ПАТЕНТНЫЙ ПОИСК В РФ
НОВЫЕ ПАТЕНТЫ, ЗАЯВКИ НА ПАТЕНТ
БИБЛИОТЕКА ПАТЕНТОВ НА ИЗОБРЕТЕНИЯ

способ дифференциации токсигенных генетически измененных штаммов vibrio cholerae биовара эль тор с разным эпидемическим потенциалом методом мультиплексной полимеразной цепной реакции и тест-система для его осуществления - заявка на патент 2014100736


Классы МПК: C12Q1/68   (2006.01)
C12R1/63   (2006.01)
Автор: Смирнова Нина Ивановна (RU),
Агафонов Дмитрий Анатольевич (RU),
Шашкова Алена Владимировна (RU),
Заднова Светлана Петровна (RU),
Челдышова Надежда Борисовна (RU)
Заявитель: Федеральное казенное учреждение здравоохранения "Российский научно-исследовательский противочумный институт "Микроб" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФКУЗ "РосНИПЧИ "Микроб") (RU)

ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ

1. Способ дифференциации токсигенных генетически измененных штаммов V. cholerae биовара Эль Тор с низким и высоким эпидемическим потенциалом методом мультиплексной полимеразной цепной реакции, характеризующийся тем, что ПЦР проводят в реакционной смеси, содержащей три пары праймеров к генам vc0497, vc0502 и vc0514, с температурой отжига праймеров 60°С в течение 30 сек при числе циклов амплификации, равном 35, дифференциацию проводят по структуре VSP-II путем сравнения амплифицированных фрагментов генов исследуемых и контрольных штаммов, при этом к штаммам с низким эпидемическим потенциалом относят штаммы с интактным островом пандемичности VSP-II, для которых характерно наличие ампликонов фрагментов генов vc0497, vc0502 и vc0514, идентичных контрольному образцу, и штаммы с короткой делецией в VSP-II, для которых характерно наличие ампликонов фрагментов генов vc0502 и vc0514, а к штаммам с высоким эпидемическим потенциалом относят штаммы с протяженной делецией VSP-II, для которых характерно наличие ампликона фрагмента гена vc0514.

2. Тест-система для осуществления способа по п. 1 методом мультиплексной полимеразной цепной реакции, содержащая компоненты для выделения ДНК, компоненты для проведения ПЦР, компоненты для анализа результатов, отличающаяся тем, что компоненты для проведения ПЦР содержат смесь праймеров: VSPIIregF/VSPIIreg-R, VSPIIpilin-F/VSPIIpilin-R, VSPIIchem-F/VSPIIchem-R, в соотношении 1:1:1:1:1:1, соответственно.

3. Тест-система по п. 2, отличающаяся тем, что праймеры VSPIIreg-F/VSPIIreg-R, VSPIIpilin-F/VSPIIpilin-R, VSPIIchem-F/VSPIIchem-R имеют следующие нуклеотидные последовательности:

VSPIIreg-F - 5'-TGGAAAGAAGAGCGTTACTGC-3',

VSPIIreg-R - 5'-CCCTGTTGATGATGTGATTTG-3',

VSPIIpilin-F - 5'-CTGTGATTCGGGCTTTATCGG-3',

VSPIIpilin-R - 5'-GCGTAAACTGAGCCAATAAGC-3',

VSPIIchem-F - 5'-CTTGATGGAGCGGAGAAAAC-3',

VSPIIchem-R - 5'-CGATGAATAGCCTGTTGAAC-3'.

Наверх