 845717
SDF2L1
белок 1, подобный фактору 2, полученному из стромальных клеток
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
Cfa. 8688.1.A1 s at
4,89E-03
1,75E-02
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником белка 1, подобного фактору 2, полученному из стромальных клеток (SDF2-подобный белок 1) (PWP1-взаимодействующий белок 8) (LOC608633); мРНК
XM 845717
SDF2L1
белок 1, подобный фактору 2, полученному из стромальных клеток
CfaAffx. 23546.1.S1 at
1,85E-03
1,31E-02
0,67
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником белка 1, подобного фактору 2, полученному из стромальных клеток (SDF2-подобный белок 1) (PWP1-взаимодействующий белок 8) (LOC608633); мРНК
XM 845717
SDF2L1
белок 1, подобный фактору 2, полученному из стромальных клеток
Cfa. 18281.1.S1 at
4,59E-02
4,86E-02
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с флавопротеидной субъединицей сукцинатдегидрогеназы [убихинон]; митохондриальный предшественник (Fp) (флавопротеидная субъединица комплекса II); вариант транскрипта 6 (LOC478634); мРНК
XM 851844
SDHA
комплекс сукцинатдегидрогеназы, субъединица A, флавопротеид (Fp)
CfaAffx. 24257.1.S1 s at
7,29E-04
1,08E-02
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с содержащим железо и серу белком сукцинатдегидрогеназы [убихинон]; митохондриальный предшественник (Ip) (содержащая железо и серу субъединица комплекса II); вариант транскрипта 1 (LOC478217); мРНК
XM 535392
SDHB
комплекс сукцинатдегидрогеназы, субъединица B, железо-сера (Ip)
CfaAffx. 3371.1.S1 s at
5,52E-04
1,02E-02
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, содержащим железо и серу белком сукцинатдегидрогеназы [убихинон]; митохондриальный предшественник (Ip) (содержащая железо и серу субъединица комплекса II); (LOC608210); мРНК
XM 845169
SDHB
комплекс сукцинатдегидрогеназы, субъединица B, железо-сера (Ip)
семейство растворимых переносчиков 12 (переносчики натрия/калия/хлорида), представитель 2
CfaAffx. 12315.1.S1 s at
1,57E-03
1,26E-02
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 25; представитель 36 (LOC477095); мРНК
XM 534289
SLC25A36
семейство растворимых переносчиков 25, представитель 36
CfaAffx. 14394.1.S1 s
2,47E-02
3,48E-02
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с митохондриальным белком, подобным растворимому переносчику; вариант транскрипта 5 (LOC486U5); мРНК
XM 853761
SLC25A37
семейство растворимых переносчиков 25, представитель 37
Cfa. 2658.1.S1 at
5,48E-04
1,02E-02
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG8931-PA (LOC488876); мРНК
XM 545993
SLC25A46
семейство растворимых переносчиков 25, представитель 46
Cfa. 1352.1.S1 s at
9,84E-04
1,16E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 25; представитель 5; вариант транскрипта 1 (LOC492093); мРНК
XM 549215
SLC25A5
семейство растворимых переносчиков 25 (митохондриальный переносчик; переносчик аденинового нуклеотида), представитель 5
Cfa. 13227.1.A1 s at
2,22E-02
3,31E-02
0,66
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ацил-CoA-синтетазой очень длинных цепей (лигаза CoA и жирных кислот с очень длинными цепями); вариант транскрипта 2 (LOC478298); мРНК
XM 857161
SLC27A2
семейство растворимых переносчиков 27 (переносчик жирных кислот), представитель 2
Cfa. 593.1.A1 at
1,70E-03
1,29E-02
0,67
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, переносчик ацетил-кофермента A (SLC33A1); мРНК
XM 516831
SLC33A1
семейство растворимых переносчиков 33 (переносчик ацетил-CoA), представитель 1
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
CfaAffx. 25900.1.S1 at
7,27E-04
1,08E-02
0,62
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 35; представитель B1; вариант транскрипта 5 (LOC480549); мРНК
XM 860061
SLC35B1
семейство растворимых переносчиков 35, представитель B1
Cfa. 17007.1.S1 at
5,28E-03
1,80E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 35; представитель C2; вариант транскрипта 4 (LOC609863); мРНК
XM 861605
SLC35C2
семейство растворимых переносчиков 35, представитель C2
Cfa. 9951.1.A1 at
1,83E-03
1,31E-02
0,73
мРНК Homo sapiens; кДНК DKFZp686H1697 (из клона DKFZp686H1697)
BX 647547
SLC38A1
семейство растворимых переносчиков 38, представитель 1
CfaAffx. 16816.1.S1 at
3,51E-04
9,49E-03
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с переносчиком аминокислот 1 системы N (SN1) (переносчик аминокислот 1 N-системы) семейство растворимых переносчиков 38; представитель 3) (LOC476617); мРНК
XM 533820
SLC38A3
семейство растворимых переносчиков 38, представитель 3
Cfa. 16809.1.S1 at
2,19E-03
1,37E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 41; представитель 2 (LOC481298); мРНК
XM 538419
SLC41A2
семейство растворимых переносчиков 41, представитель 2
Cfa. 16809.1.S1 s at
1,O6E-03
1,19E-02
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 41; представитель 2 (LOC481298); мРНК
XM 538419
SLC41A2
семейство растворимых переносчиков 41, представитель 2
CfaAffx. 10961.1.S1 at
6,74E-03
1,95E-02
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с Y4C6B.5 (LOC477324); мРНК
XM 534517
SLC46A3
семейство растворимых переносчиков 46, представитель 3
CfaAffx. 6523.1.S1 at
3,10E-03
1,53E-02
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с сиротским зависимым от натрия и хлорида переносчиком нейромедиаторов NTT5 (семейство растворимых переносчиков 6, представитель 16) (L0C484383); мРНК
XM 541498
SLC6A16
семейство растворимых переносчиков 6,представитель 16
CfaAffx. 12404.1.S1 s at
8,95E-03
2,20E-02
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, ассоциированным с сарколеммой; вариант транскрипта 17 (L0C476577); мРНК
XM 852570
SLMAP
ассоциированный с сарколеммой белок
Cfa. 660.2.A1 s at
3,73E-03
1,62E-02
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a модулятора индуцируемой эстрогеном транскрипции; вариант транскрипта 11 (LOC478322); мРНК
XM 859168
SLTM
SAFB-подобный, модулятор транскрипции
Cfa. 15466.1.S1 s at
6,18E-03
1,89E-02
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактором сплайсинга стадии II SLU7 (LOC479308); мРНК
XM 536446
SLU7
гомолог фактора сплайсинга SLU7 (S. cerevisiae)
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
Cfa. 936.1.S1 at
1,27E-02
2,54E-02
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, SWI/SNF-родственный, ассоциированный с матриксом зависимый от актина регулятор хроматина a5; вариант транскрипта 5 (SMARCA5); мРНК
XM 5174
SMARC
SWI/SNF-родственный, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство a, представитель 5
CfaAffx. 12160.1 .S1 s at
2,27E-02
3,33E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris сходный с представителем 5 подсемейства A SWI/SNF-родственного, ассоциированного с матриксом, актин-зависимого регулятора хроматина (SWI/SNF-родственный, ассоциированный с матриксом актин-зависимый регулятор хроматина A5) (гомолог белка 2, неферментирующего сахарозу) (hSNF2H)...; вариант транскрипта 1 (LOC475451); мРНК
XM 532676
SMARCA5
SWI/SNF родственный, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство a, представитель 5
Cfa. 9379.1.S1 at
5,31E-03
1,80E-02
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SWI/SNF-родственным; ассоциированный с матриксом; актин-зависимым регулятором хроматина; подсемейство b; представитель 1; вариант транскрипта 7 (LOC486407); мРНК
XM 852298
SMARCB1
SWI/SNF родственный, ассоциированный с матриксом, актин зависимый регулятор хроматина, подсемейство b, представитель 1
Cfa. 5396.1.A1 s at
1,59E-02
2,82E-02
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SWI/SNF родственным, ассоциированным с матриксом, актин-зависимым регулятором хроматина; подсемейство e; представитель 1; вариант транскрипта 1 (LOC608250); мРНК
XM 537645
SMARCE1
SWI/SNF родственный, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство e, представитель 1
Cfa. 20347.1.S1 s at
5,15E-03
1,79E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SWI/SNF-родственным, ассоциированным с матриксом, актин-зависимым регулятором хроматина; подсемейство e; представитель 1; вариант транскрипта 2 (LOC608250); мРНК
XM 845917
SMARCE1
SWI/SNF родственный, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство e, представитель 1
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
Cfa. 8883.1.A1 at
3,53E-02
4,21E-02
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SWI/SNF-родственным, ассоциированным с матриксом; актин-зависимым регулятором хроматина; подсемейство e; представитель 1; вариант транскрипта 8 (LOC608250); мРНК
XM 857912
SMARCE1
SWI/SNF родственный, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство e, представитель 1
CfaAffx. 24592.1.S1 at
5,77E-02
5,52E-02
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SWI/SNF-родственным, ассоциированным с матриксом, актин-зависимым регулятором хроматина; подсемейство e; представитель 1; вариант транскрипта 8 (LOC608250); мРНК
XM 857912
SMARCE1
SWI/SNF родственный, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство e, представитель 1
CfaAffx. 22089.1.S1 s at
8,90E-03
2,19E-02
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, подобным белку 4, поддерживающему структуру хромосом (ассоциированный с хромосомой полипептид C) (hCAP-C) (гомолог XCAP-C); вариант транскрипта 2 (LOC478679); мРНК
XM 856436
SMC4
белок 4, поддерживающий структуру хромосом 4
Cfa. 1060.1.S1 at
7,01E-03
1,98E-02
0,68
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, подобным белку 4, поддерживающему структуру хромосом (ассоциированный с хромосомой полипептид C) (hCAP-C) (гомолог XCAP-C); вариант транскрипта 3 (LOC478679); мРНК
XM 856465
SMC4
белок 4, поддерживающий структуру хромосом 4
CfaAffx. 26898.1 .S1 at
1,52E-02
2,76E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG9351-PA; изоформа A; вариант транскрипта 2 (LOC612974); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a фактора транскрипции EC; вариант транскрипта 1 (LOC475292); мРНК
XM 532523
TFEC
фактор транскрипции EC
Cfa. 18602.2.S1 s at
2,39E-02
3,42E-02
0,67
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2 белка TIA1; вариант транскрипта 1 (LOC610625); мРНК
XM 847849
TIA1
РНК-связывающий белок, ассоциированный с цитотоксическими гранулами, TIA1
Таблица 2: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных по сравнению с худыми животными
Cfa. 5301.1.S1 at
1,85E-04
9,00E-03
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с тирозинкиназой с иммуноглобулин-подобным and EGF-подобным доменами 1 (LOC482535); мРНК
XM 539652
TIE1
тирозинкиназа с иммуноглобулин-подобным и EGF-подобным доменами 1
Cfa. 17788.1.S1 at
1,48E-03
1,25E-02
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей Tim23 транслоказы внутренней митохондриальной мембраны, участвующей в импорте; вариант транскрипта 2 (LOC486776); мРНК
XM 850859
TIMM23
гомолог транслоказы внутренней митохондриальной мембраны 23 (дрожжи)
CfaAffx. 14014.1.S1 at
8,89E-03
2,19E-02
0,74
мРНК Homo sapiens; кДНК DKFZp686N0351 (из клона DKFZp686N0351); полная кодирующая последовательность
BX537965
TIPARP
TCDD-индуцируемая поли(АДФ-рибоза)полимераза
Cfa. 12147.1.A1 s at
5,58E-02
5,41E-02
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с талином 1; вариант транскрипта 11 (LOC474759); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с убиквитин-конъюгирующим ферментом E2 A (убиквитинпротеинлигаза A) (белок-носитель убиквитина A) (HR6A) (mHR6A) (LOC492095); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом белка центромеры/кинетохора zw10; вариант транскрипта 1 (LOC479433); мРНК
XM 536569
ZW10
ZW10, ассоциированный с кинетохором, гомолог (Drosophila)
CfaAffx. 31203.1.S1 s at
4,13E-03
1,66E-02
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с цинковым пальцем; ZZ-домен-содержащий 3; вариант транскрипта 1 (LOC490203); мРНК
XM 547324
ZZZ3
цинковый палец, белок 3, содержащий домен ZZ-типа
Таблица 3 Ключевые гены, ассоциированные с метаболизмом жирных кислот у тучных животных по сравнению с худыми животными Зонды, идентифицирующие ключевые гены в жировой ткани тучных и худых собак
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 27 (переносчик жирных кислот); представитель 6 (LOC474666); мРНК
XM 531894
SLC27A6
семейство растворимых переносчиков 27 (переносчик жирных кислот); представитель 6
CfaAffx.2004.1.S1 s at
1,11E-02
1,00E+00
0,48
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 27 (переносчик жирных кислот); представитель 6 (LOC474666); мРНК
XM 531894
SLC27A6
семейство растворимых переносчиков 27 (переносчик жирных кислот); представитель 6
Таблица 3 Ключевые гены, ассоциированные с метаболизмом жирных кислот у тучных животных по сравнению с худыми животными Зонды, идентифицирующие ключевые гены в лимфоцитах тучных и худых собак
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ацил-CoA-синтетазой очень длинных цепей (лигаза CoA и жирных кислот с очень длинной цепью); вариант транскрипта 2 (LOC478298); мРНК
XM 857161
SLC27A2
семейство растворимых переносчиков 27 (переносчик жирных кислот), представитель 2
представитель 5 семейства ELOVL; элонгация длинноцепочечных жирных кислот (FEN1/Elo2; SUR4/Elo3-подобный; дрожжи)
CfaAffx.4290.1.S1 s at
5,85E-02
5,56E-02
0,74
Pongo abelii, мРНК; кДНК DKFZp469M0522 (из клона DKF2P469M0522)
CR 857140
ELOVL5
представитель 5 семейства ELOVL; элонгация длинноцепочечных жирных кислот (FEN1/Elo2; SUR4/Elo3-подобный; дрожжи)
Пример 2
Определение влияния различных веществ или ингредиентов на экспрессию генов в линиях клеток собак
Использовали генные чипы для собак Affymetrix Canine-1 и Canine-2 (Canine-2 заменял Canine-1), чтобы определить влияние различных тестируемых веществ или ингредиентов, таких как MCT; TAG; АЛК; ЭПК; ДГК; линолевая кислота (ЛК); арахидоновая кислота (АРК); стеариновая кислота (СК), миристиновая кислота (МК), конъюгированная линолевая кислота (КЛК), ГЛК; арахидоновая кислота; лецитин; витамин A, витамин D, витамин E, витамин K, рибофлавин, ниацин, пиридоксин, пантотеновая кислота, фолиевая кислота, биотин, витамин C, катехин, кверцетин, теафлавин; убихинон; ликопен, ликоксантин; ресвератрол; -липоевая кислота; L-карнитин; D-лимонен; глюкозамин; S-аденозилметионин; хитозан, различные материалы, содержащие одно или несколько из таких соединений, и их различные комбинации, на экспрессию генов в четырех линиях клеток собак и соответствующих контролях. Каждый ингредиент тестировали в двух концентрациях, как показано для выбранных образцов ингредиентов в таблице 6. В качестве контроля использовали растворитель в более высокой из двух концентраций. Использовали следующие четыре линии клеток собак: CCL34 (почка), CRL1430 (тимус), CCL183 (кость) (полученные из Американской коллекции типов культур) и CTAC (щитовидная железа) (см. Measurement of NK Activity in Effector Cells Purified from Canine Peripheral Lymphocytes, Veterinary Immunology and Immunopathology, 35 (1993) 239-251). Линию клеток, обработанную ингредиентом в конкретной концентрации, обозначали «обработка», и необработанный образец обозначали как «контроль». Слова «гены» и «зонды» использовали в данном способе как синонимы. Экспрессию генов измеряли в обработанных линиях клеток и контролях, используя инструкции, прилагаемые к чипам Affymetrix.
Образец данных, полученных в таких экспериментах, показан в таблице 5. В таблице 5 показаны идентификационные номера зондов, p-значение, кратное изменение, аннотация к наилучшему совпадению BLAST, номер доступа к наилучшему совпадению BLAST, символ гена и, наконец, описание гена приведено в последней колонке.
На основании физиологического состояния собак (диагноз ожирение) и сравнения информации, приведенной в таблицах 1, 2, 3 и 5, т.е. описания генов, на которые оказывает влияние тестируемое вещество или ингредиент, и которые также дифференциально экспрессируются у собак с избыточной массой, по сравнению с худыми собаками, можно полагать, что состав питательных веществ, используемых для подбора и приготовления кормовой композиции для собак с избыточной массой, включает один или несколько из следующих ингредиентов в следующих количествах (количества in vivo в миллиграммах на килограмм массы тела в сутки (мг/кг/сутки) основаны на экстраполяции количеств, используемых in vitro, например: ДГК - от 1 до 30; ЭПК - от 1 до 30; комбинированные ЭПК/ДГК (соотношение 1,5:1) - от 4/2 до 30/45; АЛК - от 10 до 100; ЛК - от 30 до 600; АРК - от 5 до 50; СК - от 3 до 60 и МК - от 3 до 60. На основании полученных данных может быть получена кормовая композиция и соответствующий корм, содержащий один или несколько из указанных ингредиентов, и использованы для регуляции генов, которые дифференциально экспрессируются у животных с избыточной массой, по сравнению с худыми животными. Такая регуляция может вызывать модулирование количества жировой ткани у животного и, следовательно, в одном варианте осуществления стимулировать сдвиг в сторону требуемого или нормального (более худого) статуса и способствовать лучшему состоянию здоровья и самочувствия животного.
Таблица 4 Ингредиенты, тестируемые в линиях клеток собак
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с белком 1 поглощения и подвижности клеток; вариант транскрипта 1 (LOC100055551); мРНК
XM 001501263
LOC 100055551
гипотетический белок LOC100055551
1597449 x at
3,16E-02
1,49
Синтетическая конструкция ДНК; клон: PF1KSDA0016; Homo sapiens, гомолог 20 гена TOMM20 транслоказы наружной митохондриальной мембраны; полная кодирующая последовательность; без стоп-кодона; в системе Flexi system
AB383705
1585402 at
4,17E-02
1,34
Homo sapiens, кДНК FU36515 fis; клон TRACH2001810
AK093834
1598681 at
4,86E-02
-1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG5038-PA (LOC476977); мРНК
XM 534177
TMTC4
белок 4, содержащий трансмембранный и тетратрикопептидный повтор
1604212 at
3,23E-03
1,68
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с сортирующим нексином-10; вариант транскрипта 1 (SNX10); мРНК
XM 001093939
SNX10
сортирующий нексин 10
1593517 at
4,73E-02
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с белком 1 , содержащим повтор WD и домен FYVE (LOC706913); мРНК
XR 013603
LOC 706913
сходный с белком 1 , содержащим повтор WD и домен FYVE
1603578 at
2,89E-03
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с антигеном CD63 (ассоциированный с меланомой антиген ME491) (ассоциированный с лизосомами мембранный гликопротеид 3) (LAMP-3) (ассоциированный с глазной меланомой антиген) (OMA81H) (гранулофизин) (тетраспанин-30) (Tspan-30) (LOC474391); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, содержащим домен гомологии в плекстрином; семейство E (с богатыми лейцином повторами), представитель 1 (LOC477053); мРНК
XM 534250
LOC 477053
сходный с белком, содержащим домен гомологии с плекстрином, семейство E (с богатыми лейцином повторами), представитель 1
1583284 at
2,86E-02
1,84
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, бета-спектрин; вариант транскрипта 7 (LOC403743); мРНК
XM 860139
SPTBN1
спектрин бета, неэритроцитарный 1
1604421 s at
1,83E-02
1 3
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, взаимодействующим с киназой 1 активируемой митогенами протеинкиназы; вариант транскрипта 1 (LOC478492); мРНК
XM 535670
MAP2K1IP1
белок 1, взаимодействующий с киназой 1 активируемой митогенами протеинкиназы
1585792 at
1,47E-02
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с флавопротеидом, участвующим в переносе электронов; изоформа 1 полипептида бета; вариант транскрипта 1 (LOC476400); мРНК
XM 533603
ETFB
флавопротеид, участвующий в переносе электронов; полипептид бета
1587615 s at
1,64E-02
1,54
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, связывающим белок теплового шока 70 кД; вариант транскрипта 3 (LOC607960); мРНК
XM 844401
LOC 607960
сходный с белком, связывающим белок теплового шока 70 кД
1593240 s at
1,97E-02
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, связывающим белок теплового шока 70 кД; вариант транскрипта 4 (LOC607960); мРНК
XM 853827
LOC 607960
сходный с белком, связывающим белок теплового шока 70 кД
1605213 at
1,61E-02
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком предимплантации 3; вариант транскрипта 2 (LOC478856); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с гомологом белка C6orf130; вариант транскрипта 2 (LOC719685); мРНК
XM 001117219
LOC719685
сходный с гомологом белка C6orf130
Cfa. 14928.1.S1 s at
3,64E-02
-1,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеидом U (LOC476053); мРНК
XM 533261
HNRNPUL2
подобный гетерогенному ядерному рибонуклеопротеиду U, 2
CfaAffx. 6434.1.S1 x at
4,36E-02
-1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактором ядерного транспорта 2 (NTF-2); вариант транскрипта 3 (LOC479681); мРНК
XM 859446
NUTF2
фактор ядерного транспорта 2
Cfa. 15509.1.S1 at
2,27E-02
-1,48
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 42 цикла деления клеток; вариант транскрипта 2 (LOC607429); мРНК
XM 844251
LOC607429
сходный с белком 42 цикла деления клеток
Cfa. 12323.1.A1 at
4,13E-05
4,09
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Cams familiaris, сходный с ангиопоэтин-подобным белком 4 (LOC476724); мРНК
XM 533928
ANGPTL4
ангиопоэтин-подобный 4
Cfa. 13103.1.A1 at
3,71E-02
-1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, подобным инозитолполифосфатфосфатазе 1; вариант транскрипта 2 (LOC485209); мРНК
XM 856340
INPPL1
белок 1, подобный инозитолполифосфатфосфатазе 1
CfaAffx. 30508.1.S1 at
2,76E-02
-1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком раннего индуцируемого эстрогеном гена 1 (LOC490130); мРНК
XM 547251
LOC490130
сходный с белком раннего индуцируемого эстрогеном гена 1
Cfa. 20794.1.S1 s at
4,58E-02
-2,89
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный со слиянием (вовлеченным в t(12;16) при злокачественной липосаркоме) (предполагаемый); вариант транскрипта 7 (LOC479778); мРНК
XM 851770
LOC479778
сходный со слиянием (вовлеченным в t(12:16) при злокачественной липосаркоме) (предполагаемый)
Cfa. 18834.1.S1 at
1,39E-05
2,06
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ангиопоэтин-подобным белком 4 (LOC476724); мРНК
XM 533928
ANGPTL4
ангиопоэтин-подобный 4
Cfa. 17571.1.S1 at
2,22E-02
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с митохондриальным белком-носителем карнитина/ацилкарнитина (карнитин/ацилкарнитин-транслоказа) (CAC); вариант транскрипта 3 (LOC484774); мРНК
XM 858026
PRKAR2A
протеинкиназа, цАМФ-зависимая, регуляторная, тип II, альфа
CfaAffx. 19697.1.S1 at
2,03E-02
-1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SWI/SNF-родственным; ассоциированный с матриксом; актин-зависимый регулятор хроматина; подсемейство d; представитель 2; вариант транскрипта 2 (LOC480477); мРНК
XM 845276
SMARCD 2
SWI/SNF-родственный, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство d, представитель 2
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, гомолог D белка 13 сортировки вакуолярных белков (S. cerevisiae) (VPS13D); мРНК
XM 001490932
VPS13D
гомолог D белка 13 сортировки вакуолярных белков (S. cerevisiae)
CfaAffx. 29815.1.S1 s at
4,97E-02
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей убихинол-цитохром с-редуктазы; вариант транскрипта 1 (LOC611791); мРНК
XM 849498
LOC611791
сходный с субъединицей убихинол-цитохром с-редуктазы
Таблица 6 Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Diet71341 относительно 66934 d113, все гены, порог отсечения кратного изменения: 1,3; порог отсечения P-значения: 0,1; порог отсечения Q-значения: 1
Количество образцов в группе 1 (высокобелковая диета с рыбьим жиром): 5, в группе 2 (высокобелковая диета): 4
Кратное изменение >1 предполагает, что зонды повергаются повышающей регуляции в образцах Diet71341.
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris сходный с аминоадипат-полуальдегидсинтазой (LOC482429); мРНК
100
XM 5395
AASS
аминоадипат-полуальдегидсинтаза
Cfa. 4754. 1.A1 at
4,28E-03
4,46E-01
1,64
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с АТФ-связывающей кассетой; подсемейство A; изоформа a представителя 6; вариант транскрипта 1 (LOC480456); мРНК
100
XM 537574
ABCA6
АТФ-связывающая кассета; подсемейство A; (ABC1), представитель 6
Cfa. 19800 .1.S1 s at
2,47E-02
4,46E-01
1,57
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с представителем 1 подсемейства E АТФ-связывающих кассет (ингибитор РНКазы L) (ингибитор рибонуклеазы 4) (RNS4I); вариант транскрипта 1 (LOC475454); мРНК
95,9
XM 532679
ABCE1
ATP-связывающая кассета, подсемейство E (OABP), представитель 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 20999.1.S1 s at
7,52E-02
4,54E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой c партнера 1, взаимодействующего с abl; вариант транскрипта 20 (LOC607247); мРНК
99,2
XM 853138
ABI1
abl-партнер 1
CfaAffx. 7474.1.S1 s at
3,62E-02
4,46E-01
1,53
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой c партнера 1, взаимодействующего с abl; вариант транскрипта 12 (LOC607247); мРНК
100
XM 852773
ABM
abl-партнер 1
CfaAffx. 14971.1.S1 s at
6,13E-02
4,50E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством генов ABI; представитель 3, изоформа 2 (NESH)-связывающего белка изоформа 2 (L0C478544); мРНК
71,1
XM 535721
ABI3BP
семейство генов ABI, представитель 3, (NESH)-связывающего белка
Cfa. 10796.1.S1 at
1,46E-02
4,46E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой s актин-связывающего белка LIM 1; вариант транскрипта 2 (LOC477828); мРНК
100
XM 535022
ABLIM1
актин-связывающий белок LIM 1
Cfa. 18661.1.S1 s at
1,43E-02
4,46E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой s актин-связывающего белка LIM 1; вариант транскрипта 3 (LOC477828); мРНК
100
XM 859794
ABLIM1
актин-связывающий белок LIM 1
CfaAffx. 18010.1.S1 s at
4,98E-02
4,48E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой s актин-связывающего белка LIM 1; вариант транскрипта 4 (LOC477828); мРНК
100
XM 859813
ABLIM1
актин-связывающий белок LIM 1
Cfa. 18249.1.S1 s at
2,52E-02
4,46E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с активатором Rho-зависимой передачи сигналов поперечно-полосатой мышцы (LOC481999); мРНК
98,3
XM 539120
ABRA
актин-связывающий, Rho-активирующий белок
CfaAffx. 032.1.S1 at
2,21E-02
4,46E-01
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2 белка 1, содержащего домен анкирина и домен BTB (POZ) (LOC609299); мРНК
100
XM 846538
ABTB1
белок 1, содержащий повтор анкирина и домен BTB (POZ)
Cfa. 1658.1.S1 a at
1,30E-02
4,46E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ацил-CoA-дегидрогеназой; специфической для цепи средней длины; митохондриальный предшественник (MCAD) (LOC490207); мРНК
100
XM 547328
ACADM
ацил-кофермент A-дегидрогеназа, неразветвленная цепь от C-4 до C-12
CfaAffx. 31225.1.S1 s at
3,89E-02
4,46E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ацил-CoA-дегидрогеназой; специфической для цепи средней длины; митохондриальный предшественник (MCAD) (LOC490207); мРНК
100
XM 547328
ACADM
ацил-кофермент A-дегидрогеназа, неразветвленная цепь от C-4 до C-12
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ацил-CoA-синтетаза, семейство средней длины цепи, представитель 5
Cfa. 10333.1.A1 at
8,49E-02
4,57E-01
1,6
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG6432-PA (LOC475414); мРНК
100
XM 532637
ACSS3
ацил-CoA-синтетаза, семейство короткой цепи, представитель 3
CfaAffx. 17722.1. S1 s at
4,28E-03
4,46E-01
1,55
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с актин-подобным белком 6A (53 кД BRG1-ассоциированный фактор A) (актин-родственный белок Baf53a) (ArpN-бета); вариант транскрипта 3 (LOC478637); мРНК
99,6
XM 843131
ACTL6A
актин-подобный 6A
Cfa. 17841 .1.S1 s at
1,04E-02
4,46E-01
0,71
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с актинином; альфа 4; вариант транскрипта 7 (LOC484526); мРНК
96,3
XM 862287
ACTN4
актинин, альфа 4
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 10338.1.S1 at
1,22E-02
4,46E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с актин-родственным белком 10 (hARP11); вариант транскрипта 1 (LOC480337); мРНК
99,4
XM 537459
ACTR10
гомолог актин-родственного белка 10 (S. cerevisiae)
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с киназой 1 бета-адренергического рецептора (бета-ARK-1) (сопряженная с G-белком рецепторная киназа 2); вариант транскрипта 4 (LOC483701); мРНК
100
XM 859935
ADRBK1
киназа 1 бета-адренергического рецептора
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 12520.1.A1 s at
1,64E-02
4,46E-01
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с аденилосукцинатлиазой; вариант транскрипта 1 (LOC474499); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis Familiaris, сходный с индуцируемым андрогенами 1 (LOC611677); мРНК
53,6
XM 849376
AIG1
индуцируемый андрогенами 1
Cfa. 19796.1.S1 at
2,90E-02
4,46E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом белка сросшихся пальцев ног; вариант транскрипта 1 (LOC478126); мРНК
98,5
XM 535302
AKTIP
АКТ-взаимодействующий белок
Cfa. 21376.1.S1 s at
7,08E-02
4,54E-01
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris сходный с предшественником альдегиддегидрогеназы 4A1 (LOC612452); мРНК
97,9
XM 850179
ALDH4A1
семейство альдегиддегидрогеназ 4, представитель A1
Cfa. 21036.1.S1 s at
6,25E-02
4,50E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником альдегиддегидрогеназы 4A1 (LOC612452); мРНК
100
XM 850179
ALDH4A1
семейство альдегиддегидрогеназ 4, представитель A1
CfaAffx. 1496.1.S1 s at
1,50E-02
4,46E-01
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с антиквитином (LOC481486); мРНК
98,9
XM 538607
ALDH7A1
семейство альдегиддегидрогеназ 7, представитель A1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 403.1.A1 s at
1,01E-02
4,46E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с антиквитином (LOC481486); мРНК
99,3
XM 538607
ALDH7A1
семейство альдегиддегидрогеназ 7, представитель A1
Cfa. 403.1.A1 at
3,72E-02
4,46E-01
1,66
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris сходный с антиквитином (LOC481486); мРНК
100
XM 538607
ALDH7A1
семейство альдегиддегидрогеназ 7, представитель A1
гомолог аспарагин-связанного гликозилирования 2 (S. cerevisiae, альфа-1,3-маннозилтрансфераза)
CfaAffx. 28581.1.S1 at
3,86E-02
4,46E-01
1,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с долихилпирофосфат-Man9GlcNAc2-альфа-1,3-глюкозилтрансферазой (долихил-P-Glc:Man9GlcNAc2-PP-долихилглюкозилтрансфераза) (LOC609974); мРНК
100
XM 847338
ALG6
гомолог аспарагин-связанного гликозилирования 6 (S. cerevisiae, альфа-1,3-маннозилтрансфераза)
Cfa. 1139.1.A1 at
3,86E-02
4,46E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, гипотетический LOC459598; вариант транскрипта 4 (LOC459598); мРНК
92
XM 515780
AMMECR1L
подобный гену 1 хромосомной области AMME
Cfa. 17250.1.S1 s at
1,74E-02
4,46E-01
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей 2 стимулирующего комплекса анафазы (APC2) (субъединица 2 циклосомы) (LOC491236); мРНК
99,7
XM 548357
ANAPC2
субъединица 2 стимулирующего комплекса анафазы
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis Familiaris, сходный с архаином; вариант транскрипта 2 (LOC479415); мРНК
96
XM 855468
ARCN1
архаин 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 17840.1.S1 s at
9,57E-02
4,63E-01
1,54
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 домена 4B, взаимодействующего с AT-богатым участком; вариант транскрипта 3 (LOC488959); мРНК
100
XM 843623
ARID4B
домен 4B, взаимодействующий с AT-богатым участком (RBP1-подобный)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 1205.1.S1 at
1,45E-02
4,46E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с Сходный с белком 1, подобным ядерному переносчику рецептора арилуглеводорода (ARNT-подобный 1 головного мозга и мышц) (представитель белков PAS 3) (основная спираль петля-спираль PAS-орфан MOP3) (bHLH-PAS-белок JAP3); вариант транскрипта 6 (LOC476860); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, содержащим два домена AAA; вариант транскрипта 2 (LOC475090); мРНК
98,3
XM 845427
ATAD 2
семейство АТФ-аз, белок 2, содержащий домен AAA
CfaAffx. 29 389.1.S1 s at
3,16E-02
4,46E-01
1,3
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с AAA-АТФазой TOB3 (LOC479568); мРНК
100
XM 536708
ATAD3A
семейство АТФ-аз, белок 3A, содержащий домен AAA
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 15399.1.A1 at
4,56E-02
4,47E-01
1,55
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2 аргинилтрансферазы 1; вариант транскрипта 4 (LOC486919); мРНК
100
XM 860764
ATE1
аргинилтрансфераза 1
CfaAffx. 28602.1.S1 s at
3,01E-02
4,46E-01
1,58
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом C аутофагии 4, APG4; вариант транскрипта 1 (LOC489561); мРНК
100
XM 546681
ATG4C
гомолог C аутофагии 4, APG4 (S. cerevisiae)
CfaAffx. 10676.1.S1 at
2,86E-02
4,46E-01
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG16965-PA (LOC483395); мРНК
99,8
XM 540514
ATHL1
ATH1, белок 1, подобный кислой трегалозе (дрожжи)
CfaAffx. 10130.1.S1 s at
5,91E-02
4,50E-01
1,55
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1a транспортирующей кальций АТФ-азы 2C1; вариант транскрипта 8 (LOC477066); мРНК
100
XM 858651
ATP2C1
АТФ-аза, транспортирующая Ca++, тип 2C, представитель 1
CfaAffx. 12618.1.S1 at
3,70E-02
4,46E-01
1,48
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный со связанным с атаксией-телеангиэктазией и Rad3-родственным белком; вариант транскрипта 4 (LOC477101); мРНК
100
XM 860680
ATR
связанный с атаксией-телеангиэктазией и Rad3-родственный
CfaAffx. 26396.1.S1 s at
5,95E-03
4,46E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 регулятора транскрипции ATRX; вариант транскрипта 7 (LOC480963); мРНК
37,7
XM 855075
ATRX
альфа-талассемия/синдромом умственной отсталости, сцепленный с X-хромосомой (гомолог RAD54, S. cerevisiae)
CfaAffx. 26397.1.S1 s at
5,11E-02
4,48E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 регулятора транскрипции ATRX; вариант транскрипта 7 (LOC480963); мРНК
55
XM 855075
ATRX
альфа-талассемия/синдромом умственной отсталости, сцепленный с X-хромосомой (гомолог RAD54, S. cerevisiae)
CfaAffx. 26395.1.S1 s at
4,32E-02
4,47E-01
1,48
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris сходный с изоформой 1 регулятора транскрипции ATRX; вариант транскрипта 2 (LOC480963); мРНК
68,8
XM 854886
ATRX
альфа-талассемия/синдромом умственной отсталости, сцепленный с X-хромосомой (гомолог RAD54, S. cerevisiae)
Cfa. 10959.1.A1 at
1,23E-02
4,46E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с атаксином-10 (белок спинально-церебеллярной атаксии типа 10) (гомолог белка E46 головного мозга); вариант транскрипта 3 (LOC474467); мРНК
100
XM 851945
ATXN10
атаксин 10
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с HLA-B-ассоциированным транскриптом 2; вариант транскрипта 2 (LOC481713); мРНК
91,1
XM 844311
BAT2
HLA-B-ассоциированный транскрипт 2
Cfa. 7385.1.S1 s at
9,73E-02
4,64E-01
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris сходный с HLA-B-ассоциированным транскриптом 2; вариант транскрипта 1 (LOC481713); мРНК
98,1
XM 538834
BAT2
HLA-B-ассоциированный транскрипт 2
Cfa. 21524.1.S1 s at
8,54E-03
4,46E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с HLA-B-ассоциированным транскриптом 2; вариант транскрипта 4 (LOC481713); мРНК
98,8
XM 853603
BAT2
HLA-B-ассоциированный транскрипт 2
Cfa. 18910.1.S1 s at
2,80E-02
4,46E-01
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с бром-доменом, близлежащим с домену цинкового пальца 2A (белок 5, взаимодействующий с фактором терминации транскрипции) (TTF-I-взаимодействующий белок 5) (Tip5) (hWALp3); вариант транскрипта 1 (LOC48U16); мРНК
100
XM 538237
BAZ2A
бром-домен, близлежащий к домену цинковго пальца, 2A
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 7103.1.S1 at
4,26E-02
4,47E-01
1,57
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой b белка 7 синдрома Бардет-Биделя; вариант транскрипта 4 (LOC476092); мРНК
100
XM 852128
BBS7
синдром Бардет-Биделя 7
Cfa. 13280.2.S1 s at
3,89E-02
4,46E-01
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1 резистентности к антиэстрогену при раке молочной железы (LOC479648); мРНК
100
XM 847859
BCAR1
белок 1 резистентности к антиэстрогену при раке молочной железы
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
биогенез комплекса родственных лизосомам органоидов-1; субъединица 1
CfaAffx. 23436.1.S1 at
9,92E-02
4,65E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с основным ядерным фактором 1 с лейциновой молнией (LOC490354); мРНК
98,5
XM 547475
BLZF1
основной ядерный фактор 1 с лейциновой молнией
Cfa. 19858.1.S1 s at
6,30E-02
4,50E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с основным ядерным фактором 1 с лейциновой молнией (LOC490354); мРНК
99,1
XM 547475
BLZF1
основной ядерный фактор 1 с лейциновой молнией
CfaAffx. 7166.1.S1 s at
3,49E-02
4,46E-01
1,6
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 4 с кольцевыми пальцами группы Polycomb (белок комплекса Polycomb BMI-1) (белок с кольцевыми пальцами 51); вариант транскрипта 2 (LOC487097); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, подобным белку 44 головного мозга; вариант транскрипта 5 (LOC609356); мРНК
99,6
XM 858018
BRP44L
подобный белку 44 головного мозга
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp451B077 (из клона DKFZP451B077)
49,3
BX 647629
C1orf71
открытая рамка считывания 71 хромосомы 1
Cfa. 1379.1.S1 at
3,40E-02
4,46E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субкомпонентом комплемента C1q; предшественник цепи A (LOC478194); мРНК
98,5
XM 535367
C1QA
компонент комплемента 1 q, субкомпонент, цепь
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 16472.2.S1 a at
6,14E-02
4,50E-01
0,71
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником субкомпонента комплемента C1s (C1-эстераза); вариант транскрипта 2 (LOC486714); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2 кальций/кальмодулин-зависимой протеинкиназы ID (LOC607636); мРНК
94,1
XM 844395
CAMK1D
кальций/кальмодулин-зависимая протеинкиназа ID
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 18796.1.S1 at
2,24E-03
4,46E-01
1,65
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с цепью дельта кальций/кальмодулин-зависимой протеинкиназы типа II (дельта-цепь CaM-киназы I) (дельта-субъединица CaM-киназа II) (дельта-субъединица CaMK-II) (LOC610764); мРНК
95,5
XM 848313
CAMK2D
кальций/кальмодулин-зависимая протеинкиназа (CaM киназа) II дельта
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris сходный с предполагаемым NFkB-активирующим белком; вариант транскрипта 1 (LOC4849U); мРНК
100
XM 542027
CC2D1A
двуспиральный и содержащий домен C2 белок 1A
CfaAffx. 21274.1.S1 at
3,21E-02
4,46E-01
1,6
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, регулирующим клеточный цикл и апоптоз; вариант транскрипта 5 (LOC479230); мРНК
100
XM 855565
CCAR1
регулятор цикла клеточного деления и апоптоза 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 10456.1.A1 at
7,93E-02
4,55E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 кинуренинаминотрансферазы III изоформа 1; вариант транскрипта 1 (LOC479959); мРНК
94,7
XM 537084
CCBL2
цистеин-конъюгат-бета-лиаза 2
CfaAffx. 3956.1.S1 at
1,87E-03
4,46E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG4996-PA (LOC475228); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с GGA-связывающим партнером вспомогательный белок (p56) (HSD8); вариант транскрипта 2 (LOC486622); мРНК
54,9
XM 860231
CCDC91
белок 91, содержащий двуспиральный домен
Cfa. 3424.1.S1 at
9,38E-02
4,62E-01
1,62
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с GGA-связывающим партнером (вспомогательный белок p56) (HSD8); вариант транскрипта 4 (LOC486622); мРНК
95,5
XM 860280
CCDC91
белок 91, содержащий двуспиральный домен
Cfa. 389.1.S1 at
3,73E-02
4,46E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis Familiaris, сходный с циклином C; вариант транскрипта 7 (LOC475007); мРНК
96,1
XM 863125
CCNC
циклин С
CfaAffx. 26 324.1.S1 s at
3,67E-02
4,46E-01
1,3
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis Familiaris, сходный с циклином G1 (циклин G); вариант транскрипта 4 (LOC479303); мРНК
98,8
XM 861898
CCNG1
циклин G1
CfaAffx. 13 729.1.S1 at
8,90E-02
4,59E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с циклином G2 (LOC478442); мРНК '
100
XM 535619
CCNG2
циклин G2
CfaAffx. 24 405.1.S1 at
3,55E-02
4,46E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 4 белка прохождения клеточного цикла 1; вариант транскрипта 3 (LOC487566); мРНК
79,5
XM 858478
CCPG1
белок прохождения клеточного цикла 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 24597.1.S1 at
1,44E-03
4,46Е-01
1,66
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником рецептора хемокина C-C типа 7 (C-C CKR-7) (CC-CKR-7) (CCR-7) (рецептор MIP-3 бета) (EBV-индуцируемый сопряженный с G-белком рецептор 1) (EBI1) (BLR2)(LOC491011); мРНК
100
XM 548131
CCR7
рецептор хемокина (C-C-мотив) 7
Cfa. 18704.1.S1 s at
7,42E-02
4,54E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с шаперонин-содержащий TCP1; субъединица 2; вариант транскрипта 1 (LOC474445); мРНК
100
XM 531675
CCT2
шаперонин-содержащий TCP1, субъединица 2 (бета)
Cfa. 5626.1.A1 at
6,68E-02
4,51E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с шаперонин-содержащим TCP1; субъединица 3 изоформа c; вариант транскрипта 2 (LOC480123); мРНК
100
XM 859150
CCT3
шаперонин-содержащий TCP1, субъединица 3 (гамма)
Cfa. 1285.1.A1 at
2,61E-02
4,46E-01
1,31
Homo sapiens, частичная мРНК субъединицы 6A шаперонина (ген CCT6A)
Homo sapiens, CD2-ассоциированный белок (CD2AP); мРНК
83,8
NM 012120
CD2AP
CD2-ассоциированный белок
CfaAffx. 22280.1.S1 s at
3,57E-02
4,46E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, сходный с TREM4 альфа; вариант транскрипта 1 (LOC740064); мРНК
67,2
XM 001153114
CD 300LG
представитель 9 семейства молекул, подобных молекуле CD300
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Pongo abelii, мРНК, кДНК DKFZD459I233 (из клона DKFZp459I233)
59,7
CR 861291
CDC 42SE2
малый CDC42-эффектор 2
CfaAffx. 2024.1.S1 at
1,01E-02
4,46E-01
1,61
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с малым CDC42-эффектором 2 (LOC609492); мРНК
100
XM 846751
CDC 42SE2
малый CDC42-эффектор 2
CfaAffx. 16477.1.S1 at
7,13E-02
4,54E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, белок 73 цикла клеточного деления; компонент комплекса Pafl/РНК-полимераза II; гомолог . (S. cerevisiae) (CDC73); мРНК
92,1
XM 001492217
CDC73
белок 73 цикла клеточного деления, компонент комплекса Paf1/РНК-полимераза II, гомолог (S. cerevisiae)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 18970.1.S1 at
3,38E-02
4,46E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактор транскрипции RAM2 (LOC482347); мРНК
100
XM 539464
CDCA7L
подобный белку 7, ассоциированному с циклом деления клеток
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CCAAT/энхансер-связывающий белок эпсилон (LOC490607); мРНК
47,4
XM 547729
СЕВРЕ
CCAAT/энхансер-связывающий белок (C/EBP), эпсилон
CfaAffx. 10125.1.S1 at
2,53E-02
4,46E-01
1,47
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CCAAT/энхансер-связывающим белком зета; вариант транскрипта 1 (LOC483035); мРНК
88,9
XM 540150
CEBPZ
CCAAT/энхансер-связывающий белок зета
Cfa. 1767.1.A1 s at
5,41E-02
4,50E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с центромерным белком С 1 (LOC475158); мРНК
95,8
XM 532388
CENPC1
цнтромерный белок С 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 18979.1.S1 s at
5,87E-02
4,50E-01
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis amiliaris, сходный с изоформой a центаурина дельа 2 (LOC485207); мРНК
99,8
XM 542325
CENTD2
центаурин, дельта 2
CfaAffx. 10305.1.S1 at
8,22E-02
4,56E-01
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с центаурином; дельта 3 (LOC487188); мРНК
100
XM 544316
CENTD3
центаурин, дельта 3
CfaAffx. 24199.1 .S1 s at
7,36E-02
4,54E-01
1,5
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с KARP 1-связывающим белком; вариант транскрипта 1 (LOC480096); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
faAffx.7706.1. S1 s at
2,72E-02
4,46E-01
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с креатинкиназой M-типа (креатинкиназа; цепь M) (M-CK) (LOC476435); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 cornichon-подобного белка; вариант транскрипта 4 (LOC609358); мРНК
100
XM 859302
CNIH
гомолог cornichon (Drosophila)
Cfa. 20110.1.S1 at
6,39E-03
4,46E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, представитель 3 семейства CNKSR (CNKSR3); мРНК
50,9
XM 518820
CNKSR3
представитель 3 семейства CNKSR
CfaAffx. 4925.1.S1 s at
2,24E-03
4,46E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с комплексом транскрипции CCR4 NOT; субъединица 3; вариант транскрипта 4 (LOC484312); мРНК
65,5
XM 857708
CNOT3
комплекс транскрипции CCR4-NOT, субъединица 3
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 2659.1.S1 s at
9,73E-02
4,64E-01
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с коллаген; тип XXII; альфа 1 (LOC482056); мРНК
42,4
XM 539177
COL 22A1
коллаген, тип XXII, альфа 1
Cfa. 18065.1.S1 s at
3,28E-02
4,46E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, связывающим антиген Гудпасчера (GPBP) (белок, связывающий коллаген типа IV альфа 3) (StAR-родственный белок переноса липидов 11) (StARDU) (белок 11, содержащий домен START); вариант транскрипта 1 (LOC612799); мРНК
100
XM 844832
COL 4A3BP
белок, связывающий коллаген, тип IV, альфа 3 (антиген Гудпасчера)
Cfa. 1656.1.A1 at
2,89E-02
4,46E-01
1,33
полноразмерный клон кДНК CS0DB004YM03 нейробластомы Cot 10-нормализованной Homo sapiens (человек)
47,7
CR611628
COM MD10
белок 10, содержащий домен COMM
Cfa. 9530.1.S1 at
9,32E-02
4,62E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2, содержащим домен COMM (LOC485713); мРНК
54,3
XM 542834
COM MD2
белок 2, содержащий домен COMM
Cfa. 1670.1.S1 at
2,89E-02
4,46E-01
1,53
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 8, содержащим домен COMM (LOC475138); мРНК
95,9
XM 532368
COM MD8
белок 8, содержащий домен COMM
Cfa. 2267.1.S1 s at
2,43E-02
4,46E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей 4 сигналосомы COP9; вариант транскрипта 2 (LOC478455); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG9410-PA; изоформа A (LOC478853); мРНК
81,9
XM 536015
COQ 10B
гомолог B кофермента Q10 В (S. cerevisiae)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 2647.1.S1 at
4,40E-03
4,46E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с пара-гидроксибензоатполипренид трансферазой; митохондриальный; вариант транскрипта 1 (LOC478457); мРНК
99,8
XM 535634
COQ2
гомолог кофермента Q2, пренилтрансфераза (дрожжи)
CfaAffx. 13209.1.S1 s at
6,17E-03
4,46E-01
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, церулоплазмин; вариант транскрипта 1 (CP); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 21178.1.S1 s at
3,86E-02
4,46E-01
1,51
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a белка, подобного белку 1 сегрегации хромосом CSE1; вариант транскрипта 2 (LOC477257); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с кДНК RIKEN 0610040D20 (LOC476768); мРНК
96,7
XM 533974
CWC15
гомолог CWC15 (S. cerevisiae)
Cfa. 1056.1.A2 at
5,60E-02
4,50E-01
1,54
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с кДНК RIKEN 0610040D20 (LOC476768); мРНК
96,9
XM 533974
CWC15
гомолог CWC15 (S.cerevisiae)
CfaAffx. 95 28.1.S1 s at
3,46E-02
4,46E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CXXC-пальцем 5; вариант транскрипта 2 (LOC487156); мРНК
91,1
XM 843344
CXXC5
CXXC-палец 5
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей динактина p62; вариант транскрипта 4 (LOC479326); мРНК
99,8
XM 862430
DCTN4
динактин 4 (D62)
CfaAffx. 3918.1.S1 at
3,45E-02
4,46E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG6597-PA; изоформа A (LOC611020); мРНК
99
XM 848631
DCUN1D4
белок 4, содержащий домен DCN1, дефектного по недделированию куллина белка 1 (S. cerevisiae)
CfaAffx. 2516.1.S1 at
3,65E-02
4,46E-01
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактором 1 ускорения развития и дифференцировки (LOC482044); мРНК
96,7
XM 539165
DDEF1
фактор 1 ускорения развития и дифференцировки
CfaAffx. 20537.1.S1 at
6,39E-02
4,50E-01
0,73
Bos taurus, ArfGAP с доменом SH3; повтор анкирина и домен PH 3; мРНК (клон кДНК MGC155101 IMAGE:8479064); полная кодирующая последовательность
93,3
BC 133412
DDEFL1
подобный фактору ускорения развития и дифференцировки 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с онкогеном DEK (ДНК-связывающий) (LOC610538); мРНК
99,6
XM 848066
DEK
онкоген DEK (ДНК-связывающий)
CfaAffx. 28477.1.S1 at
5,11E-02
4,48E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG18659-PA; изоформа A (LOC485019); мРНК
99,8
XM 542137
DENND1C
белок 1C, содержащий домен DENN/MADD
Cfa. 9933.1.S1 at
1,48E-02
4,46E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с регулируемой плотностью белок (DRP) (белок DRP1) (ассоциированный с гладкомышечными клетками белок-3) (SMAP-3) (LOC610709); мРНК
54,2
XM 848252
DENR
регулируемый плотностью белок
Cfa. 9451.1.A1 at
9,80E-02
4,64E-01
1,49
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с деэтиолированным 1 (LOC479036);.мРНК
99,2
XM 536186
DET1
деэтиолированный гомолог 1 (Arabidopsis)
Cfa. 11327.1.A1 s at
2,88E-02
4,46E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с диацилглицерин-O-ацилтрансферазой 1 (диглицеридацилтрансфераза) (продукт 1 ACAT-родственного гена); вариант транскрипта 1 (LOC482093); мРНК
98
XM 539214
DGAT1
гомолог 1 диацилглицерин-О-ацилтрансферазы (мышь)
Cfa. 19642.1.S1 s at
7,30E-03
4,46E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предполагаемой РНК-геликазой фактора сплайсинга пре-мРНК (содержащий DEAH-бокс белок 15); вариант транскрипта 17 (L.OC488856); мРНК
94,6
XM 859167
DHX15
полипептид 15 DEAH (Asp-Glu-Ala-His)-бокса
Cfa. 9885.1.S1 s at
1,21E-02
4,46E-01
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предполагаемой РНК-геликазой фактора сплайсинга пре-мРНК (содержащий DEAH-бокс белок 15); вариант транскрипта 2 (LOC488856); мРНК
99,7
XM 846442
DHX15
полипептид 15 DEAH (Asp-Glu-Ala-His)-бокса
Cfa. 11317.1.A1 s at
1,08E-02
4,46E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предполагаемой РНК-геликазой фактора сплайсинга пре-мРНК (содержащий DEAH-бокс белок 15)); вариант транскрипта 9 (LOC488856); мРНК
100
XM 858970
DHX15
полипептид 15 DEAH (Asp-Glu-Ala-His)-бокса
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, делетируемый при раке легкого и пищевода 1 (DLEC1); мРНК
87,2
XM 001488926
DLEC1
делетируемый при раке легкого и пищевода 1
CfaAffx. 11407.1.S1 at
7,39E-02
4,54E-01
0,76
Homo sapiens, дермокин; мРНК (клон кДНК IMAGE:3690018); полная кодирующая последовательность
82,8
BC004493
DMKN
дермокин
CfaAffx. 11463.1.S1 at
3,84E-02
4,46E-01
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG1842-PA (L0C486244); мРНК
100
XM 543369
DNAH10
Динеин аксонемы, тяжелая цепь 10
CfaAffx. 11469.1.S1 s at
7,46E-02
4,54E-01
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG1842-PA (L0C486244); мРНК
100
XM 543369
DNAH10
Динеин аксонемы, тяжелая цепь 10
Cfa. 406.1.S1 at
5,64E-02
4,50E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, сходный с гомологом DnaJ (Hsp40); подсемейство B; представитель 14; вариант транскрипта 3 (LOC471258); мРНК
45,9
XM 001167856
DNAJB14
гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство B, представитель 14
CfaAffx. 31168.1.S1 s at
2,69E-02
4,46E-01
1,55
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом DnaJ (Hsp40); подсемейство B; представитель 4; вариант транскрипта 2 (LOC479982); мРНК
97
XM 862576
DNAJB4
гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство B, представитель 4
Cfa. 16255.1.S1 at
4,08E-02
4,46E-01
1,63
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом DnaJ (Hsp40); подсемейство B; представитель 4; вариант транскрипта 3 (LOC479982); мРНК
99,8
XM 862584
DNAJB4
гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство B, представитель 4
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 17880.1.S1 at
7,82E-02
4,55E-01
1,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом DnaJ (Hsp40) ; подсемейство B; представитель 9 (LOC475286); мРНК
100
XM 532518
DNAJB9
гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство B, представитель 9
Cfa. 17880.2.S1 s at
8,92E-02
4,59E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом DnaJ (Hsp40) ; подсемейство B; представитель 9 (LOC475286); мРНК
100
XM 532518
DNAJB9
гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство B, представитель 9
Cfa. 14652.1.A1 at
1,46E-02
4,46E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом DnaJ (Hsp40) ; подсемейство C; представитель 1; вариант транскрипта 2 (LOC607587); мРНК
96,2
XM 853802
DNAJC1
гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство C, представитель 1
Cfa. 1884.1.S1 at
7,47E-02
4,54E-01
1,41
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом DnaJ (Hsp40) ; подсемейство C; представитель 10; вариант транскрипта 2 (LOC478826); мРНК
95,1
XM 845828
DNA JC10
гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство C, представитель 10
Cfa. 10112.1.A1 s at
1,02E-02
4,46E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом DnaJ (Hsp40) ; подсемейство C; представитель 2, изоформа 2; вариант транскрипта 2 (LOC483275); мРНК
99,1
XM 540394
DNAJC2
гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство C, представитель 2
CfaAffx. 5449.1.S1 at
8,37E-03
4,46E-01
1,64
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG7872-PA; вариант транскрипта 1 (LOC481665); мРНК
100
XM 538787
DNA JC25
гомолог DnaJ (Hsp40), подсемейство C, представитель 25
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 1118.1.A1 at
2,93E-02
4,46E-01
1,62
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный со специализированным белком-регуятором цитокинеза 9 (Cdc42, фактор обмена гуаниновых нуклеотидов зизимин 1); вариант транскрипта 1 (LOC612820); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфатазой, взаимодействующей с комплексом RNA/RNP (фосфатаза, которая взаимодействует с комплексом RNA/RNP 1) (протеинфосфатаза 11 с двойной специфичностью) (LOC483110); мРНК
81,2
XM 540226
DUSP11
фосфатаза с двойной специфичностью 11 (взаимодействующая с комплексом RNA/RNP 1)
Cfa. 21293.1.S1 s at
9,75E-02
4,64E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфатазой, взаимодействующей с комплексом RNA/RNP 1 (фосфатаза, которая взаимодействует с комплексом RNA/RNP 1) (протеинфосфатаза с двойной специфичностью 11) (LOC483110); мРНК
99,4
XM 540226
DUSP11
фосфатаза с двойной специфичностью 11 (взаимодействующая с комплексом RNA/RNP 1)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 12631.1.A1 s at
2,67E-02
4,46E-01
1,49
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфатазой с двойной специфичностью 12 (LOC478985); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с спергеном-3 (LOC490916); мРНК
100
XM 548039
EFCAB3
кальций-связывающий домен 3, содержащий EF-руку
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с эукариотическим фактором инициации трансляции 3; субъединица 6 (предполагаемая); вариант транскрипта 4 (LOC475070); мРНК
100
XM 854853
EIF3E
эукариотический фактор инициации трансляции 3, субъединица E
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1 цинк-фосфодиэстеразы ELAC (рибонуклеаза Z 1) (РНКаза Z 1) (тРНКаза Z 1) (эндонуклеаза 1 тРНК 3) (белок 1, гомолог ElaC) (делетированный в случае Ma29); вариант транскрипта 2 (LOC476197); мРНК
70,1
XM 844400
ELAC1
гомолог 1 elaC (E. coli)
Cfa. 1872.1.S1 at
5,51E-02
4,50E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ETS-родственным фактором транскрипции Elf-2 (E74-подобный фактор 2) (новый ETS-родственный фактор); вариант транскрипта 1 (LOC476080); мРНК
Pongo abelii, мРНК; кДНК DKFZp469M0522 (из клона DKFZp469M0522)
82,9
CR 857140
ELOVL5
представитель 5 семейства ELOVL, элонгация длинноцепочечных жирных кислот (FEN1/Elo2. SUR4/Elo3-подобный, дрожжи)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 22 271.1.S1 at
6,19E-02
4,50E-CU
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предполагаемым белком биогенеза рибосом NEP1 (C2f белок); вариант транскрипта 2 (LOC477708); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком PTX1; вариант транскрипта 1 (L0C477657); мРНК
98,8
XM 534852
ERGIC2
ERGIC и гольжди 2
Cfa. 11513.1.S1 at
9,30E-02
4,62E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris,сходный с энхансером гомолога rudimentary (LOC480371); мРНК
99,4
XM 537493
ERH
энхансер гомолога rudimentary (Drosophila)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 3, содержащим F-бокс and богатый лейцином повтор (LOC485499); мРНК
98,4
XM 542618
FBXL3
белок 3, содержащий F-бокс и богатый лейцином повтор
CfaAffx. 31207.1.S1 at
3,34E-02
4,46E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 8, содержащим F-бокс and богатый лейцином повтор (LOC611261); мРНК
100
XM 848903
FBXL8
белок 8, содержащий F-бокс и богатый лейцином повтор
Cfa. 5036. 1.A1 s at
1,35E-02
4,46E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a белка 22, содержащего только F-бокс (LOC487672); мРНК
100
XM 544796
FBXO 22
белок 22, содержащий F-бокс
CfaAffx. 21 489.1.S1 at
4,88E-02
4,48E-01
1,49
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 33, содержащим F-бокс; вариант транскрипта 2 (LOC490663); мРНК
97,5
XM 845904
FBXO 33
белок 33, содержащий F-бокс
Cfa. 19071.1.S1 s at
1,16E-02
4,46E-01
2
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 белка 4, содержащего только F-бокс(LOC489220); мРНК
95,8
XM 546338
FBXO 4
белок 4, содержащий F-бокс
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 9434.1.A1 s at
1,36E-03
4,46E-01
2,01
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 белка 4, содержащего только F-бокс(LOC489220); мРНК
99,5
XM 546338
FBX04
белок 4, содержащий F-бокс
Cfa. 19261.1.S1 s at
1,31E-02
4,46E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 8, содержащим только F-бокс (F-бокс/SEC7-белок FBS) (LOC477359); мРНК
100
XM 534554
FBX08
белок 8, содержащий F-бокс
Cfa. 7574.1.A1 s at
7,71E-02
4,55E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2, содержащим F-бокс/WD-повтор (белок 2, содержащий F-бокс и домен WD-40) (белок MD6); вариант транскрипта 2 (LOC610990); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
фолатгидролаза (специфический для простаты мембранный антиген) 1
Cfa. 12297.1.A1 at
3,48E-02
4,46E-01
1,41
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, forkhead-бокс O1A (FOXOIA); мРНК
56
XM 522749
FOX01
forkhead-бокс O1
Cfa. 1958.1.S1 at
9,19E-02
4,61E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субстратом 2 рецептора фактора роста фибробластов; вариант транскрипта 3 (LOC474444); мРНК
98
XM 845407
FRS2
субстрат 2 рецептора фактора роста фибробластов
CfaAffx. 10640.1.S1 s at
4,90E-02
4,48E-01
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG32045-PB; изоформа В (LOC477318); мРНК
100
XM 534510
FRY
гомолог furry (Drosophila)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 4922.1.S1 at
1,42E-02
4,46E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником изоформы 1 рецептора фолликулостимулирующего гормона; вариант транскрипта 2 (LOC481367); мРНК
100
XM 859802
FSHR
рецептор фолликулостимулирующего гормона
Cfa. 18241.1.S1 s at
5,69E-02
4,50E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, связывающим элемент выше Far (FUSE-связывающий белок 1) (FBP) (ДНК-геликаза V) (HDH V); вариант транскрипта 19 (LOC490201); мРНК
93,9
XM 862748
FUBP1
белок 1, связывающий элемент, расположенный выше far (FUSE)
Cfa. 19410.1.S1 s at
7,41E-03
4,46E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с сходный с белком 1, связывающим элемент выше Far (FUSE-связывающий белок 1) (FBP) (ДНК-геликаза V) (HDH V); вариант транскрипта 20 (LOC490201); мРНК
97,3
XM 862753
FUBP1
белок 1, связывающий элемент, расположенный выше Far (FUSE)
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой b белка, родственного белку умственной отсталости, связанной с ломкостью X-хромосомы; вариант транскрипта 12 (LOC478642); мРНК
97,1
XM 851395
FXR1
умственная отсталость, связанная с ломкостью X-хромосомы, аутосомный гомолог 1
Cfa. 12132.1.A1 at
8,01E-02
4,55E-01
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с глюкоза-6-фосфат-1-дегидрогеназой (G6PD) (LOC481088); мРНК
95,7
XM 538209
G6PD
глюкоза-6-фосфатдегидрогеназа
Cfa. 18988.1.S1 s at
4,17E-02
4,47E-01
0,65
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с глюкоза-6-фосфат-1-дегидрогеназой (G6PD) (LOC481088); мРНК
100
XM 538209
G6PD
глюкоза-6-фосфатдегидрогеназа
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 29972.1.S1 at
5,74E-02
4,50E-01
0,68
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с глюкоза-6-фосфат-1-дегидрогеназой (G6PD) (LOC481088); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 18612.1.S1 at
3,49E-02
4,46E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG33084-PB; изоформа В (LOC477509); мРНК
97,6
XM 534705
GATC
глутамил-тРНК (Gln)-аминотрансфераза, гомолог субъединицы С (бактериальный)
Cfa. 3954.1.S1 at
9,96E-03
4,46E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком NipSnap2 (последовательность, амплифицируемая в глиобластоме); вариант транскрипта 1 (LOC479700); мРНК
100
XM 536828
GBAS
последовательность, амплифицируемая в глиобластоме
CfaAffx. 4309.1.S1 s at
4,71E-02
4,48E-01
1,57
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с каталитической субъединицей глутамат-цистеин-лигазы (гамма-глутамилцистеинсинтетаза) (гамма-ECS) (тяжелая цепь GCS); вариант транскрипта 4 (LOC609822); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с глюкозаминфруктоза-6-фосфатаминотрансферазой (LOC474624); мРНК
100
XM 531854
GFPT1
глутамин фруктоза-6-фосфаттрансаминаза 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 55 57.1.S1 at
7,36E-02
4,54E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с C44B7.7 (LOC611603); мРНК
99,8
XM 849284
GGCT
гаммаглутамилциклотрансфераза
CfaAffx. 7813.1.S1 at
8,43E-02
4,56E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ГТФазой; IMAP-семейство, представитель 7 (LOC610898); мРНК
39,2
XM 848467
GIMAP7
ГТФ-аза, семейство IMAP, представитель 7
Cfa. 1560.1.A1 s at
6,05E-02
4,50E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 белка 2, взаимодействующего с киназой рецептора, сопряженного с G-белком; вариант транскрипта 1 (LOC477520); мРНК
100
XM 534715
GIT2
белок 2, взаимодействующий с киназой рецептора, сопряженного с G-белком
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с глюкозамин-6-фосфатдезаминазой 2; вариант транскрипта 1 (LOC608049); мРНК
97
XM 844324
GNPDA2
глюкозамин-6-фосфатдезаминаза 2
Cfa. 1666.1.S1 at
1,53E-02
4,46E-01
1,85
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с глюкозаминфосфат-N-ацетилтрансферазой 1 (LOC480325); мРНК
82,2
XM 537448
GNPNAT1
глюкозаминфосфат-N-ацетилтрансфераза 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG3304-PA; изоформа A (LOC484585); мРНК
98,9
XM 541699
GRAMD1A
белок 1A, содержащий домен GRAM
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактором 3 высвобождения пептидной цепи; вариант транскрипта 1 (LOC480921); мРНК
96,3
XM 538042
GSPT2
белок 2 перехода из G1 в S-фазу
Cfa. 18875.1.S1 s at
2,56E-02
4,46E-01
1,41
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей фактора инициации транскрипции IIE-альфа (TFIIE-альфа) (субъединица общего фактора транскрипции IIE 56 кД); вариант транскрипта 1 (LOC488002); мРНК
100
XM 545124
GTF2E1
общий фактор транскрипции IIE, полипептид 1, альфа 56 кД
Cfa. 2841.1.A1 at
4,78E-02
4,48E-01
1,66
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с общим фактором транскрипции IIF; полипептид 2 (LOC609164); мРНК
86,1
XM 846373
GTF2F2
общий фактор транскрипции IIF, полипептид 2, 30 кД
CfaAffx. 14484.1.S1 at
3,46E-02
4,46E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей комплекса основного фактора транскрипции TFIIH p62 (субъединица основного фактора транскрипции 62 кД) (BTF2-p62) (полипептид 1 общего фактора транскрипции IIH полипептид 1); вариант транскрипта 2 (LOC476881); мРНК
100
XM 860245
GTF2H1
общий фактор транскрипции IIH, полипептид 1, 62кД
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 20989.1.S1 s at
4,31E-02
4,47E-01
1,41
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей комплекса основного фактора транскрипции TFIIH p44 (субъединица основного фактора транскрипции 2 44 кД) (BTF2-p44) (полипептид 2 общего фактора транскрипции IIH); вариант транскрипта 1 (LOC478089); мРНК
100
XM 535266
GTF2H2
общий фактор транскрипции IIH, полипептид 2, 44кД
CfaAffx. 12531.1.S1 at
9,25E-02
4,62E-01
1,54
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей комплекса основного фактора транскрипции TFIIH p44 (субъединица основного фактора транскрипции 2 44 кД) (BTF2-p44) (полипептид 2 общего фактора транскрипции IIH); вариант транскрипта 1 (LOC478089); мРНК
100
XM 535266
GTF2H2
общий фактор транскрипции IIH, полипептид 2, 44кД
CfaAffx. 694.1.S1 at
9,57E-02
4,63E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с GTF2IRD2-бета (LOC607692); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG10286-PA (L0C478132); мРНК
100
XM 535308
HEATR3
белок 3, содержащий повтор HEAT
CfaAffx. 20328.1.S1 s at
5,76E-02
4,50E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG2747-PB; изоформа B; вариант транскрипта 3 (LOC480285); мРНК
100
XM 856144
HEATR5A
белок 5A, содержащий повтор HEAT
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 21192.1.S1 s at
1,62E-02
4,46E-01
0,71
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 3, содержащим домен HECT; вариант транскрипта 1 (LOC482518); мРНК
100
XM 539635
HECTD3
белок 3, содержащий домен HECT
Cfa. 9346.1.A1 at
3,28E-02
4,46E-01
1,5
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG14536-PA; изоформа A; вариант транскрипта 1 (LOC475283); мРНК
97
XM 532515
HERPUD2
представитель 2 семейства HERPUD
CfaAffx. 5738.1.S1 s at
2,57E-02
4,46E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG14536-PA; изоформа A; вариант транскрипта 2 (LOC475283); мРНК
98,5
XM 860479
HERPUD2
представитель 2 семейства HERPUD
Cfa. 340.1.A1 at
4,26E:02
4,47E-01
131
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, подобный транскрипту, в большом количестве встречающемся в гиппокампе, 1 (HIATL1); мРНК
86,3
XM 520704
HIATL1
подобный транскрипту, в большом количестве встречающемся в гиппокампе, 1
Cfa. 2048.1.S1 at
1,59E-02
4,46E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с 3-гидроксиизобутиратдегидрогеназой; митохондриальный предшественник (HIBADH); вариант транскрипта 1 (LOC479610); мРНК
Canis lupus familiaris, главный комплекс гистосовместимости; класс II; DO бета (HLA-DOB); мРНК
100
NM 001048127
HLA-DOB
главный комплекс гистосовместимости, класс II, DO бета
CfaAffx. 17669.1.S1 at
9,57E-02
4,63E-01
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, H2.0-подобный гомеобокс 1 (HLX1); мРНК
90
XM 525068
HLX
H2.0-подобный гомеобокс
Cfa. 11625.1.A1 s at
5,88E-02
4,50E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с 3-гидрокси-3-метилглутарил-кофермент A-редуктазой (HMG-CoA-редуктаза); вариант транскрипта 1 (L0C479182); мРНК
100
XM 536323
HMGCR
3-гидрокси-3-метилглутарил-кофермент A-редуктаза
Cfa. 3398.1.A1 s at
5,79E-02
4,50E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой нуклеосомного связывающего домена высокомобильной группы HMGN3a (LOC611307); мРНК
100
XM 848958
HMGN3
нуклеосомный связывающий домена высокомобильной группы
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 4338.1.S1 at
5,70E-03
4,46E-01
1,48
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеидом A3; вариант транскрипта 13 (LOC608074); мРНК
99,4
XM 857010
HNRNPA3
гетерогенный ядерный рибонуклеопротеид A3
CfaAffx. 1450.1.S1 s at
9,68E-02
4,64E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеидом H (hnRNP H); вариант транскрипта 14 (LOC481455); мРНК
95,5
XM 851737
HNRNPH1
гетерогенный ядерный рибонуклеопротеид H1 (H)
Cfa. 750.1.S1 at
2,14E-02
4,46E-01
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеидом H3 изоформа a; вариант транскрипта 1 (LOC479227); мРНК
95,5
XM 536369
HNRNPH3
гетерогенный ядерный рибонуклеопротеид n НЗ (2H9)
Cfa. 18334.1.S1 s at
4,68E-02
4,48E-01
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеидом H3 изоформа a; вариант транскрипта 2 (LOC479227); мРНК
100
XM 844897
HNRNPH3
гетерогенный ядерный рибонуклеопротеид НЗ (2H9)
CfaAffx. 21010.1.S1 at
2,27E-02
4,46E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеидом H3 изоформа a; вариант транскрипта 4 (LOC479227); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеидом M изоформа a; вариант транскрипта 7 (LOC476725); мРНК
97,6
XM 863261
HNRNPM
гетерогенный ядерный рибонуклеопротеид M
Cfa. 20749.1.S1 s at
2,01E-02
4,46E-01
1,54
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Bos taurus, гетерогенный ядерный рибонуклеопротеид M; вариант транскрипта 2 (HNRPM); мРНК
100
XM 001253662
HNRNPM
гетерогенный ядерный рибонуклеопротеид M
Cfa. 19996.1.S1 s at
4,09E-03
4,46E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеидом R; вариант транскрипта 2 (LOC478192); мРНК
97,9
XM 847852
HNRNPR
гетерогенный ядерный рибонуклеопротеид R
Cfa. 11232
2,94E-02
4,46E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеидом R; вариант транскрипта 4 (LOC478192); мРНК
98,5
XM 8614
HNRNPR
гетерогенный ядерный рибонуклеопротеид R
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 4201.1.A1 at
4,99E-02
4,48E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, сходный с homer-1b; вариант транскрипта 5 (HOMER1); мРНК
79,1
XM 001139767
HOMER1
гомолог homer 1 (Drosophila)
CfaAffx. 5332.1.S1 s at
1,49E-02
4,46E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a белка гомеобокса A1; вариант транскрипта 4 (LOC482367); мРНК
67,9
XM 859434
HOXA1
гомеобокс A1
CfaAffx. 14976.1.S1 at
8,38E-02
4,56E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с дегидрогеназой/редуктазой (семейство SDR), представитель 8 (LOC487848); мРНК
100
XM 544970
HSD 17B11
гидроксистероид (17-бета)-дегидрогеназа 11
Cfa. 18106.1.S1 s at
6,10E-02
4,50E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с многофункциональным ферментом типа 2 пероксисом (MFE-2) (D-бифункциональный белок) (DBP) (17-бета-гидроксистероид дегидрогеназой 4) (17-бета-HSD 4); вариант транскрипта 4 (LOC474630); мРНК
96,9
XM 854213
HSD 17B4
гидроксистероид (17-бета)-дегидрогеназа 4
Cfa. 10807.1.S1 at
1,74E-03
4,46E-01
1,66
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2, подобным гидроксистероиддегидрогеназе; вариант транскрипта 2 (LOC474804); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом белка NGD5 (LOC610842); мРНК
98,1
XM 848399
IFT52
гомолог белка 53 внутрижгутикового транспорта (Chlamydomonas)
Cfa. 17874.1.S1 s at
6,44E-02
4,51E-01
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником инсулиноподобного фактора роста II (IGF-II) (соматомедин A); вариант транскрипта 1 (LOC483664); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG9240-PA; вариант транскрипта 1 (LOC475954); мРНК
100
XM 533164
IMMP1L
подобный IMP1, пептидазе внутренней митохондриальной мембраны (S. cerevisiae)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 18248.1.S1 s at
1,91E-02
4,46E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с инозитолмонофосфатазой (IMPase) (IMP) (инозитол-1(или 4)-монофосфатаза) (чувствительная к литию миоинозитолмонофосфатаза A1) (LOC477925); мРНК
99,3
XM 535114
IMPA1
инозитол (мио)-1(или 4)-монофосфатаза 1
CfaAffx. 28065.1.S1 at
2,62E-02
4,46E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG33556-PA (LOC490877); мРНК
52,6
XM 547999
INF2
инвертированный формин, содержащий домен FH2 и WH2
Cfa. 15497.1.A1 s at
9,42E-02
4,63E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ингибитором белка роста 2 (p33ING2) (ингибитор белка, подобного белку роста) (LOC482916); мРНК
99,8
XM 540031
ING2
ингибитор семейства белком роста, представитель 2
CfaAffx. 6377.1.S1 s at
3,58E-02
4,46E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с инозитолполифосфат-4-фосфатазой; тип II; 105 кД (LOC476072); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a белка 1, содержащего IQ-мотив и повторы WD; вариант транскрипта 5 (LOC480085); мРНК
57,5
XM 857579
IQWD1
IQ-мотив и повторы WD 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 21371.1.S1 s at
1,72E-02
4,46E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a белка 1, содержащего IQ-мотив и повторы WD; вариант транскрипта 2 (LOC480085); мРНК
100
XM 857489
IQWD1
IQ-мотив и повторы WD 1
CfaAffx. 16291.1.S1 at
3,99E-02
4,46E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, сходный с гомеодоменным белком IRXA1 (LOC750962); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником интегрина альфа-M (субъединица альфа гликопротеида клеточной поверхности MAC-1) (цепь CR-3 альфа) (CD11b) (рецептор адгезии лейкоцитов MO1) (рецептор адгезии нейтрофилов); вариант транскрипта 2 (LOC489928); мРНК
98,3
XM 843434
ITGAM
интегрин, альфа M (субъединица рецептора 3 компонента комплемента 3)
CfaAffx. 25820.1.S1 at
4,46E-02
4,47E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником интегрина альфа X (LOC489929); мРНК
100
XM 547049
ITGAX
интегрин, альфа X (субъединица рецептора 4 компонента комплемента 3)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 17954.1.S1 at
3,04E-02
4,46E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, связывающим интегрин бета-1 (белок 1, ассоциированный с цитоплазматическим доменом интегрина) (ICAP-1) (LOC475660); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с p300/CBP-ассоциированным фактором (LOC477052); мРНК
98,6
XM 534249
KAT2B
K (лизин)-ацетилтрансфераза 2B
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 943.1.A1 s at
4,32E-02
4,47E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей A1 катанина p60; вариант транскрипта 1 (LOC476240); мРНК
100
XM 533445
KATNA1
субъединица A1 катанина p60 (содержащая АТФ-азу)
Cfa. 511.1.S1 at
6,05E-02
4,50E-01
1,66
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, белок 7, содержащий повтор kelch и домен BTB (POZ) (KBTBD7); мРНК
64
XM 522666
KBTBD7
белок 7, содержащий повтор kelch и домен BTB (POZ)
Canis familiaris, мРНК калиевого канала внутреннего выпрямления Kir2.1 (KCNJ2) мРНК; полная кодирующая последовательность
99,6
AF 277647
KCNJ2
калиевый канал внутреннего выпрямления, подсемейство J, представитель 2
CfaAffx. 16002.1.S1 at
1,10E-02
4,46E-01
0,68
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с потенциалзависимым калиевым каналом; KQT-подобное подсемейство; представитель 1 изоформа 2 (L0C483669); мРНК
100
XM 540790
KCNQ1
потенциалзависимым калиевым каналом; KQT-подобное подсемейство; представитель 1
CfaAffx. 30206.1.S1 s at
5,29E-02
4,49E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с калиевым каналом; подсемейство T; представитель 1; вариант транскрипта 1 (LOC491258); мРНК
98,5
XM 548379
KCNT1
калиевый канал; подсемейство T; представитель 1
CfaAffx. 17019.1.S1 s at
6,07E-02
4,50E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 10, содержащим домен тетрамеризации калиевого канала; вариант транскрипта 1 (LOC486312); мРНК
100
XM 543438
KCTD10
белок 10, содержащий домен тетрамеризации калиевого канала
CfaAffx. 16854.1.S1 at
8,98E-03
4,46E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с содержащим KH-домен; РНК-связывающий; ассоциированный с сигнальной трансдукцией 1; вариант транскрипта 1 (LOC487316); мРНК
100
XM 544442
KHDR BS1
содержащий KH-домен; РНК-связывающий; ассоциированный с сигнальной трансдукцией 1
Cfa. 9538.1.S1 at
9,06E-03
4,46E-01
1,66
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, сходный с белком KIAA0143 (KIAA0143); мРНК
47,9
XR 022810
KIAA 0143
сходный с белком KIAA0143
Cfa. 1688.1.S1 at
8,32E-03
4,46E-01
1,81
Homo sapiens, мРНК белка KIAA1712; частичная кодирующая последовательность
86,4
AB 051499
KIAA 1712
KIAA1712
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 1938.1.A1 at
6,32E-02
4,50E-01
1,51
Homo sapiens, субстрат, взаимодействующий с киназой D; 220 кД (KIDINS220); мРНК
59,6
NM 020738
KIDINS 220
субстрат, взаимодействующий с киназой D, 220 кД
Cfa. 10496.1.S1 s at
6,44E-02
4,50E-01
1,41
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с кинезин-подобным белком KIF2 (кинезин-2) (HK2); вариант транскрипта 1 (LOC478071); мРНК
99,7
XM 535249
KIF2A
представитель 2A тяжелой цепи кинезина
Cfa. 2691.1.S1 s at
9,79E-02
4,64E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком HsKin17; вариант транскрипта 1 (LOC478010); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2 белка SBBI26; вариант транскрипта 3 (L0C475255); мРНК
95,9
XM 858043
KLHL7
kelch-подобный 7 (Drosophila)
CfaAffx. 14936.1.S1 at
7,21E-02
4,54E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с kelch подобным 8; вариант транскрипта 2 (LOC487847); мРНК
85,9
XM 855020
KLHL8
kelch-подобный 8 (Drosophila)
CfaAffx. 5295.1.S1 s at
6,24E-02
4,50E-01
0,74
C.familiaris, мРНК dKlk-2 калликреина
100
X75479
KLK1
калликреин 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 16646.1.S1 at
9,20E-02
4,61E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с протоонкогенной тирозиновой протеинкиназой LCK (P56-LCK) (LSK) (специфическая для T-клеток тирозиновая протеинкиназа); вариант транскрипта 1 (LOC478151); мРНК
98,7
XM 535327
LCK
специфическая для лимфоцитов тирозиновая протеинкиназа
CfaAffx. 29061.1.S1 at
7,95E-02
4,55E-01
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с лейциновой молнией; белок 1, подвергаемый понижающей регуляции в злокачественной опухоли (LOC492180); мРНК
100
XM 549300
LDOC1
лейциновая молния, белок 1, подвергаемый понижающей регуляции в злокачественной опухоли
CfaAffx. 4840.1.S1 at
5,19E-02
4,48E-01
0,76
Homo sapiens, кластер рецепторов лейкоцитов (LRC), представитель 8 (LENG8); мРНК
90,7
NM 052925
LENG8
кластер рецепторов лейкоцитов (LRC), представитель 8
Cfa. 17893.1.S1 at
5,60E-02
4,50E-01
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2 сопряженного с G-белком рецептора 162; вариант транскрипта 4 (LOC486719); мРНК
100
XM 862374
LEP REL2
лепрекан-подобный 2
Cfa. 11075.2.A1 s at
2,70E-02
4,46E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a галектина 8 (LOC479193); мРНК
100
XM 536335
LGA LS8
лектин, галактозид-связывающий, растворимый, 8
Cfa. 2087.1.A1 at
8,08E-02
4,55E-01
1,82
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с лигатином; вариант транскрипта 1 (LOC478951); мРНК
98,8
XM 536109
LGTN
лигатин
CfaAffx. 10006.1.S1 at
6,33E-02
4,50E-01
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Cams familiaris, сходный с ДНК-лигазой IV (LOC485544); мРНК
100
XM 542663
LIG4
ДНК-лигаза IV, АТФ-зависимая
CfaAffx. 6340.1.S1 a at
6,17E-02
4,50E-01
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с РНК-связывающим белком LIN-28 (L0C481943); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с K11G12.6 (LOC490083); мРНК
100
XM 547204
LMF1
фактор созревания липазы 1
Cfa. 462.1.S1 at
3,31E-02
4,46E-01
1,31
Homo sapiens, лиганд numb-белка X 2 (LNX2); мРНК
80,7
NM 153371
LNX2
лиганд numb-белка X 2
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 9964.1.S1 at
1,50E-02
4,46E-01
1,62
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с неохарактеризованным белком C12orf29 (LOC100051280); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 18802.1.S1 at
7,66E-02
4,55E-01
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ:Equus caballus сходный с нейгрином; ассоциированный с отростком нейритом (LOC100053531); мРНК
84,8
XM 001502846
LOC 100053531
сходный с нейгрином; ассоциированный с отростком нейритом
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с представителем 2 подсемейства A гомологов DnaJ (HIRA-взаимодействующий белок 4) (белок гена 3 восстановления прохождения клеточного цикла) (Dnj3) (Dj3) (антиген почечной карциномы NY-REN-14) (LOC100056778); мРНК
89,9
XM 001490382
LOC 100056778
сходный с белком DnaJ
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с белком NGLY1 (LOC100059456); мРНК
92,5
XM 001492043
LOC 10059456
гипотетический белок LOC100059456
Cfa. 1748.1.S1 at
4,94E-03
4,46E-01
1,51
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с диметиладенозинтрансферазой (LOC100059778); мРНК
63,7
XM 001493893
LOC 10059778
сходный с диметиладенозинтрансферазой
Cfa. 11885.1.A1 at
6,61E-03
4,46E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с семейством антигенов P; представитель 5 (LOC100059794); мРНК
35,2
XM 001492267
LOC 10059794
сходный с белком PAGE 5
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с гомологом A белка PDS5 слипания сестринских хроматид A (белок слипания сестринских хроматид 112) (SCC-112) (белок индуцирующего пролиферацию клеток гена 54) (LOC100063999); мРНК
79,3
XM 001497764
LOC 100063999
сходный с белком SCC-112
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 4602.1.S1 at
2,88E-02
4,46E-01
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с семейством доменовTBC1; представитель 2 (LOC100064O26); мРНК
92,3
XM 001915869
LOC 100064026
гипотетический LOC100064026
Cfa. 19492.1.A1 at
3,06E-03
4,46E-01
1,58
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с Kelch-подобным белком 5 (LOC100064472); мРНК
42,6
XM 001917431
LOC 100064472
Гипотетический LOC100064472
Cfa. 19724.1.S1 at
3,91E-03
4,46E-01
1,67
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с Kelch-подобным белком 5 (LOC100064472); мРНК
75,5
XM 001917431
LOC 100064472
Гипотетический LOC100064472
Cfa. 18371.1.S1 s at
5,77E-03
4,46E-01
0,69
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с KIAA0082 (LOC100064496); мРНК
91,2
XM 001917948
LOC 100064496
Гипотетический LOC100064496
CfaAffx. 24819.1.S1 at
2,05E-02
4,46E-01
1,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с Toll-подобным рецептором 10 (LOC100064614); мРНК
88,9
XM 001498678
LOC 100064614
сходный с Toll-подобным рецептором 10
CfaAffx. 15616.1.S1 at
5,75E-02
4,50E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с нейротримином; вариант транскрипта 2 (LOC100064766); мРНК
92,5
XM 001505110
LOC 100064766
сходный с нейротримином
Cfa. 342.1.A1 at
1,40E-02
4,46E-01
1,49
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с белком LOC510651 (LOC100064870); мРНК
47,5
XM 001503113
LOC 100064870
гипотетический белок LOC 100064870
CfaAffx. 29885.1.S1 at
1,28E-02
4,46E-01
1,49
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с клаудин-подобным белком 24 (LOC100065461); мРНК
88,7
XM 001497393
LOC 100065461
гипотетический белок LOC100065461
Cfa. 2674.1.S1 at
1,96E-02
4,46E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с rab11 (LOC100066U6); мРНК
89,9
XM 001496510
LOC 100066116
сходный с rab11
CfaAffx. 16441.1.S1 at
1,48E-02
4,46E-01
1,53
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с гидроксилазой цитидинмонофосфо-N-ацетилнейраминовой кислоты (LOC100067842); мРНК
92
XM 001497791
LOC 100067842
сходный с гидроксилазой CMP-ацетилнейраминовой кислоты
Cfa. 10373.1.S1 s at
9,86E-03
4,46E-01
1,62
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с белком 7, полученным из траспозируемого элемента tigger (LOC100069349); мРНК
87,5
XM 001501652
LOC 100069349
сходный с белком 7, полученным из траспозируемого элемента tigger
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 6334.1.S1 at
2,64E-02
4,46E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с фактором сплайсинга; пролин- и глутамин-богатым (фактор сплайсинга, ассоциированный с белком, связывающим полипиримидиновый тракт) (PTB-ассоциированный фактор сплайсинга) (PSF) (ДНК-связывающий комплекс p52/p100; субъединица 100 кД) (белок спаривания с ДНК 100 кД) (hPOMp100) (LOC100069588); мРНК
100
XM 001499327
LOC 100069588
сходный с фактором сплайсинга, пролин- и глутамин-богатый (фактор сплайсинга, ассоциированный с белком, связывающим полипиримидиновый тракт) (PTB-ассоциированный фактор сплайсинга) (PSF) (ДНК-связывающий комплекс D52/D100, субъединица 100 кД) (белок спаривания с ДНК 100 кД) (hPOMp100)
Cfa. 2265.1.A1 at
2,59E-02
4,46E-01
1,52
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с белком SYNCRIP; вариант транскрипта 2 (LOC100070472); мРНК
93,4
XM 001915136
LOC 100070472
сходный с синаптотагмин-связывающим, цитоплазматическим взаимодействующим с РНК белком
сходный с протеинфосфатазой 2, каталитическая субъединица, альфа
CfaAffx. 11938.1.S1 at
3,55E-02
4,46E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, сходный с кальций/кальмодулин-зависимой протеинкиназой типа IV (CAM-киназа-GR) (CaMK IV) (LOC100073192); мРНК
93,3
XM 001918310
LOC 10073192
сходный с кальций/кальмодулин-зависимой протеинкиназой типа IV (CAM-киназа-GR) (CaMK IV)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Bos taurus, сходный с субъединицей RPC5 ДНК-зависимой РНК-полимеразы III (субъединица 5 РНК-полимеразы III) (ДНК-зависимая РНК-полимераза III, полипептид 80 кД) (LOC100140537); мРНК
84,8
XM 001787720
LOC 100140537
сходный с субъединицей RPC5 ДНК-зависимой РНК-полимеразы III (субъединица 5 РНК-полимеразы III) (ДНК-зависимая РНК-полимераза III, полипептид 80 кД)
Cfa. 1992.1.S1 at
1,09E-03
4,46E-01
1,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с белком 1, содержащим цинковый палец и домен BTB (LOC100152273); мРНК
90
XM 001925789
LOC 100152273
сходный с белком 1, содержащим цинковый палец и домен BTB
Cfa. 20921.1.S1 at
4,32E-02
4,47E-01
1,68
Sus scrofa, клон Clu 5612.scr.msk.p1.Co ntig2; последовательность мРНК
83,3
AY610016
LOC 100152647
сходный с гомологом B кофермента Q10
CfaAffx. 20676.1.S1 at
3,07E-02
4,46E-01
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с семейством сходных последовательностей 19 (хемокин (C-C-мотив)-подобный); представитель A3 (LOC100153582); мРНК
83,8
XM 001926031
LOC 100153582
сходный с семейством сходных последовательностей 19 (хемокин (C-C-мотив)-подобный); представитель A3
Cfa. 1632.1.S1 at
7,95E-03
4,46E-01
1,49
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с семейством кислых (богатых лейцином) ядерных фосфопротеидов 32; представитель E (LOC100153768); мРНК
85
XM 001925042
LOC 100153768
сходный с семейством кислых (богатых лейцином) ядерных фосфопротеидов 32; представитель E
Cfa. 1146.1.S1 at
3,15E-02
4,46E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с белком LOC515537 (LOC100154619); мРНК
85
XM 001924716
LOC 100154619
сходный с белком LOC515537
Cfa. 9507.1.A1 at
1,89E-02
4,46E-01
1,47
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с гомологом ядерной ундексапернилпирофосфатсинтазы 1 (LOC100154658); мРНК
65,9
XM 001928072
LOC 100154658
сходный с гомологом ядерной ундексапернилпирофосфатсинтазы 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 11032.1.S1 s at
9,09E-03
4,46E-01
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с белком 2, родственным рецептору липопротеинов низкой плотности (LOC100155022); partial мРНК
88,4
XM 001927100
LOC 100155022
сходный с белком 2, родственным рецептору липопротеинов низкой плотности
Cfa. 2866.1.S1 at
2,00E-02
4,46E-01
1,48
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с компонентом 3 комплекса гамма-тубулина (GCP-3) (гомолог белка полюса веретена деления Spc98) (hSpc98) (hGCP3) (h104p) (LOC100155453); мРНК
37,7
XM 001928111
LOC 100155453
сходный с компонентом 3 комплекса гамма-тубулина (GCP-3) (гомолог белка полюса веретена деления Spc98) (hSpc98) (hGCP3) (h104p)
CfaAffx. 843.1.S1 at
7,76E-02
4,55E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с белком с цинковым пальцем 22 (белок с цинковым пальцем КОХ15) (белок Krox-26) (LOC100156567); мРНК
90,2
XM 001927868
LOC 100156567
сходный с белком с цинковым пальцем 22 (белок с цинковым пальцем КОХ15) (белок Krox-26)
CfaAffx. 843.1.S1 s at
4,76E-02
4,48E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с белком с цинковым пальцем 22 (белок с цинковым пальцем КОХ15) (белок Krox-26) (LOC100156567); мРНК
93,8
XM 001927868
LOC 100156567
сходный с белком с цинковым пальцем 22 (белок с цинковым пальцем КОХ15) (белок Krox-26)
Cfa. 590.1.S1 at
3,83E-02
4,46E-01
1,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, гипотетический белок LOC100156815 (LOC100156815); мРНК
76,2
XM 001926473
LOC 100156815
гипотетический белок LOC 100156815
Cfa. 1029.1.A1 at
2,15E-02
4,46E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Sus scrofa, сходный с белком миграции везикул sec22b (LOC100157002); мРНК
59,7
XM 001928686
LOC 100157002
сходный с белком миграции везикул sec22b
Cfa. 13909.1.A1 at
5,47E-02
4,50E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Acyrthosiphon pisum, сходный с предполагаемым белком (LOC100159545); мРНК
30,2
XM 001951433
LOC 100159545
сходный с предполагаемым белком
CfaAffx. 27236.1.S1 at
3,10E-02
4,46E-01
0,75
Homo sapiens, клон кДНК IMAGE:6214656; с видимым сохраняемым интроном
52,2
BC075826
LOC220594
белок TL132
CfaAffx. 3276.1.S1 at
1,07E-02
4,46E-01
0,76
Homo sapiens, кДНК FU46432 fis; клон THYMU3014701
88,1
AK128294
LOC221442
гипотетический LOC221442
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с открытой рамкой считывания 30 хромосомы 2 open reading frame 30; вариант транскрипта 1 (LOC474593); мРНК
99,8
XM 531822
LOC474593
сходный с открытой рамкой считывания 30 хромосомы 2
Cfa. 3321.1.S1 at
4,46E-02
4,47E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с открытой рамкой считывания 30 хромосомы 2; вариант транскрипта 3 (LOC474593); мРНК
100
XM 859968
LOC474593
сходный с открытой рамкой считывания 30 хромосомы 2
CfaAffx. 2621.1.S1 at
9,94E-02
4,65E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком C5orf5 (GAP-подобный белок N61); вариант транскрипта 2 (LOC474690); мРНК
100
XM 845894
LOC474690
сходный с белком C5orf5 (GAP-подобный белок N61)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 9913.1.S1 at
4,37E-02
4,47E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с представителем 1 подсемейства A гомологов DnaJ (белок 4 теплового шока 40 кД) (гомолог 2 белка DnaJ) (HSJ-2) (HSDJ); вариант транскрипта 3 (LOC474739); мРНК
51,3
XM 860355
LOC474739
сходный с представителем 1 подсемейства A гомологов DnaJ (белок 4 теплового шока 40 кД) (гомолог 2 белка DnaJ) (HSJ-2) (HSDJ)
Cfa. 10612.1.S1 at
3,28E-02
4,46E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с модифицирующим хроматин белком 5; вариант транскрипта 4 (LOC474741); мРНК
99,6
XM 860425
LOC474741
сходный с модифицирующим хроматин белком 5
Cfa. 10612.2.A1 a at
5,94E-02
4,50E-01
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с модифицирующим хроматин белком 5; вариант транскрипта 4 (LOC474741); мРНК
100
XM 860425
LOC474741
сходный с модифицирующим хроматин белком 5
Cfa. 19310.1.S1 at
4,35E-02
4,47E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, подсемейство D семейства обонятельных рецепторов 13 (LOC474791); мРНК
95,2
XM 532021
LOC474791
подсемейство D семейства обонятельных рецепторов 13
Cfa. 6248.1.A1 a at
3,22E-02
4,46E-01
1,53
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с антигеном гистосовместимости HLA класса II; предшественник цепи DO (антиген DOA MHC класса II) (MHC DZ альфа) (MHC DN-альфа); вариант транскрипта 11 (LOC474869); мРНК
100
XM 845710
LOC474869
сходный с антигеном гистосовместимости HLA класса II; предшественник цепи DO (антиген DOA MHC класса II) (MHC DZ альфа) (MHC DN-альфа)
CfaAffx. 5400.1.S1 at
3,06E-02
4,46E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с представителем семейства гомологов EEA1 (ранний антиген эндосом; Rab-эффектор) (eea-1) (LOC474983); мРНК
100
XM 532220
LOC474983
сходный с представителем семейства гомологов EEA1 (ранний антиген эндосом; Rab-эффектор) (eea-1)
CfaAffx. 6092.1.S1 at
5,29E-02
4,49E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком KIAA0776 (LOC474999); мРНК
97,4
XM 532236
LOC474999
сходный с белком KIAA0776
Cfa. 17884.1.S1 at
1,67E-02
4,46E-01
1,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с UPF0240-белком C6orf66 (LOC475001); мРНК
100
XM 532238
LOC475001
сходный с UPF0240-белком C6orf66
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ZK84.1 (LOC475238); мРНК
98,6
XM 532471
LOC475238
сходный с ZK84.1
Cfa. 8704.1.A1 s at
7,78E-02
4,55E-01
1,5
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, гипотетический LOC475363; вариант транскрипта 1 (L0C475363); мРНК
96,3
XM 532587
LOC475363
гипотетический LOC475363
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
сходный с фактором расщепления пре-мРНК I; субъединица 59
CfaAffx. 28075.1.S1 at
2,59E-02
4,46E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с тимидилатсинтазой (TS) (TS-аза) (LOC476100); мРНК
100
XM 533309
LOC 476100
сходный с тимидилатсинтазой (TS) (TS-аза)
Cfa. 4331.1.S1 at
4,36E-02
4,47E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком C2orf25; митохондриальный предшественник; вариант транскрипта 2 (LOC476145); мРНК
100
XM 843981
LOC 476145
сходный с белком C2orf25, митохондриальный предшественник
Cfa. 12334.1.A1 at
1,25E-02
4,46E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG7382-PA; вариант транскрипта 2 (LOC476170); мРНК
99,3
XM 843471
LOC 476170
сходный с CG7382-PA
CfaAffx. 1022.1.S1 at
2,02E-02
4,46E-01
1,49
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG7382-PA; вариант транскрипта 2 (LOC476170); мРНК
100
XM 843471
LOC 476170
сходный с CG7382-PA
CfaAffx. 1022.1.S1 s at
4,98E-02
4,48E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG7382-PA; вариант транскрипта 2 (LOC476170); мРНК
100
XM 843471
LOC 476170
сходный с CG7382-PA
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 483.1.A1 at
6,78E-02
4,52E-01
1,52
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, гипотетический LOC57614; вариант транскрипта 4 (LOC476181); мРНК
99,6
XM 852439
LOC 476181
Гипотетический LOC476181
Cfa. 11029.1.A1 at
4,69E-02
4,48E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком C6orf115 (LOC476222); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 10497.1.A1 at
1,39E-02
4,46E-01
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей 4 медиаторного комплекса (медиатор субъединицы 4 РНК-полимеразы II транскрипции) (компонент 36 кД комплекса белка, взаимодействующего с рецептором витамина D3) (DRIP36) (компонент 36 кД привлекаемого активатором кофактора) (ARC36) (TRAP/SMCC/PC2-субъединица... (LOC476917); мРНК
97,2
XM 534120
LOC 476917
сходный с субъединицей 4 медиаторного комплекса (медиатор субъединицы 4 РНК-полимеразы II транскрипции) (компонент 36 кД комплекса белка, взаимодействующего с рецептором витамина D3) (DRIP36) (компонент 36 кД привлекаемого активатором кофактора) (ARC36) (TRAP/SMCC/PC2-субъединица...
CfaAffx. 7541.1.S1 a at
2,18E-02
4,46E-01
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG14025-PB; изоформа В (LOC477006); мРНК
45,5
XM 534204
LOC 477006
сходный с CG14025-PB, изоформа В
Cfa. 3236.1.S1 at
4,67E-02
4,48E-01
1,3
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником селенопротеида T (LOC477113); мРНК
56,1
XM 534307
LOC 477113
сходный с предшественником селенопротеида T
CfaAffx. 8773.1.S1 s at
9,86E-02
4,65E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, гипотетический LOC477134; вариант транскрипта 12 (LOC477134); мРНК
97,1
XM 851178
LOC 477134
Гипотетический LOC477134
Cfa. 5501.1.A1 s at
1,41E-02
4,46E-01
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG8067-PA (LOC477150); мРНК
99,8
XM 534340
LOC 477150
сходный с CG8067-PA
Cfa. 41.2.S1 s at
3,83E-02
4,46E-01
1,41
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG1218-PA; вариант транскрипта 1 (LOC477355); мРНК
96,9
XM 534550
LOC 477355
сходный с CG1218-PA
CfaAffx. 12645.1.S1 at
2,11E-02
4,46E-01
1,55
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Cams familiaris, сходный с KIAA1712 (LOC477360); мРНК
64,1
XM 534555
LOC 477360
сходный с KIAA1712
CfaAffx. 16620.1.S1 at
5,06E-02
4,48E-01
1,47
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG6004-PB (LOC477650); мРНК
98,4
XM 534845
LOC 477650
сходный с CG6004-РВ
Cfa. 504.1.S1 at
1,65E-02
4,46E-01
1,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG6454-PB; изоформа B; вариант транскрипта 1 (LOC477671); мРНК
97,9
XM 534864
LOC 477671
сходный с CG6454-PB, изоформа В
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 18368.1.S1 s at
8,77E-02
4,59E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG6454-PB; изоформа B; вариант транскрипта 3 (LOC477671); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 4 ДНК-связывающего белка TAR (LOC478234); мРНК
99
XM 535409
LOC 478234
сходный с изоформой 4 ДНК-связывающего белка TAR
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
сходный с субкомплексом NADH-дегидрогеназы (убихинон) 1 бета; 5
Cfa. 10805.1.A1 at
7,82E-03
4,46E-01
1,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 белка, взаимодействующего с геликазой Вернера (LOC478698); мРНК
95,2
XM 535865
LOC 478698
сходный с изоформой 1 белка, взаимодействующего с геликазой Вернера
CfaAffx. 14566.1.S1 s at
9,86E-02
4,65E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 белка, взаимодействующего с геликазой Вернера (LOC478698); мРНК
100
XM 535865
LOC 478698
сходный с изоформой 1 белка, взаимодействующего с геликазой Вернера
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гистоновой аминотрансферазой 1 (предполагаемой); вариант транскрипта 3 (LOC478799); мРНК
100
XM 844987
LOC 478799
сходный с гистоновой аминотрансферазой 1 (предполагаемой)
CfaAffx. 471.1.S1 s at
6,63E-02
4,51E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canisfamiliaris, сходный с тубулином; бета; 2 (LOC478825); мРНК
99
XM 535987
LOC 478825
сходный с тубулином, бета 2
CfaAffx. 888.1.S1 at
1,01E-02
4,46E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с полученным из транспозируемого элемента tigger 1 (LOC478829); мРНК
97,7
XM 535991
LOC 478829
сходный с полученным из транспозируемого элемента tigger 1
CfaAffx. 15878.1.S1 s at
8,72E-02
4,59E-01
1,3
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 39 (переносчик цинка); представитель 10 (LOC478850); мРНК
100
XM 536012
LOC 478850
сходный с семейством растворимых переносчиков 39 (переносчик цинка), представитель 10
CfaAffx. 18492.1.S1 s at
4,31E-02
4,47E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, содержащим основную лейциновую молнию и домены W2; вариант транскрипта 5 (LOC478865); мРНК
91,3
XM 852868
LOC 478865
сходный с белком 1, содержащим основную лейциновую молнию и домены W2
CfaAffx. 18489.1.S1 at
1,95E-02
4,46E-01
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, содержащим основную лейциновую молнию и домены W2; вариант транскрипта 3 (LOC478865); мРНК
94,1
XM 844014
LOC 478865
сходный с белком 1, содержащим основную лейциновую молнию и домены W2
Cfa. 9172.1.S1 s at
6,96E-02
4,53E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 CDC-подобной киназы 1; вариант транскрипта 6 (L0C478866); мРНК
97,5
XM 852996
LOC 478866
сходный с изоформой 1 CDC-подобной киназы 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 17292.2.S1 s at
8,86E-02
4,59E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 CDC-подобный киназы 1; вариант транскрипта 6 (LOC478866); мРНК
99,1
XM 852996
LOC 478866
сходный с изоформой 1 CDC-подобный киназы 1
CfaAffx. 20896.1.S1 at
1,27E-02
4,46E-01
1,51
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с B0507.2 (LOC478996); мРНК
сходный с изоформой 1 белка 1, содержащего домен BTB (POZ)
CfaAffx. 20436.1.S1 s at
9,29E-02
4,62E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с полученным из гепатомы родственным фактору роста белком 3 (HRP-3) (полученный из гепатомы фактор роста 2) (LOC479059); мРНК
98,6
XM 536208
LOC 479059
сходный с полученым из гепатомы родственным фактору роста белком 3 (HRP-3) (полученный из гепатомы фактор роста 2)
Cfa. 8319.1.S1 at
1,10E-02
4,46E-01
1,52
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с C34C12.4; вариант транскрипта 2 (LOC479105); мРНК
95,9
XM 858282
LOC 479105
сходный с C34C12.4
CfaAffx. 25853.1.S1 s at
5,16E-02
4,48E-01
1,52
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с нуклеофосмином 1; вариант транскрипта 7 (L.0C479292); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с центаурином; бета 1; вариант транскрипта 2 (LOC479481); мРНК
99,4
XM 853970
LOC 479481
сходный с центаурином, бета 1
Cfa. 15309.1.A1 at
3,99E-02
4,46E-01
1,55
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, гипотетический LOC479504; вариант транскрипта 2 (LOC479504); мРНК
89,7
XM 846215
LOC 479504
Гипотетический LOC479504
CfaAffx. 23753.1.S1 at
3,52E-02
4,46E-01
1,55
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG14980-PB; вариант транскрипта 1 (LOC479750); мРНК
99,7
XM 536878
LOC 479750
сходный с CG14980-PB
Cfa. 18807.1.S1 s at
4,99E-02
4,48E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG14980-PB; вариант транскрипта 3 (LOC479750); мРНК
99,8
XM 856170
LOC 479750
сходный с CG14980-PB
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 24 689.1.S1 at
9,04E-02
4,60E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, родственным ассоциированной с мембраной гуанилаткиназой (MAGI-3) (LOC479761); мРНК
100
XM 536889
LOC 479761
сходный с белком, родственным ассоциированной с мембраной гуанилаткиназой (MAGI-3)
Cfa. 765.1.S1 s at
3,01E-02
4,46E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 взаимодействующего с рецептором фактора 1; вариант транскрипта 1 (LOC479906); мРНК
99,7
XM 537032
LOC 479906
сходный с изоформой 1 взаимодействующего с рецептором фактора 1
CfaAffx. 30685.1.S1 at
5,36E-02
4,50E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с убиквитин-конъюгирующим ферментом E2N (L0C479932); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гамма-таксилином (белок 5 специфического ответа на липополисахариды) (LOC480853); мРНК
41,9
XM 537970
LOC 480853
сходный с гамма-таксилином (белок 5 специфического ответа на липополисахариды)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 5202.1.A1 s at
1,71E-02
4,46E-01
1,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изофоромой 2 регулируемой тирозин-(Y)-фосфорилированием киназы 2 с двойной специфичностью (LOC481152); мРНК
99,7
XM 538273
LOC 481152
сходный с изофоромой 2 регулируемой тирозин-(Y)-фосфорилированием киназы 2 с двойной специфичностью
CfaAffx. 4869.1.S1 s at
9,42E-02
4,63E-01
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с мотивом 21 типа nudix (связанный с нуклеозиддифосфатом остаток X) (LOC481880); мРНК
99,8
XM 539001
LOC 481880
сходный с мотивом 21 типа nudix (связанный с нуклеозиддифосфатом остаток X)
сходный с фактором транскрипции BTEB1 (основной белок 1, связывающий элемент транскрипции) (BTE-связывающий белок 1) (GC-бокс-связывающий белок 1) (Krueppel-подобный фактор 9)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
сходный с галактозид-2-альфа-L-фукозилтрансферазой 3 (GDP-L-фукоза:бета-D-галактозид-2-альфа-L-фукозилтрансфераза 3) (альфа(1;2)FT 3) (фукозилтрансфераза 10) (белок 1 группы секреторных белков крови)
CfaAffx. 10691.1.S1 at
8,21E-02
4,56E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гипотетическим белком с цинковыми пальцами KIAA1559; вариант транскрипта 1 (LOC484560); мРНК
100
XM 541674
LOC 484560
сходный с гипотетическим белком с цинковыми пальцами KIAA1559
CfaAffx. 11687.1.S1 at
1,38E-02
4,46E-01
1,84
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком с цинковыми пальцами 91 (HPF7; HTF10) (LOC484590); мРНК
100
XM 541704
LOC 484590
сходный с белком с цинковыми пальцами 91 (HPF7; HTF10)
CfaAffx. 20946.1.S1 s at
8,40E-02
4,56E-01
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG1332-PA (LOC484784); мРНК
98,4
XM 541900
LOC 484784
сходный с CG1332-PA
CfaAffx. 370.1.S1 at
2,79E-02
4,46E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с обонятельным рецептором Olr37 (LOC485194); мРНК
93,4
XM 542312
LOC 485194
сходный с обонятельным рецептором Olr37
CfaAffx. 7634.1.S1 at
1,61E-02
4,46E-01
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с цепью A L-лактатдегидрогеназы (LDH-A) (субъединица LDH мышц) (LDH-M) (белок индуцирующего пролиферацию гена 19) (LOC485449); мРНК
100
XM 542567
LOC 485449
сходный с цепью A L-лактатдегидрогеназы (LDH-A) (субъединица LDH мышц) (LDH-M) (белок индуцирующего пролиферацию гена 19)
CfaAffx. 13017.1.S1 at
5,62E-02
4,50E-01
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с отоферлином (LOC485853); мРНК
99,7
XM 542977
LOC 485853
сходный с отоферлином
CfaAffx. 17968.1.S1 s at
1,83E-02
4,46E-01
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с C27H2.3 (LOC485925); мРНК
100
XM 543049
LOC 485925
сходный с C27H2.3
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 13944.1.S1 s at
6,92E-02
4,53E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG4845-PA; вариант транскрипта 1 (LOC486274); мРНК
100
XM 543400
LOC 486274
сходный с CG4845-PA
CfaAffx. 17545.1. S1 at
5,23E-02
4,49E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком C12orf11 (антиген саркомы NY-SAR-95); вариант транскрипта 1 (LOC486627); мРНК
99,8
XM 543753
LOC 486627
сходный с белком C12orf11 (антиген саркомы NY-SAR-95)
Cfa. 9046.1.A1 s at
3,34E-02
4,46E-01
1,41
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком цинкового пальца 32; вариант транскрипта 8 (LOC486784); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 27016.1.S1 s at
4,58E-02
4,47E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG9590-PA (LOC489167); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 23613.1.S1 x at
5,79E-02
4,50E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником области V-II RPMI6410 каппа-цепи Ig (LOC491492); мРНК
100
XM 548613
LOC 491492
сходный с предшественником области V-II RPMI6410 каппа-цепи Ig
CfaAffx. 232.1.S1 s at
3,56E-02
4,46E-01
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством A антигеном меланомы; 8 (LOC491525); мРНК
100
XM 548646
LOC 491525
сходный с семейством A антигеном меланомы; 8
CfaAffx. 18061.1.S1 s at
4,75E-02
4,48E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с цитохромом P450; семейство 2; подсемейство W; полипептид 1 (LOC491601); мРНК
100
XM 548722
LOC 491601
сходный с цитохромом P450; семейство 2; подсемейство W; полипептид 1
Cfa. 7828.1.A1 s at
9,72E-02
4,64E-01
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный со специфическим для семенников гистоном 2a (LOC491827); мРНК
100
XM 548947
LOC 491827
сходный со специфическим для семенников гистоном 2a
CfaAffx. 28749.1.S1 s at
8,01E-02
4,55E-01
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с сериновой/треониновой протеинкиназой MASK (LOC492140); мРНК
100
XM 549261
LOC 492140
сходный с сериновой/треониновой протеинкиназой MASK
CfaAffx. 29502.1.S1 at
3,10E-02
4,46E-01
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Bos taurus, сходный с семейством сходных последовательностей 132; представитель A (LOC506102); мРНК
81,1
XM 582497
LOC 506102
сходный с семейством сходных последовательностей 132, представитель A
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком цинкового пальца 4, содержащим домен BED (LOC606807); мРНК
100
XM 843226
LOC 606807
сходный с белком цинкового пальца 4, содержащим домен BED
CfaAffx. 24013.1.S1 s at
5,58E-02
4,50E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком ядрышка, регулирующим рост клеток (LOC606831); мРНК
100
XM 843269
LOC 606831
сходный с белком ядрышка, регулирующим рост клеток
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 14035.1.S1 s at
5,28E-02
4,49E-01
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником тяжелой цепи H1 интер-альфа ингибитора трипсина (тяжелая цепи HI ITI) (тяжелая цепь 1 интер-альфа-ингибитора) (компонент III комплекса интер-альфа-ингибиора трипсина) (полученный из сыворотки ассоциированный с гиалуронаном белок) (SHAP) (LOC607071); мРНК
99,5
XM 843645
LOC 607071
сходный с предшественником тяжелой цепи H1 интер-альфа ингибитора трипсина (тяжелая цепи HI ITI) (тяжелая цепь 1 интер-альфа-ингибиора) (компонент III комплекса интер-альфа-ингибитора трипсина) (полученный из сыворотки ассоциированный с гиалуронаном белок) (SHAP)
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, связывающим белок теплового шока 70 кД; вариант транскрипта 3 (LOC607960); мРНК
97,2
XM 844401
LOC 607960
сходный с белком, связывающим белок теплового шока 70 кД
CfaAffx. 2582.1.S1 s at
2,97E-02
4,46E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, связывающим белок теплового шока 70 кД; вариант транскрипта 4 (LOC607960); мРНК
97,8
XM 853827
LOC 607960
сходный с белком, связывающим белок теплового шока 70 кД
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 9736.1.S1 s at
3,74E-02
4,46E-01
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, взаимодействующим с дисферлином (LOC608003); мРНК
100
XM 844889
LOC 608003
сходный с белком 1, взаимодействующим с дисферлином
CfaAffx. 25054.1.S1 s at
1,78E-03
4,46E-01
0,68
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный со связанным с ретровирусом полибелком Pol транспозона 297 (LOC608201); частичная мРНК
83,4
XM 845147
LOC 608201
сходный со связанным с ретровирусом полибелком Pol транспозона 297
Cfa. 10068.1.A1 at
4,37E-02
4,47E-01
1,57
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом mago-nashi (LOC608220); мРНК
96,3
XM 845259
LOC 608220
сходный с гомологом maqo-nashi
CfaAffx. 11744.1.S1 at
2,22E-02
4,46E-01
1,95
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с синлейрином; вариант транскрипта 1 (LOC608232); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG18041-PA (LOC609028); мРНК
98,7
XM 846208
LOC 609028
сходный с CG18041-PA
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 313.1.S1 at
5,87E-02
4,50E-01
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом фактора, связывающего GC-богатую последовательность ДНК (LOC609740); мРНК
100
XM 847066
LOC 609740
сходный с гомологом фактора, связывающего GC-богатую последовательность ДНК
Cfa. 10530.1.A1 at
3,19E-02
4,46E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с хи-цепью алкогольдегидрогеназы класса III (глутатион-зависимая формальдегиддегидрогеназа) (FDH) (LOC609781); мРНК
100
XM 847120
LOC 609781
сходный с хи-цепью алкогольдегидрогеназы класса III (глутатион-зависимая формальдегиддегидрогеназа) (FDH)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 8055.3.A1 s at
1,42E-03
4,46E-01
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с FUS-взаимодействующим белком (серин-аргинин-богатым) 1; вариант транскрипта 2 (LOC610494); мРНК
100
XM 861290
LOC 610494
сходный с FUS-взаимодействующим белком (серин-аргинин-богатым) 1
CfaAffx. 550.1.S1 at
3,66E-02
4,46E-01
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с 60S-рибосомным белком L17 (L23); вариант транскрипта 2 (LOC610558); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с альфа-маннозидазой 2C1 (альфа-D-маннозидманногидролаза) (представитель 1 маннозидазы альфа класса 2C) (альфа-маннозидиза 6A8B) (LOC611618); мРНК
83
XM 849305
LOC 611618
сходный с альфа-маннозидазой 2C1 (альфа-D-маннозидманногидролаза) (представитель 1 маннозидазы альфа класса 2C) (альфа-маннозидиза 6A8B)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 1587.1.A1 s at
1,38E-02
4,46E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, подобным транспозазе Buster 3, полученной из транспозона (LOC611949); мРНК
97,8
XM 849669
LOC 611949
сходный с белком, подобным транспозазе Buster 3, полученной из транспозона
Cfa. 18395.1.S1 s at
9,79E-02
4,64E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с F31D4.2 (LOC611986); мРНК
99,5
XM 849706
LOC 611986
сходный с F31D4.2
CfaAffx. 21216.1.S1 s at
8,56E-02
4,57E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 22 (переносчик органических анионов); представитель 20 (LOC612044); мРНК
100
XM 849772
LOC 612044
сходный с семейством растворимых переносчиков 22 (переносчик органических анионов), представитель 20
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2 белка, взаимодействующего с фактором, подобным TATA-связывающему белку; вариант транскрипта 2 (LOC612738); мРНК
100
XM 843208
LOC 612738
сходный с изоформой 2 белка, взаимодействующего с фактором, подобным TATA-связывающему белку
CfaAffx. 17375.1.S1 at
1,90E-03
4,46E-01
1,55
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, гипотетический L0C79684; вариант транскрипта 4 (LOC612770); мРНК
92,1
XM 853586
LOC 612770
гипотетический LOC612770
Cfa. 20764.1.S1 s at
5,73E-02
4,50E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, гипотетический LOC54921; вариант транскрипта 2 (LOC612884); мРНК
97,4
XM 858504
LOC 612884
Гипотетический LOC612884
CfaAffx. 31073.1.S1 at
6,29E-02
4,50E-01
1,61
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, гипотетический LOC54921; вариант транскрипта 2 (LOC612884); мРНК
100
XM 858504
LOC 612884
Гипотетический LOC612884
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 21265.1.S1 at
1,12E-03
4,46E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG5514-PB; изоформа В (LOC612987); мРНК
97
XM 849203
LOC 612987
сходный с CG5514-PB, изоформа В
Cfa. 8007.1.A1 at
3,84E-02
4,46E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG5514-PB; изоформа В (LOC612987); мРНК
98,9
XM 849203
LOC 612987
сходный с CG5514-PB, изоформа В
CfaAffx. 20212.1.S1 at
1,06E-02
4,46E-01
1,51
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Homo sapiens, сходный с FUS-взаимодействующим белком (серин-аргинин богатый) 1 (LOC642558); мРНК
90,1
XM 001713958
LOC 642558
сходный с FUS-взаимодействующим белком (серин-аргинин богатый) 1
Cfa. 14511.1.A1 at
3,39E-03
4,46E-01
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Homo sapiens, сходный с hCG1812929 (LOC645733); мРНК
68,2
XM 001130623
LOC 645733
сходный с hCG1812929
Cfa. 5933.1.A1 at
5,30E-02
4,49E-01
1,5
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с длинной изоформой белка Jade1; вариант транскрипта 1 (LOC693690); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с ДНК-полимеразой йота (RAD30 гомолог B) (Eta2) (LOC693999); мРНК
85
XR 009781
LOC 693999
сходный с ДНК-полимеразой йота (RAD30 гомолог B) (Eta2)
Cfa. 12812.1.A1 at
2,08E-02
4,46E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с ELL-ассоциированным фактором 1 (LOC694057); мРНК
68,6
XM 001082128
LOC 694057
сходный с ELL-ассоциированным фактором 1
Cfa. 17983.1.S1 at
2,26E-02
4,46E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с CG8009-PA; изоформа A (LOC694061); мРНК
84,3
XM 001082901
LOC 694061
сходный с CG8009-PA, изоформа A
Cfa. 8455.2.S1 at
8,26E-03
4,46E-01
1,51
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с RAB4A; представитель семейства онкогенов RAS (LOC694288); мРНК
42,4
XM001082985
LOC 694288
сходный с RAB4A, представитель семейства онкогенов RAS
Cfa. 1796.1.S1 at
3,85E-02
4,46E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с кинезин-подобным моторным белком C20orf23; вариант транскрипта 3 (LOC695167); мРНК
85,2
XM 001086122
LOC 695167
сходный с кинезин-подобным моторным белком C20orf23
Cfa. 15515.1.A1 at
1,60E-02
4,46E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с белком 10, содержащим домен повтора анкирина; вариант транскрипта 5 (LOC695300); мРНК
37,4
XM 001085115
LOC 695300
сходный с белком 10, содержащим домен повтора анкирина
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
сходный с комплексом витамин К-эпоксидредуктаза; белок 1, подобный субъединице 1
Cfa. 8912.1.A1 at
5,26E-04
4,46E-01
1,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с белком 11, родственным рецептору липопротеинов низкой плотности (LOC697652); мРНК
34,4
XR 010332
LOC 697652
сходный с белком 11, родственным рецептору липопротеинов низкой плотности
Cfa. 5789.1.A1 at
5,69E-02
4,50E-01
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с белком, подобным малой фосфатазе CTD (CTDSP-подобный) (малая фосфатаза 3 C-концевого домена) (малая CTD-фосфатаза 3) (SCP3) (фактор 1, взаимодействующий с ядерным белком, взаимодействующим с LIM) (NLI-взаимодействующий фактор 1) (NIF-подобный белок) (RBSP3) (белок YA22) (... (LOC697898); мРНК
69,4
XM 001086442
LOC 697898
сходный с белком, подобным малой фосфатазе CTD (CTDSP-подобный) (малая фосфатаза 3 C-концевого домена) (малая CTD-фосфатаза 3) (SCP3) (фактор 1, взаимодействующий с ядерным белком, взаимодействующим с LIM) (NLI-взаимодействующий фактор 1) (NIF-подобный белок) (RBSP3) (белок YA22) (...
Cfa. 9673.1.A1 s at
6,48E-03
4,46E-01
1,59
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с белком C6orf203 (LOC698108); мРНК
86,9
XM 001090337
LOC 698108
сходный с белком C6orf203
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 568.1.A1 at
3,20E-02
4,46E-01
1,56
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с семейством растворимых переносчиков 38; представитель 1; вариант транскрипта 1 (LOC702135); мРНК
46,8
XM 001094126
LOC 702135
сходный с семейством растворимых переносчиков 38; представитель 1
Cfa. 292.1.A1 at
6,54E-03
4,46E-01
1,51
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с гомологом белка цинковых пальцев 2; вариант транскрипта 1 (LOC703114); мРНК
74
XM 001097848
LOC 703114
сходный с гомологом белка цинковых пальцев 2
Cfa. 20367.1.S1 at
1,85E-02
4,46E-01
1,81
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с мотивом 12 nudix-типа (LOC703898); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с CD2-ассоциированным белком (LOC705221); мРНК
45,1
XM 001103871
LOC 705221
сходный с CD2-ассоциированным белком
Cfa. 2618.1.S1 at
8,80E-03
4,46E-01
1,84
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с представителем 1 семейства A, содержащего домен гомологии с плекстрином (белок 1, содержащий тандемный PH-домен) (TAPP-1); вариант транскрипта 4 (LOC705731); мРНК
63
XM 001103375
LOC 705731
сходный с представителем 1 семейства A, содержащего домен гомологии с плекстрином (белок 1, содержащий тандемный PH-домен) (TAPP-1)
Cfa. 3309.1.A1 at
4,89E-02
4,48E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с белком скрученной формы гаструляции (LOC705804); мРНК
85,3
XM 001099214
LOC 705804
сходный с белком скрученной формы гаструляции
CfaAffx. 3911.1.S1 at
1,65E-02
4,46E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с изоформой 2 белка 2, содержащего домен OCIA; вариант транскрипта 1 (LOC706300); мРНК
89,2
XM 001104046
LOC 706300
сходный с изоформой 2 белка 2, содержащего домен OCIA
Cfa. 9770.1.A1 at
7,20E-02
4,54E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с аминотрансферазой разветвленной цепи; цитозольной; вариант транскрипта 1 (LOC707321); мРНК
69,2
XM 001101021
LOC 707321
сходный с аминотрансферазой разветвленной цепи; цитозольной
Cfa. 581.1.A1 at
1,13E-02
4,46E-01
1,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с ангиогенным фактором VG5Q; вариант транскрипта 4 (LOC707686); мРНК
71
XM 001106767
LOC 707686
сходный с ангиогенным фактором VG5Q
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с CG7222-PA (LOC713515); мРНК
44,9
XM 001102905
LOC 713515
сходный с CG7222-PA
Cfa. 19566.1.S1 at
3,16E-02
4,46E-01
1,71
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с гомологом MON2 дрожжей (LOC716872); мРНК
84,4
XR 014521
LOC 716872
сходный с гомологом MON2 дрожжей
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 9796.1.A1 at
9,97E-03
4,46E-01
1,59
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с неохарактеризованным представителем RGD1359682 семейства белков UPF0227 (10C717757); мРНК
49,5
XM 001109588
LOC 717757
сходный с неохарактеризованным представителем RGD1359682 семейства белков UPF0227
Cfa. 2855.1.A1 at
1,54E-02
4,46E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с экспрессируемой в семенниках последовательностью 2; вариант транскрипта 2 (L0C718268); мРНК
33,6
XM 001116512
LOC 718268
сходный с экспрессируемой в семенниках последовательностью 2
Cfa. 1714.1.A1 at
7,27E-02
4,54E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Macaca mulatta, сходный с белком 45, содержащим двуспиральный домен; вариант транскрипта 3 (LOC718348); мРНК
60,3
XM 001116623
LOC 718348
сходный с белком 45, содержащим двуспиральный домен
сходный с фактором некроза опухолей; альфа-индуцируемый белок 2
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 15612.1.S1 at
1,11E-02
4,46E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Bos taurus, сходный с белком 5, содержащим PAP-ассоциированный домен (белок 4-2 с функцией, родственной топоизомеразе) (TRF4-2) (LOC789894); мРНК
97
XM 001256515
LOC 789894
сходный с белком 5, содержащим PAP-ассоциированный домен (белок 4-2 с функцией, родственной топоизомеразе) (TRF4-2)
Cfa. 1597.1.S1 at
7,53E-03
4,46E-01
1,51
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Bos taurus, сходный с бета-1,2-N-ацетилглюкозаминилтрансферазой II (LOC790576); мРНК
88,4
XM 001257009
LOC 790576
сходный с бета-1,2-N-ацетилглюкозаминилтрансферазой II
Cfa. 6222.1.A1 at
3,45E-02
4,46E-01
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с липином-3 (липин 3-подобный); вариант транскрипта 2 (LOC485876); мРНК
94
XM 861017
LPIN3
липин 3
CfaAffx. 13409.1.S1 at
8,70E-02
4,59E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с лектинретинолацилтрансферазой (LOC482660); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 46, содержащим богатый лейцином повтор; вариант транскрипта 2 (LOC480539); мРНК
100
XM 859361
LRRC46
белок 46, содержащий богатый лейцином повтор
Cfa. 2068.1.S1 at
3,37E-02
4,46E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG3040-PA (LOC478269); мРНК
93,7
XM 535443
LRRC57
белок 57, содержащий богатый лейцином повтор
CfaAffx. 13605.1.S1 s at
5,26E-02
4,49E-01
1,47
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Bos taurus, сходный с белком 2, ассоциированным с натриевым каналом (LRRCC1); мРНК
91,5
XM 001254977
LRRCC1
белок 1, содержащий богатый лейцином повтор и двуспиральный домен
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 30823.1.S1 s at
2,35E-02
4,46E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, содержащим богатый лейцином повтор и стерильный мотив альфа; вариант транскрипта 1 (LOC491329); мРНК
100
XM 548450
LRSAM1
белок 1, содержащий богатый лейцином повтор и стерильный мотив альфа
Cfa. 17370.1.S1 s at
7,56E-02
4,54E-01
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с лактотрансферрином; вариант транскрипта 7 (LOC484787); мРНК
98,9
XM 859474
LTF
лактотрансферрин
CfaAffx. 1417.1.S1 s at
1,38E-02
4,46E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG7686-PA (LOC476232); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, содержащим лейциновую молнию и домен CTNNBIP1 (LOC491440); мРНК
100
XM 548561
LZIC
белок, содержащий лейциновую молнию и домен CTNNBIP1
CfaAffx. 5716.1.S1 s at
6,86E-02
4,53E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a белка, поперечно сщивающего микрофиламенты и филамента актина; вариант транскрипта 1 (LOC475321); мРНК
молекула 1 клеточной адгезии, адрессин слизистой оболочки и сосудов
Cfa. 12274.1.A1 at
7,05E-03
4,46E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ассоциированным с меланомой антигеном F1 (антиген MAGE-F1) (LOC488109); мРНК
100
XM 545233
MAGEF1
семейство антигенов меланомы F, 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 19188.1.A1 at
1,04E-02
4,46E-01
1,52
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ассоциированным с меланомой антигеном H1 (антиген MAGE-H1) (рестин) (связанный с апоптозом белок 1) (APR-1) (LOC491904); мРНК
97,2
XM 549024
MAGEH1
семейство антигенов меланомы H, 1
CfaAffx. 26407.1.S1 at
2,63E-02
4,46E-01
1,67
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ассоциированным с имплантацией белком; вариант транскрипта 1 (LOC491975); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с представителем 2 семейства ассоциированных с микротрубочками белков RP/EB (APC-связывающий белок EB2) (End-связывающий белок 2) (EB2) (LOC490487); мРНК
100
XM 547609
MAP RE2
представителем 2 семейства ассоциированных с микротрубочками белков RP/EB
Cfa. 15713.1.A1 s at
4,47E-02
4,47E-01
0,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с рецептором макрофагов MARCO (рецептор макрофагов с коллагеновой структурой) (LOC476U7); мРНК
99,7
XM 533324
MARCO
рецептор макрофагов с коллагеновой структурой
Cfa. 15713.1.A1 at
8,17E-02
4,55E-01
0,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с рецептором макрофагов MARCO (рецептор макрофагов с коллагеновой структурой) (LOC476117); мРНК
100
XM 533324
MARCO
рецептор макрофагов с коллагеновой структурой
Cfa. 4360.1.S1 s at
2,66E-02
4,46E-01
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с матрином 3; вариант транскрипта 14 (LOC474700); мРНК
99,5
XM 859179
MATR3
матрин 3
Cfa. 21092.1.S1 s
2,48E-02
4,46E-01
1,48
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с матрином 3; вариант транскрипта 1 (LOC474700); мРНК
99,8
XM 531926
MATR3
матрин 3
CfaAffx. 3456.1.S1 s at
1,82E-02
4,46E-01
0,71
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с миоглобином; вариант транскрипта 4 (LOC608715); мРНК
100
XM 857178
MB
миоглобин
Cfa. 8586.1.S1 at
1,65E-02
4,46E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой b muscleblind-подобного 1; вариант транскрипта 12 (LOC477U6); мРНК
92
XM 861250
MBNL1
muscleblind-подобный (Drosophila)
Cfa. 8586.2.S1 a at
4,19E-02
4,47E-01
1,48
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой b muscleblind-подобного 1; вариант транскрипта 12 (LOC477116); мРНК
100
XM 861250
MBNL1
muscleblind-подобный (Drosophila)
CfaAffx. 1002.1.S1 s at
3,16E-02
4,46E-01
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, LOC476160; вариант транскрипта 2 (MBP); мРНК
100
XM 843324
MBP
основной белок миелина
Cfa .4686.1.A1 at
S,82E-02
4,50E-01
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с молекулой адгезии клеток меланомы (LOC489368); мРНК
99,1
XM 546486
MCAM
молекула адгезии клеток меланомы
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 10379.1.A1 at
5,35E-02
4,50E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с кандидатом 2 развития мезодермы (LOC488765); мРНК
99,4
XM 545883
MESDC2
кандидат 2 развития мезодермы
CfaAffx. 21385.1.S1 s at
5,78E-02
4,50E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с кандидатом 2 развития мезодермы (LOC488765); мРНК
100
XM 545883
MESDC2
кандидат 2 развития мезодермы
Cfa. 18663.1.S1 s at
3,35E-02
4,46E-01
1,5
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с метионинаминопептидазой 2 (MetAP 2) (пептидаза M 2) (гликопротеид 67 кД, ассоциированный с фактором инициации 2) (p67) (p67eIF2); вариант транскрипта 2 (LOC475429); мРНК
99,1
XM 860952
METAP2
метиониламинопептидаза 2
CfaAffx. 10510.1.S1 s at
2,59E-03
4,46E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с метионинаминопептидазой 2 (MetAP 2) (пептидазаM 2) (гликопротеид 67 кД, ассоциированный с фактором инициации 2) (p67) (p67eIF2); вариант транскрипта 1 (LOC475429); мРНК
99,8
XM 847559
METAP2
метиониламинопептидаза 2
Cfa. 10084.1.S1 s at
4,S8E-02
4,47E-01
1,55
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG9666-PA; вариант транскрипта 2 (LOC478788); мРНК
белок 4, содержащий домен надсемейства главных посредников
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Homo sapiens, гомолог 1 mindbomb (Drosophila) (MIB1); мРНК
77
NM 020774
MIB1
гомолог 1 mindbomb (Drosophila)
CfaAffx. 27923.1.S1 at
3,21E-02
4,46E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом 1 mindbomb (LOC490521); мРНК
100
XM 547643
MIB1
гомолог 1 mindbomb (Drosophila)
Cfa. 1575.1.A1 s at
2,06E-02
4,46E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2 средней линии (дефект средней линии 2) (белок 1, содержащий мотив, состоящий из трех частей) (LOC481012); мРНК
98,9
XM 538133
MID2
midline 2
CfaAffx. 28355.1.S1 at
4,47E-02
4,47E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1 раннего ответа на индукцию мезодермы; вариант транскрипта 2 (LOC479536); мРНК
100
XM 846977
MIER1
гомолог белка 1 раннего ответа на индукцию мезодермы (Xenopus laevis)
Cfa. 8202.1.A1 at
6,08E-02
4,50E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с митохондриальной промежуточной пептидазой (LOC477338); мРНК
100
XM 534532
MIPEP
митохондриальная промежуточная пептидаза
CfaAffx. 3380.1.S1 s at
4,03E-02
4,46Е-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 гомолога белка 3 перехода к миелоидному/лимфоидному лейкозу или лейкозу смешанной линии; вариант транскрипта 4 (LOC481556); мРНК
96,8
XM 859933
MLLT3
гомолог белка 3 перехода к миелоидному/лимфоидному лейкозу или лейкозу смешанной линии гомолог (trithorax, Drosophila)
Cfa. 1733.2.S1 at
4,67E-02
4,48E-01
1,5
H.sapiens, мРНК транскрипта, ассоциированного с дифференцировкой моноцитов в макрофаги
71
X85750
MMD
ассоциированный с дифференцировкой моноцитов в макрофаги
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 1733.1.A1 at
1,91E-02
4,46E-01
1,96
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, ассоциированный с дифференцировкой моноцитов в макрофаги; вариант транскрипта 2 (MMD); мРНК
84,6
XM 511895
MMD
ассоциированный с дифференцировкой моноцитов в макрофаги
Cfa. 3928.1.S1 s at
8,56E-02
4,57E-01
1,41
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником белка, ассоциированного с дифференцировкой моноцитов в макрофаги (LOC480562); мРНК
100
XM 537684
MMD
ассоциированный с дифференцировкой моноцитов в макрофаги
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактором MAT1 сборки CDK-активирующей киназы (белок кольцевых пальцев MAT1) (Menage a trois) (фактор сборки CDK7/циклин H) (p36) (p35) (белок, взаимодействующий с циклином G1) белок 66 кольцевых пальцев); вариант транскрипта 1 (LOC480346); мРНК
97
XM 537469
MNAT1
гомолог 1 menaqe a trios, фактор сборки циклина H (Xenopus laevis)
CfaAffx. 23967.1.S1 s t
3,31E-02
4,46E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактором MAT1 сборки CDK-активирующей киназы (белок кольцевых пальцев MAT1) (Menage a trois) (фактор сборки CDK7/циклин H) (p36) (p35) (белок, взаимодействующий с циклином G1) белок 66 кольцевых пальцев); вариант транскрипта 1 (LOC480346); мРНК
100
XM 5374
MNAT1
гомолог 1 menaqe a trios, фактор сборки циклина H (Xenopus laevis)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 3008.1.A1 at
5,20E-02
4,48E-01
1,54
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, MOB1; белок 1A, подобный активатору Mps-один-связывающей киназы; вариант транскрипта 2 (MOBKL1A); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с моноацилглицерин-O-ацилтрансферазой 2 (LOC485186); мРНК
100
XM 542304
MOGAT2
моноацилглицерин-O-ацилтрансфераза 2
CfaAffx. 15175.1.S1 at
2,30E-02
4,46E-01
1,63
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с цинковым пальцем 3 семейства MORC CW-типа (LOC610219); мРНК
100
XM 847659
MORC3
цинковый палец 3 семейства MORC CW-типа
Cfa. 1229.2.S1 a at
1,15E-02
4,46E-01
1,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфопротеидом 6 M-фазы; вариант транскрипта 3 (LOC479632); мРНК
98,2
XM 856252
MPH OSPH6
фосфопротеид 6 M-фазы
Cfa. 767.1.S1 at
7,79E-03
4,46E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфопротеидом 9 M-фазы (LOC477453); мРНК
98,6
XM 534651
MPH OSPH9
фосфопротеид 9 M-фазы
CfaAffx. 12145.1.S1 s at
6,61E-03
4,46E-01
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris,сходный с фосфопротеидом 9 M-фазы (LOC477453); мРНК
100
XM 534651
MPH OSPH9
фосфопротеид 9 M-фазы
CfaAffx. 12147.1.S1 s at
2,89E-02
4,46E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris сходный с фосфопротеидом 9 M-фазы (LOC477453); мРНК
100
XM 534651
MPH OSPH9
фосфопротеид 9 M-фазы
CfaAffx. 26739.1.S1 at
7,49E-02
4,54E-01
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником миелопериоксидазы (MPO) (LOC609986); мРНК
100
XM 847352
MPO
миелопероксидаза
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с митохондриальным 28S-рибосомным белком S22 (S22mt) (MRP-S22); вариант транскрипта 2 (LOC609331); мРНК
99,3
XM 860393
MRPS22
митохондриальный рибосомный белок S22
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 3601.1.S1 at
6,64E-02
4,51E-01
1,34
Pongo abelii, мРНК; кДНК DKFZp468J2219 (из клона DKFZp468J2219)
91,1
CR860529
MTERFD3
белок 3, содержащий домен MTERF
CfaAffx. 16180.1.S1 s at
1,25E-02
4,46E-01
0,69
полноразмерный клон кДНК CS0DI086YB21 плаценты Cot 25-нормализованный, Homo sapiens (человек)
92,5
CR607167
MTMR10
родственный миотубулярину белок 10
CfaAffx. 16191.1.S1 s at
8,12E-02
4,55E-01
1,3
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с C01G5.8; вариант транскрипта 3 (LOC479017); мРНК
99,8
XM 851595
MTMR15
родственный миотубулярину белок 15
Cfa. 10556.1.A1 at
1,25E-02
4,46E-01
1,6
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с C01G5.8; вариант транскрипта 1 (LOC479017); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a белка 1, связывающего белок предшественник амилоида бета; вариант транскрипта 3 (LOC610026); мРНК
100
XM 859743
NAE1
субъединица 1 NEDD8-ативирующего фермента E1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 10810.2.S1 s at
3,80E-03
4,46E-01
1,48
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, подобным белку сборки нуклеосом 1 (NAP-1-родственный белок) (hNRP); вариант транскрипта 2 (LOC475407); мРНК
97,1
XM 846847
NAP1L1
белок 1, подобный белку сборки нуклеосом 1
CfaAffx. 9503.1.S1 at
4,21E-02
4,47E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, подобным белку сборки нуклеосом 1 (NAP-1-родственный белок) (hNRP); вариант транскрипта 3 (LOC475407); мРНК
100
XM 859502
NAP1L1
белок 1, подобный белку сборки нуклеосом 1
Cfa. 10810.3.S1 at
1,60E-02
4,46E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, подобным белку сборки нуклеосом 1 (NAP-1-родственный белок) (hNRP); вариант транскрипта 5 (LOC475407); мРНК
Pongo abelii, мРНК; кДНК DKFZp469H086 (из клона DKFZp469H086)
42,4
CR 859716
NCOA7
коактиватор 7 ядерного рецептора
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Rattus norvegicus, экспрессируемый клетками-предшественниками нейронов; подобный подвергаемому понижающей регуляции при развитии 4 (Nedd4l); мРНК
91,9
XM 001064485
Nedd4I
подобный экспрессируемому в клетках-предшественниках нейронов, подвергаемому понижающей регуляции при развитии гену 4
Cfa. 19686.1.S1 at
9,36E-03
4,46E-01
1,48
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с NIMA (ген never in mitosis a)-связанной киназой 7; вариант транскрипта 1 (LOC480008); мРНК
96,2
XM 537129
NEK7
NIMA (ген never in mitosis a)-связанная киназа 7
CfaAffx. 17658.1 .S1 at
9,57E-02
4,63E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с NIMA (ген never in mitosis a)-родственной киназой 7; вариант транскрипта 1 (LOC480008); мРНК
100
XM 537129
NEK7
NIMA (ген never in mitosis a)-связанная киназа 7
Cfa. 8487.1.A1 at
5,58E-02
4,50E-01
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2 нейрофибромина2; вариант транскрипта 1 (LOC477535); мРНК
100
XM 534729
NF2
нейрофибромин 2 (мерлин)
CfaAffx. 31120.1.S1 s at
5,89E-02
4,50E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2 цитоплазматического ядерного фактора 3 активируемых T-клеток; вариант транскрипта 3 (L0C479678); мРНК
54,1
XM 858877
NFATC3
ядерный фактор активируемых T-клеток, цитоплазматический, зависимый от кальциневрина 3
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 5218.1.S1 at
7,16E-02
4,54E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 3, подобным ядерному фактору (полученному из эритроидных клеток 2) (LOC482364); мРНК
100
XM 539481
NFE2L3
белок 3, подобный ядерному фактору (полученному из эритроидных клеток 2)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 30051.1.S1 s at
1,63E-02
4,46E-01
0,67
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с препробелком notch1 (LOC480676); мРНК
100
XM 537795
NOTCH1
гомолог 1 Notch, ассоциированный с транслокацией (Drosophila)
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником нардилизина (двухосновная конвертаза N-аргинина) (NRD-конвертаза) (NRD-C); вариант транскрипта 2 (LOC475354); мРНК
99,8
XM 854556
NRD1
нардилизин (двухосновная конвертаза N-аргинина)
Cfa. 15134.1.A1 s at
1,27E-02
4,46E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком C10orf86 (LOC477849); мРНК
99
XM 535041
NSMCE4A
гомолог A не-SMC-элемента 4 (S. cerevisiae)
CfaAffx. 19270.1.S1 at
5,90E-02
4,50E-01
1,71
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком C10orf86 (LOC477849); мРНК
100
XM 535041
NSMCE4A
гомолог A не-SMC-элемента 4 (S. cerevisiae)
Cfa. 15071.1.A1 at
6,36E-02
4,50E-01
1,41
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством NOL1/NOP2/Sun-доменов; представитель 6; вариант транскрипта 2 (LOC487112); мРНК
91,7
XM 850572
NSUN6
семейство NOL1/NOP2/Su n-доменов, представитель 6
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 20112.1.S1 s at
8,01E-02
4,55E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с цитозольной пурин-5-нуклеотидазой (5-нуклеотидаза цитозольная II); вариант транскрипта 1 (LOC477809); мРНК
98,3
XM 535002
NT5C2
5'-нуклеотидаза, цитозольная II
CfaAffx. 13803.1.S1 at
9,88E-03
4,46E-01
1,49
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником нуклеобиндина 2 (ДНК-связывающий белок NEFA) (антиген рака желудка 2g4); вариант транскрипта 7 (LOC476876); мРНК
95,2
XM 859996
NUCB2
нуклеобиндин 2
Cfa. 18374.1.S1 s at
9,24E-02
4,62E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником нуклеобиндина 2 (ДНК-связывающий белок NEFA) (антиген рака желудка Zg4); вариант транскрипта 5 (LOC476876); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 22285.1.S1 s at
7,90E-02
4,55E-01
1,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a нуклеопорина 35кД (LOC478830); мРНК
98,8
XM 535992
NUP35
нуклеопорин 35 кД
Cfa. 13055.1.S1 at
1,40E-02
4,46E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с нуклеопорином Nup37 (p37) (LOC475445); мРНК
100
XM 532669
NUP37
нуклеопорин 37кД
Cfa. 17092.1.S1 at
9,96E-03
4,46E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с нуклеопорином p54 (нуклеопорин 54 кД); вариант транскрипта 3 (LOC487813); мРНК
75,2
XM 843545
NUP54
нуклеопорин 54 кД
CfaAffx. 13595.1.S1 at
8,12E-03
4,46E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с нуклеопорином p54 (нуклеопорин 54 кД); вариант транскрипта 1 (LOC487813); мРНК
100
XM 544935
NUP54
Нуклеопорин 54кД
CfaAffx. 11485.1.S1 s at
2,19E-02
4,46E-01
1,4
Homo sapiens, кДНК FU41961 fis; клон PUAEN2004083; в высокой степени сходный с нуклеопорином p58/p45
94,9
AK 123955
NUPL1
белок 1, подобный нуклеопорину
CfaAffx. 27647.1.S1 at
1,92E-02
4,46E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактором экспорта 2, подобным фактору ядерного транспорта 2 (LOC612945); мРНК
98,8
XM 847926
NXT2
фактор экспорта 2, подобный фактору ядерного транспорта 2
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с комплексом узнавания начала репликации; субъединица 2 (LOC478868); мРНК
99,8
XM 536028
ORC2L
подобный субъединице 1 комплекса узнавания начала репликации (дрожжи)
Cfa. 224.1.A1 at
1,08E-02
4,46E-01
1,58
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с комплексом узнавания начала репликации; изоформа 1 субъединицы 3; вариант транскрипта 2 (LOC474991); мРНК
99,3
XM 848663
ORC3L
подобный субъединице 3 комплекса узнавания начала репликации (дрожжи)
Cfa. 20932.1.S1 s at
3,84E-02
4,46E-01
1,52
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris сходный с субъединицей 4 комплекса узнавания начала репликации (LOC476141); мРНК
96,7
XM 533348
ORC4L
подобный субъединице 4 комплекса узнавания начала репликации (дрожжи)
CfaAffx. 9239.1.S1 at
2,46E-02
4,46E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с субъединицей 4 комплекса узнавания начала репликации (LOC476141); мРНК
100
XM 533348
ORC4L
подобный субъединице 4 комплекса узнавания начала репликации (дрожжи)
CfaAffx. 7143.1.S1 s at
1,17E-02
4,46E-01
1,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 субъединицы 5 комплекса узнавания начала репликации (LOC609937); мРНК
98,3
XM 847289
ORC5L
подобный субъединице 5 комплекса узнавания начала репликации (дрожжи)
Cfa. 16807.1.S1 at
5,62E-02
4,50E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 субъединицы 5 комплекса узнавания начала репликации (LOC609937); мРНК
100
XM 847289
ORC5L
подобный субъединице 5 комплекса узнавания начала репликации (дрожжи)
Cfa. 1563.1.S1 at
8,52E-03
4,46E-01
1,41
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 11, подобным оксистерин-связывающему белку; вариант транскрипта 2 (LOC478596); мРНК
97,2
XM 844091
OSB PL11
белок 11, подобный оксистерин-связывающему белку
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 30571.1.S1 at
2,83E-02
4,46E-01
0,69
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 индуцируемого беременностью ингибитора роста 1 (LOC489687); мРНК
100
XM 546807
OSGIN1
индуцируемый окислительным стрессом ингибитор роста 1
пуринергический рецептор P2Y, сопряженный с G-белком, 12
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 13303.2.S1 a at
3,19E-02
4,46E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником субъединицы альфа-2 пролил-4-гидроксилазы (4-PH-альфа-2) (субъединица альфа-2 проколлаген-пролин-2-оксоглутарат-4-диоксигеназы); вариант транскрипта 1 (LOC474672); мРНК
99,6
XM 531898
P4HA2
проколлаген-пролин-2-оксоглутарат-4-диоксигеназа (пролин-4-гидроксилаза), полипептид II альфа
Cfa. 17965.1.S1 s at
4,89E-02
4,48E-01
1,41
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с многофункциональным белком ADE2; вариант транскрипта 2 (LOC475150); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, взаимодействующим с поли-(A)-связывающим белком; вариант транскрипта 1 (LOC479343); мРНК
100
XM 536482
PAIP1
белок 1, взаимодействующий с поли-(A)-связывающим белком
CfaAffx. 14274.1.S1 s at
4,64E-02
4,47E-01
1,56
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 4, содержащим PAP-ассоциированный домен; вариант транскрипта 2 (LOC607764); мРНК
100
XM 844605
PAPD4
белок 4, содержащий PAP-ассоциированный домен
Cfa. 1890.1.S1 at
4,50E-02
4,47E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством поли(АДФ-рибоза)полимераз; представитель 11; вариант транскрипта 2 (LOC477722); мРНК
38,9
XM 862916
PARP11
семейство поли(АДФ-рибоза)полимераз; представитель 11
Cfa. 2976.1.S1 at
8,25E-02
4,56E-01
1,64
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, семейство поли(АДФ-рибоза)полимераз; представитель 8; вариант транскрипта 3 (PARP8); мРНК
42,3
XM 517772
PARP8
семейство поли(АДФ-рибоза)полимераз, представитель 8
Cfa. 8067.1.S1 at
6,44E-02
4,51E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 4 полибром 1; вариант транскрипта 5 (LOC476593); мРНК
95,3
XM 853988
PBRM1
полибром 1
CfaAffx. 26258.1.S1 s at
5,55E-02
4,50E-01
0,57
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, взаимодействующим с фактором транскрипции лейкоза пре-B-клеток (LOC480133); мРНК
46,2
XM 537257
PBXIP1
белок 1, взаимодействующий с гомеобоксом лейкоза пре-B-клеток
CfaAffx. 26256.1.S1 at
3,36E-02
4,46E-01
0,68
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, взаимодействующим с фактором транскрипции лейкоза пре-B-клеток (LOC480133); мРНК
100
XM 537257
PBXIP1
белок 1, взаимодействующий с гомеобоксом лейкоза пре-B-клеток
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с PEST-содержащим ядерным белком (PCNP); вариант транскрипта 1 (LOC478546); мРНК
99,7
XM 535723
PCNP
ядерный сигнал, содержащий протеолитический сигнал PEST
CfaAffx. 5957.1.S1 s at
3,06E-02
4,46E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с пренилцистеиноксидазой 1 (LOC481418); мРНК
99,8
XM 538538
PCYOX1
пренилцистеиноксидаза 1
CfaAffx. 20081.1.S1 s at
7,09E-02
4,54E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с холинфосфатцитидилилтрансферазой A (фосфорилхолинтрансфераза A) (CTP:фосфохолинцитидилилтрансфераза A) (CT A) (CCT A) (CCT-альфа) (LOC478600); мРНК
99,8
XM 535776
PCYT1A
холинфосфатцитидилилтрансфераза 1, альфа
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 7302.1.A1 at
5,30E-02
4,49E-01
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфодиэстеразой 10A (LOC484073); мРНК
99,5
XM 541190
PDE 10A
фосфодиэстераза 10A
CfaAffx. 13444.1.S1 at
5,63E-02
4,50E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с цГМФ-ингибируемой 3,5-циклической фосфодиэстеразой В (ингибируемая циклическим ГМФ фосфодиэстераза B) (CGI-PDE B) (CGIPDE1) (CGIP1) (LOC611730); мРНК
100
XM 849436
PDE3B
фосфодиэстераза 3B, цГМФ-ингибируемая
Cfa. 2568.1.A1 at
4,00E-02
4,46E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМАЯ: Macaca mulatta, фосфодиэстераза 8A; вариант транскрипта 4 (PDE8A); мРНК
40
XM 001085955
PDE8A
фосфодиэстераза 8A
CfaAffx. 2924.1.S1 s at
5,97E-03
4,46E-01
0,77
Canis familiaris, полученный из тромбоцитов фактор роста В (PDGFB) мРНК; полная кодирующая последовательность
100
AY553983
PDGFB
полипептид полученного из тромбоцитов фактора роста бета (гомолог онкогена вируса саркомы обезьян (v-sis))
Cfa. 10618.1.S1 at
5,09E-02
4,48E-01
1,54
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предполагаемой субъединицей альфа компонента E1 пируватдегидрогеназы; соматическая форма; митохондриальный предшественник (PDHE1-A типа I); вариант транскрипта 4 (LOC480858); мРНК
100
XM 853468
PDHA1
пируватдегидрогеназа (липоамид) альфа 1
Cfa. 1231.1.S1 at
4,33E-02
4,47E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с компонентом X белка пируватдегидрогеназы; митохондриальный предшественник (дигидролипоамиддегидрогеназа-связывающий белок предполагаемого комплекса дегидрогеназы) (компонент X липоил-содержащего комплекса пируватдегидрогеназы) (E3-связывающий белок) (E...; вариант транскрипта 4 (L0C475942); мРНК
семейство A изомераз дисульфида белка, представитель 2
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфоацетилглюкозаминмутазой (PAGM) (ацетилглюкозаминфосфомутаза) (N-ацетилглюкозаминфосфатмутаза) (фосфоглюкомутаза 3); вариант транскрипта 6 (LOC474981); мРНК
98,7
XM 862638
PGM3
фосфоглюкомутаза 3
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 20228.1.S1 s at
1,18E-02
4,46E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфоацетилглюкозаминмутазой (PAGM) (ацетилглюкозаминфосфомутаза) (N-ацетилглюкозамин-фосфатмутаза) (фосфоглюкомутаза 3); вариант транскрипта 6 (LOC474981); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, фосфатидилинозитолгликан класса N (PIGN); мРНК
98,7
XM 533387
PIGN
биосинтез фосфатидилинозитолгликанового якоря, класса N
Cfa. 1783.1.A1 at
6,95E-02
4,53E-01
1,49
Pan troglodytes, фосфоинозитид-3-киназа; класс 2; полипептид альфа; вариант транскрипта 1 (PIK3C2A); мРНК
79,7
XM 001172509
PIK3C2A
фосфоинозитид-3-киназа; класс 2; полипептид альфа
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 27145.1.S1 s at
4,95E-02
4,48E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, фосфоинозитид-3-киназа; класс 3 (PIK3C3); мРНК
92,3
XM 001497768
PIK3C3
фосфоинозитид-3-киназа, класс 3
CfaAffx. 29304.1.S1 s at
4,23E-02
4,47E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфатидилинозитол-4-фосфат-5-киназой; тип I; гамма (LOC485054); мРНК
99,6
XM 542172
PIP5K1C
фосфатидилинозитол-4-фосфат-5-киназа; тип I; гамма
CfaAffx. 17850.1.S1 at at
5,97E-02
4,50E-01
1,41
Homo sapiens, белок переноса фосфатидилинозитола; цитоплазматический 1 (PITPNC1); вариант транскрипта 2; мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с 1-фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфатфосфодиэстераза бета 2 (фосфоинозитидфосфолипаза C) (PLC-бета-2) (фосфолипаза C-бета-2) (LOC487491); мРНК
100
XM 544615
PLCB2
фосфолипаза C, бета 2
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 21502.1.S1 s at
3,06E-02
4,46E-01
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфолипазой С дельта 3 (LOC490929); мРНК
100
XM 548052
PLCD3
фосфолипаза C, дельта 3
CfaAffx. 3053.1.S1 s at
6,85E-02
4,53E-01
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 плектина 1; вариант транскрипта 1 (LOC482083); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с представителем 3 семейства A белков, содержащих домен гомологии с плекстрином (фосфоинозитол-4-фосфат-адаторный белок-1) (FAPP-1) (LOC488425); мРНК
98,8
XM 545547
PLEKHA3
представитель 3 семейства A, содержащего домен гомологии с плекстрином (специфический связывающие фосфоинозитид)
Cfa. 17302.1.S1 s at
2,29E-02
4,46E-01
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, содержащим домен гомологии с плекстрином; семейство G; представитель 3 (LOC611460); мРНК
99,3
XM 849129
PLEKHG3
представитель 3 семейства G белков, содержащего домен гомологии с плекстрином (с доменом RhoGef)
CfaAffx. 24620.1.S1 at
1,61E-03
4,46E-01
0,71
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, содержащим домен гомологии с плекстрином; семейство G; представитель 3 (LOC611460); мРНК
100
XM 849129
PLEKHG3
представитель 3 семейства G белков, содержащего домен гомологии с плекстрином (с доменом RhoGef)
CfaAffx. 23389.1.S1 s at
9,28E-02
4,62E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, содержащим домен гомологии с плекстрином; семейство G (с доменом RhoGef), представитель 6 (LOC477717); мРНК
96,4
XM 534913
PLEKHG6
представитель 6 семейства G белков, содержащего домен гомологии с плекстрином (с доменом RhoGef)
CfaAffx. 24843.1.S1 s at
1,63E-02
4,46E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, белок, содержащий домен гомологии с плекстрином; семейство M (с доменом RUN) представитель 2 (PLEKHM2); мРНК
90,1
XM 001488946
PLEKHM2
представитель 2 семейства М, содержащего домен гомологии с плекстрином (с доменом RUN)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 27975.1.S1 at
6,51E-02
4,51E-01
0,66
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с эстеразой, являющейся мишенью при нейропатии (LOC484993); мРНК
белок 3, содержащий домен фосфатазы фосфатидной кислоты типа 2
Cfa. 7732.1.A1 s at
1,31E-02
4,46E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 3, содержащим домен фосфатазы фосфатидной кислоты типа 2 (LOC491289); мРНК
100
XM 548410
PPAPD C3
белок 3, содержащий домен фосфатазы фосфатидной кислоты типа 2
Cfa. 7732.2.A1 s at
1,48E-02
4,46E-01
1,82
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 3, содержащим домен фосфатазы фосфатидной кислоты типа 2 (LOC491289); мРНК
100
XM 548410
PPAPD C3
белок 3, содержащий домен фосфатазы фосфатидной кислоты типа 2
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 9458.1.A1 at
5,12E-02
4,48E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфопантотенатцистеинлигазой (фосфопантотеноилцистеинсинтетаза) (PPC-синтетаза); вариант транскрипта 1 (LOC475309); мРНК
97,8
XM 532539
PPCS
фосфопантотеноилцистеинсинтетаза
Cfa. 20080.1.S1 at
7,01E-03
4,46E-01
1,47
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2 перифилина 1; вариант транскрипта 5 (LOC477639); мРНК
98
XM 859391
PPHLN1
перифилин 1
Cfa. 760.1.A1 at
3,98E-03
4,46E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с пептидилпролилизомеразой D; вариант транскрипта 2 (LOC475481); мРНК
97,1
XM 862819
PPID
пептидилпролилизомераза D (циклофилинD)
CfaAffx. 13745.1.S1 s at
4,18E-03
4,46E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с пептидилпролилизомеразой D; вариант транскрипта 1 (LOC475481); мРНК
100
XM 532704
PPID
пептидилпролилизомераза D (циклофилинD)
Cfa. 9641.1.A1 at
2,44E-02
4,46E-01
1,8
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, подобным пептидилпролил-цис-транс-изомеразе (PPIase) (ротамаза); вариант транскрипта 2 (LOC474891); мРНК
93
XM 859501
PPIL1
пептидилпролилизомераза (циклофилин)-подобный 1
Cfa. 12015.1.S1 at
9,52E-02
4,63E-01
1,55
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, подобным пептидилпролил-цис-транс-изомеразе (PPIase) (ротамаза); вариант транскрипта 1 (LOC474891); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 4677.1.S1 s at
8,45E-02
4,56E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2 протеинфосфатазы 1B; вариант транскрипта 9 (LOC474573); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 10581.1.S1 s at
8,78E-02
4,59E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, содержащим домен пептидилпролилизомеразы и повтор WD; вариант транскрипта 1 (LOC478078); мРНК
99,8
XM 535256
PPWD1
с белком 1, содержащим домен пептидилпролилизомеразы и повтор WD
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с протеинкиназой C; тип тета (nPKC-тета); вариант транскрипта 2 (LOC478013); мРНК
96,5
XM 844199
PRKCQ
Протеинкиназа C, тета
Cfa. 10787.1.A1 at
4,60E-02
4,47E-01
1,41
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с протеинкиназой C; тип тета (nPKC-тета); вариант транскрипта 2 (LOC478013); мРНК
99,2
XM 844199
PRKCQ
Протеинкиназа C, тета
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 8704.1.S1 s at
4,62E-02
4,47E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с протеинкиназой C; тип тета (nPKC-тета); вариант транскрипта 1 (LOC478013); мРНК
100
XM 535196
PRKCQ
Протеинкиназа C, тета
Cfa. 1274.1.A1 at
4,09E-02
4,46E-01
1,48
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с протеинкиназой; индуцируемый интерфероном зависимый от двунитевой РНК активатор (LOC488423); мРНК
98,5
XM 545545
PRKRA
протеинкиназа, индуцируемый интерфероном, зависимый от двунитевой РНК активатор
Cfa. 1336.1.S1 at
2,54E-02
4,46E-01
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2, подобным метилтрансферазе гетерогенных ядерных рибонуклеопротеидов; вариант транскрипта 13 (LOC476411); мРНК
97,9
XM 859079
PRMT1
протеинаргининметилтрансфераза 1
Cfa. 19854.1.S1 at
3,73E-02
4,46E-01
1,63
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 3, подобным метилтрансферазе гяРНП HMT1; вариант транскрипта 1 (LOC476887); мРНК
32,3
XM 534089
PRMT3
протеинаргининметилтрансфераза 3
CfaAffx. 15427.1.S1 s at
1,2SE-02
4,46E-01
1,93
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 3, подобным метилтрансферазе гяРНП HMT1; вариант транскрипта 1 (LOC476887); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с сериновой/треониновой протеинкиназой PRP4K; вариант транскрипта 13 (LOC488199); мРНК
100
XM 851724
PRPF4B
гомолог B фактора 4 процессинга пре-мРНК PRP4 (дрожжи)
CfaAffx. 27543.1.S1 at
3,90E-02
4,46E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с рибозофосфатпирофосфокиназой I (фосфорибозилпирофосфатсинтетаза I) (PRS-I); вариант транскрипта 2 (LOC481011); мРНК
100
XM 845760
PRPS1
фосфорибозилпирофосфатсинтетаза 1
Cfa. 21205.1.S1 s at
4,83E-02
4,48E-01
1,3
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с рибозофосфатпирофосфокиназой II (фосфорибозилпирофосфатсинтетаза II) (PRS-II); вариант транскрипта 1 (LOC476855); мРНК
100
XM 534058
PRPS2
фосфорибозилпирофосфатсинтетаза 2
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 3815.1.S1 at
4,14E-02
4,46E-01
1,37
Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp564L1962 (из клона DKFZp564U962)
98,2
AL136650
RAB 10
RAB10, представитель семейства онкогенов RAS
CfaAffx. 14113.1.S1 at
7,95E-02
4,55E-01
0,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 RAB11, семейство взаимодействующих белков 5 (класс I) (LOC483115); мРНК
100
XM 540231
RAB 11FIP5
RAB 11, семейство взаимодействующих белков 5 (класс I)
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, сходный с ГТФ-связывающим белком; вариант транскрипта 2 (LOC464197); мРНК
85,9
XM 001158192
RAB2A
RAB2A, представитель семейства онкогенов RAS
CfaAffx. 9403.1.S1 s at
2,46E-02
4,46E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком RAB2B; вариант транскрипта 1 (LOC475402); мРНК
100
XM 532625
RAB2B
RAB2B, представитель семейства онкогенов RAS
Cfa. 3637.1.S1 s at
5,49E-02
4,50E-01
2,25
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, RA88A; представитель семейства онкогенов RAS (RAB8A); мРНК
100
XM 850476
RAB8A
RAB8A, представитель семейства онкогенов RAS
CfaAffx. 22251.1.S1 s at
6,76E-02
4,52E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, подобным белку 1, активирующему ГТФ-азу RAB; вариант транскрипта 7 (LOC480064); мРНК
100
XM 856228
RABGAP1
активирующий RAB-ГТФазу
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с стимулятором диссоциации гуаниновых нуклеотидов Ral (RalGEF) (RalGDS); вариант транскрипта 1 (LOC480686); мРНК
98,8
XM 537806
RALGDS
стимулятор диссоциации гуаниновых нуклеотидов
Cfa. 20389.1.S1 at
6,13E-02
4,50E-01
1,47
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, гипотетический белок LOC457549; вариант транскрипта 5 (LOC457549); мРНК
36,5
XM 001155200
RALGPS2
Ral GEF с доменом PH и SH3-связывающим мотивом 2
CfaAffx. 15465.1.S1 at
2,23E-03
4,46E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с RAN-связывающим белком 9 (LOC478728); мРНК
100
XM 535893
RANBP9
RAN-связывающий белок 9
CfaAffx. 21140.1.S1 at
5,29E-02
4,49E-01
1,3
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с Ras-родственным белком Rap-1A (Ras-родственный белок Krev-1); вариант транскрипта 3 (LOC483225); мРНК
97,9
XM 857999
RAP1A
RAP1A, представитель семейства онкогенов RAS
Cfa. 20872.1.S1 s at
1,75E-02
4,46E-01
1,3
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с Ras-родственным белком Rap-1A (Ras-родственный белок Krev-1); вариант транскрипта 2 (LOC483225); мРНК
98,1
XM 857973
RAP1A
RAP1A, представитель семейства онкогенов RAS
Cfa. 21068.1.S1 s at
6,19E-02
4,50E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с RAS-родственным белком 1b (LOC608981); мРНК
97,4
XM 846157
RAP1B
RAP1B, представитель семейства онкогенов RAS
Cfa. 1011.1.S1 at
1,68E-03
4,46E-01
1,85
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с RAS-родственным белком 1b (LOC608981); мРНК
98,7
XM 846157
RAP1B
RAP1B, представитель семейства онкогенов RAS
Cfa. 1011.1.S1 s at
2,64E-03
4,46E-01
1,48
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с RAS-родственным белком 1b (LOC608981); мРНК
99,8
XM 846157
RAP1B
RAP1B, представитель семейства онкогенов RAS
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 2471.1.A1 s at
8,82E-02
4,59E-01
1,41
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактором 2 обмена гуаниновых нуклеотидов Rap 2 (фактор 1 обмена гуаниновых нуклеотидов, содержащий домен PDZ) (PDZ GEF1) (RA-GEF); вариант транскрипта 1 (LOC482670); мРНК
100
XM 539787
RAPGEF2
фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) Rap 2
Cfa. 21620.1.S1 at
7,82E-03
4,46E-01
1,54
Homo sapiens, фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rap (GEF) 5; мРНК (клон кДНК MGC26203 IMAGE:4811483); полная кодирующая последовательность
76,5
BC 039203
RAPGEF5
фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) Rap 5
CfaAffx. 6591.1.S1 s at
1,59E-02
4,46E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с аргинил-тРНК-синтетаза; вариант транскрипта 4 (LOC609803); мРНК
97,7
XM 861845
RARS
аргинил-тРНК-синтетаза
Cfa. 18029.1.S1 s at
1,78E-02
4,46E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с аргинил-тРНК-синтетаза; вариант транскрипта 1 (LOC609803); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с RAS-подобным; белок семейства 12 (LOC487600); мРНК
99,8
XM 544725
RASL12
RAS-подобный, семейство 12
Cfa. 851.1.S1 at
2,84E-02
4,46E-01
1,3
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с Rb1-индуцируемым двуспиральным белком 1; вариант транскрипта 3 (LOC477876); мРНК
98,2
XM 851678
RB1CC1
RB1-индуцируемый двуспиральный 1
CfaAffx. 26877.1.S1 s at
4,14E-02
4,46E-01
1,49
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 3 связывающего белка 6 ретинобластомы; вариант транскрипта 1 (LOC479802); мРНК
100
XM 536929
RBBP6
связывающий белок 6 ретинобластомы
Cfa. 19902.1.S1 s at
1,20E-02
4,46E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный со связывающим белком 7 ретиобластомы; вариант транскрипта 9 (LOC480854); мРНК
100
XM 853007
RBBP7
связывающий белок 7 ретинобластомы
Cfa. 12061.1.A1 s at
2,31E-02
4,46E-01
1,64
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2, подобным белку ретинобластомы (ассоциированный с ретинобластомой белок 130 кД) (PRB2) (P130) (RBR-2); вариант транскрипта 1 (LOC478127); мРНК
100
XM 535303
RBL2
белок 2, подобный белку ретинобластомы (p130)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Bos taurus, белок 25 c РНК-связывающим мотивом; вариант транскрипта 5 (RBM25); мРНК
40,7
XM 879644
RBM25
белок 25 c РНК-связывающим мотивом
CfaAffx. 8829.1.S1 s at
1,15E-02
4,46E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с антигеном se70-2 опухоли кожной T-клеточной лимфомы; вариант транскрипта 5 (LOC476955); мРНК
100
XM 853024
RBM26
белок 26 c РНК-связывающим мотивом
Cfa. 15731.3.S1 s at
9,18E-02
4,61E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2, содержащим РНК-связывающую область (белок 1 гепатоклеточной карциномы) (фактор сплайсинга HCC1); вариант транскрипта 22 (LOC477216); мРНК
46,4
XM 860230
RBM39
белок 39 c РНК-связывающим мотивом
Cfa. 2357.1.S1 at
2,56E-02
4,46E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с РНК-связывающим белком 7 (белок 7 c РНК-связывающим мотивом) (LOC611169); мРНК
96,1
XM 848812
RBM7
белок 7 c РНК-связывающим мотивом
CfaAffx. 20892.1.S1 s at
5,83E-02
4,50E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с РНК-связывающим белком 7 (белок 7 с РНК-связывающим мотивом) (LOC611169); мРНК
99,2
XM 848812
RBM7
белок 7 c РНК-связывающим мотивом
Cfa. 1583.1.S1 at
2,29E-03
4,46E-01
1,47
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеидом G (гяРНП G) (белок, содержащий РНК-связывающий мотив; X-хромосома) (гликопротеид p43); вариант транскрипта 5 (LOC481063); мРНК
99,2
XM 861331
RBMX
белок с РНК-связывающим мотивом, X-сцепленный
Cfa. 17021.1.S1 at
8,84E-02
4,59E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 3 белка 1, содержащего кольцевой палец и домен цинкового пальца CHY; вариант транскрипта 3 (LOC612746); мРНК
98,2
XM 850688
RCHY1
белок 1, содержащий кольцевой палец и домен цинкового пальца CHY
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 21641.1.S1 at
1,66E-03
4,46E-01
1,73
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris сходный с ретикулокалбином 2 (LOC487666); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком репарации ДНК REV1 (Rev1-подобная концевая дезоксицитидилтрансфераза) (белок 80, связывающий интегрин альфа)(AIBP80) (LOC481337); мРНК
81,7
XM 538458
REV1
гомолог REV1 (S. cerevisiae)
Cfa. 19342.2.A1 s at
8,18E-02
4,55E-01
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с большой субъединицей фактора репликации С (LOC479112); мРНК
95,9
XM 536259
RFC1
фактор репликации С (активатор 1) 1, 145 кД
CfaAffx. 24662.1.S1 s at
6,51E-02
4,51E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с большой субъединицей фактора репликации С (LOC479112); мРНК
100
XM 536259
RFC1
фактор репликации С (активатор 1) 1, 145 кД
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Canis familiaris, гликопротеид Rh типа С (RhCG) мРНК; полная кодирующая последовательность
99,8
AY831678
RHCG
Rh-семейство, гликопротеид С
Cfa. 4395. 1.A1 s at
3,06E-02
4,46E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ГТФ-связывающим белком Rheb (гомолог Ras, с повышенным содержанием в головном мозге) (LOC475545); мРНК
99,7
XM 532768
RHEB
гомолог Ras с повышенным содержанием в головном мозге
CfaAffx. 14792.1.S1 at
9,76E-02
4,64E-01
0,77
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством генов гомологов ras; представитель V (LOC487502); мРНК
100
XM 544626
RHOV
семейство генов гомологов ras, представитель V
Cfa. 2520.1.A1 at
1,71E-02
4,46E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, гомолог B резистентности к ингибиторам холинэстеразы 8 (С. elegans) (RIC8B); мРНК
37,9
XM 001499080
RIC8B
гомолог B резистентности к ингибиторам холинэстеразы 8 (С. eleqans)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 17049.1.S1 s at
3,09E-03
4,46E-01
1,5
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с RIO-киназой 2; вариант транскрипта 1 (LOC479147); мРНК
95,4
XM 536291
RIOK2
RIO-киназа 2 (дрожжи)
Cfa. 17049.1.S1 at
9,54E-03
4,46E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с RIO-киназой 2; вариант транскрипта 1 (LOC479147); мРНК
100
XM 536291
RIOK2
RIO-киназа 2 (дрожжи)
CfaAffx. 2964.1.S1 at
7,77E-02
4,55E-01
1,43
Homo sapiens, RMI1; RecQ-опосредованная нестабильность генома 1; гомолог (S. cerevisiae) (RMI1); мРНК
92,8
NM 024945
RMI1
RMI1; RecQ-опосредованная нестабильность генома 1; гомолог (S. cerevisiae)
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с РНК U; адаптер экспорта малой ядерной РНК (регулируемый фосфорилированием) (LOC479305); мРНК
98,9
XM 846266
RNUXA
РНК U; адаптер экспорта малой ядерной РНК (регулируемый фосфорилированием)
CfaAffx. 1810.1.S1 s at
2,84E-02
4,46E-01
1,65
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с РНК U; адаптер экспорта малой ядерной РНК (регулируемый фосфорилированием) (LOC479305); мРНК
100
XM 846266
RNUXA
РНК U; адаптер экспорта малой ядерной РНК (регулируемый фосфорилированием)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой C ретикулона 4; вариант транскрипта 4 (LOC474598); мРНК
73,4
XM 860155
RTN4
ретикулон 4
CfaAffx. 5075.1.S1 s at
4,71E-02
4,48E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой C ретикулона 4; вариант транскрипта 3 (LOC474598); мРНК
100
XM 847143
RTN4
ретикулон 4
Cfa. 10177.1.S1 s at
5,10E-02
4,48E-01
1,55
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с rap2-взаимодействующим белком x; вариант транскрипта 1 (LOC475168); мРНК
99,3
XM 532400
RUFY3
белок 3, содержащий домен RUN и FYVE
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 6555.1.S1 at
5,22E-02
4,48E-01
1,51
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с геном 4, подобным sex comb на колене (LOC481951); мРНК
100
XM 539072
SCML4
ген 4 подобный sex comb на колене (Drosophila)
Cfa. 21262.1.S1 at
3,54E-03
4,46E-01
1,91
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с коротким двуспиральным белком; вариант транскрипта 1 (LOC606862); мРНК
99,2
XM 843274
SCOC
короткий двуспиральный белок
CfaAffx. 6489.1.S1 s at
1,61E-02
4,46E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с коротким двуспиральным белком; вариант транскрипта 1 (LOC606862); мРНК
100
XM 843274
SCOC
короткий двуспиральный белок
Cfa. 391.1.S1 at
3,04E-02
4,46E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SCY1-подобным белком 2; вариант транскрипта 1 (LOC482622); мРНК
100
XM 539739
SCYL2
SCY1-подобный 2 (S. cerevisiae)
CfaAffx. 11063.1.S1 s at
1,07E-02
4,46E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SCY1-подобным белком 2; вариант транскрипта 1 (LOC482622); мРНК
100
XM 539739
SCYL2
SCY1-подобный 2 (S. cerevisiae)
CfaAffx. 28519.1.S1 at
7,77E-02
4,55E-01
0,74
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с геном гомеобокса OG9 (LOC491164); мРНК
100
XM 548284
SEБОКС
гомеобокс SEBOX
Cfa. 14967.1.S1 at
4,15E-02
4,47E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SEC13-подобным 1; вариант транскрипта 1 (LOC607653); мРНК
100
XM 845344
SEC13
гомолог SEC13 (S. cerevisiae)
Cfa. 319.1.A1 at
7,82E-02
4,55E-01
1,38
Pongo abelii, мРНК; кДНК DKFZP469D0613 (из клона DKFZp469D0613)
37,1
CR 859634
SEC 23IP
SEC23-взаимодействующий белок
Cfa. 18120.1.S1 s at
4,00E-02
4,46E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, подобным нуклеопорину SEH1 (SEC13-подобный белок); вариант транскрипта 1 (LOC490564); мРНК
100
XM 547686
SEH1L
SEH1-подобный (S. cerevisiae)
Cfa. 16984.1.S1 s at
3,70E-02
4,46E-01
1,53
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SUMO1/сентрин-специфической протеазой 6 (LOC481883); мРНК
94,7
XM 539004
SENP6
SUMO1/сентрин-специфическая пептидаза 6
CfaAffx. 4947.1.S1 at
8,51E-02
4,57E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SUMO1/сентрин-специфической протеазой 6 (LOC481883); мРНК
100
XM 539004
SENP6
SUMO1/сентрин-специфическая пептидаза 6
Cfa. 408.1.A1 at
6,24E-02
4,50E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris сходный, с селенофосфатсинтетазой; вариант транскрипта 5 (LOC477999); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 109.1.S1 at
2,80E-02
4,46E-01
0,66
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, ингибитор активатора плазминогена типа 1; вариант транскрипта 2 (PAI-1); мРНК
56,5
XM 853392
SER PINE1
ингибитор серпинпептидазы, клад E (нексин, ингибитор активатора плазминогена типа 1), представитель 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 2367.1.A1 at
2,55E-02
4,46E-01
1,43
Homo sapiens, фактор сплайсинга; аргинин/серин-богатый 2; взаимодействующий белок (SFRS2IP); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, содержащим домен SH3 и повторы тетратрикопептида (LOC488788); мРНК
99,6
XM 545906
SH3TC1
белок 1, содержащий домен SH3 и повторы тетратрикопептида
Cfa. 20886.2.S1 s at
3,65E-02
4,46E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с трансмембранным семейством SID1; представитель 2 (LOC489391); мРНК
99,2
XM 546509
SIDT2
трансмембранное семейство SID1, представитель 2
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с тирозиновой протеинфосфатазой; предшественник субстрата 1 не-рецепторного типа (LOC609452); мРНК
97,5
XM 846710
SIRPA
регуляторный сигнальный белок альфа
CfaAffx. 20596.1.S1 at
3,67E-02
4,46E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с NAD-зависимой деацетилазой сиртуином-1 (hSIRT1) (hSIR2) (SIR2-подобный белок 1); вариант транскрипта 3 (LOC489012); мРНК
100
XM 854638
SIRT1
сиртуин (гомолог белка 2 регуляции молчащей информации типа спаривания) 1 (S. cerevisiae)
CfaAffx. 16036.1.S1 s at
2,82E-02
4,46E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с NAD-зависимой деацетилазой сиртуином-4 (SIR2-подобный белок 4); вариант транскрипта 3 (LOC477507); мРНК
100
XM 858071
SIRT4
сиртуин (гомолог белка 2 регуляции молчащей информации типа спаривания) 4 (S. cerevisiae)
Cfa. 15659.1.A1 at
1,11E-02
4,46E-01
1,53
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фосфопротеидом 1, ассоциированным с семейством src (LOC480543); мРНК
100
XM 537665
SKAP1
ассоциированный с киназой src фосфопротеид 1
Cfa. 2346.1.A1 s at
6,12E-02
4,50E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2, подобным суперкиллерной вирулицидной активности 2; вариант транскрипта 1 (LOC607950); мРНК
99,3
XM 844583
SKIV2L2
белок 2, подобный суперкиллерной вирулицидной активности 2 (S. cerevisiae)
CfaAffx. 19553.1.S1 at
2,70E-02
4,46E-01
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с представителем 7 семейства SLAM (LOC609992); мРНК
62,8
XM 847365
SLAMF7
представитель 7 семейства SLAM
Cfa. 15304.1.A1 at
5,43E-03
4,46E-01
1,49
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, связывающим структуру стебель-петля; вариант транскрипта 4 (LOC488810); мРНК
97,6
XM 545928
SLBP
белок, связывающий структуру стебель-петля
Cfa. 12597.1.A1 s at
4,36E-03
4,46E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, связывающим структуру стебель-петля; вариант транскрипта 4 (LOC488810); мРНК
100
XM 545928
SLBP
белок, связывающий структуру стебель-петля
CfaAffx. 23101.1.S1 s at
5,34E-02
4,50E-01
1,3
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, связывающим структуру стебель-петля; вариант транскрипта 5 (LOC488810); мРНК
100
XM 857160
SLBP
белок, связывающий структуру стебель-петля
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
семейство растворимых переносчиков 22, представитель 18
CfaAffx. 19921.1.S1 s at
3,71E-02
4,46E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 25 (митохондриальный носитель; Aralar); представитель 12; вариант транскрипта 1 (LOC478798); мРНК
100
XM 535962
SLC 5A12
семейство растворимых переносчиков 25 (митохондриальный носитель, Aralar), представитель 12
Cfa. 19529.1.S1 s at
9,90E-02
4,65E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком пероксисомным интегральным мембранным белком 47; вариант транскрипта 1 (LOC474498); мРНК
99,5
XM 531726
SLC 5A17
семейство растворимых переносчиков 25 (митохондриальный носитель; пероксисомный мембранный белок, 34 кД), представитель 17
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 2593.1.S1 at
4,32E-02
4,47E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с пероксисомным интегральным мембранным белком 47; вариант транскрипта 3 (LOC474498); мРНК
100
XM 853946
SLC25A17
семейство растворимых переносчиков 25 (митохондриальный носитель; пероксисомный мембранный белок, 34 кД), представитель 17
CfaAffx. 30511.1.S1 s at
1,94E-02
4,46E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2 представителя 24 семейства растворимых переносчиков 25 (LOC611922); мРНК
100
XM 849645
SLC25A24
семейство растворимых переносчиков 25 (митохондриальный переносчик; переносчик фосфата), представитель 24
CfaAffx. 12315.1.S1 at
8,40E-02
4,56E-01
1,57
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 25; представитель 36 (LOC477095); мРНК
100
XM 534289
SLC 25A36
семейство растворимых переносчиков 25, представитель 36
CfaAffx. 11964.1.S1 s at
6,97E-02
4,53E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG8931-PA (LOC488876); мРНК
100
XM 545993
SLC 25A46
семейство растворимых переносчиков 25, представитель 46
Cfa. 6145.1.A1 at
2,11E-02
4,46E-01
1,36
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 26; представитель 11 (LOC483354); мРНК
98,2
XM 540473
SLC 26A11
семейство растворимых переносчиков 26, представитель 11
Cfa. 6595.1.A1 at
8,12E-02
4,55E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 26; изоформа a представителя 8 (LOC474888); мРНК
99,2
XM 532122
SLC 26A8
семейство растворимых переносчиков 26, представитель 8
Cfa. 21099.1.S1 s at
3,14E-02
4,46E-01
0,69
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 27 (переносчик жирных кислотr); представитель 1; вариант транскрипта 1 (LOC484835); мРНК
97,6
XM 541951
SLC 27A1
семейство растворимых переносчиков 27 (переносчик жирных кислот), представитель 1
CfaAffx. 12368.1.S1 s at
1,41E-02
4,46E-01
1,51
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 переносчика цинка ZTL1; вариант транскрипта 2 (LOC487237); мРНК
100
XM 845257
SLC 30A5
семейство растворимых переносчиков 30 (переносчик цинка), представитель 5
семейство растворимых переносчиков 35 (переносчик УДФ-галактозы), редставитель A2
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
семейство растворимых переносчиков 4, анионообменник, представитель 2 (белок 1, подобный полосе белка мембраны эритроцитов)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 9384.1.S1 s at
3,94E-02
4,46E-01
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 4; копереносчик бикарбоната натрия; представитель 7 (LOC485637); мРНК
100
XM 542756
SLC 4A7
семейство растворимых переносчиков 4, копереносчик бикарбоната натрия, представитель 7
Cfa. 3073.1.A1 at
2,07E-02
4,46E-01
1,45
Bos taurus, семейство растворимых переносчиков 7 (переносчик катионных аминокислот; система y+); представитель 6 (SLC7A6); мРНК
81,6
NM 001075937
SLC 7A6
семейство растворимых переносчиков 7 (переносчик катионных аминокислот; система y+), представитель 6
CfaAffx. 31112.1.S1 at
4,76E-02
4,48E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков 7 (переносчик катионных аминокислот; система y+); представитель 6; вариант транскрипта 5 (LOC489744); мРНК
100
XM 858703
SLC 7A6
семейство растворимых переносчиков 7 (переносчик катионных аминокислот; система y+), представитель 6
CfaAffx. 18957.1.S1 at
6,23E-02
4,50E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, семейство растворимых переносчиков 9 (осуществляющий обмен натрий/водород); изоформа 1 (антипортер; Na+/H+; чувствительный к амилориду) (SLC9A1); мРНК
99,8
XM 535345
SLC 9A1
семейство растворимых переносчиков 9 (осуществляющий обмен натрий/водород), представитель 1 (антипортер, Na+/H+, чувствительный к амилориду)
CfaAffx. 9091.1.S1 s at
3,16E-02
4,46E-01
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством растворимых переносчиков органических анионов; представитель 2B1 (LOC485192); мРНК
100
XM 542310
SLC 02B1
семейство растворимых переносчиков органических анионов, представитель 2B1
Cfa. 7767.1.S1 at
4,13E-02
4,46E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком C20orf45; вариант транскрипта 1 (LOC477277); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a модулятора индуцируемой эстрогенами транскрипции; вариант транскрипта 9 (LOC478322); мРНК
100
XM 859116
SLTM
SAFB-подобный модулятор транскрипции
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 12364.1.S1 s at
3,15E-02
4,46E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом 1 «Mothers against decapentaplegic» (SMAD 1) (гомолог 1 «Mothers against DPP») (Mad-родственный белок 1) (белок-1 передачи сигнала трансформирующего фактора роста-бета) (BSP-1) (hSMADl) (JV4-1); вариант транскрипта 14 (LOC475456); мРНК
100
XM 862253
SMAD1
семейство SMAD, представитель 1
CfaAffx. 1218.1.S1 s at
7,86E-03
4,46E-01
1,56
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, белок 4, подобный «mothers against decapentaplegic»; вариант транскрипта 1 (MADH4); мРНК
97
XM 533400
SMAD4
семейство SMAD, представитель 4
Cfa. 936.1.S1 at
2,27E-02
4,46E-01
1,5
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, SW1/SNF-родственный ассоциированный с матриксом зависимый от актина регулятор хроматина a5; вариант транскрипта 5 (SMARCA5); мРНК
35,2
XM 517459
SMARCA5
SWI/SNF-родственный, ассоциированный с матриксом, зависимый от актина регулятор хроматина, подсемейство a, представитель 5
CfaAffx. 12160.1.S1 s at
3,57E-02
4,46E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris сходный с представителем 5 подсемейства A SWI/SNF-родственного ассоциированного с матриксом, зависимого от актина регулятора хроматина (SWI/SNF-родственный ассоциированный с матриксом, зависимый от актина регулятор хроматина A5) (гомолог неферментирующего сахарозу белка 2) (hSNF2H)...; вариант транскрипта 1 (LOC475451); мРНК
45,9
XM 532676
SMARCA5
SWI/SNF-родственный, ассоциированный с матриксом, зависимый от актина регулятор хроматина, подсемейство a, представитель 5
Cfa. 9945.1.A1 at
1,56E-02
4,46E-01
1,6
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SWI/SNF-родственным, ассоциированным с матриксом зависимым от актина регулятором хроматина; подсемейство a; содержащий DEAD/H-бокс 1; вариант транскрипта 1 (LOC478480); мРНК
98,8
XM 535658
SMARCAD1
SWI/SNF-родственный, ассоциированный с матриксом, зависимый от актина регулятор хроматина, подсемейство a, содержащий DEAD/H-бокс 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 8883.1.A1 at
1,80E-02
4,46E-01
1,63
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SWI/SNF-родственным, ассоциированным с матриксом зависимым от актина регулятором хроматина; подсемейство e; представитель 1; вариант транскрипта 8 (LOC608250); мРНК
97,6
XM 857912
SMARCE1
SWI/SNF-родственный, ассоциированный с матриксом, зависимый от актина регулятор хроматина, подсемейство e, представитель 1
Cfa. 5396.1.A1 s at
5,87E-02
4,50E-01
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SWI/SNF-родственным, ассоциированным с матриксом зависимым от актина регулятором хроматина; подсемейство e; представитель 1; вариант транскрипта 1 (LOC608250); мРНК
98,4
XM 537645
SMARCE1
SWI/SNF-родственный, ассоциированный с матриксом, зависимый от актина регулятор хроматина, подсемейство e, представитель 1
CfaAffx. 16837.1.S1 at
2,73E-02
4,46E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 3, поддерживающим структуру хромосомы 3 (хондроитинсульфатпротеогликан 6) (ассоциированный с хромосомой полипептид) (hCAP) (Bamacan) (ассоциированный с базальной мембраной хондроитинпротеогликан); вариант транскрипта 2 (LOC486886); мРНК
99,6
XM 846725
SMC3
структурное поддержание хромосом, 3
CfaAffx. 22089.1.S1 s at
8,33E-02
4,56E-01
1,47
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, подобным белку 4, поддерживающим структуру хромосом (ассоциированный с хромосомой полипептид C) (hCAP-C) (гомолог XCAP-C); вариант транскрипта 2 (LOC478679); мРНК
100
XM 856436
SMC4
структурное поддержание хромосом, 4
Cfa. 16405.2.S1 s at
1,87E-02
4,46E-01
1,61
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком SMC5; вариант транскрипта 1 (LOC476327); мРНК
100
XM 533529
SMC5
структурное поддержание хромосом, 5
Cfa. 19957.1.S1 s at
8,03E-02
4,55E-01
1,6
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком SMC6 (LOC475675); мРНК
98,1
XM 532882
SMC6
структурное поддержание хромосом, 6
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 29166.1.S1 x at
7,60E-02
4,54E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком B, ассоциированным с малым ядерным рибонуклеопротеидом (мяРНП-B) (Sm-белок B) (Sm-B) (SmB) (SM11); вариант транскрипта 4 (LOC485806); мРНК
77,3
XM 856578
SNRPB
полипептиды B и B1 малых ядерных рибонуклеопротеидов
Cfa. 4340.1.S1 at
2,06E-02
4,46E-01
1,54
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком рамки считывания, расположенной выше SNRPN; вариант транскрипта 3 (LOC606883); мРНК
47,4
XM 843416
SNURF
рамка считывания, расположенная выше SNRPN
CfaAffx. 4575.1.S1 at
5,70E-02
4,50E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с сортирующим нексином-13 (белок, содержащий домен RGS и домен РНОХ) (RGS-PX1) (LOC475252); мРНК
100
XM 532486
SNX13
сортирующий нексин 13
Cfa. 2011.1.S1 at
3,25E-02
4,46E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a сортирующего нексина 14 (LOC474985); мРНК
82,7
XM 532222
SNX14
сортирующий нексин 14
Cfa. 2011.1.S1 s at
4,01E-02
4,46E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a сортирующего нексина 14 (LOC474985); мРНК
98,8
XM 532222
SNX14
сортирующий нексин 14
CfaAffx. 15316.1.S1 at
6,39E-02
4,50E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a сортирующего нексина 21 (LOC485900); мРНК
100
XM 543024
SNX21
семейство сортирующих нексинов, представитель 21
CfaAffx. 19614.1.S1 at
1,07E-02
4,46E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с сортирующим нексином-4 (LOC478595); мРНК
100
XM 535771
SNX4
сортирующий нексин 4
Cfa. 8877.1.A1 at
1,62E-02
4,46E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с сортирующим нексином-5 (LOC485754); мРНК
55,2
XM 542877
SNX5
сортирующий нексин 5
CfaAffx. 9150.1.S1 s at
5,02E-02
4,48E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с сортирующим нексином-5 (LOC485754); мРНК
99,8
XM 542877
SNX5
сортирующий нексин 5
CfaAffx. 1703.1.S1 x at
3,72E-03
4,46E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой A SON-ДНК-связывающего белка; вариант транскрипта 14 (LOC478406); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 ассоциированного со сперматозоидами антигена 16 (L0C478899); мРНК
54,4
XM 536057
SPAG16
ассоциированный со сперматозоидами антиген 16
CfaAffx. 26465.1.S1 s at
2,79E-02
4,46E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 ассоциированного со сперматозоидами антигена 9; вариант транскрипта 5 (LOC480557); мРНК
100
XM 860904
SPAG9
ассоциированный со сперматозоидами антиген 9
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 26551.1.S1 s at
1,98E-02
4,46E-01
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ассоциированным со сперматогенезом белком 7; вариант транскрипта 2 (LOC480411); мРНК
98,6
XM 863275
SPATA7
ассоциированный со сперматогенезом белок 7
Cfa. 19894.1.S1 s at
1,78E-02
4,46E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ассоциированным со сперматогенезом белком 7; вариант транскрипта 1 (LOC480411); мРНК
99,1
XM 537532
SPATA7
ассоциированный со сперматогенезом белок 7
Cfa. 10778.1.A1 at
3,85E-03
4,46E-01
1,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ассоциированным со сперматогенезом белком 7; вариант транскрипта 1 (LOC480411); мРНК
100
XM 537532
SPATA7
ассоциированный со сперматогенезом белок 7
CfaAffx. 761.1.S1 at
1,33E-02
4,46E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный со специфической для поперчено-полосатых мышц сериновой/треониновой протеинкиназой (GMPPA); мРНК
99,8
XM 536083
SPEG
локус комплекса SPEG
Cfa. 15603.1.S1 at
1,65E-02
4,46E-01
1,55
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с кислым кластерным белком 33; вариант транскрипта 1 (LOC487599); мРНК
белок 2, содержащий домен рецептора splA/рианодина и SOCS-бокс
CfaAffx. 24765.1.S1 s at
6,72E-03
4,46E-01
0,71
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a спектрина бета; вариант транскрипта 3 (LOC490734); мРНК
99,8
XM 847737
SPTB
спектрин бета, эритроцитарный
Cfa. 9175.1.S1 s at
8,61E-02
4,58E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с скваленмонооксигеназой; вариант транскрипта 2 (LOC608021); мРНК
98,7
XM 856851
SQLE
скваленэпоксидаза
Cfa. 9175.1.S1 at
7,41E-02
4,54E-01
1,55
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с скваленмонокосигеназой; вариант транскрипта 2 (LOC608021); мРНК
99,7
XM 856851
SQLE
скваленэпоксидаза
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 2791.1.A1 at
8,81E-02
4,59E-01
1,35
Homo sapiens, U2-ассоциированный белок SR140 (SR140); мРНК
86,5
NM 001080415
SR140
U2-ассоциированный белок SR140
CfaAffx. 13882.1.S1 at
9,07E-02
4,60E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, онкоген src; вариант транскрипта 1 (src); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SYT; вариант транскрипта 1 (SS18); мРНК
100
XM 537295
SS18
транслокация при синовиальной саркоме, хромосома 18
CfaAffx. 27783.1.S1 at
5,82E-02
4,50E-01
1,57
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с SYT; вариант транскрипта 1 (SS18); мРНК
100
XM 537295
SS18
транслокация при синовиальной саркоме, хромосома 18
Cfa. 19683-1.S1 at
4,45E-02
4,47E-01
1,47
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, антиген B синдрома Шегрена (аутоантиген La); вариант транскрипта 1 (SSB); мРНК
42,9
XM 001497893
SSB
антиген B синдрома Шегрена (аутоантиген La)
CfaAffx. 19266.1.S1 at
9,25E-03
4,46E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с autoантигеном La (LOC478787); мРНК
98,7
XM 535952
SSB
антиген B синдрома Шегрена (аутоантиген La)
Cfa. 1636.1.A1 s at
6,52E-02
4,51E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2, связывающим однонитевую ДНК (специфический для последовательности белок 2, связывающий однонитевую ДНК); вариант транскрипта 1 (LOC479160); мРНК
51,9
XM 536304
SSBP2
белок 2, связывающий однонитевую ДНК
Cfa. 1637.1.S1 s at
3,59E-02
4,46E-01
1,68
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2, связывающим однонитевую ДНК (специфический для последовательности белок 2, связывающий однонитевую ДНК); вариант транскрипта 1 (LOC479160); мРНК
100
XM 536304
SSBP2
белок 2, связывающий однонитевую ДНК
CfaAffx. 21963.1.S1 at
6,38E-02
4,50E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный со специфическим для сперматозоидов антигеном 2 (LOC478824); мРНК
100
XM 535986
SSFA2
специфический для сперматозоидов антиген 2
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 18120.1.S1 at
3,07E-03
4,46E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом slingshot 3 (Drosophila) (предполагаемый); вариант транскрипта 1 (LOC483699); мРНК
99,6
XM 540820
SSH3
гомолог slingshot 3 (Drosophila)
Cfa. 20386.1.S1 at
8,21E-02
4,56E-01
1,8
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком синовиальной саркомы; белок, взаимодействующий с точкой разрыва X 2; вариант транскрипта 7 (LOC479970); мРНК
100
XM 862329
SSX2IP
синовиальная саркома, белок, взаимодействующий с точкой разрыва X 2
Cfa. 10782.1.A1 at
2,73E-02
4,46E-01
1,43
Homo sapiens, мРНК ассоциированного со старением белка 14a; полная кодирующая последовательность
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, гипотетический LOC474070 (STCH); мРНК
35,5
XM 531517
STCH
белок-шаперон стресса 70, ассоциированный с микросомами,60 кД
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 22970.1.S1 s at
4,30E-02
4,47E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с сериновой/треониновой киназой 36 (гомолог fused; Drosophila); вариант транскрипта 2 (LOC478913); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с стриатином-4 (зинедин); вариант транскрипта 4 (LOC610799); мРНК
100
XM 860239
STRN4
стреатин, кальмодулин-связывающий белок 4
CfaAffx. 9075.1.S1 at
4,96E-02
4,48E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с источником иммунодоминантных MHC-ассоциированных пептидов; вариант транскрипта 6 (LOC485628); мРНК
100
XM 856694
STT3B
STT3, субъединица олигосахарилтрансферазного комплекса, гомолог В (S. cerevisiae)
CfaAffx. 26073.1.S1 at
7,44E-02
4,54E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с синтаксином-10 (Syn10); вариант транскрипта 3 (LOC476691); мРНК
41,7
XM 862072
STX10
синтаксин 10
Cfa. 18354.1.S1 s at
4,90E-02
4,48E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с синтаксином 12 (LOC478168); мРНК
99,8
XM 535342
STX12
синтаксин 12
CfaAffx. 18679.1.S1 at
7,08E-02
4,54E-01
1,31
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с синтаксином 12 (LOC478168); мРНК
100
XM 535342
STX12
синтаксин 12
Cfa. 21018.1.S1 at
9,62E-03
4,46E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a синтаксина 1; вариант транскрипта 7 (LOC477275); мРНК
67,3
XM 862448
STX16
синтаксин 16
CfaAffx. 24052.1.S1 s at
1,32E-02
4,46E-01
1,5
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с синтаксином-18; вариант транскрипта 1 (LOC609342); мРНК
100
XM 845928
STX18
синтаксин 18
Cfa. 19475.2.S1 s at
4,89E-03
4,46E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2 эпиморфина (LOC477439); мРНК
98
XM 534637
STX2
синтаксин 2
Cfa. 1859.1.S1 at
6,37E-02
4,50E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с синтаксином-7; вариант транскрипта 5 (LOC483987); мРНК
81,3
XM 854089
STX7
синтаксин 7
CfaAffx. 1243.1.S1 at
7,86E-02
4,55E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с синтаксином-7; вариант транскрипта 4 (ШС483987); мРНК
100
XM 854052
STX7
синтаксин 7
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком, объединенным с JAZF1 (L0C491158); мРНК
83,4
XM 548278
SUZ12
супрессор гомолога zeste 12 (Drosophila)
Cfa. 20926.1.S1 at
2,28E-02
4,46E-01
1,6
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Bos taurus, сходный с белком Polycomb SUZ12 (супрессор гомолога белка zeste 12) (объединенный с белком JAZF1) (белок мишени 9 E2F преципитированного хроматина) (белок ChET 9) (SUZ12); мРНК
93,8
XM 582605
SUZ12
супрессор гомолога zeste 12 (Drosophila)
Cfa. 19132.1.S1 s at
1,52E-02
4,46E-01
0,72
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 1 супервиллина; вариант транскрипта 4 (LOC477965); мРНК
98,1
XM 855044
SVIL
супервиллин
CfaAffx. 19552.1.S1 at
3,82E-03
4,46E-01
1,54
Homo sapiens, кДНК FU60548, полная кодирующая последовательность; в высокой степени сходный с ассоциированным с синапсом белком 1
54,3
AK 295322
SYAP1
ассоциированный с синапсом белок 1, гомолог SAP47 (Drosophila)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
TAF9, РНК-полимераза II, TATA-бокс связывающий белок, (TBP)-ассоциированный фактор, 32 кД
Cfa. 21037.1.S1 s at
7,66E-02
4,55E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с TBP-ассоциированным фактором 9L; вариант транскрипта 1 (LOC480965); мРНК
100
XM 538086
TAF9B
TAF9B, РНК-полимераза II, TATA-бокс-связывающий белок, (TBP)-ассоциированный фактор, 31 кД
Cfa. 2947.1.S1 at
3,78E-02
4,46E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой a TRAF-взаимодействующего белка TANK (LOC608092); мРНК
96,9
XM 844996
TANK
активатор NFKB, ассоциированный с представителем семейства TRAF
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 2825.1.A1 at
8,59E-02
4,58E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с треонил-тРНК-синтетазой (LOC479370); мРНК
76,6
XM 536509
TARS
треонил-тРНК синтетаза
CfaAffx. 9349.1.S1 a at
2,64E-02
4,46E-01
1,9
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с треонинаспартазой 1 (таспаза 1); вариант транскрипта 4 (LOC477152); мРНК
100
XM 853264
TASP1
таспаза, треонинаспартаза 1
Cfa. 10871.1.A1 s at
9,77E-02
4,64E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, связывающим Taxi (вирус T-клеточного лейкоза человека типа I); вариант транскрипта 5 (LOC475264); мРНК
99,5
XM 859731
TAX1BP1
белок 1, связывающий Taxi (вирус T-клеточного лейкоза человека типа I)
CfaAffx. 5437.1.S1 s at
8,91E-02
4,59E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, связывающим Taxi (вирус T-клеточного лейкоза человека типа I); вариант транскрипта 8 (LOC475264); мРНК
100
XM 859787
TAX1BP1
белок 1, связывающий Taxi (вирус T-клеточного лейкоза человека типа I)
CfaAffx. 1657.1.S1 a at
6,72E-02
4,51E-01
1,57
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством домена TBC1; представитель 15 (LOC474451); мРНК
100
XM 531681
TBC1D15
семейство доменов TBC1, представитель 15
CfaAffx. 9740.1.S1 s at
8,48E-02
4,57E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с представителем 5 семейства доменов TBC1 (LOC485651); мРНК
99,1
XM 542771
TBC1D5
семейство доменов TBC1, представитель 5
Cfa. 3145.1.A1 at
4,66E-02
4,48E-01
1,56
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Equus caballus, семейство доменов TBC1; представитель 9 (с доменом GRAM) (TBC1D9); мРНК
54,7
XM 001501060
TBC1D9
семейство доменов TBC1, представитель 9 (с доменом GRAM)
CfaAffx. 1484.1.S1 a at
2,63E-02
4,46E-01
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с TANK-связывающей киназой 1; вариант транскрипта 2 (LOC481145); мРНК
100
XM 855742
TBK1
TANK-связывающаякиназа 1
CfaAffx. 25534.1.S1 s at
6,17E-02
4,50E-01
0,76
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Cams familiaris, сходный с белком ProSAPiP2 (LOC491043); мРНК
88,9
XM 548163
TBKBP1
TBK1-связывающий белок 1
Cfa. 9500.1.S1 at
2,13E-02
4,46E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 1, подобным фактору элонгации транскрипции A (SII) (LOC481000); мРНК
95,9
XM 538121
TCEAL1
белок 1, подобный фактору элонгации транскрипции A (SII)
Cfa. 21472.1.S1 s at
5,91E-02
4,50E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с регулятором элонгации транскрипции 1 (фактор 2S, ассоциированный с TATA-бокс-связывающим белком) (фактор транскрипции CA150) (pl44) (формин-связывающий белок 28) (FBP 28); вариант транскрипта 8 (LOC478052); мРНК
70,9
XM 853836
TCERG1
регулятор элонгации транскрипции 1
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с TRK-слитым геном; вариант транскрипта 3 (LOC4879S4); мРНК
95,5
XM 851438
TFG
TRK-слитый ген
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформо1 1 белка 1, содержащего домен тромбоспондина типа I (LOC477293); мРНК
100
XM 534485
THSD1
белок 1, содержащий домен тромбоспондина типа I
Cfa. 15469.1.A1 s at
7,71E-02
4,55E-01
1,61
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с сходный с субъединицей Tim9A транслоказы внутренней митохондриальной мембраны, участвующей в импорте; вариант транскрипта 2 (LOC609619); мРНК
100
XM 859875
TIMM9
гомолог транслоказы внутренней митохондриальной мембраны 9 (дрожжи)
CfaAffx. 23548.1.S1 at
8,22E-04
4,46E-01
1,37
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с TIP41; подобный регулятору пути передачи сигнала TOR (LOC480084); мРНК
100
XM 537207
TIPRL
TIP41; подобный регулятору пути передачи сигнала TOR (S. cerevisiae)
Cfa. 11048.1.A1 at
2,92E-02
4,46E-01
1,71
полноразмерный клон кДНК CS0DM004YP08 печени плода Homo sapiens (человека)
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством 3 генов, подобных генам трансмембранных каналов (LOC488760); мРНК
100
XM 545878
TMC3
подобный трансмембранному каналу 3
CfaAffx. 20818.1.S1 s at
2,78E-02
4,46E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предполагаемым мембранным белком (LOC478992); мРНК
96,1
XM 549626
TMC01
трансмембранный и двуспиральный домены 1
CfaAffx. 23281.1.S1 at
5,26E-02
4,49E-01
0,7
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с трансмембранным и двуспиральным доменами 4 (LOC487401); мРНК
100
XM 544527
TMC04
трансмембранный и двуспиральный домены 4
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 2058.1.A1 at
2,22E-02
4,46E-01
1,43
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, молекула 2 адаптера toll-подобного рецептора; вариант транскрипта 2 (TICAM2); мРНК
81,8
XM 001147606
TMED7
белок 7, содержащий домен транспорта трансмембранного белка emp24
CfaAffx. 1277.1.S1 s at
3,35E-02
4,46E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, молекула 2 адаптера toll-подобного рецептора; вариант транскрипта 3 (TICAM2); мРНК
88,5
XM 001147833
TMED7
белок 7, содержащий домен транспорта трансмембранного белка emp24
CfaAffx. 15844.1.S1 s at
6,61E-02
4,51E-01
2,2
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником трансмембранного белка с EGF-подобным и двумя фоллистатин-подобными доменами 2 (томорегулин) (TR) (LOC478848); мРНК
98,5
XM 536010
TMEFF2
трансмембранный белок с EGF-подобным и двумя фоллистатин-подобными доменами 2
Cfa. 1297.1.A1 at
6,73E-02
4,52E-01
2
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с предшественником трансмембранного белка с EGF-подобным и двумя фоллистатин-подобными доменами 2 (томорегулин) (TR) (LOC478848); мРНК
98,8
XM 536010
TMEFF2
трансмембранный белок с EGF-подобным и двумя фоллистатин-подобными доменами 2
CfaAffx. 15844.1.S1 at
4,80E-02
4,48E-01
1,87
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, предшественником трансмембранного белка с EGF-подобным и двумя фоллистатин-подобными доменами 2 (томорегулин) (TR) (LOC478848); мРНК
100
XM 536010
TMEFF2
трансмембранный белок с EGF-подобным и двумя фоллистатин-подобными доменами 2
Cfa. 11400.1.A1 at
9,71E-02
4,64E-01
1,56
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком PM1; вариант транскрипта 1 (LOC479532); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с ZK1067.4 (LOC483713); мРНК
84,2
XM 540834
TMEM 151A
трансмембранный белок 151A
CfaAffx. 13247.1.S1 s at
3,23E-02
4,46E-01
1,54
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Bos taurus, сходный с трансмембранным белком 161В (TMEM161B); мРНК
87,6
XM 587515
TMEM 161В
трансмембранный белок 161В
CfaAffx. 30730.1.S1 at
4,78E-02
4,48E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG12341-PA; вариант транскрипта 1 (LOC612858); мРНК
100
XM 845412
TMEM 170A
трансмембранный белок 170A
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с R12C12.6; вариант транскрипта 1 (LOC476843); мРНК
100
XM 534047
TMEM9B
семейство доменов TMEM9, представитель В
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактором 5, ассоциированным с рецептором TNF (LOC480019); мРНК
100
XM 537142
TRAF5
фактор 5, ассоциированный с рецептором TNF
CfaAffx. 10368.1.S1 s at
4,77E-02
4,48E-01
1,53
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 22, содержащим состоящий из трех частей мотив (белок кольцевых пальцев 94) (стимулируемый транс-активирующий фактор 50 кД) (Staf 50) (LOC485284); мРНК
98,2
XM 542402
TRIM22
белок 22, содержащий состоящий из трех частей мотив
CfaAffx. 10378.1.S1 s at
2,90E-02
4,46E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, cOR52B8, подобный подсемейству B семейства обонятельных рецепторов 52 (COR52B8); мРНК
100
XM 848205
TRIM6-TRIM34
TRIM6-TRIM34
CfaAffx. 23978.1.S1s at
8,78E-02
4,59E-01
1,39
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с метилтрансферазой тРНК (N1G37) (LOC480347); мРНК
100
XM 537470
TRMT5
TRM5, гомолог 5 метилтрансферазы тРНК 5 (S. cerevisiae)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 13305.1.S1 s at
4,95E-02
4,48E-01
1,64
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2 семейства доменов TSC22 (TSC22-родственный индуцируемый белок лейциновой молнии 4); вариант транскрипта 1 (LOC477111); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG5290-PA (LOC475719); мРНК
100
XM 532927
TTC27
домен повтора тетратрикопептида 27
Cfa. 4004.1.S1 at
2,11E-02
4,46E-01
0,72
Mus musculus, семейство подобных тирозинлигазе тубулина; представитель 3 (TUB); вариант транскрипта 1; мРНК
57,1
NM 133923
Ttll3
семейство подобных тирозинлигазе тубулина, представитель 3
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 8903.1.S1 s at
2,69E-02
4,46E-01
0,67
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с семейством подобных тирозинкиназе тубулина; изоформа 1 представителя 3 (LOC484664); мРНК
100
XM 541779
TTLL3
семейство подобных тирозинлигазе тубулина, представитель 3
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с убиквитин-активирующим ферментом E1 (комплементирующий чувствительность к температуре A159T и BN75) (LOC475160); мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с убиквитин-активирующим ферментом E1 (комплементирующий чувствительность к температуре A159T и BN75) (LOC475160); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 24510.1.S1 s at
8,75E-02
4,59E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с УДФ-глюкозодегидрогеназой; вариант транскрипта 1 (LOC479107); мРНК
98,4
XM 536254
UGDH
УДФ-глюкозодегидрогеназа
CfaAffx. 2954.1.S1 at
7,15E-02
4,54E-01
1,45
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой b Np95-подобного белка кольцевых пальцев; вариант транскрипта 2 (LOC474702); мРНК
100
XM 846656
UHRF2
убиквитин-подобный с доменом PHD и доменом кольцевого пальца 2
Cfa. 10244.1.A1 s at
1,66E-02
4,46E-01
1,48
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с уридин-5-монофосфатсинтаза (UMP-синтаза) (LOC478593); мРНК
98,7
XM 535769
UMPS
уридинмонофосфатсинтаза
Cfa. 10244.1.A1 at
2,10E-02
4,46E-01
1,42
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с уридин-5-монофосфатсинтазой (UMP-синтаза) (LOC478593); мРНК
100
XM 535769
UMPS
уридинмонофосфатсинтаза
CfaAffx. 8340.1.S1 at
3,66E-02
4,46E-01
0,75
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гомологом D unc-13 (LOC483319); мРНК
100
XM 540438
UNC13D
гомолог D unc-13 (C. eleqans)
Cfa. 2046. 1.S1 at
9,65E-02
4,63E-01
1,39
Homo sapiens, гомолог A unc-84 (C. elegans) (UNC84A); вариант транскрипта 1; мРНК
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG5537-PA; вариант транскрипта 2 (LOC480960); мРНК
100
XM 538081
UPRT
гомолог урацилфосфорибозилтрансферазы (FUR1) (S. cerevisiae)
CfaAffx. 13431.1.S1 s at
4,83E-02
4,48E-01
1,5
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с фактором pi15 общего транспорта везикул (ассоциированный с трансцитозом белок) (TAP) (белок стыковки везикул); вариант транскрипта 2 (LOC478430); мРНК
46
XM 851270
US01
гомолог US01, белок стыковки везикул (дрожжи)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 19994.1.S1 s at
8,01E-03
4,46E-01
1,68
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гидролазой 1 карбоксильного конца убиквитина (убиквитинтиолэстераза 1) (протеаза 1 убиквитин-специфического процессинга) (деубиквитинилирующий фермент 1) (hUBP); вариант транскрипта 1 (LOC479549); мРНК
97,5
XM 536688
USP1
убиквитин-специфическая пептидаза 1
CfaAffx. 28718.1.S1 at
4,76E-03
4,46E-01
1,69
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с гидролазой 1 карбоксильного конца убиквитина (убиквитинтиолэстераза 1) (протеаза убиквитин-специфического процессинга 1) (деубиквитинилирующий фермент 1) (hUBP); вариант транскрипта 1 (LOC479549); мРНК
UTP18, компонент малой субъединицы (SSU) процессомы, гомолог (дрожжи)
Cfa. 11226.1.A1 at
4,31E-02
4,47E-01
1,4
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с антигеном 66, ассоциированным с гепатоклеточной карциномой; вариант транскрипта 2 (LOC480616); мРНК
97,2
XM 848784
UTP6
UTP6, компонент малой субъединицы (SSU) процессомы, гомолог (дрожжи)
Cfa. 13657.1.S1 s at
9,62E-03
4,46E-01
1,38
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с антигеном 66, ассоциированным с гепатоклеточной карциномой; вариант транскрипта 2 (LOC480616); мРНК
98,7
XM 848784
UTP6
UTP6, компонент малой субъединицы (SSU) процессомы, гомолог (дрожжи)
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 4057.1.S1 at
8,43E-02
4,56E-01
1,63
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с УДФ-глюкуронатдекарбоксилазой 1 (LOC481318); мРНК
92,2
XM 538439
UXS1
УДФ-глюкуронатдекарбоксилаза 1
Cfa. 21235.1.S1 at
2,68E-02
4,46E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком вакуолярной сортировки 26; вариант транскрипта 2 (LOC479233); мРНК
60,7
XM 855882
VPS26A
гомолог A белка вакуолярной сортировки 26 (S. pombe)
CfaAffx. 21356.1.S1 s at
3,99E-02
4,46E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком вакуолярной сортировки 26; вариант транскрипта 1 (LOC479233); мРНК
100
XM 536375
VPS26A
гомолог A белка вакуолярной сортировки 26 (S. pombe)
Cfa. 505.1.A1 at
4,49E-02
4,47E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, белок вакуолярной сортировки 33A; вариант транскрипта 5 (VPS33A); мРНК
39,2
XM 509444
VPS33A
гомолог A белка вакуолярной сортировки 33 (S. pombe)
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с изоформой 2 домена 20 WD-повтора; вариант транскрипта 6 (LOC611234); мРНК
97,9
XM 863505
WDR20
домен 20 WD-повтора
CfaAffx. 15597.1.S1 s at
4,68E-02
4,48E-01
1,33
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 2 WD-повтора (LOC483143); мРНК
99,6
XM 540261
WDR3
домен 3 WD-повтора
Cfa. 8901.1.A1 s at
7,14E-02
4,54E-01
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с доменом 36 WD-повтора (LOC488875); мРНК
100
XM 545992
WDR36
домен 36 WD-повтора
Cfa. 1554.1.A1 at
4,14E-02
4,46E-01
1,59
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с доменом 47 WD-повтора; вариант транскрипта 1 (LOC490126); мРНК
99,8
XM 547247
WDR47
домен 47 WD-повтора
Cfa. 17135.1.S1 s at
1,33E-02
4,46E-01
1,49
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с доменом 75 WD-повтора (LOC488443); мРНК
98,4
XM 545565
WDR75
домен 75 WD-повтора
CfaAffx. 14786.1.S1 at
9,72E-02
4,64E-CH
1,46
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с WD- повтором; белок 1, содержащий SAM и домен U-бокса (LOC478761); мРНК
92,2
XM 535926
WDSUB1
WD-повтор, белок 1, содержащий стерильный мотив альфа и домен U-бокса
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Cfa. 847.1.S1 at
2,10E-02
4,46E-01
1,35
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с WD-повтором; белок 1, содержащий SAM и домен U-бокса (LOC478761); мРНК
99,5
XM 535926
WDSUB1
WD-повтор, белок 1, содержащий стерильный мотив альфа и домен U-бокса
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с цинковым пальцем; изоформа 1 матрина типа (LOC480993); мРНК
100
XM 538114
ZMAT1
цинковый палец, матрин типа 1
CfaAffx. 9824.1.S1 at
9,35E-02
4,62E-01
1,51
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с цинковым пальцем; матрин типа 2; вариант транскрипта 2 (LOC607047); мРНК
100
XM 852454
ZMAT2
цинковый палец, матрин типа 2
CfaAffx. 11883.1.S1 at
7,21E-02
4,54E-01
1,53
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком цинкового пальца 198 (белок, слитый при миелопролиферативных расстройствах) (белок, подвергаемый перестройке при атипичном миелопролиферативном расстройстве); вариант транскрипта 3 (LOC477346); мРНК
100
XM 855426
ZMYM2
цинковый палец, MYM-типа 2
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
CfaAffx. 6343.1.S1 at
2,64E-02
4,46E-01
1,52
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком цинкового пальца 258; вариант транскрипта 3 (LOC475341); мРНК
99,5
XM 853798
ZMYM6
цинковый палец, MYM-типа 6
Cfa. 21595.1.S1 s at
4,78E-02
4,48E-01
1,47
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 11 цинкового пальца, содержащим домен MYND (белок, связывающий E1A аденовируса 5) (белок BS69); вариант транскрипта 3 (LOC478023); мРНК
55,3
XM 853691
ZMYND11
цинковый палец, белок 11, содержащий домен MYND
CfaAffx. 9458.1.S1 s at
2,97E-02
4,46E-01
1,34
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с белком 11 цинкового пальца, содержащим домен MYND (белок, связывающий E1A аденовируса 5) (белок BS69); вариант транскрипта 1 (LOC478023); мРНК
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
Таблица 6: Гены, дифференциально экспрессируемые в лимфоцитах тучных животных, которых кормили либо кормом с высоким содержанием белка, либо таким же кормом с добавлением рыбьего жира
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG1463-PA (LOC479966); мРНК
100
XM 537090
ZNHIT6
цинковый палец, HIT-типа 6
Cfa. 15903.1.A1 at
2,19E-02
4,46E-01
1,39
Homo sapiens, белок 2, содержащий цинковый и кольцевой пальцы (ZNRF2); мРНК
90
NM 147128
ZNRF2
белок 2, содержащий цинковый и кольцевой пальцы
Cfa. 20128.1.S1 s at
2,63E-02
4,46E-01
1,51
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с CG7386-PA; вариант транскрипта 1 (LOC476272); мРНК
99,5
XM 533478
ZUFSP
цинковый палец с доменом UFMI-специфической пептидазы
Cfa. 541.1.S1 at
1,98E-02
4,46E-01
1,41
РОГНОЗИРУЕМЫЙ: Pan troglodytes, гомолог B zyg-11 (ZYG11B); мРНК
35,5
XM 001139134
ZYG11B
гомолог B zyg-11 (С. eleqans)
Cfa. 323.1.S1 s at
9,91E-02
4,65E-01
1,32
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с цинковым пальцем; белок 3, содержащий домен ZZ; вариант транскрипта 1 (LOC490203); мРНК
100
XM 547324
ZZZ3
цинковый палец, белок 3, содержащий домен ZZ
CfaAffx. 31203.1.S1 s at
1,27E-02
4,46E-01
1,44
ПРОГНОЗИРУЕМЫЙ: Canis familiaris, сходный с цинковым пальцем; белок 3, содержащий домен ZZ; вариант транскрипта 1 (LOC490203); мРНК
100
XM 547324
ZZZ3
цинковый палец, белок 3, содержащий домен ZZ
Корма, содержащие высокие количества длинноцепочечных жирных кислот, стимулируют потерю массы и могут быть использованы для перепрограммирования экспрессии генов животных, так чтобы придать склонность к тому, чтобы стать худым и потенциально поддерживать худобу
Данные, полученные в результате скрининга ингредиентов in vitro, обсужденных выше, показывают, что некоторые ингредиенты, которые дают высокое содержание длинноцепочечных жирных кислот (см. таблицу 5), могут эффективно влиять на экспрессию генов, вовлеченных в метаболизм жиров, таким образом, что могут способствовать похудению животного в целом. Такое влияние определяют на основании анализа данных, полученных для жировой ткани, и на основании анализов ингредиентов, обсужденных выше, с использованием обычных анализов на базе компьютерных алгоритмов. Код алгоритмов, используемых для этой цели, известен специалисту в данной области, и может быть найден без излишнего экспериментирования. Пример такого кода приведен ниже:
FROM GERIATRICS_RNRM2 A, TOP_PROBE_ANNOT_2_3 B, FILT_INDIV_CELLS_2 C, F1LT_ACROSS_4_CELLS_2 D WHERE A.PROBE=B.PROBE AND A.PROBE=C.PROBE (+) AND A.PROBE=D.PROBE (+) AND UPPER(A.PROBE) NOT LIKE 'AFFX%' GROUP BY A.PROBE, B.TOP_HIT_DEF HAVING STATS_T_TEST_INDEPU( A.EXPTDAY, GENE_NORM_INT) <= .01 AND AVG(DECODE(A.EXPTDAY, 'D0', GENE_NORMJNT, null))/AVG(DECODE(A.EXPTDAY, 'D14', GENE_NORM_INT, null)) >= 5 AND SUM(DECODE(PAMCALL,'P', 1,0)) = 40 ORDER BY PROBE
Чтобы подтвердить данные, суммированные в приведенной выше таблице 5, о том, что некоторые биологически активные компоненты кормов, такие как ЭПК/ДГК (1,5:1), которые встречаются в рыбьем жире, являются более эффективными, чтобы вызвать потерю массы у собак по сравнению с другими биологически активными компонентами корма благодаря действию на ключевые гены, ассоциированные с метаболизмом жирных кислот (как показано в таблице 3), разработали три корма с высоким содержанием белка, либо без добавления длинноцепочечных жирных кислот (корм A), либо с добавлением линоленовой (примерно 1% из расчета на 100% сухую массу, корм B) или ЭПК/ДГК (1,5:1, примерно 0,30%:0,20%) (корм C) для сравнения с кормом с высоким содержанием волокон, который, как известно, индуцирует потерю массы у собак. В исследовании всех 45 собак с клинически проявляемой избыточной массой сначала кормили полным по питательным веществам контрольным кормом в течение 30 дней перед началом испытания. После первых 30 дней собак случайным образом делили на 4 группы. Три из четырех групп получали один из тестируемых кормов, и одна группа получала корм с высоким содержанием волокон в качестве контроля в течение установленного периода времени, например, 4 месяца. Результаты показывают, что три экспериментальных корма (корма A, B и C) имели значительно более высокую усваиваемость, чем корм с более высоким содержанием волокон. Результаты также показывают, что примерно 38% собак, потреблявших корм, содержащий ЭПК/ДГК, достигали целевой потери массы на 90 день. Интересно, что собаки, потреблявшие корм с ЭПК/ДГК, также сохраняли сухую мышечную массу и содержание минеральных веществ в костях. Результаты также показывают, что по меньшей мере при клиническом уровне, корма, диета, содержащая ЭПК/ДГК, может также эффективно, как и диета с высоким содержанием волокон, влиять на потерю массы.
Пример 5
Эксперименты по поддержанию возможной потери массы
На основе результатов эксперимента по потере массы, обсужденного выше, выдвинута гипотеза, что животные, которых кормят кормом, содержащим ЭПК/ДГК, будут не только терять массу, но также будут сохранять потерю в течение более длительного периода времени, по сравнению с животными, которых кормят другими испытуемыми кормами и контрольным кормом с высоким содержанием волокон.
Чтобы охарактеризовать эффекты кормов A, B, и C и корма с высоким содержанием волокон на поддержание утраченной массы, можно осуществить, например, следующий тип эксперимента:
Животных с избыточной массой можно кормить четырьмя разными кормами (как описано в примере 4) вплоть до достижения оптимального уровня «худобы». Затем их можно случайным образом разделить на подгруппы, которых либо продолжают кормить тем же тестируемым кормом, которым их кормили ранее, или их переводят на поддерживающую диету, которая сбалансирована по питательным веществам, но не предназначена для того, чтобы индуцировать и поддерживать потерю массы, и не включает существенных количеств, например, линоленовой кислоты или ЭПК/ДГК.
Затем за животными можно наблюдать в течение установленного периода времени, например, до 3 месяцев, регистрируя при этом ежедневно их массу, еженедельно определяя оценки упитанности их тела, и каждый месяц определяя процентное содержание жира в организме, используя обычные методики DEXA.