Поиск патентов
ПАТЕНТНЫЙ ПОИСК В РФ

олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего (tgf- ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена

Классы МПК:C07K5/087 боковая цепь первой аминокислоты содержит карбоциклические кольца, например Phe, Tyr
C07K5/107 боковая цепь первой аминокислоты содержит карбоциклические кольца, например Phe, Tyr
C07K7/06 содержащие от 5 до 11 аминокислот
A61K38/06 трипептиды
A61K38/07 тетрапептиды
A61K38/08 пептиды, содержащие 5-11 аминокислот
Автор(ы):, , , ,
Патентообладатель(и):ИБМЕД ХОЛДИНГС ЛИМИТЕД (CY)
Приоритеты:
подача заявки:
2008-05-22
публикация патента:

Изобретение относится к области биотехнологии, конкретно к получению биологически активных веществ пептидной природы, обладающих активностью факторов роста по отношению к стимулированию коллагеногенеза, и может быть использовано в медицине. Путем in silico конструирования получают олигопептид общей формулы: олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385873/2385873-2-s.gif" BORDER="0"> где А представляет собой Ас - ацетил; XI представляет собой G, или А, или отсутствует; Х2 представляет собой Р, или I, или L, или V, или А; Х3 представляет собой G; Х4 представляет собой Р, или I, или L, или V, или А; Х5 представляет собой G, или А, или отсутствует и В представляет собой ОМе - метил. Изобретение позволяет получить олигопептид, обладающий активностью кислого (aFGF) и трансформирующего (TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, и расширить арсенал эффективных терапевтических средств с ранозаживляющим действием, ускоряющих регенерацию поврежденных тканей и образование рубца. 4 ил. олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385873/2385873-3-s2.jpg" BORDER="0">

Настоящее изобретение относится к области биоорганической химии, биохимии и медицины, а именно к биологически активных веществам пептидной природы, обладающих активностью факторов роста по отношению к стимулированию коллагеногенеза, и может найти применение в медицине, ветеринарии, а также в экспериментальной биохимии.

Коллаген - самый распространенный белок животных клеток и важнейший молекулярный участник фиброплазии, т.е. образования соединительной ткани, происходящего при заживлении ран. Он присутствует не только в коллагеновых волокнах и базальных мембранах, но и в аморфном основном веществе соединительной ткани. Коллагеногенез стимулируется рядом сигнальных молекул, основными из которых являются кислый фактор роста фибробластов aFGF и трансформирующий фактор роста TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> [1].

Фактор роста фибробластов кислый aFGF (FGF-1) относится к семейству гепаринсвязывающих белков, трансформирующий фактор роста TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> - к семейству трансформирующих факторов роста. Показано, что aFGF [2] и TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> [3] стимулируют биосинтез коллагена in vitro.

Задачей настоящего изобретения является расширение арсенала эффективных терапевтических средств с ранозаживляющим действием, ускоряющих регенерацию поврежденных тканей, образование рубца и другие подобные процессы восстановления поврежденных тканей.

Основной технический результат, который может быть получен при осуществлении настоящего изобретения, заключается в реализации данного назначения: создании новых олигопептидов, обладающих активностью факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, общей формулы I:

олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385873/2385873-s.gif" BORDER="0">

где А представляет собой Ас;

Х1 представляет собой Gly, Ala или отсутствует;

Х2 представляет собой Pro, lle, Leu, Val или Ala;

Х3 представляет собой Gly;

Х4 представляет собой Pro, lle, Leu, Val или Ala;

Х5 представляет собой Gly, Ala или отсутствует и

В представляет собой ОМе,

при этом размер олигопептидов, проявляющих данную активность, варьируется от три- до пентапептидов. В формуле: Ас - ацетил, Gly - глицин, Ala - аланин, Pro - пролин, lle - изолейцин, Leu - лейцин, Val - валин, Оме - метил.

В отличие от производства чистых белков синтез заявляемых олигопептидов осуществляется по упрощенной и недорогостоящей технологии, что снижает стоимость новых препаратов, сказывается на их доступности и, следовательно, расширяет возможности их применения.

Формула заявляемых олигопептидов была выявлена по результатам компьютерного конструирования участков связывания кислого фактора роста фибробластов aFGF и трансформирующего фактора роста TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> с рецепторами поверхности стволовых клеток. Компьютерное конструирование участков связывания aFGF и TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> с их рецепторами проводили с помощью программного комплекса [4], осуществляющего компьютерное моделирование пространственной структуры белковых молекул и дизайн низкомолекулярных соединений, ответственных за биологическую функцию белка.

Нижеследующие чертежи составляют часть описания настоящего изобретения и включены для дополнительной демонстрации некоторых аспектов настоящего изобретения. Настоящее изобретение можно лучше понять путем обращения к одному или нескольким из этих чертежей в сочетании с подробным описанием представленных здесь конкретных вариантов осуществления настоящего изобретения.

На чертежах представлены:

фиг.1 - пространственная структура фрагмента белка aFGF [5];

фиг.2 - пространственная структура фрагмента кислого фактора роста фибробластов aFGF с идентифицированным функциональным сайтом (функциональные сайты в каждом из двух гомологичных доменов белка выделены);

фиг.3 - пространственная структура фрагмента белка TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> [6];

фиг.4 - пространственная структура фрагмента белка TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> с идентифицированным функциональным сайтом (функциональный сайт выделен).

Пример 1.

In silico конструирование функционального сайта aFGF на основе пространственной структуры белка aFGF

Для осуществления конструирования функционального сайта aFGF использовалась компьютерная программа [4].

Исходными данными для работы послужили первичные и пространственные структуры белков, импортированные из банка данных Protein Data Bank [7]. В базе данных банка проводили поиск пространственной структуры aFGF. В результате для компьютерного конструирования отобрали пространственную структуру aFGF [5] (фиг.1).

Далее проводили компьютерное моделирование, которое позволило идентифицировать пространственно сближенные аминокислотные остатки, находящиеся на поверхности глобулы белка aFGF и принимающие участие во взаимодействии aFGF с его рецептором (фиг.2). На основе полученных данных спрогнозировали формулу заявляемых олигопептидов.

Пример 2.

In silico конструирование функционального сайта TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> на основе пространственной структуры белка TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle">

Для осуществления конструирования функционального сайта TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> использовалась компьютерная программа [4].

Исходными данными для работы послужили первичные и пространственные структуры белков, импортированные из банка данных Protein Data Bank [7]. В базе данных банка проводили поиск пространственной структуры TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> . В результате для компьютерного конструирования отобрали пространственную структуру TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> [6] (фиг.3).

Далее проводили компьютерное моделирование, которое позволило идентифицировать пространственно сближенные аминокислотные остатки, находящиеся на поверхности глобулы белка TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> и принимающие участие во взаимодействии TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> с его рецептором (фиг.4). На основе полученных данных спрогнозировали формулу заявляемых олигопептидов.

Идентифицированные участки связывания являются структурными аналогами эпитопов, определенных для aFGF (см. пример 1), что подтверждает активность in silico спрогнозированных соединений по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена.

Из представленных на фиг.2 и фиг.4 данных, по результатам компьютерного моделирования можно сделать вывод, что заявляемый олигопептид представляет собой функциональный сайт aFGF и TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> , принимающий участие в связывании с рецепторами на поверхности стволовых клеток и стимулирующий биосинтез коллагена. Данное соединение может найти применение в медицине и ветеринарии в качестве средства с ранозаживляющим действием, ускоряющего регенерацию поврежденных тканей, образование рубца и другие подобные процессы восстановления поврежденных тканей.

Источники информации

1. Чеснокова Н.П. Инфекционный процесс / Н.П.Чеснокова [и др.]. - М.: Академия естествознания, 2006. - 484 с.

2. Пат. US/08558/9418, МПК7 С07К 14/50; А61К 31/375; А61К 38/18; А61К 45/06. Wound healing compositions containing fibroblast growth factor and ascorbic acid / J.C.Geesin, J.S.Gordon. - № EP 19910312105.

3. Rodriguez-Barbero, A. Endoglin Modulation of TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> 1-Induced Collagen Synthesis is Dependent on ERK 1/2 МАРК Activation / A.Rodriguez-Barbero [et al.] // Cell Physiol Biochem. - 2006. - Vol.18. - P.135-142.

4. Шутова И.В. Компьютерное моделирование пространственной структуры белковых молекул / И.В.Шутова, Л.М.Чемитова, В.П.Голубович // Химия, структура и функция биомолекул: Тез.докл. - Мн., 2006. - С.PR-162.

5. http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureld=1RG8.

6. http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureld=1KLC.

7. http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do.

ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ

Олигопептид, обладающий активностью кислого (aFGF) и трансформирующего (TGF-олигопептид, обладающий активностью кислого (afgf) и трансформирующего   (tgf-<img src= ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, патент № 2385873" SRC="/images/patents/78/2385156/946.gif" BORDER="0" ALIGN="absmiddle"> ) факторов роста по отношению к стимулированию биосинтеза коллагена, общей формулы

А-Х1-Х2-Х3-Х4-Х5-В,

где А представляет собой Ас;

X1 представляет собой G, или А, или отсутствует;

Х2 представляет собой Р, или I, или L, или V, или А;

Х3 представляет собой G;

Х4 представляет собой Р, или I, или L, или V, или А;

Х5 представляет собой G, или А, или отсутствует и В представляет собой ОМе,

где Ас - ацетил, G - глицин, А - аланин, Р - пролин, I - изолейцин, L - лейцин, V - валин, ОМе - метил, при этом размер олигопептида варьируется от три- до пентапептида.


Скачать патент РФ Официальная публикация
патента РФ № 2385873

patent-2385873.pdf
Патентный поиск по классам МПК-8:

Класс C07K5/087 боковая цепь первой аминокислоты содержит карбоциклические кольца, например Phe, Tyr

Патенты РФ в классе C07K5/087:
производные 1-(1-адамантил)этиламина и их противовирусная активность -  патент 2461544 (20.09.2012)
пептидные эпоксикетоны для ингибирования протеасомы -  патент 2450016 (10.05.2012)
ингибиторы hcv/вич и их применение -  патент 2448976 (27.04.2012)
новые биологически активные пептиды и их новое применение -  патент 2423375 (10.07.2011)
олигопептид, обладающий активностью трансформирующего фактора роста (tgf- ) и онкостатина m (osm) по отношению к пролиферации фибробластов -  патент 2385874 (10.04.2010)
производные гемиастерлина и их применение при лечении рака -  патент 2342399 (27.12.2008)
промежуточные соединения для синтеза антагониста рилизинг-фактора лютеинизирующего гормона (lhrh), способ их получения и способ получения антагониста lhrh -  патент 2307125 (27.09.2007)
пептид, стимулирующий противоопухолевый иммунный ответ, фармацевтическая композиция на его основе, способ лечения млекопитающего и способ модуляции иммунного ответа -  патент 2305107 (27.08.2007)
1,5-бензотиазепины и их применение в качестве антигиперлипидемических средств -  патент 2302414 (10.07.2007)
пептидильные гетероциклы, используемые при лечении тромбинассоциированных заболеваний -  патент 2181125 (10.04.2002)

Класс C07K5/107 боковая цепь первой аминокислоты содержит карбоциклические кольца, например Phe, Tyr

Патенты РФ в классе C07K5/107:
синтетические пептидные амиды -  патент 2500685 (10.12.2013)
ингибиторы hcv/вич и их применение -  патент 2448976 (27.04.2012)
тетрапептид, обладающий анксиолитическим действием -  патент 2429003 (20.09.2011)
новые биологически активные пептиды и их новое применение -  патент 2423375 (10.07.2011)
олигопептид, обладающий активностью трансформирующего фактора роста (tgf- ) и онкостатина m (osm) по отношению к пролиферации фибробластов -  патент 2385874 (10.04.2010)
соединения для ингибирования ферментов -  патент 2384585 (20.03.2010)
иммуносупрессоры -  патент 2334760 (27.09.2008)
способ получения аналогов аденокортикотропного гормона (актг), последовательности (4-10), обладающих нейротропной активностью, и тетрапептид для его получения -  патент 2315057 (20.01.2008)
пептид, стимулирующий противоопухолевый иммунный ответ, фармацевтическая композиция на его основе, способ лечения млекопитающего и способ модуляции иммунного ответа -  патент 2305107 (27.08.2007)
композиция из пептидов, обладающая иммунорегуляторным свойством -  патент 2266297 (20.12.2005)

Класс C07K7/06 содержащие от 5 до 11 аминокислот

Патенты РФ в классе C07K7/06:
модульный молекулярный конъюгат для направленной доставки генетических конструкций и способ его получения -  патент 2529034 (27.09.2014)
циклический октапептид, радиофармацевтическое средство на его основе и способ применения радиофармацевтического средства для получения лекарственных (фармацевтических) средств для лечения новообразований, экспрессирующих соматостатиновые рецепторы -  патент 2528414 (20.09.2014)
проникающие в клетку пептиды и полипептиды для клеток микроорганизмов -  патент 2526511 (20.08.2014)
новый пептид и его применение -  патент 2525913 (20.08.2014)
пептиды и их производные, взаимодействующие с никотиновым ацетилхолиновым рецептором и пригодные для использования в косметологии против мимических и возрастных морщин -  патент 2524428 (27.07.2014)
конъюгаты, содержащие гидрофильные спейсеры линкеров -  патент 2523909 (27.07.2014)
конъюгаты антагониста пептида аналога бомбезина -  патент 2523531 (20.07.2014)
применение производных пептида wnt5-a для лечения меланомы и рака желудка -  патент 2517190 (27.05.2014)
способ получения дегареликса -  патент 2515555 (10.05.2014)
композиции для лечения боли и/или воспаления -  патент 2515054 (10.05.2014)

Класс A61K38/06 трипептиды

Патенты РФ в классе A61K38/06:
средство пептидной структуры, обладающее анальгетическим, противовоспалительным действием, и лекарственные формы на его основе -  патент 2528094 (10.09.2014)
пептидные производные 1-(1-адамантил)этиламина и их противовирусное действие -  патент 2524216 (27.07.2014)
ингибиторы протеазы вируса гепатита с и их применение -  патент 2523790 (27.07.2014)
средство против гипоксии миокарда -  патент 2522953 (20.07.2014)
средства для профилактики и лечения заболеваний суставов и способы их применения -  патент 2521973 (10.07.2014)
способ лечения животных с хирургическим сепсисом -  патент 2517053 (27.05.2014)
ингибиторы протеазы вируса гепатита с и их применение -  патент 2515318 (10.05.2014)
равномерномеченный тритием пиро-glu-his-pro-nh2 -  патент 2513852 (20.04.2014)
иммуномодулирующие олигопептиды -  патент 2503684 (10.01.2014)
способ лечения локализованных форм псориаза -  патент 2501563 (20.12.2013)

Класс A61K38/07 тетрапептиды

Патенты РФ в классе A61K38/07:
пептидные производные 1-(1-адамантил)этиламина и их противовирусное действие -  патент 2524216 (27.07.2014)
синтетические пептидные амиды и их димеры -  патент 2510399 (27.03.2014)
пептидные фрагменты для индукции синтеза белков внеклеточного матрикса -  патент 2501807 (20.12.2013)
синтетические пептидные амиды -  патент 2500685 (10.12.2013)
пептиды, обладающие цитопротекторной активностью -  патент 2482128 (20.05.2013)
средство для инактивации днк-вирусов -  патент 2480478 (27.04.2013)
способ профилактики и лечения нарушений углеводного и липидного обмена при метаболическом синдроме и энцефалопатии, применение тетрапептида и фармацевтическая композиция для профилактики и лечения таких нарушений -  патент 2480234 (27.04.2013)
способ получения пептида -  патент 2478105 (27.03.2013)
композиция биологически активных веществ, обладающая геропротекторной активностью, и способ комплексной коррекции возрастных изменений гормонального баланса, функций эпифиза и антиоксидантного статуса, включающий введение указанной композиции -  патент 2464816 (27.10.2012)
фармацевтическая композиция, обладающая стресс-протекторным действием, и способ профилактики и лечения функциональных или стресс-индуцированных нарушений -  патент 2455310 (10.07.2012)

Класс A61K38/08 пептиды, содержащие 5-11 аминокислот

Патенты РФ в классе A61K38/08:
применение пептида актг (4-7)-пгп гепатопротекторного воздействия -  патент 2528741 (20.09.2014)
циклический октапептид, радиофармацевтическое средство на его основе и способ применения радиофармацевтического средства для получения лекарственных (фармацевтических) средств для лечения новообразований, экспрессирующих соматостатиновые рецепторы -  патент 2528414 (20.09.2014)
содежащий октреотид состав с замедленным высвобождением со стабильно высоким уровнем воздействия -  патент 2526822 (27.08.2014)
применение опиорфина в качестве психостимулирующего агента -  патент 2526819 (27.08.2014)
способ хирургического лечения острого панкреатита с ранним энтеральным интраоперационным питанием пациента -  патент 2526247 (20.08.2014)
способ лечения болезни альцгеймера -  патент 2526155 (20.08.2014)
новый пептид и его применение -  патент 2525913 (20.08.2014)
пептиды и их производные, взаимодействующие с никотиновым ацетилхолиновым рецептором и пригодные для использования в косметологии против мимических и возрастных морщин -  патент 2524428 (27.07.2014)
ингибиторы протеазы вируса гепатита с и их применение -  патент 2523790 (27.07.2014)
применение аналогов соматостатина при менингиоме -  патент 2523416 (20.07.2014)

Наверх